7. Transposition d'ADN Flashcards
Qu’est-ce que la transposition ?
- Cas particulier de recombinaison.
- Déplace, ou copie et déplace, un segment d’ADN à un autre endroit du génome.
Quel est le type de séquence induit par la transposition ?
Élément transposable ou transposon.
Qu’est-ce qu’un déplacement sans duplication dans la transposition ?
Excision de l’ancien site et insertion dans le nouveau site.
Qu’est-ce qu’un déplacement avec duplication ?
Copies de l’élément dans les sites ancien et nouveau.
Que nécessite le déplacement des transposons ?
Une recombinaison des séquences des extrémités du transposon avec celles de son site d’acueil.
Ou peuvent s’insérer des transposons ?
- Au milieu de la séquence codante d’un gène et l’inactiver.
- Dans la séquence régulatrice et modifier ainsi l’expression du gène associée.
Quelles sont les caractéristiques des transposons ?
- Présents dans le génome de tous les organismes vivants.
- Source majeure de mutation.
- Responsables de certaines maladies génétiques, cancers.
- Utilisés comme vecteurs de transformation génétique.
Expliquez l’exemple de la globine theta.
Le transposon ALU s’est inséré dans le gène dormant de la globine theta. ALU contient des séquences activatrices de transcription et a activé la globine theta.
Que sont les syncytines ?
Protéines d’origine rétrovirale qui ont été recrutés pour assurer la synthèse d’une membrane du placenta d’origine embryonnaire (syncytiotrophoblaste).
Est-ce que les transposons ont une durée de vie illimitée ?
Non, lorsqu’ils “meurent”, ils sont remplacés par un autre gène équivalent.
Quelles sont les trois classes de transposon ?
- Transposons à ADN.
- Transposons à ARN.
- Rétrotransposons non viraux.
De quoi sont composés les transposons à ADN ?
1 transposase + 2 sites de recombinaison.
Que contiennent les sites de recombinaison dans les transposons à ADN ?
- 25 pb à plusieurs centaines de pb.
- séquences plus ou moins répétées, inversées.
- Sites de liaison à la transposase.
De quoi sont formées les séquences flanquantes du transposon à ADN ?
Sont formées d’un même mptif dupliqué de 2 à 20 pb. Elles sont générées lors du processus de recombinaison.
De quoi est composé un transposon autonome ?
1 transposase et 2 sites de recombinaisons.
De quoi est composé un transposon non autonome ?
2 sites de recombinaison, mais peut utiliser la transposase d’un transposon autonome.
Que contiennent les sites de recombinaisons des transposons à ARN ?
- Idem à ADN.
- Imbriqués dans des longues séquences répétées : LTR.
Quelles sont les 2 protéines encodées par l’ARN des rétrotransposons ?
- Une intégrase = transposase.
2. Une transcriptase inverse = ADN polymérase qui utilise l’ARN comme matrice pour synthétiser de l’ADN.
Pourquoi la transcriptase inverse est nécessaire ?
Pour rétro-transcrire l’intermédiaire ARN en ADN double brin, afin de pouvoir l’intégrer au génome de l’hôte.
Quelle est la différence entre rétrotransposons et rétrovirus ?
- Le génome d’un rétrovirus est empaqueté dans une capsule virale qui peut sortir de sa cellule hôte pour en infecter une autre.
- La séquence d’un rétrotransposon reste prisonnière de sa cellule hôte et ne peut se déplacer que vers de nouveaux sites à l’intérieur de cette même cellule.
Quelle est la caractéristique générale des rétrotransposons poly-a ?
Pas de séquences terminales inversées et répétées, au contraire, les 2 extrémités de l’élément portent des régions distinctes : 5’UTR et 3’UTR.
Les rétrotransposons poly-a peuvent prendre quelles formes ?
Formes autonomes et non autonomes.
Dans les rétrotransposons poly-a, que sont les deux séquences flanquantes ?
Se sont des sites d’intégration dans l’ADN cible (hors transposon).
Quelles sont les deux protéines indispensables qu’encode l’ARN des rétrotransposons ?
- ORF-1 code pour une protéine de liaison à l’ARN.
- ORF-2 code pour une protéine à double fonction : transcriptase inverse et endonucléase.
Quelles sont les deux grandes étapes du déplacement d’un transposon à ADN ?
- Excision du transposon de son site et intégration à un nouveau site.
- La transposase se lie aux séquences terminales répétées et inversées pour former un complexe ADN-protéine stable (le transposome = complexe synaptique).
