ביוכימיה 2 רשף Flashcards
? counter regulators מי הם
שכן הם מבצעות פעולות הפוכות לאינסולין Counter regulators קיימים הורמונים קטבוליים ביניהם ניתן למצוא
אדרנלין, נוראדרנלין, קורטיזול
מבצעים פעולות פירוק הפוכות לפעולות האינסולין
?מאיזה בלוטה מופרש אדרנלין=אפינפרין
?האם אינסולין משפיע על המוח
?אם לא על מה הוא משפיע
?האם אינסולין הוא מבנה רבעוני
? דומה אצל A שרשרת
? באינסולין דומה אצל B שרשרת
אדרנלין=אפינפרין - מופרש מבלוטת יותר הכליה עובד על שריר
( אינסולין לא עובד על המוח (משפיע על הכבד והשריר
SS אינסולין מיוצר משרשרת אחת ולכן לא רבעוני. השרשרת הפוליפפטידית יוצרת קשרי
מופרש מחוץ לתאים C ואז עוברת ביקוע פפטיד
- A שרשרת
היא זהה אצל בני אדם, חזירים, כלבים, לווייתנים
-B שרשרת
חזירים, פרות, כלבים, כבשים וסוסים
?סוכזור בצמחים משמש
? למה משמשים ביוסינתזה של פולימרים סוכריים
כחומר תשמורת כמו גליקוגן ואמילן אצלינו
ביוסינתזה של פולימרים סוכריים המשמשים לתפקידים מבניים, הגנתיים, תקשורתיים
חמצון במסלול הפנטוזות אשר בהמשך יניב יצירה של ריבוז הדרוש לאבני הבניין של הדנ”א והרנ”א
?איך נראים נשאי אלקטרונים
פתח תמונה
אנזימים הגליקוליזה
פוספו-פרוקטו-קינאז1
אלדולאז
גליצר-אלדהיד-3-פוספאט-דה-הידרוגנאז
פוספו-גליצראט-קינאז
פוספו-גליצראט-מוטאז
אנולאז
פירובאט קינאז
?ספר על האנזימים האלה
במהלך הגליקוליזה לא נפלט פחמן דו חמצני
תהליכים רציפרוקלים, כלומר באופן עקרוני לא אמורים להתרחש בו זמנית למרות שתמיד יש גם וגם גליקוליזה וגלוקונאוגנזה
פוספו-פרוקטו-קינאז1
חיידקים רבים וכל הצמחים מבצעים ריאקציה אחרת – הקבוצה התורמת פופסאט היא פירו-
ATP פוספט ולא
אלדולאז
ישנם שני סוגים של אלדולאזות: _סוג 1-_קיים ביונקים ובצמחים מבצע מנגנון צ’יף בייס
סוג 2: קיים בפטריות ובחיידקים ,נעזר ביון אבץ לצורך מנגנון צ’יף בייס עליו נרחיב במצגת ביוכימיה ד
בתנאים סטנדרטיים הריאקציה איננה ספונטנית , בתנאים פיזיולוגיים ההפרש באנרגיה החופשית קרוב ל 0
גליצר-אלדהיד-3-פוספאט-דה-הידרוגנאז
שלב 1: אנזים המזרז חמצון של גליצראלדהיד ליצירת החומצה גליצראט:
בשלב השני האנרגיה המתקבל מתהליך החמצון מנוצלת. לחיבור של קבוצת פוספאט
חופשי מהתמיסה - לפחמן הקרבוקסילי החדש שזה עתה נוצר.
הקבוצה הקרבוקסילית המחוברת לקבוצת הפוספוריל מכונה אציל-פוספאט - מצב מאוד אנרגטי שהידרוליזה פשוטה שלו מניבה המון אנרגיה. האנרגיה ליצירתו נעוצה בתהליך החמצון שיצר
אותה.
