4to parcial Flashcards

Sacar 100!!!

1
Q

Estructura de nucleotidos

A

Tienen una base nitrogenada (purinas y pirimidinas), una pentosa monosacarido y 1, 2 o 3 grupos fosfato

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2
Q

Bases puricas

A

Adenina y Guanina

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3
Q

Bases pirimidica

A

Citosina, Timina (tiene un grupo metilo) o Uracilo (esta en el ARN)

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4
Q

Nucleosidos

A

Se produce cuando se añade un azucar pentosa a una base por un enlace N-glucosidico
Azucar ribosa= ribonucleosido (A, G, C y U)
Azucar 2-desoxirribosa= desoxirribonucleosido (A, G, C y T)

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5
Q

Nucleotidos

A

Cuando se agregan 1 o + grupos fosfatos en un nucleosido

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6
Q

Nucleosido 5’-fosfato

A

El 1er grupo fosfato se une por un enlace ester al 5’-OH de la pentosa

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7
Q

Monofosfato de Nucleosido

A

Grupo fosfato se une al carbono-5’ de la pentosa (AMP o adelinato)

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8
Q

Difosfato de nucleosido

A

Si se añade un 2do o 3er fosfato al nucleosido. (ADP o ATP)

El 2do o 3er fosfatos estan conectados al nucleotido por “un enlace de alta energia”

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9
Q

Sintesis de nucleotidos purinicos

A

Los atomos del anillo de purinas vienen de aminoacidos (aspartato, glutamina y glicina), CO2 y N10-formiltetrahidrofolato (N10-formil-THF). Se sintetiza en el higado por reacciones que van agregando carbonos y nitrogenos donados a la ribosa 5-fosfato preformada

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10
Q

Sintesis de 5-fosforribosil-1-pirofosfato

A

PRPP, pentosa activada que participa en la sintesis y captacion de purinas y pirimidinas. Se sintetiza a partir de ATP y ribosa 5-fosfato por la PRPP sintetasa, enzima ligada al cromosoma X que se activa con fosfato inorganico y se inhibe por nucleotidos purinicos

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11
Q

Sintesis de 5-fosforribosilamina

A

Se sintetiza a partir de PRPP y glutamina, el grupo amida de la glutamina se reemplaza al grupo pirofosfato unido al carbono 1 del PRPP, es el paso determinante catalizado por GPAT, enzima que se inhibe con AMP y GMP y se activa con PRPP

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12
Q

Sintesis de monofosfato de inosina

A

Son 9 pasos de la biosintesis de nucleotidos purinicos que conducen a la sintesis de IMP, que tiene base hipoxantina, el IMP es un nucleotido purinico madre para AMP y GMP, hay 4 pasos en esta via que requieren a N10-formil-THF como donador de un carbono

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13
Q

Sulfonamidas

A

Inhibidores sinteticos de la sintesis de purinas, estan diseñados para inhibir el crecimiento de microorganismos de division rapida sin interferir con las funciones de las celulas humanas

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14
Q

Metotrexato

A

U otros analogos estructurales de acido folico, se usan farmacologicamente para controlar la diseminacion del cancer interfiriendo con la sintesis de nucleotidos y por tanto la sintesis del ADN y ARN

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15
Q

Acido micofenolico

A

Farmaco inhibidor reversible de inosina monofosfato deshidrogenasa (IMP deshidrogenasa), priva a celulas T y B en rapida proliferacion de componentes clave de los acidos nucleicos, es un inmunosupresor que se usa para evitar el rechazo de injertos.

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16
Q

Sintesis de AMP

A

La conversion de IMP a AMP usa una via de 2 pasos que necesita de GTP, como fuente de energia y aspartato, como fuente de nitrogeno

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17
Q

Sintesis de GMP

A

La conversion de IMP a GMP usa una via de 2 pasos que necesita de ATP, como fuente de energia y glutamina, como fuente de nitrogeno

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18
Q

Sintesis de di y trifosfatos de nucleosidos

A

Los difosfatos se sintetizan a partir de monofosfatos de nucleosido por medio de nucleosido monofosfato cinasas. El ATP suele ser el donador de fosfatos.

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19
Q

Adenilato cinasa

A

Su actividad es alta en el higado y musculo, donde el recambio de energia de ATP es alto, su funcion es mantener el equilibrio entre nucleotidos de adenina (AMP, ADP y ATP).

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20
Q

Nucleosido difosfato cinasa

A

Hace que los difosfatos y trifosfatos se interconviertan y tiene una amplia especificidad por el sustrato.

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21
Q

Via de rescate de purinas

A

Cuando las purinas que resultan del recambio normal de acidos nucleicos celulares o lo poco que se obtiene de la dieta y no se degrada, pueden convertirse en trifosfatos de nucleosidos. Esta via es importante en el cerebro.
La APRT y HGPRT usan PRPP como la fuente del grupo ribosa 5-fosfato. La liberacion de pirofosfato y su hidrolisis por pirofosfatasa hace que las reacciones sean irreversibles.

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22
Q

Sindrome de Lesch-Nyhan

A

Trastorno ligado al cromosoma X, en donde hay una deficiencia virtualmente completa de HGPRT, provocando una incapcidad de rescatar hipoxantina o guanina, provocando que se produzca acido urico en exceso. A falta de esta via de rescate, hay un incremento en los niveles de PRPP y disminucion de IMP y GMP. Como resultado GPAT tiene mucho sustrato y poco inhibidor y la sintesis de novo de la purina aumenta. Gracias a esto, hay un incremento de la degradacion de purinas y la produccion de grandes cantidades de acido urico, provocando que este sindrome sea la causa hereditaria de hiperuricemia, que con frecuencia resulta en la formacion de piedras de acido urico en los riñones (urolitiasis) y en el deposito de cristales de urato en las articulaciones (artritis gotosa) y los tejidos blandos. Este sindrome se caracteriza por disfuncion motora, deficits cognitivos y trastornos del comportamiento que incluyen la automutilacion

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23
Q

Ribonucleotido reductasa

A

Enzima que produce 2’-desoxirribonucleotidos a partir de difosfato de ribonucleosido. La enzima esta compuesta por 2 subunidades no identicas R1 (o alfa) y R2 (o beta). La enzima es especifica para la reduccion de difosfatos de nucleosidos purinicos (ADP y GDP) y difosfatos de nucleosidos pirimidicos (CDP y UDP) a sus formas desoxi (dADP, dGDP, dCDP y dUDP). Los donadores inmediatos a los atomos de hidrogeno son 2 grupos sulfihidrilo (-SH) de la enzima R1, que forman un enlace disulfuro durante la reaccion.
Para que se continue la produccion de desoxirrubonucleotidos, el enlace disulfuro debe reducirse. La fuente de equivalentes reductores es la tiorredoxina, que tiene 2 residuos de cisteina separados por 2 aminoacidos en la cadena peptidica. Los 2 grupos de -SH de tiorredoxina donan sus atomos de hidrogeno a la ribonucleotido reductasa y forman un enlace disulfuro

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24
Q

Tiorredoxina reductasa

A

Para que la tiorredoxina continue con su funcion se debe de reducir. Los equivalentes reductores se obtienen de NADPH+H y la reaccion es catalizada por tiorredoxina reductasa

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25
Q

Regulacion de sintesis de desoxirribonucleotidos

A

La ribonucleotido reductasa mantiene equilibrado los desoxirribonucleotidos requeridos para la sintesis de ADN, el R1 tiene 2 sitios alostericos implicados en la regulacion enzimatica.

  • Sitios activos: si dATP se une a los sitios activos en R1 se inhibe la actividad catalitica y evita la reduccion de cualquiera de los 4 difosfatos de nucleosidos, asi se evita la sintesis de ADN y explica la toxicidad de los niveles aumentados de dATP.
  • Sitios de especificidad del sustrato: la union de los trifosfatos de nucleosido en sitios de especificidad del sutrato en R1 regula la especificidad del sus trato y causa un incremento en la conversion de diferentes especies de ribonucleotidos a desoxirribonucleotidos
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26
Q

Hidroxiurea (hidroxicarbamida)

A

Inhibe a la ribonucleotido reductasa, por lo que se inhibe la generacion de sustratos para la sintesis de ADN, se usa en el tratamiento de canceres como melanoma, en el tratamiento de anemia de celulas falciformes, sin embargo, el incremento en hemoglobina fetal que se ve con hidroxiurea se debe a cambios en la expresion de genes y no a la inhibicion de ribonucleotido reductasa.

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27
Q

Degradacion de acidos nucleicos en el intestino delgado

A

Las ribonucleasas y desoxirribonucleasas hidrolizan el ARN y ADN hasta obtener oligosacaridos que se hidrolizan aun mas por medio de fosfodiesterasas produciendo una mezcla de 3’ y 5’-mononucleotidos, las nucelotidasas eliminan los grupos fosfato hidrolicamente y se liberan nucleosidos que entran a los enterocitos por medio de transportadores dependientes de sodio y se degradan por nucleosidasas a bases libres mas ribosa 1-fosfato. Las bases puricas derivadas de la dieta se degradan a acido urico en los enterocitos, la mayor parte del acido urico entra en la sangre y se excreta en la orina

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28
Q

Formacion de acido urico

A
  1. Se elimina un grupo amino del AMP para producir IMP por la AMP (adenilato) desaminasa o apartir de la adenosina para producir inosina (hipoxantina-ribosa) por la adenosina desaminasa
  2. El IMP y GMP se convierten a nucleosidos (inosina y guanosina) por 5’-nucleotidasa
  3. La purina nucleosido fosforilasa convierte la inosina y guanosina a sus bases puricas (hipoxantina y guanina)
  4. La guanina se desamina para formar xantina
  5. La hipoxantina se oxida a xantina por la xantina oxidasa (XO), la xantina se oxida a acido urico
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29
Q

