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bio moléculaire > 3. Réplication de l'ADN > Flashcards

3. Réplication de l'ADN Flashcards

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Biology 101 flashcards
1
Q

Afin d’entamer la réplication, quel type de lien doit être brisé en premier?

A

Les liaisons H dans les zones riches en A-T (les ORI)

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Q

Qui reconnait les ORIs?

A

les protéines initiatrices

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Q

Nommer les protéines initiatrices d’une cellule procaryote vs eucaryote.

A

Procaryote: DnaA
Eucaryote: ORC

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Q

Nommer les deux fonctions de la protéine initiatrice.

A
  • reconnaissance de l’endroit qu’elle doit s’installer
  • recruter les autres protéines (comme hélicase)
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Q

La protéine initiatrice est responsable de reconnaître quel type de séquence de bases pour se lier à l’ADN?

A

Aux séquences spécifiques

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5
Q

Qu’est-ce qui fait en sorte que la protéine initiatrice est capable de recruter et de reconnaître?

A

Le fait qu’elle est complémentaire au sillon majeur, c’est-à-dire qu’ils sont compatibles pour aligner les hydrogènes.

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6
Q

Il y a combien de fourches de réplication présents par oeil de réplication?

A

deux (un par côté)

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7
Q

Quel est la fonction de la protéine hélicase?

A

Briser les ponts H, c-à-d couper l’hélice.

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8
Q

Quel est le mode d’action simple des ORC (3 étapes)

A

il s’installe, recrute, quitte

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9
Q

Dans quelle phase du cycle cellulaire est-ce que ORC recrute et active la réplication?

A

recrutement: complexe pré-réplicatif de G1
activation de la réplication: complexe réplicatif dans la phase S

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9
Q

Que reconnaît la ORC? (2)

A
  • une séquence
  • un motif structurel d’ADN
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10
Q

Que se passe-t-il lorsque ORC quitte le site pour laisser la place au réplisome?

A

la polymérase et les autres enzymes de la réplication viennent.

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11
Q

Décrire l’enzyme hélicase.

A

enzyme hexamérique en forme d’anneau/beigne qui laisse passer un brin simple d’ADN (exclusion stérique). il bouge le long de l’ADN en hydrolysant l’ATP

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12
Q

Quel est le nom de la prot/ine qui est responsable d’empêcher la reformation db et de bloquer la formation d’épingles et pourquoi?

A

La SSB, car ils sont autocomplémentaires et ils sont capables de mettre l’ADN en ligne droite.

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12
Q

Pourquoi est-ce que la forme de l’hélicase est importante et pertinente pour accomplir sa fonction?

A

Elle a une grosse processivité, c-à-d un gros processus. sa forme est favorable car elle a besoin d’une grande processivité à se détacher. sinon, sa forme en anneau ne permettrait pas le détachement

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13
Q

Mode d’action de SSB

A

entoure l’ADN monocaténaire pour empêcher des interactions entre deux brins monocaténaires d’ADN

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14
Q

Rôle d’ADN pol

A

catalyse le lien phosphodiester et attache le nucléotide correspondant selon la matrice

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14
Q

Lors de la synthèse d’un nouveau brin, où se placent les topoisomérases?

A

Ils se placent sur l’ADN db devant les fourches

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15
Q

Les topoisomérases II (ADNgyrase) sont responsables de quoi?

A

ils empêchent le supercoiling ou bien la tension

16
Q

L’ADN a besoin d’une ___ synthétisé par ___ pour entamer la synthèse d’ADN

A

Amorce d’ARN synthétisé par ARN primase

17
Q

À environ cmb de nucléotides s’attache la primase

A

À environ chaque 10 nucléotides

18
Q

Quel côté du double brin de ADN pol se trouve dans le site catalytique?

A

3’OH

19
Q

Définition de primase et ADN polymérase

A
  • primase: enzyme qui entame la réplication en faisant une amorce d’ARN
  • enzyme responsable de la synthèse d’un NOUVEAU brin d’ADN à partir d’une amorce
20
Q

La primase et ADN polyméraseIII catalysent quel lien?

