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Génétique moléculaire II > 2.5 : la réparation de l'ADN > Flashcards

2.5 : la réparation de l'ADN Flashcards

1
Q

Quels sont les différents types de dommage que peut subir l’ADN (causes des mutations)?

A
  1. Facteurs environnementaux (radiations UV et ionisantes) et agents mutagènes
  2. Métabolisme oxydatif qui génère des espèces d’oxygène réactives (radicaux)
  3. Réactions spontanées via l’action de l’eau (dépurination et désamination)
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Q

Une erreur de réplication peut donner lieu à?

A

À une paire de bases mésappariées → mutation d’insertion/délétion

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3
Q

Les mutations d’insertion/délétion affectent quoi en particulier? Pourquoi?

A

Les régions contenant de courtes séquences répétées (microsatellites)

  • La machinerie de réplication a de la difficulté à à répliquer ces segments répétés → elle glisse sur ces régions : augmente ou diminue le nombre de séquences répétées (replication slippage)
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4
Q

Chez l’homme, de quoi est responsable le replication slippage?

A

De plusieurs maladies neurodégénératives qui se caractérisent par l’expansion d’une répétition de trinucléotides

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5
Q

Que provoquent les rayons UV dans l’ADN? Conséquence?

A

La formation d’un dimère de pyrimidines (souvent thymines)

- Dimère déforme la double hélice → elle ne peut plus servir de matrice pour la réplication et la transcription

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6
Q

Combien de produits génèrent les rayons UV?

A

2 types : un avec un cycle cyclobutane et l’autre avec un seul lien covalent entre les 2 pyrimidines

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7
Q

Que font les radiations ionisante (rayons X et gamma) dans l’ADN?

A

Peuvent causer des cassures double-brin dans l’ADN en s’attaquant au désoxyribose ou en générant des ROS (qui réagissent avec le désoxyribose)

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8
Q

Que se passe-t-il si les extrémités associées aux cassures double-brin ne sont pas reliées correctement?

A

Il en résulte des réarrangements chromosomiques et des translocations (les ¢ ont besoin de chromosomes intacts pour répliquer leur ADN)

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9
Q

Vrai ou faux :

Il est possible d’utiliser les radiations ionisantes pour tuer rapidement les cellules cancéreuses.

A

Vrai,

Certains agents chimio thérapeutiques comme la bléomycine causent des cassures double-brin dans l’ADN

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10
Q

Qu’est-ce que l’oxoG?

A

Base mutagène qui peut s’apparier à A et C

- générée par la réaction d’oxydation de la guanine de la position 8 suite à l’attaque par des ROS

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11
Q

Que se passe-t-il si l’oxoG s’apparie avec l’adénine au lieu de la cytosine?

A

Une transversion G-C→T-A apparaît. L’une des mutations les plus communes chez les cancers humains

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12
Q

Que peut provoquer l’alkylation d’une base?

A

Une distorsion de l’hélice d’ADN et inhiber la réplication de l’ADN

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13
Q

Explique comment l’ADN peut être endommagée par des réactions d’hydrolyse spontanées

A
  1. La désamination de la cytosine génère l’uracile
  2. La dépurination via l’hydrolyse du lien N-glycosidique produit un site abasique
  3. La désamination de la 5-méthylcytosine génère une base naturelle (thymine) au lieu de l’uracil
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14
Q

Qu’est-ce qu’un site abasique? Causé par quoi?

A

Un désoxyribose sans base → produit par l’hydrolyse du lien N-glycosidique

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15
Q

Qu’est est la conséquence d’une dépurination?

A

Bloque la réplication → car remplacement de bases

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16
Q

Les 4 systèmes de réparation de l’ADN?

A
  1. Système de réparation directe (enzyme suicide → brise ponts cyclo-butane)
  2. Système de réparation par excision
    - De nucléotides (NER)
    - De bases (BER)
  3. Système de réparation de bases mésappariées
  4. Système de réparation par recombinaison → système de réparation de cassures bicaténaires
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17
Q

Différence entre systèmes de réparation par excision de nucléotides et excision de bases?

