ביוכימיה שאלות Flashcards
שאלות בנושא ביוכימיה
? מסמל PKb מה ערך גבוה או נמוך של
יותר קרוב ל-0 כך הבסיס חזק יותר PKb ככל ש
?חומצה חזקה מצריכה ריכוז גבוה של בסיס כידי למסור פרוטון
?חומצה חזקה היא חומצה שמיועדת למסירת פרוטון
?קבוע שיווי משקל של חומצה חזקה גבוה או נמוך מחומצה חלשה
הסבר בשקופית המצורפת
?האם קשר פפטידי הוא קשר יחיד מסוג סיגמא
קשר פפטידי הוא קשר יחיד מסוג סיגמא
האם אינטראקציות בין תתי היחידות מיוצבות ע”י יון ברזל
שמצויה בכל אחד מהיחידות ולא בין היחידות Heme-לא נכון ,הברזל מצוי בקבוצת ה
מכאן שלברזל אין תפקיד בייצוב המבנה הרבעוני של ההמוגלובין
האינטראקציות בין היחידות הם בעיקר הידרופוביות
הקשרים השולטים בייצוב המבנה הרבעוני הם בעיקר קשרים הידרופוביים הסיבה לכך היא שעל מנת שבסביבה המימית של התא יוכלו תת היחידות להישאר מחוברות , הן חייבות ליצור לעצמן סביבה שונה .אינטראקציות הידרופוביות מאפשרות את ההפרדה הזאת . אם האינטראקציות העיקריות היו קשרי מימן או קשרים יוניים , תת היחידות היו מתפרקות בשל מגע עם מים
אין זה אומר שלא קיימים גם קשרי מימן וקשרים יוניים , אך החשיבות שלהם היא בעיקר בייצוב המצבים השונים של חלבון כאשר הוא קושר או לא קושר חמצן
?ממה מורכב פרוטופירין ומה הוא מרכיב
. HEME פרוטופירין היא חומר מוצא ליצירת
פרוטופירין הוא חומר אורגני במבנה טבעתי
חומר מוצא לפרוטופירין היא החומצה האמינית גליצין
ארבע פרוטופירינים יוצרים קבוצת “הם” כל קבוצת “הם” קושרת ברזל
בהמוגלובין של יש 4 יחידות חלבוניות בכל אחת מיהם קבוצת “הם” וברזל
מה מעלה ומה מוריד את האפיניות לחמצן של ההמוגלובין
תשובה מצורפת
?האם לאוקסידורדוקטאזות יש פעילות משותפת עם ליאזות
אנזימים שהם אוקסידורדוקטאזות לפעמים הם בעלי פעילות משולבת עם ליאז . חלק גדול מהליאזות מזרזות ריאקציות מסוג חמצון חיזור , לכן ניתן לשייך אותם למשפחת אוקסידורדוקטאזות.
מה עושיפ הליגאזות? כ
והאם כל הליגאזות מחברות מולקולות אחת לשניה
ATP האם הליגאזות צורכות
ליגאזות היא משפחת אנזימים היוצרים קשרים קוולנטיים שונים. דנ”א ליגאז הוא אנזים ליגאז ספציפי המיועד לחיבור מולקולות דנ”א
משפחת דנ”א ליגאז וסינתתאז הם דוגמאות לכך ATP ליגאזות בד”כ מנצלות
?לאיזו משפחה דהידרוגנאזות שייכות
דהידרוגנאזות שייכות למשפחת הליאזות וגם למשפחת האוקסידורדוקטאזות
?מה מתאר טריאדה קטליטית
פתח קובץ
?אנזימים הטרוטרופיים , מה גורם האקטיבטור
אנזימים הטרוטרופיים , האקטיבטור גורם לגרף להפוך ליותר היפרבולי
?היכן מיוצר אדרנלין
אדרנלין הוא הורמון קטבולי המיוצר בבלוטת האדרנל ולא בלבלב
?בתסיסה כוהלית NADH למה נועד שימוש ב
תפתח תמונה
?מה התהליך שהלבלב מרגיש את הגלוקוז בדם
?מה מתרחש בתא
המכניס גלוקוז לתוך תאי הבטא GLUT2 בלבלב ישנו טרנספורטר לגלוקוז הנקרא
בלבלב . הגלוקוז שנכנס לתאי הלבלב עובר תהליך הגליקוליזה ומעגל החומצה