Gota

A

Trastorno que se inicia por altos niveles de acido urico en la sangre (hiperuricemia), que puede conducir al deposito de urato monosodico (UMS) en las articulaciones y a una respuesta inflamatoria hacia los cristales, lo cual provoca artritis gotosa. Las masas nodulares de cristales de UMS (tofos) se pueden depositar en los tejidos blandos y resultar en gota tofacea cronica, tmb pueden formarse calculos de acido urico en el riñon (urolitiasis). El dx necesita de aspiracion y analisis del liquido sinovial de la articulacion afectada (o del material de un tofo) por medio de microscopia de luz polarizada para confirmar la presencia de cristales de UMS en forma de agujas

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30
Q

Tratamiento de gota

A

Se usa agentes antiinflamatorios, colchina, farmacos esteroides, como: prednisona, y medicamentos esteroides como: indometacina. Las estrategias terapeuticas a largo plazo ayudan a reducir el nivel de acido urico y prevenir el deposito de cristalesde UMS
Baja excrecion: agentes uricosuricos como probenecid o sulfinpirazona
Cantidades excesivas de acido urico: alopurinol inhibe la sintesis del acido

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31
Q

Deficiencia ADA

A

Hay acumulacion de adenosina que se convierte en su ribonucleotido o desoxirribonucleotido por las cinasas. Cuando hay niveles altos de dATP, se inhibe la ribonucleotido reductasa y se evita la produccion de nucleotidos que tienen desoxirribosa, provocando que las celulas no tengan ADN ni puedan dividirse.
Forma mas grave= enfermedad de inmunodeficiencia combinada grave (SCID), que involucra la disminucion de celulas T, B y asesinas naturales (NK).
Tx: transplantes de medula osea, terapias de reemplazo enzimatico y genetica, sin el tratamiento hay muerte por infeccion

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32
Q

Deficiencia de purina nucleosido fosforilasa (PNP)

A

Resulta en una inmunodeficiencia menos grave que ADA y afecta principalmente a las celulas T, hay infecciones recurrentes y retraso del neurodesarrollo

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33
Q

Sintesis de pirimidinas

A

El anillo pirimidico se sintetiza antes de unirse a la ribosa 5-fosfato donada por PRPP. Las fuentes de los atomos son: glutamina, CO2 y aspartato

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34
Q

Sintesis de carbamoil fosfato

A

Es el paso regulado de la via de sintesis de pirimidinas, el carbamoil fosfato se sintetiza a partir de glutamina y CO2 por la carbamoil fosfato sintetasa (CPS) II.
Inhibidor: trifosfato de uridina
Activador: PRPP

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35
Q

Sintesis de acido orotico

A

El 2do paso en la sintesis de pirimidinas es la formacion de carbamoil a aspartato por la aspartato transcarbamoilasa.
Luego, el anillo de pirimidina se cierra por la dihidroorotasa. El dihidroorotato se oxida para producir acido orotico (orotato)

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36
Q

Dihidroorotato deshidrogenasa

A

Proteina de la membrana mitocondrial interna que produce orotato

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37
Q

CAD

A

3 dominios cataliticos que realizan las primeras 3 actividades de la sintesis de pirimidinas. CPS II, aspartato transcarbamoilasa y dihidroorotasa

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38
Q

Sintesis de nucleotidos pirimidicos

A

Anillo pirimidico se convierte en el nucleótido orotidina monofosfato (OMP), la enzima orotato fosforribosiltransferasa produce OMP y libera pirofosfato hacienco la reacción irreversible. El OMP se descarboxila a UMP por orotidilato descarboxilasa. La fosforribosiltransferasa y descarboxilasa son dominios catalíticos separados de UMP sintasa

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39
Q

Aciduria orotica hereditaria

A

Deficiencia de una o ambas actividades de UMP sintasa, que resultan en la presencia de acido orotico en la orina

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40
Q

dUTPasa

A

La UMP se fosforila a UDP y UTP, el UDP es sustrato de la ribonucleotido reductasa, que genera dUDP, que se fosforila a dUTP, el cual se hidroliza a dUMP por la dUTPasa.
Por eso, esta enzima es muy importante en la disponibilidad reductora de dUTP cono sustrato para la sintesis de ADN y se previene la incorporacion erronea de uracilo en el ADN

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41
Q

Sintesis de trifosfato de citidina

A

El CTP se produce por la aminacion del UTP por la CTP sintetasa, donde la glutamina proporciona el nitrogeno. Parte de este CTP se desfosforila a CDP, sustrato de ribonucleotido reductasa. El producto dCDP puede fosforilarse a dCTP para la sintesis de ADN o desfosforilarse a dCMP que se desamina a dUMP

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42
Q

Sintesis de monofosfato de desoxitimidina

A

El dUMP se convierte en dTMP por timidilato sintasa, que usa N5, N10-metilen-THF, como fuente de grupo metilo. THF contribuye con una unidad de carbono y tambien con 2 atomos de hidrogeno del anillo de pteridina, lo cual resulta en la oxidacion de THF a DHF.

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43
Q

Inhibidores de timidilato sintasa

A

Analogos de timina: 5-fluorouracilo, que sirven como agentes antitumorales.
El 5-Fluorouracilo se convierte a 5-FdUMP, se une de manera permanente a timidilato sintasa inactiva haciendo que el farmaco sea un inhibidor suicida.
El DHF se reduce a THF por la dihidrofolato reductasa, enzima que se inhibe con metotrexato. Al reducir el suministro de THF, se inhibe la sintesis de purinas, y al evitar la metilacion de dUMP a dTMP, tmb disminuye la disponibilidad del componente esencial del ADN. La sintesis de ADN se inhibe y el crecimiento celular se hace mas lento, estos farmacos son para tratar cancer

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44
Q

Tx para infecciones por virus herpes simplex y virus de inmunodeficiencia humana

A

Aciclovir y AZT, cada uno inhibe la ADN polimerasa viral

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45
Q

Degradacion y via de rescate de pirimidinas

A

El anillo pirimidinico se rompe y se degrada para dar productos solubles como: la beta-alanina (degradacion de CMP y UMP) y beta-aminoisobutirato (degradacion de TMP) con la produccion de amoniaco y CO2. Las bases pirimidicas pueden rescatarse como nucleosidos, los cuales se fosforilan a nucleotidos.
El rescate de nucleosidos pirimidinicos es la base para el uso de uridina en el tratamiento de la aciduria orotica hereditaria

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46
Q

Transcripcion

A

Sintesis de ARN, primera etapa de la expresion de la informacion genetica

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47
Q

Traduccion

A

El codigo contenido en las moleculas de ARN mensajero se traduce y asi se completa la expresion del gen.

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48
Q

Dogma central

A

El flujo de informacion del ADN al ARN y a las proteinas, permite describir a todos los organismos, con excepcion de algunos virus que tienen ARN como deposito de su informacion genetica

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49
Q

Estructura del ADN

A

El ADN es un polimero de monofosfatos de desoxirribonucleosidos (dNMP) unidos covalentemente por medio de enlaces fosfodiester 3’—>5’
Tiene 2 cadenas que se enrollan entre si, formando una doble helice.
Eucariotas: el ADN se encuentra relacionado con diversos tipos de proteinas (nucleoproteinas) en el nucleo
Procariotas: el complejo proteina-ADN esta presente en el nucleoide

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50
Q

Enlaces fosfodiester 3’—->5’ de ADN

A

Unen el grupo 3’-hidroxilo de la desoxipentosa de un nucleotido al grupo 5’-hidroxilo de la desoxipentosa de un nucleotido adyacente a traves de un grupo fosforilo. La cadena larga no ramificada resultante tiene polaridad, con un extremo 5’ (fosfato libre) y un extremo 3’ (hidroxilo libre).
Se escribe del extremo 5’ hacia el extremo 3’ de la cadena. Los enlaces fosfodiester de los nucleotidos pueden hidrolizarse por las desoxirribonucleasas y ribonucleasas

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51
Q

Doble helice de ADN

A

Las cadenas se enrollan alrededor del eje helicoidal. Las cadenas estan emparejadas de manera antiparalela (extremo 5’ de una cadena con extremo 3’ de la otra cadena). En la helice de ADN, el esqueleto hidrofilo de desoxirribosa-fosfato de acada cadena esta en la parte externa de la molecula y las bases hidrofobas estan en la parte interna. Tienen surcos mayores y menores que proporcionan un acceso para la union de las proteinas reguladoras a sus secuencias de reconocimiento especificas a lo largo de la cadena del ADN

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52
Q

Antineoplasicos

A

Como actinomicina D, ejercen su efecto citotoxico interponiendose en el surco estrecho de la doble helice del ADN, interfiriendo en la sintesis del ADN y del ARN

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53
Q

Emparejamiento de bases

A

Las bases de una cadena del ADN se emparejan con las bases de la 2da cadena. Adenina: Timina y Citosina: Guanina. Las bases se disponen perpendiculares al eje de la helice. Una cadena de polinucleotidos de la doble helice del ADN es siempre el complemento de la otra.
Los pares bases se mantienen unidos por enlaces de hidrogeno. 2 entre A y T y 3 entre G y C, estos enlaces estabilizan la estructura de doble helice

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54
Q

Regla de Chargaff

A

Esta regla lo lleva el emparejamiento especifico de las bases. Y dice que en todo ADN bicantenario, la cantidad de adenina es = a la cantidad de timina, la cantidad de guanina es = a la cantidad de citosina y la cantidad total de purinas (A+G) es = a la cantidad total de pirimidinas (T+C).