פוספו-גליצראט-קינאז
זהו הקינאז השלישי שאנחנו נתקלים בו. הוא מזרז מעבר של קבוצת פוספאט
מפחמן 1 (הקרבוקסילי) של 1,3 ביס-פוספו-גליצראט ל ADP ליצירת .ATP
על אף שהוא קינאז, מדובר בריאקציה שהיא הפיכה בתנאים פיזיולוגיים
השם של האנזים ניתן דווקא על הריאקציה לכיוון ההפוך (תהליך חשוב ביותר באסימלציה של
פחמן דו חמצני בזמן פוטוסינתזה
פוספו-גליצראט-מוטאז
הריאקציה נעשית בשני שלבים, כאשר השלב הראשון כולל זרחון של פחמן מס’ 2 ליצירת תוצר
ביניים הדרוש כמויות קטנות (ואנחנו מכירים אותו כמעכב של המוגלובין
2,3 BPG
אנולאז – אנזים המזרז ריאקציה של דה-הידרציה ליצירת קשר כפול בין פחמן 2 ל- 3 בגליצראט
פירובאט קינאז משתמשים ביון אשלגן + מגנזיום
ADP על אף הזרחון של ה
הריאקציה עדיין בלתי הפיכה בתנאים פיזיולוגיים בשל האנרגיה הרבה המשתחררת מהטאוטומריזציה.
תסיסה לקטית
?מי האנזימים והקופקטורים שמשתתפים
?האם יש תסיסה לקטית באריתרוציטים
?למה נועד הלקטאט
תסיסה לקטית בבני אדם תאי שריר הם ממש תאים מומחים בביצוע תסיסה לקטית, ובאריטרוציטים, שהם חסרי גרעין ומיטוכונדריה, תסיסה לקטית היא תהליך מחייב על מנת
לשמור על המשכיות הגליקוליזה.
ללקטאט דהידרוגנאז יש איזואנזימים רבים (5) בכבד בשריר וברקמות נוספות.
הלקטאט המיוצר ברקמות יכול לעבור מחזור – הוא עובר דרך זרם הדם, מגיע לכבד ומשמש
כחומר מוצא נהדר ליצירה של גלוקוז אשר יכול להזין את השריר בזמן פעילות מאומצת
\עובדה מעניינת היא שלפחמנים של לקטאט ולפחמנים של גלוקוז יש את אותו מספר החמצון וגם היחס פחמנים : מימנים : חמצנים נשאר זהה לשל גלוקוז.
?מהי תסיסה כהלית
?מי האנזימים המעורבים בתהליך
?מהו התוצר הסופי
תסיסה כהלית
תסיסה כהלית היא תהליך המבוצע בשמרים ובמיקרואורגניזמים
-שלב אחד
השלב ראשון מזורז על ידי האנזים פירובאט דה-קרבוקסילאז (הנעזר ביון מגנזיום
כתוצאה מכך מפלט פחמן דו חמצני TPP וקו אנזים
השלב השני
האנזים אלכוהול דה-הידרוגנאז מזרז חיזור של אצלדהיד על הפחמן הקרבונילי עם אלקטרונים שמקורם NADH המומר בחזרה ל- +.NAD
האנזים אלכוהול דה-הידרוגנאז הוא אנזים הקיים גם בחולייתנים. אצלנו הוא משמש לתהליך של חמצון חומצות שומן – חמצון הקרוי חמצון אומגה. עם זאת, שימוש עיקרי הוא לקחת אתנול הנצרך על ידינו (או מיוצר על ידי מיקרואורגניזמים) ולחמצן אותו ליצירת אצטלדהיד (חומר מוצא
נהדר ליצירת חומצות שומן
גבינה שוויצרית – החיידק פרופיונבקטריום יוצר במהלך התסיסה חומצה פרופיונית ופחמן דו חמצני. הפחמן הדו חמצני אחראי ליצור את החורים בגבינה.
