2.5 : la réparation de l'ADN Flashcards
Quels sont les différents types de dommage que peut subir l’ADN (causes des mutations)?
- Facteurs environnementaux (radiations UV et ionisantes) et agents mutagènes
- Métabolisme oxydatif qui génère des espèces d’oxygène réactives (radicaux)
- Réactions spontanées via l’action de l’eau (dépurination et désamination)
Une erreur de réplication peut donner lieu à?
À une paire de bases mésappariées → mutation d’insertion/délétion
Les mutations d’insertion/délétion affectent quoi en particulier? Pourquoi?
Les régions contenant de courtes séquences répétées (microsatellites)
- La machinerie de réplication a de la difficulté à à répliquer ces segments répétés → elle glisse sur ces régions : augmente ou diminue le nombre de séquences répétées (replication slippage)
Chez l’homme, de quoi est responsable le replication slippage?
De plusieurs maladies neurodégénératives qui se caractérisent par l’expansion d’une répétition de trinucléotides
Que provoquent les rayons UV dans l’ADN? Conséquence?
La formation d’un dimère de pyrimidines (souvent thymines)
- Dimère déforme la double hélice → elle ne peut plus servir de matrice pour la réplication et la transcription
Combien de produits génèrent les rayons UV?
2 types : un avec un cycle cyclobutane et l’autre avec un seul lien covalent entre les 2 pyrimidines
Que font les radiations ionisante (rayons X et gamma) dans l’ADN?
Peuvent causer des cassures double-brin dans l’ADN en s’attaquant au désoxyribose ou en générant des ROS (qui réagissent avec le désoxyribose)
Que se passe-t-il si les extrémités associées aux cassures double-brin ne sont pas reliées correctement?
Il en résulte des réarrangements chromosomiques et des translocations (les ¢ ont besoin de chromosomes intacts pour répliquer leur ADN)
Vrai ou faux :
Il est possible d’utiliser les radiations ionisantes pour tuer rapidement les cellules cancéreuses.
Vrai,
Certains agents chimio thérapeutiques comme la bléomycine causent des cassures double-brin dans l’ADN
Qu’est-ce que l’oxoG?
Base mutagène qui peut s’apparier à A et C
- générée par la réaction d’oxydation de la guanine de la position 8 suite à l’attaque par des ROS
Que se passe-t-il si l’oxoG s’apparie avec l’adénine au lieu de la cytosine?
Une transversion G-C→T-A apparaît. L’une des mutations les plus communes chez les cancers humains
Que peut provoquer l’alkylation d’une base?
Une distorsion de l’hélice d’ADN et inhiber la réplication de l’ADN
Explique comment l’ADN peut être endommagée par des réactions d’hydrolyse spontanées
- La désamination de la cytosine génère l’uracile
- La dépurination via l’hydrolyse du lien N-glycosidique produit un site abasique
- La désamination de la 5-méthylcytosine génère une base naturelle (thymine) au lieu de l’uracil
Qu’est-ce qu’un site abasique? Causé par quoi?
Un désoxyribose sans base → produit par l’hydrolyse du lien N-glycosidique
Qu’est est la conséquence d’une dépurination?
Bloque la réplication → car remplacement de bases
Les 4 systèmes de réparation de l’ADN?
- Système de réparation directe (enzyme suicide → brise ponts cyclo-butane)
- Système de réparation par excision
- De nucléotides (NER)
- De bases (BER) - Système de réparation de bases mésappariées
- Système de réparation par recombinaison → système de réparation de cassures bicaténaires
Différence entre systèmes de réparation par excision de nucléotides et excision de bases?
- Nucléotides : excisent un segment d’ADN contenant la/les bases altérées et synthétisent un nouveau segment
- Bases : seule la base altérée est excisée, le squelette sucre-phosphate est intact
E. coli → système de réparation qui est sujet à des erreurs?
Système de réparation induit par la réponse SOS
- Utilise une ADN polymérase qui ne fait pas partie de la machinerie de réplication normale pour répliquer le site d’ADN endommagé
- ADN translésionnelle ou de contournement
Système de réparation “autre” des eucaryotes?
- Utilisation d’ADN polymérases distinctes pour répliquer les sites d’ADN endommagé (DDR : DNA damage response)
- Réparation des cassures double-brin par le mécanisme NHEJ (“non-homologous end-joining”
Vrai ou faux :
Le génome humain possède peu de gènes de réparation.
Faux
Les systèmes de réparation directe?
- Voie mineure
- Agissent directement sur les nucléotides endommagés (par les UV/agents alkylants)
- Convertissent les nt endommagés à leur structure originale → utilisent une seule enzyme
Vrai ou faux :
Systèmes de réparation directe peuvent éliminent les dimères de pyrimidine et les groupements alkyles
Vrai
Qu’est-ce que la photoréactivation?
- Réparation de l’ADN dépendante de la lumière (300-500nm) → ADN photolyase
- Répandu chez plusieurs organismes mais absente chez l’homme
Fonctionnement de l’ADN photolyase?
- Pas besoin de lumière pour reconnaître un dimère de pyrimidines et s’y lier
- *Capte l’énergie lumineuse
- Besoin de lumière pour cliver