A
  • Nucléotides : excisent un segment d’ADN contenant la/les bases altérées et synthétisent un nouveau segment
  • Bases : seule la base altérée est excisée, le squelette sucre-phosphate est intact
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18
Q

E. coli → système de réparation qui est sujet à des erreurs?

A

Système de réparation induit par la réponse SOS

  • Utilise une ADN polymérase qui ne fait pas partie de la machinerie de réplication normale pour répliquer le site d’ADN endommagé
    • ADN translésionnelle ou de contournement
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19
Q

Système de réparation “autre” des eucaryotes?

A
  • Utilisation d’ADN polymérases distinctes pour répliquer les sites d’ADN endommagé (DDR : DNA damage response)
  • Réparation des cassures double-brin par le mécanisme NHEJ (“non-homologous end-joining”
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20
Q

Vrai ou faux :

Le génome humain possède peu de gènes de réparation.

A

Faux

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21
Q

Les systèmes de réparation directe?

A
  • Voie mineure
  • Agissent directement sur les nucléotides endommagés (par les UV/agents alkylants)
  • Convertissent les nt endommagés à leur structure originale → utilisent une seule enzyme
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22
Q

Vrai ou faux :

Systèmes de réparation directe peuvent éliminent les dimères de pyrimidine et les groupements alkyles

A

Vrai

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23
Q

Qu’est-ce que la photoréactivation?

A
  • Réparation de l’ADN dépendante de la lumière (300-500nm) → ADN photolyase
  • Répandu chez plusieurs organismes mais absente chez l’homme
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24
Q

Fonctionnement de l’ADN photolyase?

A
  • Pas besoin de lumière pour reconnaître un dimère de pyrimidines et s’y lier
  • *Capte l’énergie lumineuse
  • Besoin de lumière pour cliver
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25
Q

Quels sont les 2 facteurs de l’ADN photolyase, liés à l’enzyme de façon covalente?

A

MTHF et FADH

  • MTHF : permet captation de l’É lumineuse (sous sa forme activée)
  • FADH : permet de briser liens covalents entre les dimères
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26
Q

Que font les alkyltransférases?

A

Désalkylent les nt alkylés → retirent groupements éthyles ou méthyles
- Agissent sur une faible proportion des sites

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27
Q

Quels sont les sites d’attaque les plus fréquents des agents alkylants sur l’ADN?

A

Les groupes phosphate, N7 de la guanine et N3 de l’adénine

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28
Q

Vrai ou faux :

Les conséquences de l’alkylation de l’ADN sont souvent les mêmes.

A

Faux, dépendent des sites qui sont touchés.

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29
Q

Par quoi est formé le dérivé O6-éthylguanine? Que fait-il?

A
  • Formé par l’éthyl méthane sulfonate (EMS) → agent alkylant puissant
  • S’apparie avec T, ce qui cause le remplacemebt G-C par A-T (transition)
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30
Q

Par quoi sont réparées les lésions de l’ADN sous forme O6-alkylguanine?

A

Directement réparées par une O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase → retire groupements éthyles et méthyles

  • Protéine transfère directement le groupement alkyle sur l’un de ses résidus Cys → inactivation irréversible
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31
Q

Pourquoi l’O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase n’est pas considérée comme une enzyme?

A

Car elle ne peut pas être regénérée → les protéines de ce type incluent Ada de E. coli

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32
Q

Quelles sont les deux fonctions de la protéine Ada d’E. coli?

A
  1. Le segment C-terminal contient la fonction O6-méthylguanine-ADN méthyltransférase → enzyme suicidaire
  2. Le segment N-terminal assure la fonction de réparation des groupements phosphate méthylés → retire groupements méthyles
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33
Q

Pourquoi considère-t-on que les systèmes de réparation directe représentent une composante mineure des mécanismes de réparation de la cellule?

A

Car un seul gène du génome humain spécifie une protéine participant à la réparation directe (MGMT → 06-méthylguanine-ADN méthyltransférase)

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34
Q

Que permet le système de réparation par excision de nt?

A

Permet d’éliminer/réparer les dimères de pyrimidines et les lésions dues à l’addition d’un groupement volumineux sur une base → reconnaît déformation de l’hélice d’ADN

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35
Q

Quels sont les deux sentiers NER?