A

le lien phosphodiester (covalent) lorsqu’il y a alignement de deux bases complémentaires.

21
Q

Dans quel sens va;
1. la lecture du brin matrice d’ADN?
2. la synthèse de l’amorce ou le nouveau brin d’ADN?

A
  1. lecture: 3’-5’
  2. Synthèse: 5’-3’

pense au fait que l’Amorce est dans le sens 5’-3’ et le nouveau brin va suivre directement donc il doit être 3’-5’ pour continuer la file

22
Q

Qui recrute primase? On en a cmb de primase

A

3 primases recrutés par hélicase

23
Q

Nommer les étapes de la synthèse de primase (6)

A
  1. déroulement de l’ADN
  2. passage par hélicase
  3. 1 des 3 primases captent et la charge positive attire le grp P dans le site actif pour bien placer les bases
    4: éloignement du brin matrice
  4. décollement du brin matrice
  5. SSB lie l’ADN décollé et les aligne. SSB éloigne les amorces en attente de primase
24
Q

Quel est le nom de la protéine qui reconnaît l’amorce et que fait-il

A

Le poseur d’anneau est responsable de mettre un anneau pour que l’ADN polymérase puisse s’attacher

25
Q

Pourquoi est-ce que l’ADN pol a besoin du poseur d’anneau?

A

Il s’agit d’une chaise pour le permettre de ne pas partir grâce à sa grande processivité

26
Q

Quelle est l’étabe limitante de la réplication?

A

Le positionnement de la polymérase à l’aide du poseur d’anneau

27
Q

Expliquer l’utilité des ions métalliques dans le site catalytique.

A

Un ion 2+ va tasser H et l’autre ion va se lier au O libre

28
Q

Que trouvons-nous dans la fourche de réplication?

A

le brin continu (dans la même direction que l’ouverture) et discontinu (fragments d’Okazaki, synthèse contraire de l’ouverture)

29
Q

Combien d’amorces sur le brin continu et discontinu?

A

Continu: 1
Discontinu: panoplie

30
Q

Que fait le réplisome?

A

il coordonne les deux brins

31
Q

Hélicase se déplace sur quel brin et pourquoi?

A

discontinue, car on a besoin de bcp d’amorces

32
Q

Les nouveaux nucléosomes de placent où grâce à qui?

A

Entre les vieux
recrutés par l’Anneau

32
Q

Que se passe-t-il quand l’ADN pol rencontre le fragment d’Okazaki précédent?

A

Elle se détache de l’Anneau

33
Q

La conservation des vieux nucléosomes chez les eucaryotes permet quoi?

A

De maintenir l’identité de la cellule, car l’information dans la queue N indique quelle partie d’euchromatine doit s’exprimer pour différencier les souche

34
Q

Mode d’action de ADN pol (responsable de maturation et non synthèse)

A

Enlève les ARN de l’amorce et place les ADN à partir du 3’ du fragment (remplace l’amorce par de l’ADN)

35
Q

Que fait la ligase

A

liaison phosphodiester entre 2 Okazaki (colle)

36
Q

La convergence des fources de réplication forme quoi?

A

des caténanes, nécessite décaténation par topII

37
Q

Qui protège le bout 3’ du télomère et son rôle?

A

Le sherlterin, il évite un bris d’ADN et évite la réparation de cet endroit

37
Q

Quel est le rôle de la télomérase?

A

allonger l’extrémité 3’ les chx en ajoutant des séquences répétitives (télomères)

38
Q

Quelle est la répétition des télomères?

A

TTAGGG

39
Q

Nommer ce qu’il faut avoir pour faire le PCR

A
  • ADN pol, amorce ADN3P, séquences ouvertes
  • ouvrir adn (faire chauffer)
  • nucléotides 3-p
40
Q

nom des 3 étapes de pcr

A
  • dénaturation (2 min 90 deg): ouvrir adn qu’on veut amplifier
  • hybridation (2 min 60 deg) : hybrider les amorces
  • élongation (2 min 75 deg): détacher les amorces
41
Q

dans un pcr, qui définit la séquence d’ADN à amplifier?

A

L’amorce

bio moléculaire (5 decks)

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