אלכוהול הוא אחד החומרים הכי משמינים , אתנול הופך לאצטאלדהיד שיהפוך
וממנו ייצרו חומצות שומן A לאצטיל קו
אצטאלדהיד היא מולקולה שומנית השוקעת בכבד ואז נקבל כבד שומני
איך אלכוהול משפיע על רמות של גלוקוז
כאשר שותים הרבה אלכוהול זה גורם לירידה של ריכוז הגלוקוז בדם
הסיבה לכך שכאשר שותים אלכוהול אז אתנול הופך לאצטאלדהיד וביחד עם זה מיוצר
ולכן כאשר הגוף נמצא במצב רעב הוא רוצה לקחת לקטאט להעביר אותו NADH
לפירובט ומשם גלוקונאוגנזה אבל הוא זקוק ל
מכיוון שהגוף בזבז את כל NAD+ אבל אין לגוף NAD+
כידי להפוך אתנול לאצטאלדהיד NAD+ המולקולות כ
שתיתת אלכוהול גורמת להיפוגלקמיה לא יהיה מספיק סוכר בדם
?HIF מהו פקטור
(פקטור שעתוק)HIF-1 -hypoxia-induced transcription factor
אחראי להגברת שעתוק של לפחות 8 אנזימים גליקוליטים ושל גלוקוז טראנספורטרים
VEGF – אשר גורם ליצירת כלי דם מסביב לגידול
FDG הזרקת גלוקוז המסומן בפלואור רדיאוקטיבי
הנטייה של גידולים לצרוך כמות מוגברת של גלוקוז משמשת לא רק לטיפול אלא גם לאבחון. אם מזריקים למטופלים גלוקוז המסומן בפלואור רדיואקטיבי
FDG
הוא ייקלט ברקמות ובאזורים בהם יש צריכה מוגברת
של גלוקוז – כמו מוח וכליות. אם למשל נראה קליטה מוגברת בעצמות – נדע כי יש שם תהליך שקולט גלוקוז –זו כנראה גרורה. לבדיקה הזו קוראים pet-CT (תמונה ימנית
נציין ש
אינו יכול לעבור איזומרציה על ידי פוספוהקסואיזומראז ולכן מצטבר בתאים במצב של FDG
מזורחן FDG
?האם נכון לומר שמבנה קויל-קויל מורכב מחלבונים סיביים בלבד
על אף שרבים הם החלבונים הסיביים שבנויים במבנה קויל קויל , לא רק חלבונים סיביים עשויים ממבנה זה . כך למשל החלבון דינאמין הקשור להנצת ממברנות הוא דימר הבנוי ממבנה קויל קויל ואיננו נחשב לחלבון סיבי
סיבי אקטין בעלי מבנה של חלבונים גלובולריים לא קויל קויל כך שלא כל הסיבים בנויים מקויל קויל
?איזה קסקדה מפעיל גלוקגון
?מכמה רמות משפיע הבקרה ההורמונאלית
על איזו חומצה אמינית סרין מזרחן
?האם קינאז ופוספטאז הוא אותו אנזים
?האם הם אותו אנזים
המזרחן חלבונים PKA גלוקגון מפעיל קסקדה תאית המסתיימת בשפעול של האנזים
מטבוליים על גבי שיירי סרין ותריאונין
אינסולין - מפעיל קסקדה תאית המסתיימת בשפעול של אנזימים מסוג
המסיר זרחנים מהאנזימים מטבוליים PPP
מודיפיקציות קוולנטיות על אנזימים
למשל גלוקגון משפעל רצפטור מסוג
GPCR –
רצפטור זה גורם לשפעול של אנזים מפתח הקרוי
PKA
אשר יודע לזרחן מטרות רבות, ביניהן אנזימים מטבוליים. זרחון שכזה יכול להגביר או להנמיך את פעילותו של האנזים. בקרה זו היא בקרה מהירה
בקרת שעתוק
למשל אינסולין משפעל רצפטור מסוג טירוזין קינאז
RTK
רצפטור זה משפעל קסקאדות שונות שמסתיימות בהפעלת פקטורי שעתוק. חלק מפקטורי השעתוק הללו אחראים להגברת ביטוי של אנזימים מטבוליים.