A
  1. Sentier agissant sur le génome global → GGR

2. Sentier agissant sur les gènes transcrits → TCR (cible les lésions qui bloquent la transcription)

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36
Q

Chez E. coli, quel type de protéines fait intervenir la voie NER? Comment?

A

Les protéines Uvr (UvrA, B, C et D)
- Protéines (endonucléases) se fixent de chaque côté de la lésion et le brin d’ADN est coupé et un oligonucléotide de 12-13 bases est libéré → brèche résultante est comblée par Pol I et l’ADN ligase

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37
Q

Où spécifiquement se fixent les protéines Uvr?

A

Aux positions -8 et +4 (ou +5)

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38
Q

Vrai ou faux : le mécanisme de réparation NER est dépendant de l’ATP.

A

Vrai

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39
Q

Quel est le seul mécanisme permettant la réparation de ponts thymines?

A

NER

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40
Q

Quelle maladie est causée par une NER génétiquement défectueuse?

A

Xeroderma pigmentosum → les enfants de la nuit

  • Hypersensibilité aux rayons solaires
  • Cancer de la peau : 2000x + de risque
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41
Q

Des expériences de fusions cellulaires entre ¢ provenant de différents patients XP ont montrés qu’il y a 7 groupes de complémentation. Qu’est-ce que cela démontre?

A

Démontre qu’il y a au moins 7 produits de gènes différents (XPA-XPG) sont impliqués dans la voie de réparation des lésions UV.

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42
Q

Nomme les 2 produits de gènes différents (XPA-XPG) sont impliqués dans la voie de réparation des lésions UV qui sont des SU de TFIIH.

A

XPB et XPD

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43
Q

Comment le système NER des eucaryotes est-il différent de celui des bactéries?

A
  • Plus complexe
  • Fait intervenir 2 SU de TFIIH, XPB et XPD (activité hélicase)
  • 2 endonucléases distinctes qui introduisent les coupures simple brin au lieu de 1
  • Segment d’ADN libéré = 24-32 nt au lieu de 12-13 nt
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44
Q

Qu’à démontré l’étude du syndrome de Cockayne (SC)?

A

Que le système NER est couplé à la transcription → chez les personnes atteintes, les dimères de pyrimidines ne sont pas excisés des gènes transcrits

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45
Q

Symptômes du syndrome de Cockayne ?

A

Croissance retardée, dysfonctionnements neurologiques dus à la démyélisation des neurones, hypersensibilité aux UV (mais incidence normale des cancers de la peau)

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46
Q

Que sont les protéines CSA et CSB?

A
  • Associées à SC
  • Participent à la reconnaissance des lésions dans les gènes transcrits
  • Reconnaissent ARN pol qui a arrêté de transcrire un gène en raison de nt endommagés sur le brin d’ADN matrice
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47
Q

Explique comment la réparation de l’ADN est couplée à la transcription.

A

Quand une ARN pol rencontre une lésion dans l’ADN, elle tombe en panne et la transcription s’arrête.

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48
Q

Chez E. coli, quelle protéine reconnaît l’ARN pol en détresse? Chez les eucaryotes? Chez l’homme?

A
  • MDF → reconnaît et déloge

- RAD26 (levure) et CSB → famille SWI/SNF des enzymes de remodelage des nucléosomes

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49
Q

Que font les enzymes de remodelage des nucléosomes

A

Aident à recruter les protéines de réparation du système NER au site de la lésion et à dissocier l’ARN pol de la lésions → explique pourquoi l’ADN endommagé est réparé plus rapidement dans les régions activement transcrites

50
Q

Vrai ou faux : CSB et CSA ne dissocient pas l’ARN pol de l’ADN.

A

VRAI, font reculer l’ARN pol en détresse pour que la lésion puisse être corrigée

51
Q

Que fait le système de réparation par excision des bases? (BER)

A

Enlève les bases anormales ou chimiquement modifiées (changements subtils) par rapport aux bases normales

  • Peut aussi enlever une base normale dans des paires de bases mésappariées (T-G ou A-oxoG) afin de prévenir l’apparition de mutations (fail-safe)
  • Réparation des sites abasiques
52
Q

Les seuls mésappariements que l’on peut réparer avec le système BER?

A

T-G ou A-oxoG

53
Q

Que font les ADN glycosylases?