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55
Q

Separacion de las 2 cadenas de ADN

A
Se separan cuando se rompen los enlaces de hidrogeno entre las bases emparejadas, la rotura puede hacerse en un laboratorio si se altera el pH de la solucion del ADN de modo que se ionicen las bases del nucleotido o si se calienta una solucion (los enlaces fosfodiesteres covalentes no se rompen con esto). 
La desnaturalizacion (perdida de estructura helicoidal) se controla midiendo su absorbancia a 260 nm. En condiciones adecuadas, las cadenas complementarias del ADN pueden volver a formar la doble helice por renaturalizacion o reemparejamiento
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56
Q

Temperatura de fusion

A

La temperatura a la cual se pierde la mitad de la estructura helicoidal

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57
Q

Forma B

A

Descritas por Watson y Crick, es una helice dextrogira con 10 pares de bases por vuelta o giro de 360 grados de la helice y con los planos de las bases perpendiculares al eje helicoidal, se cree que el ADN cromosomico consta sobretodo de ADN-B

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58
Q

Forma A

A

Se produce deshidratando moderadamente la forma B, es una helice dextrogira con 11 pares de bases por vuelta y los planos de los pares bases estan inclinados 20 grados con respecto a la perpendicular al eje helicoidal, esta conformacion se encuentra en los hibridos ADN-ARN o en las regiones de doble cadena de ARN-ARN

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59
Q

Forma ADN-Z

A

Helice levogira que tiene 12 pares bases por vuelta, en las regiones del ADN con secuencia de purinas y pirimidinas alternas pueden producirse estiramientos de ADN-Z de forma natural.

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60
Q

Funciones de la formas B y Z del ADN

A

Las transiciones entre las formas helicoidales B y Z del ADN pueden desempeñar una funcion en la regulacion de la expresion genica

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61
Q

ADN circular

A

Esta superenrollado, la doble helice cruza sobre si misma una o + veces, puede ser un superenrollado positivo (torcion excesiva) o un superenrollado negativo (torcion insuficiente), el superenrollado es un tipo de estructura terciaria que compacta al ADN

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62
Q

Replicacion del ADN

A

Se separan las 2 cadenas de la doble helice del ADN y cada una puede servir como plantilla para la replicacion/sintesis. Es una replicacion semiconservadora, ya que el duplex original se separa en 2 mitades y cada una de las cadenas originales permanece intacta en cada uno de los 2 duplex nuevos.
Enzimas: polimerasas dirigidas por una plantilla y requieren Mg y pueden sintetizar la secuencia complementaria de cada cadena con fidelidad. El comienzo de la replicacion de ADN compromete a la celula a continuar el proceso hasta que se ha replicado el genoma entero

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63
Q

Separacion de las cadenas complementarias (procariotas)

A

Primero se separan o “funden” en una pequeña region porque las polimerasas usan el ADN monocatenario como plantilla. La replicacion del ADN comienza en una unica secuencia de nucleotidos, en un sitio conocido como: replicacion u ori u ori C, el cual tiene segmentos cortos ricos en AT que facilitan la fusion

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64
Q

Formacion de la horquilla de replicacion

A

Las 2 cadenas se separan y ocurre una sintesis en las 2 horquillas de replicacion que se alejan del origen en direcciones opuestas (bidireccional) generando una burbuja de replicacion

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65
Q

Proteina AdnA

A

Va a iniciar la replicacion al unirse a secuencias nucleotidicas especificas en el oriC, region rica en AT, la fusion/separacion de cadenas resulta en una region corta y localizada de ADN monocatenario

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66
Q

Helicasas del ADN

A

Se unen al ADN monocatenario y se mueven hacia la region bicatenaria vecina y fuerzan la separacion de las cadenas, desenrollan a la doble helice, necesitan de ATP

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67
Q

Proteinas de union al ADN monocatenario

A

Se unen al ADN de una sola cadena, las proteinas USC actuan alterando el equilibrio entre el ADN bicatenario y el ADN monocatenario en la direccion de las formas de cadena simple, estas proteinas mantienen separadas a las 2 cadenas de ADN en el area de origen de replicacion, proporcionando asi la plantilla de cadena simple requerida por las polimerasas, y protegen al ADN de las nucleasas que degradan al ADN monocatenario

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68
Q

Topoisomerasas del ADN tipo I

A

Enzima que escinde de manera reversible una cadena de doble helice, tiene actividad de corte y resellado de las cadenas, no ocupa ATP, parece que almacena la energia del enlace fosfodiester que escienden y vuelven a usar esa energia para resellar la cadena. Cada que se crea una muesca transitoria en una cadena de ADN, se pasa la cadena intacta a traves de la rotura antes de volver a sellarla, y asi relaja a los superenrollamientos acumulados

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69
Q

Topoisomerasas del ADN tipo II

A

Enzima que se une con fuerza a la doble helice del ADN y genera roturas transitorias en ambas cadenas, luego la enzima causa un segundo estiramiento de la doble helice de ADN para que pase a traves de la rotura y por ultimo vuelve a sellarla. Requiere de ATP puede liberar los superenrollamientos positivos y negativos

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70
Q

ADN girasa

A

Una topoisomerasa tipo II que esta en bacterias y plantas, tiene la capacidad de introducir superenrollamientos negativos en el ADN circular relajado usando energia de la hidrolisis de ATP. Esto facilita la replicacion de ADN porque los superenrollamientos negativos neutralizan los superenrollamientos positivos, tambien ayuda ala separacion transitoria de las cadenas, necesaria durante la transcripcion

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71
Q

Cadena adelantada

A

Cadena que se copia en direccion de la horquilla de replicacion, se sintetiza de forma continua

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72
Q

Cadena retrasada

A

Cadena que se copia en la direccion que se aleja de la horquilla de replicacion se sintetiza de manera discontinua, es decir, se copian pequeños fragmentos del ADN cerca de la horquilla de replicacion, estos fragmentos son fragmentos de Okazaki, se unen/ligan por la ligasa para convertirse en una sola cadena continua

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73
Q

Polimerasas del ADN

A

Son responsables de copiar las plantillas de ADN y solo pueden leer las secuencias de nucleotidos originales en direccion 3’—>5’ y sintetizan las cadenas nuevas de ADN en direccion 5’—–>3’ (antiparalela), por consiguiente, comenzando con una doble helice original, los 2 tramos de cadenas de nucleotidos recien sintetizados deben crecer en direcciones opuestas

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74
Q

ARN iniciador

A

Tramo corto de una base de ARN emparejada con la plantilla de ADN, con lo que forma un hibrido de doble cadena de ADN-ARN. El ARN iniciador lo necesita la ADN polimerasa para iniciar la sintesis de una cadena de ADN complementaria.
El grupo hidroxilo libre en el extremo 3’ del iniciador de ARN sirve como 1er aceptor de un desoxinucleotido por accion de la ADN polimerasa

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75
Q

Primasa (AdnG)

A

ARN polimerasa especifica, sintetiza cortos fragmentos de ARN que son complementarios y antiparalelos de la plantilla del ADN. Los sustratos para este proceso son los trifosfatos de 5’-ribonucleosidos y se libera pirofosfato mientras se añade cada ribonucleosido monofosfato mediante la formacion del enlace fosfodiester 3’—–>5’

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76
Q

Primosoma

A

La adicion de la primasa convierte el complejo preiniciador de proteinas necesario para la separacion de las cadenas de ADN en un primosoma, el primosoma genera ARN iniciador necesario para la sintesis de la cadena adelantada e inicia con la formacion de fragmentos Okazaki en la sintesis de cadena retrasada discontinua

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77
Q

ADN polimerasa III

A

Usando al grupo hidroxilo 3’ del ARN iniciador como el aceptor del 1er desoxirribonucleotido, la ADN pol III comienza a añadir nucleotidos a lo largo de la plantilla de cadena unica que especifica la secuencia de bases de la nueva cadena sintetizada. Es una enzima procesiva gracias a que su subunidad beta forma un anillo que rodea y se mueve a lo largo de la cadena de ADN que sirve de plantilla, actuando como una pinza deslizante por el ADN. La cadena nueva crece en direccion 5’—>3’, antiparalela a la cadena original.
Para la elongacion de ADN, se necesita de: dATP, dTTP, dCTP y dGTP

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78
Q

Correccion del ADN recien sintetizado

A

La ADN pol III tiene actividad polimerasa 5’—>3’ y una actividad correctora (exonucleasa 3’—->5’)
Exonucleasa 3’—->5’ corrige el error en direccion opuesta a la polimerizacion, va a eliminar hidrolicamente el nucleotido mal colocado
Polimerasa 5’—->3’ sustituye por el nucleotido correcto

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79
Q

Escision de los ARN iniciadores y su sustitucion por ADN

A

La ADN pol III continua la sintesis del ADN en la cadena retrasada hasta que queda bloqueada por la proximidad de un ARN iniciador, cuando esto ocurre, el ARN se escinde y el hueco se llena por la ADN pol I

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80
Q

ADN polimerasa I

A

Primero localiza el espacio/muesca entre el extremo 3’ del ADN recien sintetizado y el extremo 5’ del ARN iniciador adyacente, luego la actividad de la exonucleasa 5’—>3’ elimina hidrolicamente los nucleotidos del ARN qu estan por delante de ella, moviendose en direccion 5’—>3’, luego la actividad de polimerasa 5’—>3’ los sustituye por desoxirribonucleotidos y sintetiza ADN en direccion 5’–>3’, mientras se sintetiza el ADN, tmb corrige usando la actividad exonucleasa 3’—>5’ para eliminar los errores. Esta eliminacion/sintesis/correccion continua hasta que el ARN cebador se ha degradado por completo y el hueco se llena de ADN

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81
Q

Comparacion de las actividades de las exonucleasas 5’–>3’ y 3’—>5’

A

La actividad de exonucleasa 5’—>3’ de la ADN pol I permite que la polimerasa se mueva en direccion 5’—>3’ para eliminar de forma hidrolica uno o + nucleotidos del extremo 5’ del ARN iniciador
La actividad de exonucleasa 3’—>5’ de la ADN pol I y III permite que las polimerasas, que se mueven de 3’—>5’, eliminen de manera hidrolitica un nucleotido mal colocado a la vez del extremo 3’ de una cadena de ADN en crecimiento

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82
Q

ADN ligasa

A

El enlace fosfodiester final entre el grupo 5’-fosfato en el ADN sintetizado por la ADN pol III y el grupo 3’-hidroxilo en el ADN generado por ADN pol I, esta catalizado por la ADN ligasa y requiere de energia