השפעה על טראנספורטרים וויסות רמת הסובסטרט בתא
אינסולין יכול לשפעל תהליך של טראנספורטר של וזיקולות ואקסוציטוזה
הוא סרין תריאונין קינאז מזרחן בעיקר על סרין ובמקרה אחד על תריאונין -PKa
קינאז ופוספטאז הם לא אותו אנזים
קינאז הוא טרספראז
פוספטאז הוא הידרולאז
למה משמשים
GLUT1,GLUT2,GLUT3,GLUT4
?
?איך אינסולין מווסת את רמת הסוכר בדם
? מי אלה מיוציטים
?ומי אלה אדיפוציטים
!כל הגלוטים פה בטבלה
אינסולין מווסת את רמות הסוכר בדם על ידי כך שברגע שהוא נקשר לרצפטור
יעבור אקסוציטוזה GLUT4
AKT ובביולוגיה של התא נקרא לו PKb בתהליך המערב
GLUT4 כאשר גלוקוז נכנס לתאי שריר\שומן שעליהם מצוי
רמת גלוקוז בדם יורדת
מצוי כמעט בכל הרקמות ואחראי לשמירה על רמת גלוקוז בזאלית בתא.-GLUT1
מצוי בכבד, בלבלב באיי לנגרהאנס ובמעי הדק .
סילוק עודפי גלוקוז מהדם והכנסתם לכבד ,לבלב או מעי-GLUT2
בלבלב הוא בעל תפקיד חשוב בבקרה על רמת האינסולין לא תלוי באינסולין
בנוירונים של המוח גם לא תלוי באינסולין-GLUT3
היחיד שמגיב לאינסולין במנגנון אקסוציטוזה ומצוי בשריר ,שומן ולב-GLUT4
מיוציטים הם תאי שריר
אדיפוציטים הם תאי שומן
? משפעל AMP את מי
?ומה התוצר של השפעול משפעל
?ומה תפקידו
משפעל את האנזים AMP
AMP-K
AMP-K תפקידו:
יודע לעשות את המעבר בין “פול אנרגטי נמוך” לבין מצב רעב AMPK האנזים
גבוה מפעיל סיגנל דמוי רעב AMP מופעל בסמני אנרגיה נמוכה -AMPK
מגביר תחושת רעב
משפיע על הפרשת האינסולין מדכא הפרשת אינסולין מהלבלב
מדכא רמת האינסולין מהלבלב
מגביר צריכת שומן וגלוקוז בשריר ומגביר את הפעילות המיטוגכונדריאלית של השריר
מגביר תחושת הרעב במוח
מגביר מטבוליזם בלב
מדכא יצירת שומן וכולסטרול בכבד ובתאי שומן
? מזרז ומה הוא מעקב AMP מה
?ADP
?ATP
מזרז גליקוליזה ומעקב גלוקונאוגנזה AMP
מזרז גליקוליזה ADP
מעקב גליקוליזה ATP
?מי מעקב את הקסוקינאז 1 בשריר
?מה הבקרה על הקסוקינאז 4 בכבד
?בזמן גלוקונאוגנזה מצטבר פרוקטוז 6 פוספט מה ההשלכות
הקסוקינאז1 - מצוי בשריר ומעוכב באופן אלוסטרי על ידי התוצר שלו גלוקוז 6 פוספאט
גלוקוז 6 פוספט כאשר מצטבר בעודף מעקב באופן אלוסטרי .האפיניות בין
האתר של גלוקוז שלשם נקשר וגלוקוז 6 פוספט נמוכה יחסית ולכן צריך הרבה
גלוקוז 6 פוספט כידי לעכב
גלוקוקינאז איננו מעוכב על ידי התוצר
גבוה KM אך הוא בעל
משל הקסוקינאז 1 ולכן בזמן רעב, כאשר ריכוז הגלוקוז נמוך, פעילותו תהיה נמוכה בהרבה
וריכוז גבוה של ATP גלוקוקינאז מבוקר היטב גם ברמת השעתוק, כך שבריכוז נמוך של
או בזמן צריכה מוגברת של מזון ,AMP
ברמה גבוהה של גלוקוז בדם ובזמן כיווץ שריר (כן, זו לא טעות) –
מתבצעת הגברת שעתוק של האנזים
כאשר מתרחש תהליך גלוקונאוגנזה מצטבר פרוקטוז 6 פוספט אשר גורם
להפעלה של חלבון רגולטורי המבצע סיקווסטרינג של גלוקוקינאז בגרעין. בזמן שובע, ריכוז גבוה של גלוקוז חופשי מעכב את החלבון הרגולטורי ומאפשר לגלוקוקינאז לחזור לציטוזול שם הוא
פעיל.
