1.1 : le code génétique Flashcards

1
Q

La traduction est la biosynthèse des polypeptides dirigées par …….?

A

L’ARNm

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2
Q

À quoi sert le code génétique?

A

À établir la correspondance entre les groupes de bases (codons) dans les acides nucléiques (ARNm) et les a.a dans les polypeptides.

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3
Q

Combiens de bases doivent contenir les codons pour spécifier les 20 acides aminés?

A

3 bases → 64 codons différents (4x4x4), un excès de 44 codons → code génétique dégénéré.

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4
Q

Donne les 3 arrangements possibles des codons composés de 3 bases.

A
  1. Codons contigus (rien de spécial, 5’ → 3’)
  2. Codons chevauchants (on réutilise la dernière base du codon précédent pour partir le codon suivant).
  3. Codons séparés par une/plusieurs bases (Base qui sert de séparation/virgule).
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5
Q

Donne les 3 caractéristiques du code génétique.

A
  1. Code à triplets (codon = groupe de 3 bases, 3 bases = minimum requis pour spécifier tous les a.a, 64 codons possibles)
  2. Code dégénéré (plus d’un codon peut spécifier un a.a)
  3. Code non-chevauchant et sans virgules (aucune base ne sépare 2 codons successifs)
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6
Q

Quelles expériences ont permis de décrypter le code génétique?

A
  1. Mutagénèse chimique
  2. Les codons sont des triplets
  3. Décryptage du code génétique
  4. Analyse de la structure du code
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7
Q

Nomme les deux types de mutations.

A
  • Mutations ponctuelles (substitution d’une seule pb, mutations les plus faciles à obtenir)
  • Mutations par insertion/délétion d’une ou plusieurs pb (beaucoup plus complexes car changement majeur au niveau des bases).
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8
Q

Nomme les deux types de mutations ponctuelles.

A
  • Transitions (purine R → R ou pyrimidine Y → Y)

- Transversions (R → Y ou Y → R)

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9
Q

Nomme les purines.

Nomme les pyrimidines.

A
  • Purines : A ou G

- Pyrimidines : C ou T (U)

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10
Q

Nomme les deux façons dont les mutations ponctuelles sont obtenues par des bases modifiées.

A
  • Suite à un traitement avec des analogues de bases (ajouter des nucléotides synthétiques à un milieu → les bactéries s’approprient l’ADN et le code génétique est modifiée). Ex : 5BU ou 2AP
  • Suite à un traitement par des agents modifiant chimiquement certaines bases (pénètrent la cellule et modifient le matériel génétique).
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11
Q

Les analogues de bases 5BU et 2AP causent…?

A

Des transitions.

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12
Q

Dans la forme énol, 5BU (U) (analogue de T) s’apparie avec …? 2AP (analogue de A) peut s’apparier avec un ….? Tous les deux causent les transitions…..?

A

Sous forme céto : s’apparie à un A
Sous forme énol : s’apparie à un G au lieu d’un A → G au lieu d’un A dans le brin d’ARN produit.
- C
- A;T → G;T (si introduit sous forme céto) et G;C → A;T (si introduit sous forme énol) Après 3 rondes de réplication

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13
Q

Nomme 2 composés qui induisent des transitions dans les mutations ponctuelles, mais qui ne sont pas des analogues de bases.

A
  • L’acide nitreux (HNO2) → provoque désamination oxydative (groupe amino est perdu)
  • L’hydroxylamine (NH2OH) → réaction d’hydroxylation
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14
Q

Quel type d’agents provoquent souvent des transversions? Lesquelles sont les plus fréquemment utilisés?

A

Les agents alkylants. Ils agissent sur l’ADN chimiquement, mais ne jouent pas au niveau de l’appariement des bases.
- Le diméthyl sulfate et l’éthylnitrosurée.

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15
Q

Les mutations par insertion/délétion sont causées par …..? À quoi conduisent-elles? Qu’ont permis de montrer ces mutations?

A
  • Des agents intercalants (EtBr, proflavine…).
  • Conduisent à des déphasage du cadre de lecture.
  • Ont permis de démontrer que les codons sont des triplets.
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16
Q

Décrit le fonctionnement des agents intercalants.

A

Ce sont des molécules fortement aromatiques qui ont une structure planaire. Ces molécules peuvent s’intégrer dans l’ADN (entre les bases) et étirer la structure normale de celle-ci. Il y a ensuit ajout ou délétion d’une base lors de la réplication de l’ADN.

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17
Q

Comment a-t-il été démontré que les codons sont des triplets?

A
  • Crick et Brenner ont fait l’analyse génétique de mutants (révertants) induits dans le gène rIIB du phage T4 (E. coli) suite à un traitement à la proflavine.
  • Phénotype mutant original (FCO) → ajout de suppresseurs intrageniques
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18
Q

Vrai ou faux : les mutations paires sont différentes des mutations impaires.

A

Vrai. Paire = ajout d’une base, impaire = délétion d’une base → les deux mènent au déphasage du cadre de lecture.

19
Q

Décrit l’expérience de Crick et Brenner.