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83
Q

Terminacion en E. coli

A

Esta medida por la union especifica de secuencia de la proteina Tus (sustancia de uso de la terminacion) a los sitios de terminacion de la replicacion en el ADN, deteniendo el movimiento de la horquilla de replicacion

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84
Q

Diferencias de la replicacion de ADN en eucariotas

A

Hay multiples origenes de replicacion en las celulas eucariotas, proteinas de reconocimiento de origen eucariota, proteinas de union al ADN monocatenario y ADN helicasas dependientes de ATP y los ARN iniciadores son eliminados por RNasa H y la endonucleasa colgajo 1 (FEN1)

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85
Q

Ciclo celular eucariota

A

Los acontecimientos que rodean la replicacion del ADN eucariota y la division celular (mitosis) estan coordinados para producir el ciclo celular. El periodo que precede a la replicacion se denomina fase G1 (Gap1). La replicacion de ADN esta en la fase S (sintesis) , luego esta la fase G2 y al ultimo mitosis.
Las celulas que se han dejado de dividirse (linfocitos T maduros), salen del ciclo celular y estan en fase G0 aunque pueden estimularse para entrar a G1 y reanudar la division. Hay 2 clases de proteinas que controlan el progreso de una celula durante el ciclo celular y son: ciclinas y las cinasas dependientes de ciclinas (Cdk)

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86
Q

Pol alfa

A

ADN polimerasa de eucariotas, es una enzima de multiples subunidades, una de ellas tiene la actividad primasa, que inicia la sintesis de cada cadena adelantada y al principio de cada fragmento Okazaki en la cadena retrasada, sintetiza un ARN iniciador corto que despues se extiende por la actividad polimerasa 5’—>3’ de la pol alfa, que genera un fragmento de ADN

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87
Q

Pol epsilon y pol delta

A

Pol epsilon se recluta para completar la sintesis de ADN en la cadena adelantada y pol delta alarga los fragmentos de Okazaki de la cadena retrasada, cada uno usando la actividad de exonucleasa 3’—>5’ para corregir el ADN recien sintetizado

88
Q

Pol beta y pol gamma

A

Pol beta interviene en el llenado del hueco en la reparacion del ADN y pol gamma replica el ADN mitocondrial

89
Q

Telomeros

A

Complejos de ADN mas proteinas que estan en los extremos de los cromosomas lineales, mantienen la integridad estructural del cromosoma, evitando el ataque de las nucleasas, ademas de permitir la reparacion de los sistemas para distinguir entre un extremo verdadero y una rotura en el ADN bicatenario . En nosotros, el ADN telomerico esta constituido por millares de repeticiones en tandem de una secuencia hexamera no codificante

90
Q

Acortamiento de los telomeros

A

Despues de eliminar el ARN iniciador del extremo 5’ de la cadena retrasada, no hay forma de llenar el hueco restante con ADN, como consecuencia, en la mayoria de las celulas somaticas humanas normales, los telomeros se acortan con cada division celulares. Cuando los telomeros se acortan mas alla de una longitud critica, la celula no puede dividirse mas y se dice que es senescente.
Las celulas madre, celulas germinales y celulas cancerosas, los telomeros no se acortan y las celulas no envejecen porque tienen telomerasa, que mantiene la longitud de telomeros en estas celulas

91
Q

Telomerasa

A

Tiene una proteina Tert, que actua como transcriptasa inversa y una pieza corta de ARN (Terc) que actua como plantilla. La plantilla de ARN, rica en C, empareja sus bases con el extremo 3’, rico en G, de la cadena unica del ADN telomerico. La transcriptasa inversa usa la plantilla de ARN para sintetizar ADN en direccion 5’—>3’. La telomerasa se transloca a continuacion al extremo recien sintetizado y se repite el proceso. Una vez alargada la cadena rica en G, la actividad primasa del ADN pol alfa puede usarla como plantilla para sintetizar un ARN iniciador, el cual es extendido por la ADN pol alfa y despues eliminado por nucleasas

92
Q

Trancriptasa inversa

A

ADN polimerasas dirigidas por ARN, interviene en la replicacion de retrovirus como el de VIH. Despues de la infeccion de una celula hospedadora, la transcriptasa inversa viral utiliza el ARN viral como plantilla para la sintesis de 5’—>3’ de ADN viral, que se integrara en los cromosomas del hospedador.
Tambien se puede ver en transposones, donde la mayoria de los transposones se transcribe a ARN y una transcriptasa inversa codificada por el transposon utiliza el ARN como plantilla para la sintesis de ADN

93
Q

Inhibicion de la replicacion de ADN por analogos de nucleosidos

A

Didanosina, ddl
Arabinosa
Al bloquear la replicacion del ADN, estos compuestos hacen mas lenta la division de las celulas de crecimiento rapido y de los virus.
Arabinosido de citosina (citarabina o araC) se ha utilizado en la quimioterapia anticancerosa y el arabinosido de adenina (vidarabina o araA) es un antiviral.
La azidotimidina (AZT) o zidovudina (ZDV) tmb detiene la elongacion de la cadena de ADN

94
Q

Histonas

A

Sirven para ordenar el ADN en unidades estructurales fundamentales, que son los nucleosomas. Hay 5 clases: H1, H2A, H2B, H3 y H4 y gracias a su alto contenido de lisina y arginina, tienen carga positiva, y como consecuencia forman enlaces ionicos con el ADN cargado de manera negativa. Las histonas junto con los iones cargados positivamente como el Mg, ayudan a neutralizar los grupos fosfato con carga negativa del ADN

95
Q

Cromatina

A

El complejo de ADN y proteinas que se encuentra dentro de los nucleos de las celulas eucariotas

96
Q

Nucleosoma

A

2 moleculas de cada una de las histonas H2A, H2B, H3 y H4 forman un nucleo octamerico de cada perla individual de nucleosoma, alrededor de este nucleo estructural se enrolla casi 2 veces un segmento de ADN bicatenario, el enrollamiento elimina una vuelta helice (superenrollamiento negativo). Los nucleosomas vecinos estan unidos por un ADN conector. La histona H1 se une a la cadena del ADN conector entre las perlas del nucleosoma, es la histona mas especifica de tejido y mas especifica de las especies de las histonas, facilita el empaquetamiento de los nucleosomas en estructuras mas compactas

97
Q

Niveles superiores de organizacion de ADN

A

Los nucleosomas pueden empaquetarse con mas fuerza para formar nucleofilamentos, que adopta la forma de un espiral y se suele denominar fibra de 30 nm, esta fibra esta organizada en bucles anclados por andamiaje nuclear, estos niveles de organizacion conducen a la estructura cromosomica final

98
Q

Destino de los nucleosomas durante la replicacion de ADN

A

Los nucleosomas originales se disocian para permitir el acceso al ADN durante la replicacion, cuando ya se sintetiza el ADN, los nucleosomas se forman con rapidez, asi que sus proteinas de histonas vienen de la sintesis de novo y de la transferencia de histonas originales

99
Q

Agentes perjudiciales del ADN

A

Productos quimicos: acido nitroso, desamina bases
Radiacion (UV no ionizante): fusiona 2 pirimidinas adyacentes entre si en el ADN
Radiacion ionizante de alta energia: puede provocar roturas de la doble cadena

100
Q

Identificacion de la cadena con errores de apareamiento

A

Las proteinas Mut identifican los nucleotidos mal apareados gracias al grado de metilacion. La cadena original metilada es la correcta y la cadena hija es la que se repara

101
Q

Procedimiento de reparacion

A

Una endonucleasa produce muescas en la cadena y los nucleotidos mal apareados son eliminados por una exonucleasa, el hueco dejado por la eliminacion de nucleotidos es llenado por una ADN polimerasa (ADN pol III), que utiliza la cadena hermana como plantilla. El hidroxilo 3’ del ADN es unido al fosfato 5’ del fragmento restante de la cadena de ADN original por una ADN ligasa

102
Q

Cancer colorrectal hereditario no poliposico (CCHNP)

A

La mutacion en las proteinas que intervienen en la reparacion de los apareamientos erroneos se relaciona con este cancer o tmb conocido como sindrome de Lynch, este cancer se relaciona con un mayor riesgo de desarrollar cancer de colon (asi como otros canceres)

103
Q

Reconocimiento y escision de los dimeros inducidos por UV

A

Una uvrABC escinucleasa reconoce el dimero voluminoso y escinde la cadena dañada en el lado 3’ y en el lado 5’ de la lesion. Se escinde un corto oligonucleotido que contiene el dimero y deja un hueco que se llena usando una ADN polimerasa y un ADN ligasa

104
Q

Xerodema pigmentoso

A

Las celulas no pueden reparar el ADN dañado y el resultado es la acumulacion extensa de mutaciones y por consiguiente, numerosos canceres de la piel de aparicion temprana, puede estar causados por defectos en cualquiera de los diferentes genes necesarios que codifican para proteinas del xeroderma pigmentoso requeridas para la REN del daño UV en humanos

105
Q

Reparacion por escision de bases

A

Las bases del ADN pueden alterarse de manera espontanea o por compuestos desaminantes o alquilantes, como: acido nitroso. Las lesiones que incluyen alteraciones o perdidas de bases pueden corregirse por medio de la escision por reparacion de bases (ERB)

106
Q

Eliminacion de bases anomalas

A

Las bases anomalas son reconocidas por ADN glucosilasas especificas que las escinden hidroliticamente del esqueleto de desoxirribosa-fosfato de la cadena. Esto deja un sitio apirimidinico o apurico, denominados sitios AP

107
Q

Reconocimiento y reparacion de un sitio AP

A

Las AP endonucleasas especificas reconocen la falta de una base e inician el proceso de escision y llenado del hueco. Una desoxirribosa fosfato liasa retira el residuo de azucar fosfato unico sin base. La ADN pol I y ADN ligasa completan el proceso de reparacion