? מבוקר PFK1 איך
מבוקר אלוסטרית בלבד על ידי מעכבים ואקטיבטורים כמתואר בשקף PFK1 האנזים
האנזים עצמו מורכב כהומוטטרמר ובמנגנון פעילות קואופרטיבי. מעבר לכך, לכל המעכבים והאקטבטורים הספציפיים יש לו אתר אלוסטרי ייעודי
הוא גם סובסטרט וגם מעקב ATP שימו לב
הוא גם תוצר וגם אקטיבטור ADP
F 2,6 BP היכן קיימת הבקרה ההורמונאלית של
?האם הבקרה קיימת בכבד או גם בשריר
? F 2,6 BP איך נוצר
המנגנון הבא הוא מנגנון הוא הורמונאלי המתבצע בכבד בלבד. בשריר הבקרה הזו לא קיימת ולכן כל הזמן ייצור של האקטיבטור
F2,6 BP אנזים הטאנדם מזרחן פרוקטוז 6 פוספאט ליצירת
לאנזים הטאנדם קיים ראש קטליטי נוסף המאפשר הידרוליזה של הפוספאט מפחמן 2 ליצירה של
פעילות הפוספטאז F6P
אנזים הטאנדם מבוקר בעצמו ברמה ההורמונאלית
האנזים בגרסתו בכבד יכול להיות בשני מצבים מזורחן או לא מזורחן. במצב רעב, בשפעול PKa הרצפטור של גלוקגון על תאי הכבד, יופעל האנזים המזרחן
שיזרחן מגוון רחב של אנזימים ובעצם “יודיע להם” שאנחנו במצב רעב על פי החלטת הלבלב
מזורחן PKa כאשר האנזים
הפוספטאז פעיל והקינאז לא, כך שלא רק שאנחנו מפסיקים ליצר את האקטיבטור, אנחנו גם מפרקים אותו
?כמה איזו אנזימים קימים לפירובט קינאז
?במה מיוחד איזואנזים הכבדי
מה הם מעכבים אלוסטריים של פירובט קינאז
.לאנזים פירובאט קינאז קיימים שני איזו-אנזימים כבד ושריר
M שריר L כבד
ATP , ALANINE , ACETYL CO A מעכבים אלוסטריים :
אקטיבטורים אלוסטריים
פרוקטוז 1,6 ביספוספט
תוצר של שלב מוקדם
במקרה זה שלב 3 של גליקוליזה מגביר את הפעילות של שלב מאוחר במקרה זה .10
בזמן רעבPKa רק בגירסה הכבדית פירובט קינאז יודע לעבור זרחון
ובכך לעכב גליקוליזה ולאפשר גלוקונאוגנזה
שמבצע הידרוליזה לפוספאט ומחזיר את האנזים לפעילות PP ודה זרחון ע”י
?האם המיטוכונדריה קיים בכל התאים
? מיהו האנזים A פירובט הופך לאצטיל קו
?אלו קופקטורים משתתפים
? איך קוראים לתהליך
?מה אנחנו עושים בתהליך
?מהם התוצרים
?מהם הקואנזימים
?מכמה קומפלקסים מורכב פירובט דהידרוגנאז
המיטוכונדריון הוא איברון הקיים כמעט בכל התאים היוקריוטים (להוציא למשל תאים מומחים כמו אריתרוציטים שאיבדו את המיטוכונדריה במהלך ההתבגרות שלהם
פירובאט יפגוש את הקומפלקס פירובאט דה הידרוגנאז, אשר יזרז ריאקציה מסוג “דה-קרבוקסילציה אוקסידטיבית” בשפה פשוטה :נעיף את הקרבוקסיל ונחמצן את המולקולה
התוצרים של הריאקציה