A
  • Enlèvent les bases altérés

- Clive le lien glycosidique entre la base altérée et son sucre → crée un site abasique (AP)

54
Q

Comment peut être formé un AP?

A

Peut être formé dans les conditions physiologiques normales par l’hydrolyse spontanée d’une liaison glycosidique

55
Q

Combien d’ADN glycosylases possèdent les cellules?

A

Plusieurs
- Homme : 11
chacune peut initier la voie BER

56
Q

fonctionnement de l’ADN glycosylase?

A
  1. Glycosylase excise la base altérée
  2. Résidu désoxyribose au site AP est coupé du côté 5’ par une endonucléase AP et une ADN phosphodiestérase enlève le désoxyribose au site AP
  3. ADN pol (pol I ou Pol beta) remplace le nt manquant sur le brin complémentaire
  4. ADN ligase soude la cassure simple-brin
57
Q

Comment les ADN glycosylases repèrent-elles les bases altérées? Comment agissent-elles sur les bases?

A
  • Elles font pivoter la base altérée vers l’extérieur de la double hélice pour la placer dans leur site actif (en raison de leur structure)
  • Diffusent latéralement du côté du petit sillon de l’ADN jusqu’à ce qu’elles repèrent une lésion.
58
Q

Vrai ou faux : les ADN glycosylases sont les seules enzymes de réparation à faire pivoter leurs bases cibles.

A

Faux,

- ADN photolyase et protéine XPC

59
Q

Quelle endonucléase d’E. coli participe à la réparation BER de l’ADN? Ses deux fonctions?

A

Endonucléase III (211 a.a)

  1. ADN glycosylase reconnaissant les pyrimidines oxydées
  2. Endonucléase AP
60
Q

Fonction de l’uracile N-glycosylase?

A
  • Excise les U présents dans l’ADN (après la désamination de la cytosine) sous forme de paires U-G → U sont remplacés par C via la voie BER
  • Élimine les U qui se retrouvent dans les ADN néosynthétisés après l’incorporation de dUTP au lieu de dTTP. (U → T via la voie BER)
61
Q

Que se passerait-il si l’uracile faisait partie de l’ADN?

A

La désamination de C serait fortement mutagène (car la paire de bases mésappariées G-U n’indiquerait pas si original = G-C ou A-U) → explique pourquoi T dans l’ADN et U dans l’ARN

*** PAS POSSIBLE de distinguer les U provenant de la désamination de la cytosine des U naturellement présents

62
Q

Une glysosylase répare le mésappariement T-G. Comment la ¢ reconnaît-elle la base incorrecte?

A

Système de glycosylase assume qu’un T dans la paire T-G provient de la désamination de la 5-méthyl-cytosine et enlève sélectivement le T qui est alors remplacé par un C
*** le plus vite possible

63
Q

Que permet une ADN glycosylase reconnaissant oxoG-A?

A

Fournit un système de sécurité, car après son apparition, oxoG peut être éliminée r la voie BER avant la réplication : sinon, un A pourrait être incorrectement incorporé en face de cette base modifiée durant la réplication

64
Q

Que permet le système de réparation des mésappariements?

A
  • Élimine les bases mésappariées qui n’ont pas été enlevées par l’ADN pol pendant la réplication
  • Élimine les petites insertions/délétions (erreurs de réplication)
  • *Augmente de 100-1000x la fidélité de la réplication
65
Q

Quelle paire de bases peut être éliminée par les systèmes de réparation? Par quel système? Pourquoi les autres paires ne peuvent pas?

A
  • G-T par la voie BER (le seul qui peut éliminer une base mésappariée)
  • Autres ne peuvent pas, car les bases que les paires contiennent sont normales
66
Q

Les 2 défis du système de réparation des mésappariements?

A
  1. Détecte l’absence d’appariement entre la chaîne parentale et la chaîne-fille (sinon mutation)
  2. Excise une partie de la chaîne-fille (nt incorporé par erreur) et comble le trou résultant
67
Q

Chez E. coli, qu’est-ce qui permet de distinguer la chaîne parentale de la chaîne-fille?