108
Q

Reparacion de roturas de la doble cadena

A

La radiacion ionizante, quimioterapeuticos como doxorrubicina y los radicales libres oxidativos pueden causar roturas de la doble cadena en el ADN. Tmb ocurre de manera natural en la recombinacion genetica Hay 2 sistemas:
1. Por union de extremos no homologos, un grupo de proteinas median el reconocimiento, procesamiento y union de los 2 fragmentos de ADN, pero se pierde una porcion de ADN en el proceso, es sujeta a errores y mutagena. Puede ocurrir en cualquier momento. Se relacionan con una predisposicion al cancer y sindromes de inmunodeficiencia
2. Reparacion por recombinacion homologa, usa enzimas que suelen realizar recombinacion genetica entre los cromosomas homologos durante la meiosis, es libre de errores, ya que el ADN que se perdio se reemplaza usando ADN homologo como plantilla, ocurre ya avanzados S y G2 del ciclo celular.
Las mutaciones a las proteinas BRCA1 o BRCA2 (cancer mamario 1 o 2) que participan en la recombinacion homologa, aumenta el riesgo de desarrollar cancer mamario y ovarico

109
Q

Transcriptoma

A

Serie completa de transcritos de ARN expresados por un genoma

110
Q

Estructura del ARN

A

Esta en ARNr, ARNt, ARNm, son moleculas polimericas no ramificadas compuestas por monofosfatos de nucleosidos unidos entre si mediante enlaces fosfodiester 3’—>5’, son mas pequeñas que el ADN, tienen ribosa y uracilo, existen como cadenas unicas capaces de plegarse en estructuras complejas

111
Q

ARNr

A

Estan asociados a diferentes proteinas como componentes de los ribosomas (estructuras complejas que funcionan como puntos de sintesis de proteinas). Pueden actuar como catalizadores en la sintesis de proteinas y se denominan ribozima.
Procariotas: 23S, 16S y 5S
Eucariotas: 28S, 18S, 5.8S y 5S
Se generan a partir de un pre-ARNr por las ribonucleasas y se modifican algunas bases y ribosas

112
Q

ARNt

A

Hay al menos 1 ARNt especifico por cada uno de los 20 aminoacidos. Tiene bases inusuales/modificadas y muestra un ampli apareamiento intracatenario de bases que origina las estructuras secundaria y terciaria caracteristicas, va a transportar su aminoacido especifico, unido covalentemente a su extremo 3’, al lugar de sintesis de proteinas

113
Q

ARNm

A

Es ARN de codificacion porque transporta la informacion genetica del ADN para usarse en la sintesis de proteinas. El ARNm tiene regiones no traducidad en sus extremos 5’ y 3’

114
Q

ARNm en eucariotas

A

El transporte de ARNm es fuera del nucleo y hacia el citosol. El ARNm es monocistronico (lleva info de 1 solo gen).
Caracteristicas estructurales: larga secuencia de nucleosidos de adenina en el extremo de 3’ del ARN, y una caperuza en el extremo 5’, que consta de 7-metilguanosina unida a traves de un enlace trifosfato inusual (5’—>5’)

115
Q

ARN polimerasa

A

Sintetiza todos los ARN (menos el ARN iniciador). Enzima de multiples subunidades que reconoce la region promotora (secuencia de nucleotidos al principio de un segmento de ADN que se ha de transcribir). Despues, realiza una copia de ARN complementario de la plantilla de la cadena de ADN y despues reconoce el final de la secuencia de ADN que se ha de transcribir (region de terminacion). El ARN se sintetiza desde su extremo 5’ hasta el extremo 3’

116
Q

Enzima central

A

Componente de la ARN polimerasa. Necesita 5 de las subunidades peptidicas de la enzima, 2alfa, 1beta, 1beta’ y 1omega para el ensamblaje enzimatico (alfa y omega), union de la plantilla (beta’) y la actividad polimerasa 5’—>3’
No es capaz de reconocer la region promotora en la plantilla de ADN

117
Q

Holoenzima

A

Gracias al factor sigma la ARN pol reconoce las regiones promotoras en el ADN. La subunidad sigma mas la enzima central forman la holoenzima

118
Q

Iniciacion

A

1era fase de la transcripcion, inicia con la union de la holoenzima ARN polimerasa al promotor, que tiene secuencias de consenso caracteristicas

119
Q

Secuencia -35

A

Secuencia de consenso (5’-TTGACA-3’), punto inicial de contacto para la holoenzima y se forma un complejo cerrado.
Se asigna un numero negativo a la base en la region promotora si ocurre antes (izquierda de, hacia el extremo 5’)

120
Q

Caja de Pribnow

A

La holoenzima se mueve y cubre una segunda secuencia de consenco (5’-TATAAT-3’) es el sitio de fusion (desenrollamiento) de un tramo corto, esta fusion convierte el complejo de iniciacion cerrado en un complejo abierto que se conoce como burbuja de transcripcion

121
Q

Elongacion

A

2da fase de la transcripcion, comienza cuando el transcrito (suele empezar por una purina) tiene mas de 10 nucleotidos, entonces se libera el factor sigma, y la enzima central es capaz de despejar el promotor y moverse por la plantilla, sirviendo como pinza deslizante. Durante la transcripcion se va a formar una helice hibrida de ADN-ARN, la ARN pol usa trifosfatos de nucleosidos como sustratos y libera pirofosfato cada vez que se añade un monofosfato de nucleosido a la cadena en crecimiento. La transcripcion va de 5’—>3’
La ARN pol no necesita de un iniciador y carece del dominio exonucleasa 3’—>5’ para correccion, por lo que si se equivoca, se detiene, retrocede, escinde el transcrito y reinicia

122
Q

Terminacion independiente de rho

A

Se observa en genes procariotas y necesita de una secuencia de la plantilla de ADN genere una secuencia autocomplementaria en el ARN naciente, asi el ARN se pliega sobre si mismo y forma un tronco rico en GC y un bucle, esta estructura es una horquilla, mas alla de la horquilla, el transcrito tiene una cadena de uracilos en el extremo 3’. La union de los uracilos a las adeninas es debil y facilita la separacion del ARN recien sintetizado de su plantilla de ADN

123
Q

Terminacion dependiente de rho

A

Necesita de la proteina rho, que es una ATPasa hexamera con actividad helicasa. Rho se une al sitio de utilizacion rho rico en C (rut) y usando su actividad ATPasa, se desplaza a lo largo del ARN hasta alcanzar a la ARN pol detenida en el sitio de terminacion. La actividad helicasa dependiente de ATP de rho separa la helice hibrida de ARN-ADN, provocando la liberacion del ARN

124
Q

Antibioticos que inhiben la transcripcion

A
  • Rifampicina: inhibe la iniciacion uniendose a la subunidad beta de la ARN pol procariota y evitando el crecimiento de la cadena mas alla de 3 nucleotidos, se usa en el tx de tuberculosis
  • Dactinomicina: o actinomicina D, 1er antibiotico para la quimioterapia de tumores, se inserta entre las bases de ADN e inhibe el inicio y elongacion de la transcripcion
125
Q

De que forma estan los genes que se transcriben de forma activa?

A

Zona de cromatina descondensada denominada eucromatina

126
Q

Como se encuentran los segmentos inactivos del ADN?

A

Heterocromatina, muy condensada

127
Q

Remodelacion de la cromatina

A

Interconversion de las formas de eucromatina y heterocromatina y un componente importante de la remodelacion de la cromatina es la modificacion covalente de histonas con HAT y HDAC

128
Q

HAT

A

Histona acetiltransferasas elimina la carga positiva de la lisina y de este modo reduce la interaccion de la histona con el ADN cargado negativamente

129
Q

HDAC

A

La histona desacetilasas elimina el grupo acetilo y restablece la carga positiva y promueve interacciones mas fuertes entre las histonas y ADN

130
Q

ARN pol I

A

Sintetiza el precursor de ARNr de 28S, 18S y 5.8S en el nucleolo

131
Q

ARN pol II

A

Sintetiza los precursores de ARNm, tmb ciertos ARNnc pequeños, como: ARNnop, ARNnp, miARN

132
Q

Promotores para la ARN pol II

A

En algunos genes esta la caja TATA o de Hogness, en otros hay diferentes elementos promotores centrales, como: Ihr (iniciador) elemento promotor en direccion 3’. Estos elementos actuan en cis. Estas secuencias sirven de sitios de union para las proteinas conocidas como factores de transcripcion general, que interactuan entre si y con la ARN pol II

133
Q

Factores generales de transcripcion

A

Son requisitos minimos para el reconocimiento del promotor, reclutamiento de la ARN pol II hacia el promotor, formacion del complejo de preiniciacion e iniciacion de la transcripcion a nivel inicial. Estos factores son codificados por diferentes genes, se sintetizan en el citosol y transitan a sus sitios de accion y por tanto estan transactuando

134
Q

TFIIF

A

Es un factor general de transcripcion, que tiene una proteina de union a TATA y factores relacionados con TATA, reconoce y une la caja TATA (y otros elementos promotores centrales), el TFIIF lleva la polimerasa al promotor, la actividad helicasa de TFIIF fusiona el ADN y su actividad cinasa fosforila la polimerasa, permitiendo que despeje el promotor

135
Q

Elementos reguladores y activadores transcripcionales

A

Elementos reguladores proximales: estan cerca del promotor central, como cajas CAAT y GC
Elementos reguladores distales: estan lejos del promotor central, como los promotores
Los activadores transcripcionales o factores especificos de transcripcion se unen a estos elementos reguladores

136
Q

Para que se unen los factores especificos de transcripcion a los elementos proximales del promotor?

A

Para regular la frecuencia de inicio de la transcripcion

137
Q

Para que se unen los factores especificos de transcripcion a elementos distales?

