1. Structure de l'ADN Flashcards
Pourquoi veut-on que les ARN soient moins stable que l’ADN?
Car s’il est instable, c’est plus facile d’éviter de refaire la protéine et ça gaspille moins d’énergie.
Définition de gène
Séquence d’ADN qui code pour faire une protéine ou un type d’ARN particulier.
Nommer les constituants du nucléotide
ATP (groupe phosphate)
base azotée (A,T,C,G)
sucre (pentose)
Comment est-ce qu’on nomme les deux liens réalisés par une réaction de condensation?
Lien phosphoester et glycosidique
Que lie dans le nucléotide un lien glycosidique?
Ça lie le pentose à la base azotée
Que lie dans le nucléotide un lien phosphoester? Que fait ce lien?
Ça lie le groupement phosphate au pentose
Les nucléotides sont assemblés par des liens covalents phosphodiesters forts
Nommer et décrire les deux catégories de bases azotées.
1- Pyrimidine (CUT)
(1 cycle, 4C, 2N)
2- Purine (AG)
(2 cycles, 5C, 4N)
Quel carbone est le site de quel liaison?
Lien phosphoester : carbone 5
Lien glycosidique: carbone 3
Quels sont trois fonctions complémentaires de l’ADN? (autre que le fait que c’est la molécule de base)
- Source d’énergie par les grp phosphate qui se font hydrolysées facilement.
- Formation de coenzymes via l’association de différents groupements chimiques
- Signalisation/Second messager
Donner un exemple par fonction complémentaire de l’ADN.
- Source d’énergie: ATP
- Coenzymes (CoA, NADPH)
- Signalisation/seconds messagers (AMPc)
Qu’est ce qui distingue la liaison phosphodiester d’une liaison phosphoester?
Ester: à travers un O
Diester: à travers deux côtés du O
Décrire la polymérisation d’un nucléotide en ADN et les composants nécessaires pour le faire.
L’attachement des nucléotides ensemble
Besoin de: enzyme polymérase et dNTP (desoxyribonucléotides triphosphate)
De quelle direction de fait la polymérisation de l’ADN?
De 5’ vers 3’
Est-ce que les brins de l’ADN bicaténaire sont parallèles? Pourquoi?
Non, antiparallèles, car il faut aligner les groupements fonctionnels pour l’association des liens H pour la complémentarité
Qu’est-ce qui dicte les appariements AT et CG de chaque base azotée?
selon la postition des groupements fonctionnels
pourquoi est-il nécessaire de faire l’appariement purine-pyrimidine et non purine-purine ou pyrimidine-pyrimidine?
Parce que ceci permet l”association stable et la même longueur avec un nombre approprié de groupements fonctionnels.
Sinon, il y aurait soit trop soit pas assez de grp.
Quel est la différence entre la structure primaire et secondaire de l’ADN?
primaire: ordre des nucléotides
secondaire: double hélice et liaisons H entre les brins complémentaires
L’ADN est constitué de 2 chaînes complémentaires antiparallèles et hélicoïdales. Ainsi, il tourne. Pourquoi?
- Minimiser l’accès à l’eau (car en hydrolysant et détruire les liens, l’eau fait les liens H lui-même)
- Donner plus d’espace aux atomes (moins de répulsion)
- liens obliques et la liaison antiparallèle favorise la rotation
Que permet la complémentarité des bases (2)
- réparation facilitée
- réplication de l’ADN
Qu’est la structure tertiaire et quaternaire de l’ADN?
- tertiaire: chromosome
- quaternaire: protéine (ex histone)
Quel est le rôle des sillons?
Les sillons constituent d’importants sites de liaison des protéines qui maintiennent l’ADN et régulent l’activité des gènes.
Quel sillon permet la spécificité d’une séquence?
les sillons majeurs
Décrire la dénaturation de l’ADN
C’est la perte de la structure 4,3,2 de la molécule à 95 degrés
(pas primaire sinon ça serait destruction de la molécule)
Décrire l’hybridation
Le retour ensemble après refroidissement à 65 degrés
(Peut se faire entre deux brins initaux ou un brin initial et ajouté)
La présence d’une sonde (hybridation entre brin départ et brin ajouté) détecte quoi?
La présence d’une séquence ou d’un gène spécifique dans un échantillon d’ADN pour visualiser l’interaction
Décrire la spécificité
la complémentarité entre deux molécules dépendamment de :
la complémentarité de formes
et du nombre de liens chimiques formés
Est-ce que la spécificité d’un hybride augmente ou diminue avec une hausse de température
Augmente, car la spécificité est proche à la température d’hybridation
Décrire la différence entre analyse Southern et Northern
- southern c’est de l’ADN soumis à une sonde complémentaire à un gène (présence dans tissu nerveux et musculaire)
- northern c’est de l’ARN soumis à une sonde complémentaire à l’ARNm qui concorde au gène recherché