A

Le profil de méthylation des séquences GATC (par la méthylase DAM) → l’état hémiméthylé de ces séquences permet de distinguer, car les résidus A de GATC de la chaîne-fille ne sont pas convertis immédiatement en 6-méthyladénine par DAM

68
Q

Comment le système de réparation des mésappariements reconnaît-il la chaîne-fille?

A

Par la méthylation → état de transition qui dure environ 2min → moment pour chercher les bases mésappariées et les corriger (état hémiméthylée de l’adénine, quand la chaîne parentale est méthylée et la nouvelle chaîne ne l’est pas)

69
Q

Comment sont faites les corrections dans le système de réparation des mésappariements?

A

Les corrections sont faites en utilisant la chaîne parentale comme matrice d’ADN

70
Q

Quelles protéines d’E. coli participent à la réparation des mésappariements?

A

MutH, MutL et MutS

71
Q

Rôle de MutS?

A
  • Reconnaît la base mésappariée et recrute MutL

- Endonucléase latente si liant spécifiquement aux GATC hémiméthylées

72
Q

Vrai ou faux : une copie de la séquence GATC est toujours présente près d’un site de mésappariement.

A

Vrai → grande fréquence dans le génome (aux 250 pb)

73
Q

Comment fonctionne le système de réparation des mésappariements?

A
  1. MutS reconnaît la base mésappariée et recrute MutL
  2. Complexe MutL + MutS s’associe avec MutH et active sa fonction endonucléase
  3. MutH coupe la chaîne-fille (non méthylée) dans GATC (brin nouvellement synthétisée) → site d’incision : 1000 nt ou +, en 5’ ou 3’
  4. Un segment de la chaîne-fille situé entre la coupure et le mésappariement est excisé et remplacé par la séquence correcte
74
Q

Vrai ou faux : l’ADN normale est + facilement courbée que l’ADN mésappariées.

A

Faux, contraire

75
Q

Qu’est-ce qui est utilisé pour enlever l’ADN simple-brin compris entre la coupure créée par MutH et le mésappariement?

A

Une exonucléase, laquelle dépend de la position du site de coupure p/r aux mésappariements

  • 5’: exo7 ou RECJ
  • 3’ : ExoI
76
Q

Chez les eucaryotes, comment se fait l’élimination des mésappariements?

A

Système similaire à celui d’E. coli mais + complexe

  • Protéines homologues de MuTS (MSH) et MutL (MLH et PMS)
  • PAS de gène homologue à mutH ni de système de méthylation
77
Q

Comment les eucaryotes différencient-ils le brin nouvellement synthétisé du brin parental?

A

Grâce aux fragments d’Okazaki du brin retardé où à l’extrémité 3’ du brin non retardé

78
Q

Chez les eucaryotes, quel est l’avantage d’avoir des protéines homologues de MutS et MutL?

A

Formation d’hétérodimères qui permettent d’intervenir de façon spécifique

79
Q

Qu’entraînent des défauts dans les gènes codant pour les protéines MHS et MLH?

A

Un plus fort taux de mutations spontanées, ce qui augmente la prédisposition à plusieurs types de cancer (HNPCC) → instabilité des microsatellites

80
Q

Chez les eucaryotes, qu’est-ce qui élimine les insertions/délétions qui apparaissent suite au dérapage de l’ADN pol lors de la réplication?

A

Un complexe spécifique (homologues de MutS et MutL)

81
Q

Que fait le système de réparation par recombinaison homologue?

A

Répare les cassures double-brin qui sont provoquées par des agents exogènes (radiations ionisantes) ou par des fourches de réplication bloquées par une lésion d’ADN

82
Q

Comment la réparation par recombinaison homologue est-elle activée?

A

Lorsqu’une copie homologue à la région de l’ADN endommagé peut être récupérée sur un chromosome nouvellement synthétisé ou en cours de synthèse (Fin de la phase S ou G2)

83
Q

Quel type de cassures peut être éliminé par le système de recombinaison homologue?

A

Seules les cassures d’ADN (sans introduire d’erreurs)

84
Q

Pour les lésions ayant causé le blocage des fourches de réplication, qu’est-ce que le système de réparation par recombinaison?

A

Une mécanisme de tolérance

85
Q

Qu’est-ce que la recombinaison homologue?