A

Para mediar la respuesta a señales como las hormonas y para regular que genes se expresan en un momento determinado de tiempo

138
Q

Factores especificos de transcripcion

A

Tienen 2 dominios de union, uno es dominion de union a ADN y el otro es dominio de activacion de transcripcion, este va a reclutar el factor general de transcripcion hacia el promotor central, asi como las proteinas del coactivador , las enzimas HAT

139
Q

Papel de potenciadores

A

Son secuencias de ADN especiales que aumentan la tasa de iniciacion de la transcripcion por la ARN pol II. Pueden estar localizados en direccion 5’ o direccion 3’ del sitio de iniciacion de la transcripcion. Pueden estar proximos al promotor o super lejos del el. Y pueden ocurrir en cualquiera de las cadena de ADN.
Tienen elementos de respuesta que se unen a factores especificos de transcripcion. Al doblar o curvar el ADN, los factores especificos de transcripcion pueden interactuar con otros factores de transcripcion unidos al promotor y con la ARN pol II, estimulando de este modo la transcripcion

140
Q

Inhibidores de la ARN pol II

A

La alfa-amantina se une estrechamente a ARN pol II y hace mas lento su movimiento inhibiendo la sintesis de ARNm

141
Q

ARN pol III

A

Sintetiza ARNt, ARNr 5S y parte de ARNnp y ARNnop

142
Q

Transcrito primario

A

Copia lineal inicial de ARN de una unidad transcripcional y va a sufrir modificaciones postranscripcionales por escision de los transcritos originales por ribonucleasas

143
Q

Modificacion de ARNr

A

El ARNr se genera a partir de ARN preribosomicos, que es escindido por ribonucleasas para que haya segmentos de ARNr de tamaño intermedio, que son procesados aun mas (recortados por exonucleasas y modificados en algunas bases y ribosas) para producir las especies de ARN requeridas

144
Q

Modificaciones de ARNt

A

Las secuencias en ambos extremos de la molecula se eliminan y si estan las nucleasas tmb eliminan un intron del bucle. Otros cambios son: la adicion de una secuencia -CCA por la nucleotidiltransferasa al extremo 3’-terminal del ARNt y cambios de bases en posiciones especificas para producir bases inusuales caracteristicas del ARNt

145
Q

Modificaciones de ARNm en eucariota

A

Se le añade la caperuza 5’, es una 7-metilguanosina unida al extremo 5’-terminal del ARNm por un enlace trifosfato 5’—>5’, va a ayudar a estabilizar el ARNm y permite el inicio de la traduccion
Adicion de una cola de 3’poli-A por la poliadenilato polimerasa que usa ATP como sustrato, estabilizan el ARNm, facilitan su salida del nucleo y ayudan a la traduccion, cuando el ARNm entra al citosol, la cola de poli-A se acorta
Corte y empalme, eliminacion de secuencias de ARN del transcrito primario que no codifican proteinas (intrones) y los exones se unen entre si para formar ARNm maduro

146
Q

Papel de los ARN nucleares pequeños

A

Los ARNnp ricos en uracilo, se asocian con proteinas y forman ribonucleoproteinas nucleares pequeñas (RNPnp): U1, U2, U4, U5 y U6 que median el corte y empalme. Facilitan la eliminacion de intrones formando pares de bases con las secuencias de consenso presentes en cada extremo del intron
Las ARNm abandonan el nucleo y pasan al citosol por poros presentes en la membrana nuclear

147
Q

Mutaciones en el sitio de corte y empalme

A

EL corte y empalme incorrecto del ARNm de la beta-globina, es responsable de beta-talasemia, enfermedad en que la produccion de la proteina beta-globina es defectuosa
Las mutaciones pueden resultar en que se eliminen exones o retengan intrones

148
Q

Traduccion

A

Proceso de la sintesis de proteinas porque el “lenguaje” de la secuencia de nucleotidos en el ARNm se traduce al lenguaje de una secuencia de aminoacidos. Requiere de un codigo genetico a traves del cual la informacion contenida en la secuencia de nucleotidos se expresa para producir una secuencia especifica de aminoacidos

149
Q

Codigo genetico

A

Diccionario que identifica la correspondencia entre una secuencia de bases de nucleotidos y una secuencia de aminoacidos. Cada “palabra” esta compuesta por 3 bases nucleotidos que son codones

150
Q

Codones

A

Se presentan en el lenguaje del ARNm de adenina (A), guanina (G), citosina (C) y uracilo (U). Sus secuencias de nucleotidos se escriben siempre desde el extremo 5’ hacia el extremo 3’. Hay 64 combinaciones distintas de bases tomadas de 3 en 3 (triplete)

151
Q

Codones de terminacion

A

UAA, UAG y UGA, no codifican aminoacidos. Tmb se llaman de parada o sin sentido, cuando aparecen la sintesis de la proteina codificada por ese ARNm se detiene.

152
Q

Caracteristicas del codigo genetico

A

Especificidad: un codon en particular siempre codifica el mismo aminoacido
Universalidad: solo son diferentes las mitocondrias que UGA codifica para triptofano (Trp)
Degeneracion: puede haber mas de un triplete que codifique determinado aminoacido. Solo Met y Trp tienen 1 solo triplete de codificacion
Ausencia de superposicion y ausencia de comas: se lee a partir de un punto de inicio fijo como una secuencia continua de bases

153
Q

Mutacion puntual

A

Cambio de una sola base nucleotidica

154
Q

Mutacion silenciosa

A

Tipo de mutacion puntual en la que el codon que tiene la base cambiada puede codificar el mismo aminoacido

155
Q

Mutacion contrasentido

A

Tipo de mutacion puntual en la que el codon que tiene la base cambiada puede codificar un aminoacido diferente

156
Q

Mutacion sin sentido

A

Tipo de mutacion puntual en la que el codon que tiene la base cambiada puede convertirse en un codon de terminacion, causa la terminacion prematura de la traduccion en ese punto y la produccion de una proteina acortada

157
Q

Expansion por repeticion de trinucleotidos

A

Se amplifica el numero de una secuenca de 3 bases que se repite en tandem, por lo que hay muchas copias del triplete. Si se produce dentro de la region codificadora de un gen, la proteina tendra muchas copias extra de un aminoacido.
Si la expansion por repeticion ocurre en la porcion no traducida de un gen puede haber una disminucion en la cantidad de proteina producida, ej: Sindrome de X fragil y distrofia miotonica

158
Q

Enfermedad de Huntington

A

Expansion por repeticion de trinucleotidos en region codificadora, la expansion del codon CAG en el exon 1 del gen para la proteina huntingtina, provocando que haya insercion de muchos residuos de glutamina adicionales. Las proteinas añadidas resultan en una proteina anormalmente larga que se escinde y produce fragmentos toxicos que se agregan en las neuronas

159
Q

Distrofia miotonica

A

Trastorno muscular, el silenciamiento genico es el resultado de alteraciones de corte y empalme debido a expansion de triplete

160
Q

Mutaciones del marco de lectura

A

Se produce cuando se quitan o se añaden 1 o 2 nucleotidos a la region codificadora de un ARNm y tiene como resultado un producto con una secuencia de aminoacidos radicalmente diferente o un producto truncado gracias a la creacion de un codon de terminacion. Si se agregan 3 nucleotidos, se añade un aminoacido. Si se quitan 3 nucleotidos, se pierde un aminoacido, la perdida de nucleotidos puede mantener el marco de lectura pero puede haber una patologia grave

161
Q

Fibrosis quistica

A

Afecta principalmente a los sistemas pulmonar y digestivo, suele ser causada por la delecion de 3 nucleotidos de la region codificadora de un gen y tiene como consecuencia la perdida de fenilalanina, la mutacion evita el plegamiento normal de RTFQ y lo conduce a la destruccion por proteasoma. La RTFQ suele funcionar como un canal de cloruro en las celulas epiteliales y su perdida da como resultado la produccion de secreciones espesas y pegajosas en los pulmones y pancreas

162
Q

Componentes necesarios para la traduccion

A

Aminoacidos que estan en el producto terminado, ARNm que se traducira, ARNt para cada uno de los aminoacidos, ribosomas funcionales, fuentes de energia y enzimas, factores proteicos que se necesitan para los pasos de iniciacion, elongacion y terminacion de la cadena polipeptidica

163
Q

Sitio de union de los aminoacidos

A

Cada ARNt tiene un sitio de union para que un aminoacido especifico en su extremo 3’. El grupo carboxilo del aminoacido establece un enlace ester con el hidroxilo 3’ de la porcion de ribosa del nucleotido A en la secuencia -CCA en el extremo 3’ del ARNt

164
Q

Anticodon

A

Cada ARNt tiene una secuencia de nucleotidos de 3 bases, el anticodon, se acopla a un codon en especifico en el ARNm. Este codon especifica la insercion en la cadena polipeptidica en crecimiento del aminoacido transportado por el ARNt

165
Q

Aminoacil-ARNt sintetasas

A

Familia de enzimas diferentes necesaria para unir a los aminoacidos a su correspondiente ARNt, cada miembro reconoce un aminoacido especifico y todo el ARNt que corresponde a ese aminoacido.
Cataliza una reaccion de 2 pasos que resulta en la union covalente del grupo carboxilo alfa de un aminoacido a la A en la secuencia -CCA en su extremo 3’ de su ARNt correspondiente, se ocupa ATP. La enzima tiene extrema especificidad que ayuda a la fidelidad de la traduccion del mensaje genetico. Esta enzima tmb tiene actividad de correccion o edicion que puede eliminar aminoacidos incorrectos de la enzima o molecula de ARNt

166
Q

Ribosomas

A

Grandes complejos de proteinas y ARNr, consisten en 2 subunidades.
Subunidad pequeña: une al ARNm y determina la exactitud de la traduccion al asegurar el correcto apareamiento de bases entre el codon del ARNm y el anticdon de ARNt
Subunidad grande: cataliza la formacion de los enlaces peptidicos que unen los residuos de aminoacidos en una proteina
Estan en el citosol o en el RER (estos se encargan de la sintesis de proteinas)

