5. Recombinaison spécifique de site et transposition d'ADN

Question 1

Quelles sont les caractéristiques des bactériophages ?

Answer 1

• ADN double brin de 5000 à 650 000 pb.
• Taille de 24 à 200 nm.
• Hôte-spécifiques.

Question 2

Que sont les prophages ?

Answer 2

• Sont inoffensifs.
• Intègrent pacifiquement leur génome à celui de leur bactérie hôte.
• L’ADN du phage est répliqué passivement avec le génome de sa bactérie hôte.
• La bactérie hôte utilise les gènes du phage (conversion lysogénique).

Question 3

Que sont les phages lytiques ?

Answer 3

• Sont virulents.

- La cellule infectée produit des phages jusqu’à exploser en libérant les capsules de phages (phase lytique).

Question 4

Quelles sont les séquences spécifiques des sites de recombinaison ?

Answer 4

1. Sites de liaison à la recombinase.

- Sites de clivage/scellement.

Question 5

Quels sont les 3 types de réarrangement d’ADN générés par les RSS ?

Answer 5

1. Insersion d’un segment d’ADN étranger à un site spécifique.
2. Délétion ——
3. Inversion ——.

Question 6

Quelles sont les séquences aux sites de recombinaison ?

Answer 6

• 2 sites flanquants de liaison à la recombinase.

- 1 région centrale dite de croisement.

Question 7

Quel est le principe de polarisation ?

Answer 7

La séquence de la région centrale est asymétrique de sorte que les sites de liaison à la recombinase soient polarisés.

Question 8

Comment se recombinent les sites non-inversés ?

Answer 8

1. Fusion de 2 sites colinéaires appartenant chacun à une molécule distincte (insersion du segment AB entre les 2 sites colinéaires).
2. Fusion de 2 sites colinéaires appartenant chacun à une même molécule (délétion du segment AB entre les 2 sites colinéaires).

Question 9

Quelles sont les deux familles de recombinases spécifiques de site ?

Answer 9

Sérine et tyrosine.

Question 10

Quelles sont les étapes de la recombinase à sérine ?

Answer 10

1. Le résidu sérine fait une attaque nucléophile sur le pont phosphodiester.
2. Le groupe hydroxyle du brin clivé peut attaquer à son tour la liaison covalente protéine-ADN de la recombinase = scelle l’ADN et libère l’enzyme.

Question 11

Que comprend la recombinase à sérine ?

Answer 11

• 1 recombinase tétramérique dont les 4 sous unités sont physiquement liées.
• 2 molécules double brin clivées.
• Région centrale plane et hydrophobe (instable).
• Des régions hydrophiles + et - pour stabiliser la structure de l’enzyme dans sa position initiale et après sa rotation à 180.

Question 12

Quelles sont les étapes de l’action de la recombinase à sérine ?

Answer 12

1. 4 coupure simple brin nécessaires avant l’échange des brins.
2. Après l’échange des brins, les 3’-OH libres de chacun des brins clivés attaquent les liaisons covalentes recombinase-ADN de leurs nouveaux partenaires.

Question 13

Quelles sont les étapes de l’action de la recombinase à tyrosine ?

Answer 13

1. R1 et R3 coupent l’ADn en 3’-O-P avec leur résidu tyrosine.
2. R2 et R4 opèrent de la même manière.

Question 14

Que dirige l’intégrase du phage lambda ?

Answer 14

L’intégration puis l’excision de l’ADn viral dans un chromosome bactérien hôte.

Question 15

Que catalyse l’intégrase du phage lambda ?

Answer 15

La recombinaison entre 2 sites spécifiques attP et attB dont le deuxième se situe sur le chromosome bactérien.

Question 16

Que font les protéines accessoires dans le complexe protéine-ADN ?

Answer 16

1. Initier la formation du complexe protéine-ADN.
2. INtégrer le génome du phage au génome bacctérien.
3. Exciser l’ADN.

Question 17

Quels sont les deux domaines de liaison de l’enzyme intégrase lambda ?

Answer 17

• 1 avec le coeur.

- 1 avec le bras.

Question 18

Que sont les FIH ?

Answer 18

Protéines de liaison à l’ADN qui courbent la double hélice à 160.