2b - Transposition Flashcards
qu’est ce qu’un transposon? (Autonomie et Homologie)
morceau d’ADN
autonome
sans homologie
quelle modification provoquent les transposons? (5)
1.inactivation/activation de gènes,
2.transfert,
3.inversion,
4.délétion,
5.translocation
chez quelle espèce est-ce que les transposons représentent une fraction importante du génome, E.Coli ou humain?
chez l’humain
quels sont les 3 réarrangements possibles effectués par les transposons et comment sont les séquences impliquées ? (3)
deletion: sequences repetées directes
inversion: séquences répétées inversées
insertion: non mentionné
quels sont les types d’éléments transposables chez la bactérie? (3)
- élément d’insertion (IS)
- Transposons (Tn-A)
- Transposons composés (Tn10, Tn5)
que sont les éléments d’insertion required I.S ? (2) et que provoquent-ils ?
séquences répétées inversées à chaque extrémité + 1/2 gènes. provoquent une duplication.
que sont les transposons composés ?
séquences d’ADN variable avec élément IS aux extrémités
quels sont les types de transpositions possibles? Chez les procaryotes
- transposition réplicative
- transposition non-réplicative (aka conservaTIVE)
quel est le mécanisme de la transposition non-réplicative? (2) et quelle est sa particularité?
- liaison + excision du transposon: soit par enzyme, soit par transposase, soit par Hermes (épingles!!!)
- intégration du transposon: ligature par réaction de transestérification, liaison covalente.
particularité: létal pour le génome donneur.
comment régule-t-on la transposition chez les procaryotes? (2)
- régulation du déplacement par les éléments transposables
- facteurs cellulaires
quels sont les éléments transposables chez les eucaryotes?
- Transposon d’ADN
- Rétrotransposon: soit viral ou poly-A
c’est quoi un rétrotransposon?
enzymes impliquées (3) et mécanisme (2) ?
transposons nécessitant un intérmédiaire ARN
transposon->ARN->ADN->dans nouveau génome.
enzymes; transcriptase inverse et intégrase
quelle est la spécificité des rétrotransposons de type viral?
sont pris à partir de provirus, donne donc transcription d’ARN viral.
que sont les rétrotransposons poly-A?
comportent un géne spécial aux extrémités (LINE) + séquence polyA (SINE)
quel est le mécanisme de réplication des transposons polyA?
- ARNpol qui transcrit séquence du rétroposon
- traduction de l’ARN et liaison à une région riche en T (pcq séquence polyA) - hybridation ADN-ARN
- copie d’ARN en ADN
- réparation et ligature
Les différence (2) éléments LINE vs SINE
LINE = autonome + UTR
SINE = non autonome
Quelle sont les 2 transposons composé vue ?
Tn5 et Tn10
Différence chez les intermédiaires épingle à cheveux chez le transposon hermès et “ normale “ ?
Hermès : dans l’ADN et non aux extrémités du transposon
Chez une réplication non-réplicatif , quelle réaction chimique permet l’intégration du transposon ?
Réaction de transterificastion
Qu’elle type de transposition je suis ? (Procaryote)
J’ai un intermédiaire Co-Intégrât liée de façons covalente
Réplication réplicative
Mécanisme de la transposition replicative (4)
- coupure des brins
- réplication
- recombinaison homologue
- résolution
Régulation du déplacement es transposon chez les Tn-A , IS , Tn5 et 10
Diapo 29
2 manière de réguler les transposons chez les procaryote
-Régulation du déplacement des transposons
- Facteurs cellulaires (polymérase, méthylase, girase etc)
Transposition ; Je provoque quelque chose d’important à court termes et à long terme ?
À court terme : changement phénotypique
À long terme : évolution
