1. Structure de l'ADN Flashcards

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1
Q

Pourquoi veut-on que les ARN soient moins stable que l’ADN?

A

Car s’il est instable, c’est plus facile d’éviter de refaire la protéine et ça gaspille moins d’énergie.

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Q

Définition de gène

A

Séquence d’ADN qui code pour faire une protéine ou un type d’ARN particulier.

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Q

Nommer les constituants du nucléotide

A

ATP (groupe phosphate)
base azotée (A,T,C,G)
sucre (pentose)

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Q

Comment est-ce qu’on nomme les deux liens réalisés par une réaction de condensation?

A

Lien phosphoester et glycosidique

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Q

Que lie dans le nucléotide un lien glycosidique?

A

Ça lie le pentose à la base azotée

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6
Q

Que lie dans le nucléotide un lien phosphoester? Que fait ce lien?

A

Ça lie le groupement phosphate au pentose

Les nucléotides sont assemblés par des liens covalents phosphodiesters forts

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7
Q

Nommer et décrire les deux catégories de bases azotées.

A

1- Pyrimidine (CUT)
(1 cycle, 4C, 2N)

2- Purine (AG)
(2 cycles, 5C, 4N)

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8
Q

Quel carbone est le site de quel liaison?

A

Lien phosphoester : carbone 5

Lien glycosidique: carbone 3

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9
Q

Quels sont trois fonctions complémentaires de l’ADN? (autre que le fait que c’est la molécule de base)

A
  1. Source d’énergie par les grp phosphate qui se font hydrolysées facilement.
  2. Formation de coenzymes via l’association de différents groupements chimiques
  3. Signalisation/Second messager
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10
Q

Donner un exemple par fonction complémentaire de l’ADN.

A
  1. Source d’énergie: ATP
  2. Coenzymes (CoA, NADPH)
  3. Signalisation/seconds messagers (AMPc)
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11
Q

Qu’est ce qui distingue la liaison phosphodiester d’une liaison phosphoester?

A

Ester: à travers un O
Diester: à travers deux côtés du O

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12
Q

Décrire la polymérisation d’un nucléotide en ADN et les composants nécessaires pour le faire.

A

L’attachement des nucléotides ensemble

Besoin de: enzyme polymérase et dNTP (desoxyribonucléotides triphosphate)

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13
Q

De quelle direction de fait la polymérisation de l’ADN?

A

De 5’ vers 3’

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14
Q

Est-ce que les brins de l’ADN bicaténaire sont parallèles? Pourquoi?

A

Non, antiparallèles, car il faut aligner les groupements fonctionnels pour l’association des liens H pour la complémentarité

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15
Q

Qu’est-ce qui dicte les appariements AT et CG de chaque base azotée?

A

selon la postition des groupements fonctionnels

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16
Q

pourquoi est-il nécessaire de faire l’appariement purine-pyrimidine et non purine-purine ou pyrimidine-pyrimidine?

A

Parce que ceci permet l”association stable et la même longueur avec un nombre approprié de groupements fonctionnels.

Sinon, il y aurait soit trop soit pas assez de grp.

17
Q

Quel est la différence entre la structure primaire et secondaire de l’ADN?

A

primaire: ordre des nucléotides

secondaire: double hélice et liaisons H entre les brins complémentaires

17
Q

L’ADN est constitué de 2 chaînes complémentaires antiparallèles et hélicoïdales. Ainsi, il tourne. Pourquoi?

A
  • Minimiser l’accès à l’eau (car en hydrolysant et détruire les liens, l’eau fait les liens H lui-même)
  • Donner plus d’espace aux atomes (moins de répulsion)
  • liens obliques et la liaison antiparallèle favorise la rotation
18
Q

Que permet la complémentarité des bases (2)

A
  • réparation facilitée
  • réplication de l’ADN
19
Q

Qu’est la structure tertiaire et quaternaire de l’ADN?

A
  • tertiaire: chromosome
  • quaternaire: protéine (ex histone)
20
Q

Quel est le rôle des sillons?

A

Les sillons constituent d’importants sites de liaison des protéines qui maintiennent l’ADN et régulent l’activité des gènes.

21
Q

Quel sillon permet la spécificité d’une séquence?

A

les sillons majeurs

22
Q

Décrire la dénaturation de l’ADN

A

C’est la perte de la structure 4,3,2 de la molécule à 95 degrés
(pas primaire sinon ça serait destruction de la molécule)

23
Q

Décrire l’hybridation

A

Le retour ensemble après refroidissement à 65 degrés
(Peut se faire entre deux brins initaux ou un brin initial et ajouté)

24
Q

La présence d’une sonde (hybridation entre brin départ et brin ajouté) détecte quoi?

A

La présence d’une séquence ou d’un gène spécifique dans un échantillon d’ADN pour visualiser l’interaction

25
Q

Décrire la spécificité

A

la complémentarité entre deux molécules dépendamment de :
la complémentarité de formes
et du nombre de liens chimiques formés

26
Q

Est-ce que la spécificité d’un hybride augmente ou diminue avec une hausse de température

A

Augmente, car la spécificité est proche à la température d’hybridation

26
Q

Décrire la différence entre analyse Southern et Northern

A
  • southern c’est de l’ADN soumis à une sonde complémentaire à un gène (présence dans tissu nerveux et musculaire)
  • northern c’est de l’ARN soumis à une sonde complémentaire à l’ARNm qui concorde au gène recherché