כאשר נוצרת כמות מסוימת של.ATP הציטרית -וגורם ליצירה מוגברת של
שמסמנת ללבלב שבדם ישנה כמות גבוה של סוכר ATP
שנוצר גורם לסגירה של תעלות אשלגן -שהוא יון בעל מטען חיובי ATP ה
לכן התא עובר דה פולריזציה נטען במטען חיובי -נטען במטען חיובי
ER לעומת הסביבה החוץ תאית שלו .דה פולריזציה גורמת ליציאה של סידן מה
וגם לפתיחה של תעלות סידן בתא ,מה שגורם לדה פולריזציה גדולה אף יותר
רמות הסידן הגבוהות גורמות לאקסוציטוזה של אינסולין בעזרת וסיקולות
משמשות יעד לטיפול תרופתי ATP תעלות האשלגן התלויות בנוכחות
בסוכרת מסוג 2 . ע”י תרופה הנקשרת לתת יחידה מסוימת במשאבת האשלגן
וגורמת לסגירת המשאבה וכתוצאה מכך שיחרור אינסולין
איך אינסולין וגלוקגון משפיעים ומושפעים על מצב רעב ויצירת גלוקוז
בכבד אינסולין מקדם את הכנסת הגלוקוז לכבד והפיכתו לגליקוגן
ברקמת שומן אינסולין מגרה את יצור השומן מגלוקוז ואיחסונו בתאי שומן
באדיפוציטים
לסיכום אינסולין גורם לסוכר עודף בדם להיכנס לרקמות ולאחסנו בצורות שונות
גלוקגון גורם לפירוק גליקוגן בכבד לגלוקוז ויצירת גלוקוז על ידי גלוקונאוגנזה מחומצות אמינו , גליצרול ואוקסלואצטאט
? מהם מיהם Counter regulators
? האם גלוקגון הוא הומון אנגוקריני או הורמון אקסוקריני
?הרצפטורים לגלוקגון היכן נמצאים
?ולעומתם הרצפטורים לאדרנלין
הם המתנגדים לאינסולין Counter regulators
גלוקגון , אדרנלין,כורטיזול
גלוקגון הוא הומון אנגוקריני כמו כל הורמון אחר
הרצפטורים לגלוקגון מצויים בכבד , קליטה של גלוקגון ברצפטורים לגלוקגון
בכבד תגרום לפירוק של גליקוגן לדוגמא
אדרנלין להבדיל הרצפטורים שלו נמצאים גם על הכבד וגם על השריר
?GLUT4 על אילו תאים נמצא
? הוא טרנספורטר או תעלה GLUT4
הוא טרנספורטר של גלוקוז המצוי בתאי שריר וגם ברקמות אדיפליות-_GLUT4_
הוא טרנספורטר לא תעלה-GLUT4
המצטבר בזמן רעב או סטרס AMP הוא אנזים המשופעל מרמות גבוהות של AMPK
גופני או בעקבות הורמוני רעב
לדוגמא , רמות נמוכות של לפטין .מכיוון שהאנזים פועל כאשר יש חוסר באנרגיה
הפעילות שלו תיהיה דיכוי של תהליכים דורשי אנרגיה והפעלת תהליכים של
פירוק חומצות שומן והגברת טרנספורטר של גלוקוז וגליקוליזה
?סקווסטריזציה לגרעין לאנזימים ציטוזוליים מי האנזים שעובר תהליך כזה
גלוקוקינאז בכבד עובר סקווסטריזציה לגרעין בזמן רעב
ChREBP גלוקוז שנכנס לכבד מפעיל פקטור שעתוק שנקרא
פקטור זה נכנס לגרעין ומייצר גנים הקשורים למטבוליזם של סוכר
לגרעין .פקטור זה גורם לשעתוק FOXO1 אינסולין גורם לכניסה של פקטור הנקרא
של חלבונים הקשורים למטבוליזם של סוכרים
?איך גלוקוקינאז מבוקר בכבד
?מה משפיע על שעתוק של האנזים גלוקוקינאז
?מה קורה לפירובט קינאז בנוכחות גלוקגון
בכבד :כאשר יש רמות גבוהות של פרוקטוז 6 פוספט
האנזים גלוקוקינאז עובר צימוד לחלבון רגולטורי ששומר אותו בגרעין
עד אשר רמות גלוקוז גבוהות שגורם לשחרור גלוקוקינאז מהכבד
