1.2 : L'ARNt et son amino-acylation Flashcards
Hypothèse de l’adaptateur (Crick) : la traduction se fait pas l’intermédiaire de ____________________?
Molécules adaptatrice, possiblement des ARN (ARNt). Elles portent un l’anticodon et un acide aminé.
Quelle est la structure primaire et la structure secondaire des ARNt?
- 10 des 76 bases sont des bases modifiées.
- Structure secondaire en feuille de trèfle (universel)
VRAI OU FAUX : la base adjacente au nucléotide 3’ de l’anticodon n’est pas toujours modifiée. Explique
Faux, elle est toujours modifiée (universellement conservée).
- Ceci assure la fidélité de la reconnaissance du codon et de l’anticodon, donc augmente fidélité de la traduction en renforçant l’appariement des bases de l’anticodon et au codon.
Jusqu’à ___% des bases peuvent être modifiées post-transcriptionnellement.
25%
VRAI OU FAUX : les bases modifiées sont indispensables pour la fonction de l’ARNt.
Faux, aucune n’est indispensable.
VRAI OU FAUX : Les mutants incapables de fabriquer certaines bases modifiées ont des vitesses de croissance réduites.
VRAI, bases modifiées augmenteraient la fonction des ARNt.
Pourquoi la structure tertiaire des ARNt nécessite-t-elle un compactage?
Puisque le ribosome doit acquérir 3 ARNt côtes à côtes → il faut donc rendre le ribosome beaucoup plus compacte pour permettre cette acquisition.
La structure complexe de l’ARNt est stabilisée par _________ et des _________.
Par des liaisons hydrogènes (non classiques) et des interactions de compactage.
** Aussi stabilisée par des liens H entre bases et des groupements phosphate ou les groupe 2’-OH des riboses.
Liaisons H : combien d’appariements de bases sont responsables de la structure tertiaire de l’ARNt? Sont-ils tous Watson-Crick?
9 appariements de bases.
Tous, sauf un, ne sont pas de type W-C (le seul W-C est G et C)
Nomme les 3 parties de la structure secondaire (forme de trèfle) des ARNt.
- Tige acceptrice
- Bras accepteurs (D-loop, U-loop, Anticodon loop)
- Bras variable
Quelle forme a la structure tertiaire de l’ARNt?
Une forme de L
Combien de bases participent à des interactions de compactage?
71 des 76 (empilement des bases)
VRAI OU FAUX : la majorité des bases sont accessibles au solvant.
Faux, la majorité ne sont pas accessibles. Par contre, les bases de l’anticodon et les bases CCA à l’extrémité 3’ font partie des exceptions.
Quelle est la fonction des aaRS (aminoacyl-ARNt synthétases)?
- Liaison de l’aa à l’ARNt correspondant (par covalence)
- Charge les ARNt de leur a.a correspondant en formant un lien ester entre a.a et ARNt
- Spécifie l’a.a et pas l’ARNt donc il existe 20 synthétases.10 synthétases par classe.
- *Exception: quelques procaryotes utilisent la même aaRS pour charger l’ARNtGln et l’ARNtGlu avec le glutamate.
Comment les acides aminés sont-ils chargés (activés)? Comment l’énergie est-elle stockée?
attachement d’un a.a à l’adénosine de l’extrémité 3’ via un lien acyle de haute énergie.1
- a.a attaché = ARNt chargé
- Pas d’a.a = ARNt pas chargé
- Énergie stockée sous la forme d’un lien ester
La réaction d’aminoacétylation se fait en ___ étapes et nécessite ________. Nomme les étapes.
2 étapes, de l'ATP 1. Activation de l'a.a (Adénylalation avec l'ATP) 2. Formation de l'aminoacyl-ARNt →Aminoacyl-AMP + ARNt → Devient Aminoacyl-ARNt + AMP
Nomme les 3 composantes nécessaires à la reconnaissance d’un ARNt par un aaRS.
ARNt, acide aminé et ATP. Les 3 doivent être reconnus (concordance) afin d’assurer la fidélité de la traduction → sinon protéines qui ne font pas de sens.
Le chargement des ARNt se fait via une attaque _______ sur le groupement ______. Un lien de _____________ sert dans tout le processus.
- Nucléophile
- Carboxyle
- Haute énergie
Les aaRS montrent de fortes différences au niveau de leur structure et séquence primaire. Qu’est-ce que cela indique?
Cela indique leur ancienneté. Suggère que les aaRS sont apparues avant le développement de la machinerie de synthèse protéique.
VRAI OU FAUX : les aaRS forment deux familles apparentées, chacune comptant 10 membres.
FAUX, 2 familles non-apparentées de 10 membres.
Quelles sont les difficultés auxquelles doivent faire face les aaRS?
- Doivent reconnaître les bons ARNt pour un acide aminé particulier.
- Doivent charger tous les ARNt iso-accepteurs avec l’acide aminé approprié.