זוהי גירסה מאוקטבת של אצטאט- A אצטיל קו
פחמן דו חמצני
הקו אנזים המעורבים
,פוספו-פנטאוט ,B5 נגזרת של ויטמין , A קו אנזים
B3 נגזרת של ויטמין -NAD+
B1 נגזרת של ויטמין -TPP
ליפואט -זו היא קבוצה פרוסטטית הקשורה קוולנטית לאנזים
B2 נשא אלקטרונים נגזרת של ויטמין FAD
E1,E2,E3 הקומפלקס מורכב משלושה חלבונים
כל אחד מהאנזימים הללו מצוי בקומפלקס במספר רב של עותקים
.מכיל ביונקים 2 אתרים פעילים ובאיקולי שלושה אתרים פעילים E2 האנזים
המופרדים אחד מהשני ברצף של 20-30 ח”א עשיר באלנין ופרולין. עוד ניתן למצוא בתוך הקומפלקס – אנזים מסוג קינאז הקרוי
PDH kinase
?מיהם קשרים עתירי אנרגיה
קשר תיו אסתרי הכי עתיר באנרגיה מבין הקשרים שבתמונה
?תאר מהו ליפואט
שימו לב למצבי החמצון והחיזור השונים שלו E2 ליפואט משמאל הנעוץ על
הקשור בקשר תיואסטרי S או SH במצב מחומצן קיים שם קשר די-סולפידי במצב מחוזר או
לקבוצת אציל זוהי הקבוצה היחידה שקשורה קוולנטית לאנזים, ספציפית לחומצה אמינית ליזין בקשר אמידי עם קבוצת האפסילון-אמין שלה
לכן מדוייק יותר לכנות אותה קבוצה פרוסטטית מאשר קו-אנזים זו אינה נגזרת מויטמין כלשהו
?Thioester מה זה קבוצת
מצרף צילום קבוצות פונקציונליות
בעיקרון קשר גופרית לפחמן קרבונילי
?A ממה מורכב קו אנזים
- A קו אנזים
מימין מורכב מקבוצה של בטא-מרקפטו-אתיל-אמין המחובר לחומצה פנטונית. זוהי נגזרת של
. B5 ויטמין
SH הקבוצה החשובה פה היא קבוצתה התיול
succinyl או acetyl לשם יקשר
אשר יכולה לייצר קשר תיו-אסתרי עם קבוצת האצטיל קשר תיו-אסתרי הוא קשר עתיר אנרגיה
?A מהו תהליך שעובר פירובאט עד שהופך ל-אצטיל קו
TPP ושם עוברת תהליך המזורז על ידי E1 פירובאט נכנסת לאתר הפעיל של
וכולל דה קרבוקסילציה משתחרר פחמן דו חמצני פסולת אותה ננשוף החוצה בסופו של דבר
TPP השארית של פירובאט קרויה הידרוקסי-אתיל ונשארת קשורה ל
RATE LIMITING STEP זהו השלב האיטי ביותר בתהליך ולכן מוגדר כ
.של כל הריאקציה
מזרז חמצון של הידרוקסי אתיל ויוצר קבוצת אצתיל מהפחמן הכהלי E2 האנזים
שעובר ממצב E2 שתי האלקטרונים מתהליך החמצון מחזרים את הליפואט של
. SH מחומצן למצב מחוזר
האנרגיה המתקבלת מהחמצון משמשת ליצירת קשר תיו-אסתרי בין ליפואט לאצטיל מאבד את הקבוצה שהחזיק ובעצם ממוחזר לעבודה נוספת TPP שנשאר
בשלב השלישי מתרחשת ריאקציה מסוג טראנס-אסטריפיקציה
COA-SH או A קו אנזים A קבוצת האצטיל תעזור ליפואט ותתחבר לקו-אנזים