A
  1. Isolement des mutants (p.12)
  2. Analyse de la séries de mutants → construire et analyser des recombinants portant différentes combinaisons de mutations dans le but de récupérer le phénotype original.
20
Q

Qu’est-ce qu’un suppresseur intragénique?

A

C’est une mutation qui est introduit à un site voisin de la mutation originale, ce qui permet de rétablir le cadre de lecture original (de la protéine rIIB). En d’autres mots, c’est une 2ième mutation qui neutralise la première pour contrebalancer. Il y a donc 2 mutations dans le gène.

21
Q

Quel est le résultat le plus critique de l’expérience de Crick et Brenner?

A

Les recombinants avec 3 mutations + ou 3 mutations - ont tous le phénotype sauvage (3 annule le dephasage du cadre de lecture). Ce résultat appuie l’hypothèse que chaque codon contient 3 bases, que le code génétique n’a pas de virgule et que presque tous les 64 triplets codent pour un a.a.

22
Q

Mécanisme de la traduction : Les ARNm se lient spécifiquement à des ______ porteurs chacun d’un a.a correspondant.

A

ARNt

23
Q

Un anticodon s’apparie avec un ____________?

A

Codon correspondant.

24
Q

Lors de la traduction, l’ARNm s’associe au ribosome et chaque codon , tour à tour, se lie à son ________.

A

ARNt chargé.

25
Q

Lors de la traduction, qu’est-ce qui assure la formation des liens peptidiques?

A

Le ribosome.

26
Q

Qui a démontré que UUU spécifie Phe? Comment?

A
  • Nirenberg et Matthaei en 1961.
  • En traduisant des homopolymères (synthétisés par la polynucléotide phosphorylase) in vitro et en déterminant lequel des 20 a.a est incorporé dans les protéines → permet de produire des ARNm synthétiques et de prouver que l’addition de poly(U) à un système protéique acellulaire ne stimule que la synthèse de poly(Phe).
27
Q

AAA spécifie ____ et CCC spécifie ____.

A
  • Lys

- Pro

28
Q

La traduction in vitro d’ARN synthétiques (contenant 2 ou 3 nt dans un ordre aléatoire et dans des proportions différentes) a permis de démontrer que ….?

A
  • Permis de démontrer la composition en bases de plusieurs codons mais pas les séquences.
  • Permis de démontrer que le code génétique est dégénéré.
29
Q

L’incorporation de la leucine dans un polypeptide est dirigé par….?

A
  • poly(UA)
  • poly(UC)
  • poly(UG)
30
Q

Le code génétique a été élucidé par deux choses. Lesquelles?

A
  1. L’utilisation de polyribonucléotides de séquences connues.
  2. Mesures de liaison de triplets.
31
Q

Qu’a démontrer l’utilisation de polyribonucléotides de séquences connues?

A

Que des séquences alternatives de 3 nt, comme le poly(UAC), spécifient 3 polypeptides différents. Ceci est possible car l’ARNm peut être lu dans chacun des 3 cadres de lecture possibles (si pas de codons d’initiation).

32
Q

Qu’ont démontré les mesures de liaison de triplets?

A

Qu’en l’absence de GTP, un trinucléotide s’attachera au ribosome si l’ARNt chargé approprié est présent.

33
Q

Nomme les 3 codons d’arrêts (codons non-sens).

A

UAG, UAA et UGA

34
Q

Combien y-a-t ‘il de codons spécifiques pour la leucine?

A

6

35
Q

Donne les noms des trois codons d’arrêts.

A
  • UAG : codon ambre
  • UAA : codon ocre
  • UGA : codon opale
36
Q

Nomme les 2 codons d’initiation de la chaîne.

A
  • AUG (le plus fréquent)
  • GUG
  • Ils peuvent aussi être présents à l’intérieur des régions codantes des gènes où ils spécifient Met (AUG) et Val (GUG).
37
Q

Lorsqu’ils servent de signaux d’initiation, AUG et GUG sont reconnus par des ____ différents de ceux reconnaissant les codons internes.

A

ARNt → ARNt initiateurs

38
Q

Tous les a.a, sauf ___ et ____, sont spécifiés par plus d’un codon.

A

Met et Trp.

39
Q

Que sont des codons synonymes?

A

Codons spécifiant un même a.a

40
Q

Vrai ou faux : le code génétique n’est pas le fruit du hasard.

A

Vrai

41
Q

Vrai ou faux : La plupart des codons synonymes ne diffèrent que par leur 2ième nt.

A

Faux, ne diffèrent que par leur 3ième.

42
Q

Vrai ou faux : Les codons différant à la 1ière position tendent à spécifier des a.a semblables (au niveau chimique).

A

Vrai

43
Q

Vrai ou faux : poly (G) peut être utilisé comme ARNm.

A

Faux, ne peut pas car forme des hélices triples qui ne s’attachent pas aux ribosomes.

44
Q

Que voulait montrer Nirenberg et Matthaei? Comment?

A
  • Quelles bases de l’ARNm codent pour quels a.a

- addition d’une ARNm poly-A dans 20 tubes contenant les 20 a.a : seule protéine formée était dans le tube de la Phe