3. Réplication de l'ADN Flashcards
Afin d’entamer la réplication, quel type de lien doit être brisé en premier?
Les liaisons H dans les zones riches en A-T (les ORI)
Qui reconnait les ORIs?
les protéines initiatrices
Nommer les protéines initiatrices d’une cellule procaryote vs eucaryote.
Procaryote: DnaA
Eucaryote: ORC
Nommer les deux fonctions de la protéine initiatrice.
- reconnaissance de l’endroit qu’elle doit s’installer
- recruter les autres protéines (comme hélicase)
La protéine initiatrice est responsable de reconnaître quel type de séquence de bases pour se lier à l’ADN?
Aux séquences spécifiques
Qu’est-ce qui fait en sorte que la protéine initiatrice est capable de recruter et de reconnaître?
Le fait qu’elle est complémentaire au sillon majeur, c’est-à-dire qu’ils sont compatibles pour aligner les hydrogènes.
Il y a combien de fourches de réplication présents par oeil de réplication?
deux (un par côté)
Quel est la fonction de la protéine hélicase?
Briser les ponts H, c-à-d couper l’hélice.
Quel est le mode d’action simple des ORC (3 étapes)
il s’installe, recrute, quitte
Dans quelle phase du cycle cellulaire est-ce que ORC recrute et active la réplication?
recrutement: complexe pré-réplicatif de G1
activation de la réplication: complexe réplicatif dans la phase S
Que reconnaît la ORC? (2)
- une séquence
- un motif structurel d’ADN
Que se passe-t-il lorsque ORC quitte le site pour laisser la place au réplisome?
la polymérase et les autres enzymes de la réplication viennent.
Décrire l’enzyme hélicase.
enzyme hexamérique en forme d’anneau/beigne qui laisse passer un brin simple d’ADN (exclusion stérique). il bouge le long de l’ADN en hydrolysant l’ATP
Quel est le nom de la prot/ine qui est responsable d’empêcher la reformation db et de bloquer la formation d’épingles et pourquoi?
La SSB, car ils sont autocomplémentaires et ils sont capables de mettre l’ADN en ligne droite.
Pourquoi est-ce que la forme de l’hélicase est importante et pertinente pour accomplir sa fonction?
Elle a une grosse processivité, c-à-d un gros processus. sa forme est favorable car elle a besoin d’une grande processivité à se détacher. sinon, sa forme en anneau ne permettrait pas le détachement
Mode d’action de SSB
entoure l’ADN monocaténaire pour empêcher des interactions entre deux brins monocaténaires d’ADN
Rôle d’ADN pol
catalyse le lien phosphodiester et attache le nucléotide correspondant selon la matrice
Lors de la synthèse d’un nouveau brin, où se placent les topoisomérases?
Ils se placent sur l’ADN db devant les fourches
Les topoisomérases II (ADNgyrase) sont responsables de quoi?
ils empêchent le supercoiling ou bien la tension
L’ADN a besoin d’une ___ synthétisé par ___ pour entamer la synthèse d’ADN
Amorce d’ARN synthétisé par ARN primase
À environ cmb de nucléotides s’attache la primase
À environ chaque 10 nucléotides
Quel côté du double brin de ADN pol se trouve dans le site catalytique?
3’OH
Définition de primase et ADN polymérase
- primase: enzyme qui entame la réplication en faisant une amorce d’ARN
- enzyme responsable de la synthèse d’un NOUVEAU brin d’ADN à partir d’une amorce
La primase et ADN polyméraseIII catalysent quel lien?
le lien phosphodiester (covalent) lorsqu’il y a alignement de deux bases complémentaires.
Dans quel sens va;
1. la lecture du brin matrice d’ADN?
2. la synthèse de l’amorce ou le nouveau brin d’ADN?
- lecture: 3’-5’
- Synthèse: 5’-3’
pense au fait que l’Amorce est dans le sens 5’-3’ et le nouveau brin va suivre directement donc il doit être 3’-5’ pour continuer la file
Qui recrute primase? On en a cmb de primase
3 primases recrutés par hélicase
Nommer les étapes de la synthèse de primase (6)
- déroulement de l’ADN
- passage par hélicase
- 1 des 3 primases captent et la charge positive attire le grp P dans le site actif pour bien placer les bases
4: éloignement du brin matrice - décollement du brin matrice
- SSB lie l’ADN décollé et les aligne. SSB éloigne les amorces en attente de primase
Quel est le nom de la protéine qui reconnaît l’amorce et que fait-il
Le poseur d’anneau est responsable de mettre un anneau pour que l’ADN polymérase puisse s’attacher
Pourquoi est-ce que l’ADN pol a besoin du poseur d’anneau?
Il s’agit d’une chaise pour le permettre de ne pas partir grâce à sa grande processivité
Quelle est l’étabe limitante de la réplication?
Le positionnement de la polymérase à l’aide du poseur d’anneau
Expliquer l’utilité des ions métalliques dans le site catalytique.
Un ion 2+ va tasser H et l’autre ion va se lier au O libre
Que trouvons-nous dans la fourche de réplication?
le brin continu (dans la même direction que l’ouverture) et discontinu (fragments d’Okazaki, synthèse contraire de l’ouverture)
Combien d’amorces sur le brin continu et discontinu?
Continu: 1
Discontinu: panoplie
Que fait le réplisome?
il coordonne les deux brins
Hélicase se déplace sur quel brin et pourquoi?
discontinue, car on a besoin de bcp d’amorces
Les nouveaux nucléosomes de placent où grâce à qui?
Entre les vieux
recrutés par l’Anneau
Que se passe-t-il quand l’ADN pol rencontre le fragment d’Okazaki précédent?
Elle se détache de l’Anneau
La conservation des vieux nucléosomes chez les eucaryotes permet quoi?
De maintenir l’identité de la cellule, car l’information dans la queue N indique quelle partie d’euchromatine doit s’exprimer pour différencier les souche
Mode d’action de ADN pol (responsable de maturation et non synthèse)
Enlève les ARN de l’amorce et place les ADN à partir du 3’ du fragment (remplace l’amorce par de l’ADN)
Que fait la ligase
liaison phosphodiester entre 2 Okazaki (colle)
La convergence des fources de réplication forme quoi?
des caténanes, nécessite décaténation par topII
Qui protège le bout 3’ du télomère et son rôle?
Le sherlterin, il évite un bris d’ADN et évite la réparation de cet endroit
Quel est le rôle de la télomérase?
allonger l’extrémité 3’ les chx en ajoutant des séquences répétitives (télomères)
Quelle est la répétition des télomères?
TTAGGG
Nommer ce qu’il faut avoir pour faire le PCR
- ADN pol, amorce ADN3P, séquences ouvertes
- ouvrir adn (faire chauffer)
- nucléotides 3-p
nom des 3 étapes de pcr
- dénaturation (2 min 90 deg): ouvrir adn qu’on veut amplifier
- hybridation (2 min 60 deg) : hybrider les amorces
- élongation (2 min 75 deg): détacher les amorces
dans un pcr, qui définit la séquence d’ADN à amplifier?
L’amorce