AMP מה שמשפיע על הגברת שעתוק של גלוקוקינאז: כמות גדולה של
כיווץ מוגבר של השריר,צריכה של גלוקוז
בנוכחות גלוקגון PKa בכבד : פירובט קינאז עובר זרחונים ע”י
או אנדרנלין
? מכמה יחידות מורכב PFK1
של אי קולי מורכב מ -4 יחידות זהות לחלוטין Pfk1
לכל יחידה יש אתר קטליטי משלה
?B1 נגזרת של TPP חוסר בויטמין
מחלחת ברי ברי
במבוגרים מדובר בדימנציה מוקדמת ובעיות זיכרון
קוולנטית PDH קינאז יודע לעקב את האנזים PDH האנזים
?קינאז PDH מה משפעל אלוסטרית את
?קינאז PDH מי היחידה שעוברת זרחון ע”י
ATP האנזים מעוכב אלוסטרית ע”י ריכוז גבוה של
חשוב להבין שיש הגיון מאחורי הקטיבציה והעיכוב של קינאז זה
זה סממן למאגרי אנרגיה גדולים ATP כאשר התא מייצר הרבה
והוא מסמן להפסיק את פעילות ATP לכן לתא אין צורך ביצור עודף של
PDH הקומפלקס
שמסמנים רמות NAD+ ו AMP כאשר לתא יש מחסור באנרגיה יעלו רמות
ATP נמוכות של אנרגיה בתא ויפעילו את הקומפלקס על מנת לייצר עוד
וגורם לה להיות לא פעילה_. E1 מזרחן את היחידה PDH kinase_
? A ממה מורכב קואנזים
חומצה פנטאונית
אדנוזין
מרקפתואתיל אמין
?האם ביקרבונט שנכנס במעקף הראשון יוצא כקרבוקסיל עוד באותו תהליך
בתהליך גלוקונאוגנזה במעקף הראשון אנזים 10 של גלוקונאוגנזה
כאשר מתחבר ביקרבונט לפירובט קרבוקסיל נכנס למולקולה האנזים הוא
pyruvate carboxylase
בהמשך התהליך של המעקף אותו קרבוקסיל יוצא החוצה ע”י האנזים
pepcarboxykinase
מסמנים את הפחמן הכהלי של לקטאט בצורה רדיאקטיבית
?אילו פחמנים יהיו מסומנים רדיאוקטיבית על גלוקוז אם עושים גלוקונאוגנזה
מולקולת לקטאט מורכבת מ-3 פחמנים . על פחמן 1 יש מתיל
הפחמן האמצעי הוא כהלי ,הפחמן השלישי קרבוקסילי
אם מסמנים רדיאוקטיבית את הפחמן הכהלי ,קרי פחמן אמצעי ונבצע גלוקונאוגנזה
למולקולת לקטאט נראה בהתחלה את פירובט מסומן על הפחמן הקרבונילי
על הגלוקוז עצמו הפחמנים שיהיו מסומנים הם 2 ו 5
הפחמן הכהלי של לקטאט הוא תוצר חיזור של הפחמן הקרבונילי של פירובט והוא #
הפחמן האמצעי
שימו לב הפחמן הקרבוקסילי של פירובט הוא למעשה פחמן 3 או 4 של גלוקוז#
? מפעיל FOXO1 את מי פקטור שעתוק
? FOXO1 מי מדכא את
זהו פקטור שעתוק של 2 אנזימים השיכים למסלול גלוקונאוגנזה-FOXO1-Glucose 6-phosphatase, Pep carboxykinase
מדוכא ע”י אינסולין בדרך הבאה -FOXO1
כתוצאה מרמות גבוהות של גלוקוז איסולין נקשר לרצפטור שלו בתא
וגורמים FOXO1 אשר מזרחנים את AKT שהוא גם PKb המפעיל בתורו את
לו לעבור פירוק בפרוטאזום
מאילו מולקולות טרנספורטרים מעבירים
?T1
?T2
?T3
?GLUT2
ER מכניס גלוקוז 6 פוספט ל -T1 טרנספורטר
מוציא גלוקוז חופשי לציטוזול-T2 טרנספורטר
מוציא את הפוספט של הגלוקוז חזרה-T3 טרנספורטר
ER האנזים גלוקוז 6 פוספטאז נמצא על ממברנה ה
נמצא על הממברנה הפלזמתית של תאי כבד-GLUT2
?תאר את תפקיד הביוטין
?לאיזה חומצה אמינית הוא קשור
?מה הקשר שלו לפחמן הדו חמצני