167
Q

Sitio de union A del ribosoma

A

Se une un aminoacil-ARNt entrante, de acuerdo con la direccion del codon que ocupa el sitio en ese momento, este codon especifica cual es el siguiente aminoacido que debe añadirse a la cadena peptidica en crecimiento

168
Q

Sitio de union P del ribosoma

A

Ocupado por el peptidil-ARNt, el ARNt transporta la cadena de aminoacidos que ya se ha sintetizado

169
Q

Sitio de union E del ribosoma

A

Ocupado por el ARNt vacio que esta por salir del ribosoma

170
Q

Fuentes de energia para la traduccion

A

Se necesita escindir 4 enlaces de alta energia para añadir un aminoacido a la cadena polipeptidica en crecimiento 2 del ATP en la reaccion de la aminoacil-ARNt sintetasa, uno en la eliminacion de PPi y uno en la hidrolisis posterior del PPi, a 2 Pi por pirofosfatasa y 2 del GTP, uno para la union del aminoacil-ARNt al sitio A y uno para la etapa de translocacion

171
Q

Union antiparalela entre el codon y anticodon

A

El apareamiento correcto del codon del ARNm con el anticodon del ARNt es esencial para una traduccion exacta. El codon del ARNm es leido como 5’—>3’ por el apareamiento de anticodon en la direccion opuesta 3’–>5’

172
Q

Hipotesis de bamboleo

A

Mecanismo por el cual los ARNt pueden reconocer mas de un codon para un aminoacido especifico se describe en esta hipotesis. Para los 2 primeras bases, el par codon-anticodon sigue las reglas de Watson-Crick (G va con C y A con U), pero puede ser menos estricta para la ultima base.
La base en el extremo 5’ del anticodon (1era base del anticodon) no esta tan definida como las otras bases, el movimiento de esta base permite el apareamiento de bases no tradicional con la base 3’ del codon (ultima base del codon), el movimiento se denomina bamboleo y permite a un unico ARNt reconocer mas de un codon, el resultado es que no es necesario que haya 61 especies de ARNt para leer los 61 codones que codifican aminoacidos

173
Q

Etapas en la traduccion

A

El ARNm se traduce desde su extremo 5’ hacia su extremo 3’, produciendo una proteina que se sintetiza desde su extremo amino (N)-terminal hacia su extremo carboxilo (C)-terminal.
ARNm procariotas, tienen varias regiones codificadoras y cada una tiene su propio codon de iniciacion y terminacion y produce una especie distinta de polipeptido
ARNm eucariota, tiene solo 1 region codificadora.
Hay 3 etapas independientes: iniciacion, elongacion y terminacion

174
Q

Iniciacion de traduccion

A

Consiste en el montaje de los componentes del sistema de traduccion antes de que se produzca la formacion de un enlace peptidico. Componentes: subunidades ribosomicas, ARNm, aminoacil-ARNt especificado por el 1er codon del mensaje, GTP y factores de iniciacion que facilitan el montaje de este complejo de iniciacion
Procariotas: IF-1, IF-2, IF-3
Eucariotas: eIF, tmb ocupan ATP

175
Q

Secuencia de Shine-Dalgano

A

Secuencia de bases de nucleotidos rica en purinas, esta de 6 a 10 bases en direccion 5’ del codon de iniciacion AUG en la molecula del ARNm. El extremo 3’ del componente 16S de ARNr tiene una secuencia complementaria de la secuencia SD, por esto, el extremo 5’ del ARNm y el extremo 3’ del ARNr 16S pueden formar pares bases complementarios y facilitar la colocacion de la subunidad ribosomica 30S en el ARNm

176
Q

Iniciacion de traduccion en eucariotas

A

Aqui no hay secuencia SD. asi que la subunidad ribosomica pequeña se une cerca de la caperuza en el extremo 5’ del ARNm y avanza 5’—>3’ hasta que encuentra el iniciador AUG, se necesita de ATP y puede haber una iniciacion dependiente de caperuza pero la subunidad 40S se debe de unir al sitio de entrada a un ribosoma interno cerca del codon de inicio

177
Q

Codon de iniciacion

A

El AUG es reconocido por un ARNt iniciador, el ARNt iniciador es el unico ARNt reconocido por el IF-2 y el unico ARNt que va directamente al sitio P en la subunidad pequeña.
Bacterias y mitocondrias: ARNti lleva una metionina N-formilada, despues de que Met se une al ARNti, la transformilasa añade el grupo formilo que utiliza N10-formil-THF como dador de carbonos.
Eucariotas: ARNti lleva una metionina sin formilar
La subunidad ribosomica grande se une al complejo y se forma un ribosoma funcional con el ARNti cargado en el sitio P y el sitio A esta vacio

178
Q

Elongacion de traduccion

A

Adicion de aminoacidos al extremo carboxilo de la cadena en crecimiento. Se forman los enlaces peptidicos entre el grupo carboxilo alfa del aminoacido en el sitio P y el grupo amino alfa del aminoacido en el sitio A por la peptidiltransferasa, actividad intrinseca del ARN de subunidad grande. Cuando se forma el enlace peptidico, el peptido en el ARNt en el sitio P se transfiere al aminoacido en el ARNt en el sitio A, este proceso es la transpeptidacion. El ribosoma avanza entonces 3 nucleotidos hacia el extremo 3’ del ARNm, el proceso se llama translocacion, que va a causar el movimiento del ARNt descargado del sitio P al sitio E para la liberacion y el movimiento del peptidil-ARNt del sitio A al sitio E

179
Q

Terminacion de traduccion

A

Se produce cuando en el sitio A aparece un codon de terminacion
Pro: RF-1 reconoce a UAA y UAG y RF-2 reconoce a UGA y UAA.
La union de estos factores de liberacion produce la hidrolisis del enlace que une el peptido al ARNt en el sitio P provocando la liberacion del ribosoma de la proteina naciente. El RF-3-GTP causa la liberacion del RF-1 o del RF-2 mientras se hidroliza el GTP
Eucariotas: eRF reconoce los 3 codones de terminacion y el eRF-3 funciona como el RF-3 procariota

180
Q

Regulacion de la traduccion

A

Lo mas frecuente es una regulacion a nivel transcripcional. Tmb puede que proteinas se unan al ARNm e inhiben su uso bloqueando la traduccion
Eucariotas: modificacion covalente: eIF-2 fosforilado=inactivo

181
Q

Estreptomicina

A

Se une a la subunidad 30S y distorciona su estructura, interfiriendo en la iniciacion de la traduccion

182
Q

Tetraciclinas

A

Interactuan con la subunidad 30S al bloquear el acceso del aminoacil-ARNt al sitio A, inhibiendo la elongacion

183
Q

Puromicina

A

Se parece al aminoacil-ARNt y acepta un peptido del sitio P, causando la inhibicion de una elongacion y resulta en la terminacion prematura

184
Q

Cloranfenicol

A

Inhibe la peptidiltransferasa procariota y en niveles muy altos puede inhibir la sintesis de proteinas mitocondriales

185
Q

Eritromicina

A

Se une irreversiblemente a subunidad 50S y bloquea el tunel mediante el cual el peptido deja el ribosoma, inhibiendo la translocacion

186
Q

Direccionamiento cotraduccional

A

Proteinas secretadas se direccionan durante la sintesis al RER por una secuencia señal hidrofoba N-terminal, la secuencia se reconoce por la particula de reconocimiento de señales (PRS), una ribonucleoproteina que une el ribosoma, detiene la elongacion y envia un complejo ribosoma-peptido a un conducto de la membrana del RER (translocon) medianye la interaccion con el receptor de la PRS

187
Q

Modificaciones de proteinas: recorte

A

Las endoproteasas eliminan porciones de la cadena proteinica y provocan la liberacion de una molecula activa. El sitio celular de la reaccion de escision depende de la proteina que se vaya a modificar. Se pueden escindir en el RER, aparato de Goldi, vesiculas secretoras o se escinden despues de su secrecion

188
Q

Modificaciones covalentes

A

Fosforilacion: grupos hidroxilo de serina, treonina y residuos de tirosina, catalizada por proteincinasas y se puede anular por proteinfosfatasas
Glucosilacion: N-glucosilacion ocurre en el RER y O-glucosilacion en el aparato de Golgi
Hidroxilacion: residuos de lisina y prolina se hidroxilan en el reticulo endoplasmico por hidroxilasas dependientes de vitamina C
Tmb se puede añadir grupos carboxilo a los residuos de glutamato por la carboxilacion dependiente de vitamina K, la biotina se une covalentemente a los grupos epsilon-amino de los residuos de lisina de las enzimas dependientes de biotina que catalizan reacciones de carboxilacion. La union de lipidos puede ayudar al anclaje de proteinas

189
Q

Degradacion de proteinas

A

Proteinas defectuosas o destinadas a un recambio rapido suelen estar marcadas para destruirse por la ubiquitinacion y despues son degradadas por un proteosoma, sistema macromolecular proteolitico dependiente de ATP que esta en el citosol

190
Q

Degradacion relacionada con el ER

A

Cuando se plega mal una proteina resulta en su degradacion, si se impide el plegado, las proteinas desdobladas se acumulan en el RER y causa un estres que desencadena la respuesta de proteina desdoblada provocando que haya muchos chaperones, la traduccion global disminuye por la fosforilacion de eIF-2 y las proteinas desdobladas se mandan al citosol, se ubiquitinizan y se degradan en el proteosoma por medio de esta degradacion

191
Q

Gen lacZ

A

Gen del operon lac (expresion regulada) que codifica la beta-galactosidasa, que hidroliza la lactosa a galactosa y glucosa

192
Q

Gen lacY

A

Gen del operon lac (expresion regulada) que codifica una permeasa que facilita el movimiento de la lactosa en el interior de la celula

193
Q

Gen lacA

A

Fen del operon lac (expresion regulada) que codifica la tiogalactosido transacetilasa que acetila la lactosa

194
Q

Porcion reguladora del operon en procariotas

A

Esta en direccion 5’ y es constituida por la region del promotor, donde se une la ARN polimerasa, el sitio del operador (O) y el sitio de proteina activadora del catabolito (PAC), donde se unen las proteinas reguladoras