A

Échange réciproque d’information génétique entre 2 chromosomes homologues → engendre diversité génétique et donne lieu à de nouvelles combinaisons

86
Q

Qu’est-ce qui peut causer la formation de cassures bicaténaires lors de la réplication?

A

Des lésions d’ADN

87
Q

La voie de réparation des cassures bicaténaires est étroitement reliée à…?

A

À la recombinaison homologue

88
Q

Chez E. coli, quelle protéine est utilisée lors de la voie de réparation des cassures bicaténaires ?

A

RecA (eucaryotes : Rad51)

- Protéine capable de provoquer l’échange des brins frères de même polarité entre segments d’ADN homologues

89
Q

Décrit le complexe MRN, qui participe

la voie de réparation des cassures double-brin par recombinaison homologue.

A
  • Senseur → détecte les cassures double-brin et se lie à l’ADN de chaque côté
  • Contient MRE11 : se lie et peut cliver l’ADN
  • Contient RAD50 : protéine qui peut se lier aux extrémités d’ADN cassé
  • Contient NBS1 (mammifères) et Xrs2 (levure)
90
Q

Complexe MRN recrute la kinase ATM (régulateur), cela implique?

A

active son activité kinase et déclenche une cascade de phosphorylation et d’autres modifications de protéines qui conduisent à la synthèse et au recrutement de gros complexes de protéines de réparation au site de cassure.

91
Q

Que permet le système de réparation des cassures double-brin par le mécanisme NHEJ?

A

Permet de réparer les cassures double brin en réponse à l’ADN endommagée

92
Q

Dans quelles conditions intervient la voie NHEJ?

A

Quand il n’y a pas de chromosome frère pouvant servir de matrice pour la voie de recombinaison homologue (quand un chromosome non répliqué subit une cassure)

93
Q

Pourquoi dit-on que la voie NHEJ est mutagène?

A

Car même si les bonnes extrémités d’ADN sont généralement reliées ensemble, plusieurs nt sont perdus (++ effet si nt perdus dans des régions fonctionnelles)

94
Q

Chez quels organismes retrouve-t-on la voie NHEJ?

A
  • Ubiquitaire chez les eucaryotes (¢ en G1)

- Voie majeure chez les mammifères → processus de l’immunité adaptative (réarrangement d’ADN)

95
Q

Voie NHEJ : protéines qui se lie à chaque extrémité de l’ADN cassé?

A

L’hétérodimère Ku (Ku70 + Ku80)

96
Q

Comment fonctionne la voie NHEJ (étapes) ?

A
  1. Ku (K70 et K80) se lie à chaque extrémité de l’ADN cassé et recrute DNA-PKcs
  2. DNA-PKcs forme un complexe avec Artemis
  3. Artemis digère les extrémités cassées et les préparent pour la ligature
  4. Complexe (ADN ligase IV + XRCC4 et Cernunnos-XLF) ligature les extrémité cassées
97
Q

DNA-PKcs?

A

Protéine kinase

  • recrutée par Ku
  • Forme un complexe avec Artemis
98
Q

Artemis (voie NHEJ)?

A
  • Exonucléase 5’-3’ et une endonucléase latente

- Endo. activée par sa phosphorylation par DNA-PKcs

99
Q

Quand est induite la réponses SOS?

A

Induite lorsque le génome de la bactérie souffre de lésions trop nombreuses pour que les systèmes de réparation constitutifs puissent les corriger → exposition aux UV ou agents alkylants, ou inhibition de l’ADN

100
Q

Comment est l’ADN lorsque la réponse SOS est induite?

A

Plusieurs régions de l’ADN sont sous forme simple-brin dû au blocage des fourches de réplication → régions simple-brin sont celles qui déclenchent la réponse SOS

101
Q

Quel avantage procure la réponse SOS à la cellule?

A

Fournit les polymérases translésionnelles (pol IV et pol V) qui permettront à la ¢ de répliquer son ADN même si les brins matrice contiennent des sites AP ou autre chose qui retarde le complexe de réplication

102
Q

Pourquoi les polymérases translésionnelles peuvent elles accommoder, dans leur site actif, des nt qui porte des modifications substentielles?

A

Car leur site actif est plus ouvert et plus flexible que celui des réplicases

103
Q

Que se passe-t-il suite à la réponse SOS?

