#13 Génétique quantitative Flashcards
Quel type de trait est étudié en génétique quantitative?
Pourquoi ce type de trait en nature est-il généralement plus difficile à étudier que les traits « Mendéliens »?
La génétique quantitative étudie les caractères phénotypiques à variation continue.
C’est plus complexe car les caractères étudiés en génétique quantitative résultent de l’action
conjointe de nombreux facteurs (« caractères multifactoriels » ou« caractères complexes » )
Qu’est-ce que la norme de réaction?
Ça définit les relations environnement-phénotype pour un génotype déterminé.
La norme de réaction représente l’ensemble des phénotypes possibles produits par
un génotype particulier sous différentes conditions environnementales.
Pour une espèce dispersée dans un environnement varié (et qui a évolué ainsi), peut-il exister un génotype qui possède un meilleur fitness dans tous les environnements?
Non, aucun génotype n’est « le meilleur » dans tous les environnements. Un génotype est souvent seulement idéal dans une condition environnementale précise.
Quel type de graphique permet de bien observer si un trait possède une distribution normale?
L’histogramme de fréquence ou la courbe normale
Quelle valeur utilise-t-on pour mesurer la dispersion des données pour un trait?
La variance est une mesure du degré de dispersion d’un ensemble de données.
Pourquoi la variance présente-t-elle des unités au carré?
Ces unités ont-elles une signification biologique?
Elle possède des unités au carré (S^2) car elle se trouve/calcul en faisant la moyenne des écart-types à la deux!
Comme le calcul de la variance se fait à partir des carrés des écarts, les unités de mesure ne sont pas les mêmes que celles des observations originales et
n’ont pas une signification biologique!
Quels facteurs affectent l’expression des traits complexes (le phénotype) en général?
Les facteurs innés (génotypes) et les facteurs acquis (environnement) définissent le phénotype.
De quelle manière décompose-t-on la variance observée pour un trait donné?
Quelle formule résume cette décomposition?
Peut-il exister un lien entre les composantes (génétique et environnement) pour que cette formule soit valide?
La variance phénotypique totale (observé) peut être décomposée en variance génétique et en variance environnementale.
Vx = Vg + Ve
Pour utiliser cette formule: la Vg et Ve doivent être indépendants. Il ne doit pas exister de corrélation entre les deux.
Que signifie l’héritabilité au sens large?
Comment la calcule-t-on?
Héritabilité au sens large: contribution de la variance génétique à la variance phénotypique totale.
H^2 = Vg / Vx
H^2 = Vg/ (Vg + Ve)
Quel type d’expériences ou d’études nous permettent d’évaluer les variances génétiques et environnementales?
Comment fait-on pour « annuler » les effets génétiques sur la variance?
Comment fait-on pour « annuler » l’effet environnemental sur la variance?
Plusieurs types d’expérience nous permettent d’évaluer ces variances.
Chez les plantes:
- Individus obtenus par reproduction végétative (des « clones »)
Chez les animaux et les plantes:
-Individus obtenus par croisement de lignées pures
-Individus issus de plusieurs générations de croisement consanguins
Chez les humains:
-Études sur les jumeaux
Les jumeaux ou clones (même génétique) annule l’effet de variance génétique
Les études où les phénotypes se développent dans des conditions identiques annulent l’effet de l’environnement sur la variance.
Qu’arrive-t-il à la variance phénotypique dans les environnements extrêmes?
Qu’arrive-t-il à l’héritabilité au sens large (H2) dans les environnements extrêmes?
La variance phénotypique est plus grande! L’héritabilité au sens large est plus basse dans les environnements extrêmes: les différences phénotypiques s’expliquent ici surtout par des différences environnementales
Quel type d’étude permet d’estimer l’héritabilité des traits chez les humains?
Les études d’héritabilité au sens large sur les jumeaux ou cousins (25% pareil)
élevé ensemble ou séparément
Que peut-on dire sur la différence observée dans les traits entre jumeaux monozygotiques?
Est-ce que la variance des traits risque d’être plus élevée ou plus faible pour des jumeaux élevés séparément par rapport à des jumeaux élevés ensemble?
Est-ce que la variance des traits risque d’être plus élevée ou plus faible pour des jumeaux monozygotiques par rapport à des jumeaux dizygotiques?
Des jumeaux monozygotes:
- élevés ensemble (Vg = 0; Ve très faible)
- élevés séparément (Vg = 0; Ve dépend du phénotype étudié)
La variance des traits risque d’être bien plus grande lorsqu’il ne sont pas élevé ensemble.
La variance des traits de jumeaux monozygotiques vont être moins élevé que chez les dizygotiques car ils vont avoir 100% d’allèles identiques au lieu de 50%.
Si le test est dans des enviro différentes et la concordance est plus grande entre jumeaux monozygotiques
qu’entre jumeaux dizygotiques
→ le caractère est essentiellement sous contrôle génétique.
Quelles conclusions peut-on tirer de la valeur d’héritabilité au sens large (H2) pour un trait? et les conditions/exception?*****
Peut-on extrapoler les valeurs d’héritabilité au sens large d’une population et assumer qu’elle est la même pour une autre?
H^2 permet d’estimer quelle proportion de la variance phénotypique dans une population est due à des
différences génétiques entre individus.
MAISSS
-L’héritabilité faible ne veut pas dire que le caractère n’est pas sous contrôle génétique.
-L’héritabilité élevée ne veut pas dire que le caractère n’est pas influencé par
l’environnement.
Les estimations de l’héritabilité ne peuvent pas être extrapolées d’une population à l’autre. La différence phénotypique entre deux populations ne peut pas être expliquée uniquement par des facteurs génétiques même si le caractère étudié possède une héritabilité élevée car l’enviro et la culture sont tellement différents.
Si on observe une héritabilité élevée pour un trait dans une population et qu’elle est faible pour l’autre population, est-ce que cela veut dire que la première population possède de meilleurs allèles pour ce trait?
Si H2 est faible, est-ce que ça signifie qu’un faible nombre de gènes contribuent à l’expression du trait?
Le H2 n’informe pas sur l’expression du
phénotype (le meilleur), seulement sa variance. Le phénotype plus
élevé en valeur pourrait être l’effet de l’environnement
le H2 élevé signifie que la variance observée s’explique surtout par des facteurs héréditaires, mais l’environnement peut avoir un effet fort. H2 faible n’indique pas un nombre de gène mais la une variance entre individus lié à la génétique.
