5. L’ARNt et l’aminocylation Flashcards
Qu’est-ce que la traduction?
La traduction est l’étape de synthèse des protéines par les ribosomes, à partir de l’information génétique contenue dans les ARN messagers (ARNm).
Quel mécanisme sous-tend la traduction ?
La traduction est le mécanisme par lequel le flux d’information génétique passe d’une forme acide nucléique (ARN) à une forme protéique selon un code universel.
Comment l’information génétique est-elle codée dans les acides nucléiques ?
Elle est codée dans un alphabet à 4 lettres (A, C, G, U/T) et traduite en protéines dans un alphabet à 20 lettres.
Quelle est la fonction de la transcription?
La transcription est la synthèse d’une molécule d’ARN messager (ARNm) à partir de la séquence d’ADN d’un gène.
Que permet la traduction?
La traduction assure l’expression des gènes portés par l’ADN en fabriquant des protéines.
Quels sont les acteurs principaux de la traduction?
- ARNm : porte l’information.
- Ribosome : assemble les acides aminés en protéines.
- Acides aminés : pièces de construction des protéines.
- ARNt : transporte les acides aminés au ribosome.
Que représente un codon dans le code génétique ?
Un codon est un triplet de nucléotides qui code pour un acide aminé ou un signal d’initiation ou de terminaison.
Combien de nucléotides composent un codon ?
Un codon est composé de 3 nucléotides (un triplet).
Combien de codons sont associés aux acides aminés ?
61 codons sont associés aux acides aminés.
Quels sont les codons stop ?
UAA, UAG, et UGA (associés à aucun a.a.)
Quel est le codon d’initiation universel ?
Le codon AUG, qui code pour la méthionine.
Pourquoi dit-on que le code génétique est dégénéré ?
Parce que plusieurs codons peuvent coder pour un même acide aminé (codons synonymes).
Qui a permis de déchiffrer le code génétique et comment ?
Marshall Nirenberg et Heinrich Matthaei en 1961, en utilisant des extraits d’E. coli, des ARN synthétiques (poly U, poly A, poly C) et les 20 acides aminés.
Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ?
Un cadre de lecture est une manière de lire les codons par triplets, sans chevauchement ni virgule.
Qu’est-ce qui détermine le cadre de lecture ouvert (ORF) ?
Le premier nucléotide du premier codon détermine le cadre de lecture ouvert, souvent initié par un codon AUG.
Chaque triplet de nucléotides sur l’ADN correspond à …
Un codon de l’ARNm
Chaque codon de l’ARNm correspond à …
Un anti-codon spécifique de l’ARNt
Chaque anti-codon correspond à …
Un acide aminé spécifique
Quelle hypothèse Francis Crick a-t-il émise en 1954 ?
Il a suggéré l’existence d’adaptateurs moléculaires (ARNt) pour lier les triplets d’acides nucléiques aux acides aminés correspondants.
Quels sont les acteurs PROTÉIQUES dans la tradcution?
- ARNt (adaptateur)
- Anticodon (ARNt isoaccepteurs)
- Aminoacyl synthétases
- Ribosome
Quel est le rôle de l’ARNt dans la traduction ?
L’ARNt joue un rôle d’adaptateur en reconnaissant un codon de 3 bases sur l’ARNm et en transportant un acide aminé spécifique.
Quel est le rôle de ARNt isoaccepteurs?
Pour un triplet sur l’ARNm (codon), correspond un triplet sur l’ARNt (anti-codon),
puisqu’il a une séquence complémentaire au codon.
Vrai ou Faux? Il existe un seul anticodon pour chaque ARNt.
Vrai!
Vrai ou Faux? Il existe un seul ARNt pour chaque a.a.
Comme le code génétique est dégénéré, i.e. plus d’un codon code pour un acide aminé (codons synonymes), il pourra y avoir plus d’un ARNt pour un acide aminé.
Quelle est la fonction des aminoacyl-ARNt synthétases ?
Elles lient un acide aminé spécifique à son ARNt correspondant par un lien covalent, permettant la traduction.
Quel est le fonctionnement du transfert de peptide ?
Après qu’un ARNt chargé de son acide aminé spécifique se soit apparié à son triplet sur l’ARNm, son acide aminé va être transféré à l’extrémité de la protéine, qui croît ainsi d’un acide aminé. C’est le peptide qui est transféré sur l’acide aminé.
Quelles sont les étapes de l’initiation de la traduction ?
- Le brin d’ARNm s’attache au ribosome
- Liaison deux ARNt grâce à leur anticodon complémentaire
au codon. - Formation d’une liaison covalente
entre les 2 acides aminés
Quelles sont les étapes de l’élongation de la traduction ?
- Le premier ARNt quitte le ribosome
- Le ribosome avance de trois nucléotides
- Un nouvel ARNt se positionne dans le
site « libre » du ribosome
Quelle est la vitesse d’élongation de la traduction eucaryote?