נותן מימן לליפואט בתמורה
כרגע האנזים מחוזר וצריך לחמצן אותו
E3 על גבי FAD מולקולת ה-
. SS משמשת לחמצון הליפואט על מנת למחזרו לקבלת ליפואט מחומצן עם קשרי
FADH2 מחוזרת ליצירת מולקולת FAD מולקולת
כידי שזו תמוחזר ותכנס למסלול נוסף FADH2 משמשת על מנת לחמצן את NAD+ מולקולת
NADH פחמן דו חמצני ,A בסופו של דבר מקבלים 3 תוצרים :אצטיל קו
…בחן את עצמך על אנזימים של מעגל קרבס
מאיזה סוג ריאקציה (הריאקציה הראשונה)?כ
?מי האנזים שעושה מעבר מציטראט לאיזוציטראט
?מה נוסף יודעים על האנזים הזה
?איך קוראים לתהליך של האנזים איזוציטראט דה הידרוגנאז ואיזה קופקטור פעיל שם
?לאנזים הזה יש 2 איזו-אנזימים מה כל אחד עושה
? דומה PDH איזו יחידה של האנזים אלפא קטו גלוטראט דהידרוגנאז ושל האנזים
?מה תפקידו של סוקסיניל קו אי סינתתאז
?איזה קשר נשבר שם
?האנזים סוקסינאט דה הידרוגנאז האם יש ברזל גופרית
?האנזים פומראז מה הוא מזרז
? איזה ריאקציה
?מה מיוחד בריאקציה הזאת
ציטראט סינתאז מזרז ריאקציה מסוג דחיסת קלייזן דחיסה של תיו-אסטר עם קטון
האנרגיה לריאקציה מגיעה מפירוק הקשר התיו-אסטרי
אקוניטאז מזרז ריאקציה הפיכה בה ציטראט מומרת לאיזוציטראט =(איזומרים מבניים,) דרך
שבאופן נורמלי ותקין איננו מתנתק מהאתר הפעיל cis-aconitase שלב ביניים הקרוי
אנזים זה מכיל קבוצת ברזל-גופרית המשמשת גם לקישור הסובסטרט לאתר הפעיל וגם ויש לה
גם תפקיד חשוב בהומאוסטאזיס של משק הברזל בתא על כך נרחיב בהמשך
איזוציטראט דה הידרוגנאז מזרז דה קרבוקסילציה אוקסידטיבית ומסלק פחמן דו חמצני מהמולקולה ליצירת אלפא-קטו-גלוטראט
.NADH שמומר ל NAD+ איזואנזים הדורש
איזואנזים זה מצוי גם במטריקס של NADPH המומר ל NADP+ איזו אנזים המשתמש ב
המשמש ככוח מחזר NADPH המיטוכונדריה וגם בציטוזול ותפקידו העיקרי לייצר
. PDH של E3 של אנזים אלפא קטוגלוטראט דה הידרוגנאז זהה ל E3 היחידה
. CoA-SH אלפא קטו גלוטראט דהידרוגנאז בזמן פעילותו של האנזים מגיע קופקטור
סוקסיניל קו איי סינתתאז מזרז ריאקציה בה נשבר הקשר
GTP התיו-אסתרי עם קו איי ומקבלים סוקסינאט עם
ביונקים יש שני איזו-אנזימים שונים, אחד לכל סוג של נוקלאוטיד
סוקסינאט דה הידרוגנאז
גם אנזים זה מכיל צברי ברזל גופרית המשמשים בין היתר לקבלה ולהעברה של אלקטרונים
האנזים מעוכב על ידי מולקולה בשם מלונאט – הדומה לסוקסינאט אך מכילה 3 פחמנים במקום 4 פחמנים.