195
Q

Gen lacl

A

Gen regulador con expresion constitutiva que codifica la proteina represora (accion trans) que se une al sitio del operador con gran afinidad

196
Q

Operones bacterianos

A

Tienen un operador (segmento de ADN que regula la actividad de los genes estructurales del operon al unir de forma reversible el represor)
Operador no unido al represor=ARN polimerasa se une al promotor y se puede transcribir a ARNm
Operador unido al represor=ARN pol bloqueada y no se produce ARNm
Molecula inductora, se une al represor, lo cambia y el represor deja de estar unido al operador para que la ARN pol continue la transcripcion

197
Q

Operon lactosa cuando solo hay glucosa

A

El operon lac se reprime, la represion es mediada por la union de la proteina represora por un motivo helice-giro-helice al sitio O. La adenilil ciclasa esta inactiva por la glucosa y PAC no esta unida a AMPc. El represor interfiere con la ARN pol y bloquea la transcripcion. Es una regulacon negativa

198
Q

Operon lactosa cuando solo hay lactosa

A

Operon lac inducido. Una parte de la lactosa se convierte en alolactosa, que es un inductor que se une a la proteina represora, cambiando su conformacion y provocando que ya no se pueda unir al sitio O . La adenilil ciclasa esta activa porque no hay glucosa y puede hacer AMPc que se une a la PAC. El complejo de accion trans AMPc-PAC se une al sitio PAC y la ARN pol inicia la transcripcion, es una regulacion positiva

199
Q

Operon lactosa cuando hay glucosa y lactosa

A

Operon lac no es inducido y la transcripcion es insignificante. La adenilil ciclasa desactiva por la glucosa, asi que no se forma el complejo AMPc-PAC y el sitio de union PAC esta vacio y la ARN pol es incapaz de iniciar eficazmente la transcripcion. Los 3 genes estructurales del operon se expresan a niveles muy bajos

200
Q

Operon triptofano

A

Codifica 5 genes estructurales que codifican para las enzimas necesarias para la sintesis de triptofano. El control negativo consiste en la union del mismo Trp a la proteina represora, facilitando la union del represor al operador, Trp es un correpresor. Tmb esta regulado por la atenuacion, donde la transcripcion se inicia pero termina bastante antes de completarse.
Si hay mucho Trp, la iniciacion de la transcripcion que escapo a la represion por Trp se atenua/detiene por la formacion de un atenuador (horquilla/bucle) en el ARNm

201
Q

Respuesta restrictiva

A

Regulacion en respuesta a la carencia de aminoacidos. La union de un ARNt no cargado al sitio A de un ribosoma desencadena eventos que inducen a la produccion de ppGpp, su sintesis es catalizada por el factor restrictivo (RelA). Niveles elevados de ppGpp provocan la inhibicion de los ARNt y algunos ARNm

202
Q

Proteinas ribosomicas reguladoras

A

Por cada operon, una proteina-r especifica actua en represion de la traduccion del ARNm policistronico de ese operon uniendose a la secuancia SD e impidiendo la unidad de la subunidad ribosomica pequeña, por esto una proteina-r inhibe la sintesis de todas las proteinas-r del operon. Si el ARNr disminuye, hay proteina-r disponible para unirse a su propio ARNm e inhibir su traduccion. Hay un equilibrio con la transcripcion de ARNr y la sintesis de proteina-r

203
Q

FET

A

Factor especifico de la transcripcion, proteina de accion trans que se une a una secuencia de consenso reguladora de accion en cis para cada uno de los genes del grupo aunque esten en cromosomas diferentes

  • Dominio de union al ADN (DUA)
  • Dominio de activacion de la transcripcion (DAT): recluta coactivadores, como: histona acetiltransferasas, y factores generales para la transcripcion
204
Q

Circuito de galactosa

A

Ejemplo de regulacion coordinada que permite el uso de la galactosa cuando no hay glucosa. La expresion coordinada esta mediada por la proteina Gal4, un FET que se une a una secuencia activadora de galactosa en direccion 5’ (UASGal).
Cuando la galactosa no esta, Gal80une Gal4 en su DAT, inhibiendo la transcripcion genica
Cuando la glucosa esta presente, Gal3 se activa y se une a Gal80, con lo que permite que Gal4 active la transcripcion

205
Q

Sistema de respuesta hormonal

A

Ejemplo de regulacion coordinada, los elementos de respuesta a hormonas (ERH), son secuencias de ADN que se unen a proteinas de accion trans y regulan la expresion genica en respuesta a señales hormonales en organismos pluricelulares, las hormonas se unen a receptores intracelulares o receptores de la superficie celular

206
Q

Receptores intracelulares

A

Son receptores nucleares, que abarca los receptores de hormonas esteroides, vitamina D, acido retinoico y receptores de hormonas tiroideas funcionan como un FET. Tienen dominion para la union de ADN, activacion transcripcional y dominio de union a ligando. La union causa un cambio conformacional en el receptor que lo activa. El complejo receptor-hormona entra en el nucleo, se dimeriza y se une a un elemento regulador. La union permite el reclutamiento de los coactivadores al DAT. La union del complejo receptor-hormona al elemento regulador permite la expresion coordinada de un grupo de genes diana, aunque esten en cromosomas diferentes

207
Q

Receptores de la superficie celular

A

Incluyen a la insulina, adrenalina y glucagon. El glucagon se unira a su receptor en la membrana plasmatica acoplado a la proteina G, esta señal se traduce a AMPc intracelular, que puede influir en la expresion (y actividad) de la proteina por la fosforilacion mediada por la proteincinasa A. En respuesra a la elevacion de AMPc, se fosforila y activa CREB, un factor de accion trans, que se une por medio de un motivo de cremallera de leucinas a un elemento de accion cis, el ERC (elemento que responde a AMPc) y tiene como resultado la transcripcion de genes diana con ERC en sus promotores

208
Q

Edicion del ARNm

A

Modificacion postranscripcional en la que se altera una base del ARNm. Un ejemplo es el transcrito para la apo B, que se produce en higado e intestino delgado, pero en el intestino delgado, la base de citosina (C) del codon CAA para glutamina se disemina de forma enzimatica a Uracilo (U) y cambia el codon a un codon de parada produciendo una apo mas corta “apo B-48” que se incorpora en los quilomicrones

209
Q

Transferriina (Tf)

A

Es una proteina plasmatica que transporta hierro, se une a los receptores de la superficie celular que se internalizan y proporcionan hierro a las celulas. El ARNm para el TfR tiene en su UTR 3’ varios elementos de respuesta que actuan en cis, estos tienen una estructura en bucle corta a la que pueden unirse proteinas reguladoras del hierro en accion trans.
Concentracion de hierro baja: proteinas reguladoras de hierro unidas a los elementos que responden al hierro en el extremo 3’ y estabilizan el ARNm para el TfR, permitiendo su sintesis
Niveles altos de hierro: proteinas reguladoras de hierro se disocian, lo que acelera la degradacion de ARNm y resulta en una sintesis disminuida de los TfR

210
Q

Ferritina

A

Proteina de almacenamiento de hierro, solo tiene 1 elemento que responde al hierro en el UTR 5’
Niveles bajos de hierro: proteinas reguladoras de hierro se unen a los elementos que responden al hierro en 5’ y evitan el uso de ARNm, elaborando menos ferritina
Nieveles altos de hierro: proteinas reguladoras se disocian y permiten la sintesis de ferritina para almacenar el exceso de hierro

211
Q

ARN de interferencia (ARNi)

A

Mecanismo de silenciamiento genico por la menor expresion de ARNm, puede ser por una represion de la traduccion o por una mayor degradacion. Esta mediado por un microARN (ARN corto, no codificante). Tmb puede ser disparado por la introduccion de un ARN corto de interferencia (ARNci) exogeno de doble cadena en una celula, el proceso tiene potencial terapeutico

212
Q

MicroARN (miARN)

A

Surge de transcritos nucleares codificados por medios genomicos que se procesan en parte en el nucleo a pre-miARN por Drosha que despues se transporta al citoplasma, donde Dicer completa el procesamiento y genera un miARN corto de doble cadena. Una sola cadena de miARN se relaciona con el complejo silenciador inducido por ARN (RISC), la cadena guia se hibridiza con una secuencia complementaria en UTR 3’ de un ARNm diana completo, llevando RISC al ARNm, puede resultar en la represion de la traduccion del ARNm o en su degradacion por Argonautal/Ago/Slicer del RISC

213
Q

Terapia basa en ARNi

A

El primer ensayo consistio en el estudio de la forma neovascular de la degeneracion macular relacionada con la edad (DME) es provocada por la superproduccion del factor de crecimiento endotelial vascular (VEGF) que provoca la aparicion detras de la retina de vasos sanguineos en exceso. Se diseño el ARNci para dirigirse al ARNm del VEGF y promover su degradacion

214
Q

Regulacion a traves de la traduccion de ARNm

A

Se regula por la fosforilacion del factor de iniciacion de la traduccion eucariota, eIF-2, al fosforilarse se inactiva e inhibe la traduccion, la fosforilacion es catalizada por cinasas que se activan cuando hay carencia de aminoacidos, deficit del hemo, presencia de un ARN de doble cadena (infeccion viral), acumulacion de proteinas mal plegadas en el reticulo endoplasmatico

215
Q

Acceso al ADN

A

La cromatina activa (eucromatina) tiene a las histonas que han sido modificadas covalentemente en sus extremos aminoterminales por acetilacion o fosforilacion reversible. Esto disminuye la carga positiva de las histonas y por esto, se disminuye la fuerza de su asociacion con el ADN cargado negativamente. El nucleosoma se relaja y los factores de transcripccion pueden entrar a regiones especificas del ADN. La cromatina puede reposicionarse, pero ocupa ATP y es parte del proceso de remodelacion de cromatina. Los genes activos suelen estar hipometilados