Très rapide: 15-20 a.a./seconde
Quelles sont les étapes de la terminaison de la traduction ?
La synthèse s’arrête au niveau
d’un codon STOP et le polypeptide est libéré
Quels sont les niveaux de structure de l’ARNt ?
- Structure primaire : Séquence linéaire des nucléotides.
- Structure secondaire : Modèle en feuille de trèfle.
- Structure tertiaire : Structure 3-D en forme de L.
Quelle est la structure primaire de l’ARNt ?
- L’ARNt est composé de 75 à 95 nucléotides.
- Il contient 15 nucléotides invariables et 8 semi-variables.
- Les positions de ces nucléotides jouent un rôle important dans la structure secondaire et tertiaire.
Quelle est la structure secondaire de l’ARNt ?
Les molécules d’ARN ont habituellement une structure secondaire composée de tiges et de boucles.
Comment se forment les tiges dans l’ARNt ?
Les tiges proviennent de l’appariement de bases complémentaires dans le même brin. Ces structures sont stabilisées par des interactions d’appariement de bases, comme dans l’ADN.
Comment se forment les boucles dans l’ARNt ?
Les boucles apparaissent lorsque le manque de complémentarité ou la présence de bases modifiées empêche l’appariement des bases.
Comment la structure secondaire de l’ARNt est-elle stabilisée ?
En se repliant, la molécule d’ARN forme une structure stabilisée par :
- La force des ponts hydrogènes entre certaines paires de bases (A-U, C-G, G-U).
- L’empilement de paires de bases voisines.
Vrai ou faux : Les empilements G-C sont aussi stables que les empilements A-U.
Faux. Un empilement (G-C)(G-C) est plus stable qu’un empilement (A-U)(A-U).
Quels sont les neuf éléments importants de la structure secondaire de l’ARNt ?
-Pi (phosphate inorganique).
- Tige adaptatrice.
- Bras D.
- Bras anticodon.
- Bras T.
- Séquence CCA.
- Séquence de nucléotides invariants et semi-variables.
- Base modifiée en 3’.
- Bras variable.
À partir de quoi le Pi (phosphate inorganique) est-il formé dans l’ARNt ?
Le Pi est formé à partir de l’acide phosphorique (H₃PO₄).
Qu’est-ce que la tige adaptatrice dans l’ARNt ?
C’est une tige de 7 paires de bases qui peut inclure des appariements non Watson-Crick. Cette tige est appelée tige acceptatrice ou tige acide aminé, car elle accepte l’acide aminé à son extrémité 3’.
Qu’est-ce que le bras D dans l’ARNt ?
C’est une tige de 3-4 paires de bases qui se termine par une boucle contenant souvent un nucléotide modifié, la dihydrouridine (D). Cette tige et cette boucle forment le bras D.
Qu’est-ce que le bras anticodon dans l’ARNt ?
Une tige de 5 paires de bases se terminant par une boucle contenant l’anticodon, une séquence de 3 nucléotides. La tige et la boucle constituent le bras anticodon.
Qu’est-ce que le bras T dans l’ARNt ?
Une tige de 5 paires de bases se terminant par une boucle contenant la séquence TΨC (T : ribothymidine ; Ψ : pseudouridine ; C : cytidine). Cette structure stabilise la conformation tridimensionnelle de l’ARNt.
Qu’est-ce que la séquence CCA de l’ARNt ?
Tous les ARNt se terminent par la séquence CCA à leur extrémité 3’, avec un groupe hydroxyle (OH) ajouté post-transcriptionnellement.
Qu’est-ce que la séquence invariable de l’ARNt ?
Une séquence comprenant 15 nucléotides toujours présents (invariants) et 8 semi-invariants (toujours purines ou toujours pyrimidines). Ces nucléotides se trouvent principalement dans les boucles.
Qu’est-ce que la base modifiée dans l’ARNt et où se trouve-t-elle ?
Le nucléotide en 3’ de l’anticodon est toujours une base modifiée.
Qu’est-ce que le bras variable dans l’ARNt ?
C’est la région la plus variable de l’ARNt. Elle contient 3 à 21 nucléotides et peut inclure une tige allant jusqu’à 7 paires de bases.
Quelle est la forme générale de la structure secondaire de l’ARNt ?
La structure secondaire de l’ARNt est représentée sous la forme d’une feuille de trèfle.
Comment le système de numérotation standard s’applique-t-il aux ARNt ?
Le système de numérotation standard place la position 1 à l’extrémité 5’ et la position 76 à l’extrémité 3’.
Quelles positions occupent les nucléotides de l’anticodon dans l’ARNt ?
Les nucléotides de l’anticodon se trouvent aux positions 34, 35 et 36.
Quel pourcentage des bases des ARNt sont modifiées ?
Jusqu’à 25 % des bases des ARNt sont modifiées de façon post-transcriptionnelle. Certaines sont hypermodifiées.
Quels types de modifications affectent les bases des ARNt ?
- Méthylations.
- Acétylations.
- Additions d’acides aminés.