האנזים פומראז הופך את פומראט למלאט
שימו לב למולקולת המים הנכנסת לתוך הקשר הכפול
זהו אנזים מסוג ליאז רה-ארגון לקשרים כפולים
.L-MALATE הוא מיצר רק
?מה קורה כאשר רמת הברזל יורדת
?אילו חלבונים יש בתהליך
? moonlighting מה זה
כאשר רמת הברזל בדם יורדת צבר ברזל גופרית מתנתק מאקוניטאז עניין של אפיניות
apoenzyme מה שנשאר מאקוניטאז היא גרסה לא פעילה של
mRNA יודע לזהות רצפים ספיציפיים של מולקולות apoenzyme
ויודע ובעצם להשפיע על קצב התרגום
של פריטין ושל הרצפטור לטרנספריןmRNA קושר את =apoenzyme
בנוסף אליו יש חלבון רגולטורי IRP1 האפו אנזים של אקוניטאז מקבל את השם
אך הוא חסר יכולת קטליטית IRP2 מאוד דומה במבנה של החלבון
ואינו יכול להפוך לאקוניטאז
IRE מזהים מבנים שניוניים בצורת סיכה הקרויים IRP חלבוני
mRNA המצויים בקצה 5 או בקצה 3 של מולקולת
של פריטין בקצה 5 הוא מעקב את התרגום שלו_mRNA_ נקשר ל IRP כאשר
ובכך כמות החלבון של פרטין יורדת
של הרצפטור לטראנספרין בקצה 3 הוא מייצב mRNA נקשר IRP כאשר
ובכך רמת הרצפטור תעלה mRNA ומונע פירוק של ה mRNA את מולקולת
הכוללת שינוי במבנה ותפקיד כתלות בשינו moonlighting התכונה הזאת של
בשינוי הסביבה היא תכונה הקיימת
במספר רב של אנזימים, על חלק כבר דיברנו ועל חלקם נדבר בהמשך
moonlighting דוגמאות לתכונת
פירובאט קינאז – משמש גם כפקטור שעתוק המגיב לנוכחות של הורמון הטיירואיד
_DNA uracyl glycosylaseגליצר-אלדהיד-3-פוספאט דה הידרוגנא_ז משמש גם כ
עליו נדבר בביולוגיה מולקולרית BER ויש לו חשיבות רבהבתיקון נזקי דנ”א במנגנון
H2B הוא מבקר גם שעתוק של
פוספוגליצראט קינאז,טריוז-פוספאט-איזומראז__ולקטאט דה-הידרוגנאז – הם חלק מהחלבונים המרכיבים את הקומפלקס קריסטלין שנמצא בעדשת העין
?מי אלה ריאקציות ריאקציות אנאפלורטיות
?מי אלה ריאקציות אמפיבולויות
ר_יאקציות אנאפלורטיות_ אלו הן ריאקציות המייצרות את תוצרי הבינים של מעגל החומצה הציטרית ומשמשות גם לתהליכים קטבוליים וגם לתהליכים אנאבוליים
כך למשל האנזים פירובאט קרבוקסילאז מזרז ריאקציה שכזו
שכן הוא ממיר פירובאט לאוקסאלו-אצטאט
מי אלה ריאקציות אמפיבולויות-ניצול של תוצרי הביניים
הריאקציות האמפיבוליות משמשות גם לתהליכים אנאבולים וגם לתהליכים קטבוליים. אוקסאלו-אצטאט למשל
היא פרקורסור ליצירת חומצה אמינית אספרטאט. אלפא-קטו-גלוטראט – פרקורסור ליצירת גלוטמאט