A

La bactérie cesse de se diviser et les protéines codées par 45 gènes font leur apparition ou sont synthétisées en plus grande quantité → protéines de réparation des lésions d’ADN

104
Q

Qu’est-ce que pol V?

A
  • complexe formé de 1x UmuC et 2x UmuD
  • Pol capable de répliquer l’ADN en face d’un dimère de pyrimidines même si la lecture du brin lésé est impossible.
  • Ajoute des nt de manière indépendante de l’appariement des bases

-

105
Q

Rôles de RecA dans la voie SOS?

A
  • Participe à la réparation des cassures double-brins par recombinaison homologue
  • Senseur : se lie aux régions d’ADN simple-brin près des fourches bloquées → déclenche réponse SOS → activité co-protéase latente est stimulée → clivage de UmuD
  • Recombinaison génétique
106
Q

À quoi conduit la liaison de RecA aux régions d’ADN simple-brin?

A

À la formation d’un filament de nucléoprotéines

107
Q

Pol V n’est pas fidèle. Explique.

A

Pol translésionnelle peut copier une matrice d’ADN qui possède des lésions → mais peu fidèle car pas d’activité exonucléase 3’-5’ → bases incorrectes sont insérées → 100-1000x + d’erreurs que les réplicases

108
Q

Comment se fait la synthèse de l’ADN par les polymérases translésionnelles chez les bactéries?

A
  1. Pol III rencontre lésion sur la matrice → se dissocie et est remplacée par une ADN pol translésionnelle
  2. Pol IV ou V : faible processivité, ajoute quelques nt devant le dimère et BYE BYE
  3. Pol III is back
109
Q

Comment est recrutée la pol translésionnelle?

A

L’anneau B pourrait jouer un rôle → pol V peut interagir avec cet anneau

110
Q

La voie SOS est un processus mutagène qui permet à la cellule d’échapper à la mort. Explique.

A
  • Last chance des bactéries qui ont +++ lésions

- PRIX à payer : taux de mutations ++++ → transmises aux générations futures car pas la possibilité de les corriger

111
Q

Rôle du système SOS dans la mutagénèse?

A
  • Bactéries sans SOS : - de mutations induites par les UV et les agents mutagènes

→ Mutations produites en traitant les bactéries aux IV sont causées par le système SOS (pol translésionnelles)

112
Q

Principale cible de la co-protéase RecA? Comment?

A
  • LexA, un répresseur de 43 gènes impliqués dans la réparation et le contrôle de la division cellulaire
  • L’activité co-protéase de RecA stimule l’autoprotéolyse de LexA, ce qui provoque la synthèse des protéines SOS
113
Q

où se lie la protéine LexA?

A

Près du promoteur de chaque unité de transcription → en amont du gène RecA

114
Q

La réponse à l’ADN endommagé chez les eucaryotes (DDR)?

A
  • ADN pol translésionnelles sont synthétisées
  • Pol êta ajoute des nt en face des dimères de pyrimidines
  • Pol iota et dzêta fonctionnent ensemble pour répliquer des matrices contenant des sites AP ou des dimères de pyrimidines
115
Q

Que requiert la réponse à l’ADN endommagé (DDR) chez les eucaryotes?

A

Un senseur, un régulateur, un médiateur et des effecteurs

116
Q

Ce qui indique la présence d’ADN endommagé?

A

Régions d’ADN simple-brin ou des cassures double brin → réponse DDR est stimulée par la liaison de protéines senseurs

117
Q

Protéines senseurs de la voie DDR? Que font les senseurs?

A

RPA ou MRN

  • Stimule la réponse DDR
118
Q

Vrai ou faux : les senseurs de la voie DDR agissent au niveau de la régulation transcriptionnelle des gènes de réparation.

A

Faux : recrutent des protéines kinases régulatrices (ATM ou ATR) qui coordonnent une réponse plus complexe.

119
Q

Rôles des kinases régulatrices dans la voie DDR?

A

Phosphorylent et activent les médiateurs

  • Médiateurs phospho. recrutent effecteurs
  • Contrôlent le cycle cellulaire
  • Entraînent l’apoptose
120
Q

Rôle de l’ubiquitine?

A

Marque les protéines qui doivent être dégradées.

Génétique moléculaire II (10 decks)

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