5. Systèmes organisés Flashcards
C’est quoi des interactions quinaires
Interactions sporadiques en haute concentration de protéines
C’est quoi la structure quinaire et que permet-elle de faire?
niveau d’organisation des protéines où interactions peu stables et faibles échanges d’énergie
permet fct cellule, interactions enzymatiques
V ou F les enzymes sont réparties uniformément dans la cell
F, les enzymes se regroupent en métabolons pour canaliser les métabolites d’une réaction à l’autre
Que permet la canalisation du substrat
eviter l’utilisation de metabolites par d’autres voies enzymatiques concurrentes.
regule flux aux points d’embranchement
V ou F la canalisation du substrat permet de rendre la voie métabolique plus efficace ou plus rapide.
Faux, misconception.
À part 2 exceptions (E parfaites et très faible concentration d’E)
Explique les deux exceptions pour lesquelles la canalisation pourrait accélerer la vitesse catalytique
-Enzymes parfaites: très haute activité catalytique au point où elles sont slm limitée par diffusion des S
-Faible concentration d’Enzymes: grande distance d’une enzyme à l’autre
2 avantages de canalisation du substrat dans le TCA
1- regul flux aux embranchements
2- séquestration intermédiaires toxiques
Explique rétention électrostatique entre enzymes et leur coévolution
Enzymes s’assemblent grâce aux charges opposées sur leur surface
ont coévolué pr avoir struct complément
C’est quoi des clusters?
enzymes non séquentielles qui servent de pts de nucléation (regroupement) en facilitant interactions entre enzymes séquentielles.
V ou F dans un cluster on augmente les probabilités de canalisation
V
C’est quoi des métabolons?
complexes dynamiques d’Enzymes qui permettent de canaliser les substrats
ou retrouvons nous le metabolon glycolytique dans les cellules
sur les filaments d’actine
V ou F les ARN ont un rôle dans l’assemblage des métabolons glycolytiques
V
C’est quoi un condensat (séparation de phases)?
ségrégation spontanée de certaines molec dans des compartiments distincts du milieu
processus réversible, lliquie/solide
interactions influencée par températue, pH, cofacteurs
Condensat vs Agrégat
Condensat: dynamique, réversible, permet de remplir fct
Agrégat, assemblages pathologiques
Avantages séparation de phases (3)
- ctrl espace
- molécules coacervées LLPS (phase riche en soluté se séparant de la phase aq)
- formation MLO (membraneless organelles)
Nomme des éléments aidant à l’assemblage de condensats (2)
IDR: régions intrinséquement désordonnées (protéine qui a pas tt sa struct 3D stable)
ARN
Consequences fonctionnelles de la formation de condensats (4)
- augmentation concentration: aug cinétique et spécificité
- modif des propriétés physiques: ex aug viscosité formation fibrilles
- séquestration molec ds le condensat
- concentration maintenue ds le milieu
On cherche a savoir si le microenvironnement biochimique au sein d’un condensat régule la fonction enzymatique ?
Quels 3 éléments utilisons-nous dans cette expérience
- région IDR de la CAPRIN1 (permet formation condensat)
- ARN polyA court (ne contribue par à LLPS)
- enzyme CNOT qui clive ARN polyA
Résultats de l’expérience du microenvironnement chimique
CNOT7 a une queue en C-term qui l’empêche de cliver ARN polyA.
En condensat CAPRIN1, la queue C-term est tronquée donc CNOT7 augmente activité catalytique.
Donc l’environnement liquide distinct d’un condensat peut fr régulation enzymatique.