משתמשים בביוטין בין היתר בגליקונאוגנזה שם
ביוטין קשור קוולנטית לחומצת אמינו ליזין בקשר אמידי
B7 ביוטין נגזר מויטמין
פירובאט קרבוקסילז , האנזים אשר מבצע את המעקף הראשון בגלוקונאוגנזה
ישנה חומצה אמינית ליזין המחוברת בקשר אמידי לביוטין
השלב הראשון : בתגובה זו נעשה באתר קטליטי הראשון של האנזים שם ביקרבונט
אחד ATP נהפך לפחמן דו חמצני על חשבון
הפחמן הדו חמצני מגיב עם הביוטין ונקשר אליו קוולנטית
הזרוע שמרכיבה את הביוטין מעבירה את הפחמן הדו חמצני הקשור אליה קוולנטית
לאתר מס’ 2 באנזים ,שם הפחמן הדו חמצני משוחרר ומגיב עם פירובט
חשוב: תפקיד הזרוע של הביוטין היא לשאת את הפחמן הדו חמצני בין שני אתרים קטליטיים באנזים
? מאיזה פחמן של גלוקוז או פרוקטוז נוצר הפחמן הקרבוקסילי של פירובט
כשנלך בתרשים הגלוקונאוגנזה אחורה , ניתן לראות שהפחמן הקרבוקסילי של
פירובט מומר להיות או פחמן 4 או פחמן 3 במולקולת הגלוקוז או הפרוקטוז
העניין נעוץ בדרך שבה מתפרק הפרוקטוז במקור לגליצראלדהיד ולדהידרוקסי אצטון
פחמנים 3 ו 4 הופכים בהתאמה להיות פחמן מ”ס 1 של המולקולות תוצרי הפירוק האלדולי ומשם יומרו להיות הפחמן הקרבוקסילי של פירובט
פחמנים
פחמן 1 של גלוקוז-הופך לפחמן מתילי מספר 3 של פירובט
פחמן 2 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבונילי מספר 2 של פירובט
פחמן 3 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבוקסילי מספר 1 של פירובט
פחמן 4 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבוקסילי מספר 1 של פירובט
פחמן 5 של גלוקוז-הופך לפחמן קרבונילי מספר 2 של פירובט
פחמן 6 של גלוקוז-הופך לפחמן מתילי מספר 3 של פירובט
?איך משפיע סידן על גליקוגן
?ובאיזה צורה הוא מבקר
?מה עושה גלוקוז חופשי בשריר
?מה עושה גלוקוז 6 פוספאט בכבד
סידן בשריר משמש כבקר אלוסטרי המגביר את פירוק הליקוגן
שמזרחן את האנזים,phosphorylase b kinase סידן נקשר לאנזים
שהוא הגירסה הפחות פעילה ועל ידי כך הופך אותו ל phosphorylase b
שהוא הגירסה היותר פעילה נשים לב שפוספורילאז נקשר phosphorylase a
לקינאז המזרחן את האנזים ולא לאנזים עצמו
גלוקוז חופשי בשריר מדכא פירוק גליקוגן הרעיון הוא שאם יש מספיק גליקוגן אין
צורך לפרק עוד
?האם גלוקוז 6 פוספט בכבד מדכא בניית גליקוגן
!לא הפוך
גלוקוז 6 פוספאט מסמל לנו שגלוקוקינאז עבד (להזכירכם גלוקוקינאז
עובד בריכוזים גבוהים של גלוקוז, והוא מעין סנסור לרמת הגלוקוז בדם)ץ
אם הוא עבד זה אומר שאנחנו במצב של שובע , שיש מספיק גלוקוז
מכאן זה אומר שאנחנו רוצים לאגור את הגלוקוז בגליקוגן ולא לדכא את בניית הגליקוגן
של גליקוגן de-branching שאנזים
יש פעילות של בניה של קשר אלפא1-4 בלבד de-branching לאנזים
אבל הוא יודע לשבור שני סוגי קשרים אלפא 1-4 ואלפא 1-6
שובר אלפא 1-4 branching אנזים
יוצר קשר אלפא 1-6
?איפה יש במיטוכונדריה זרחון ברמת סובסטראט
במעגל קרבס
