#12 Génétique des populations : population en évolution Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que l’assortiment positif?
Pouvez-vous donner un exemple d’assortiment positif?

A

Assortiment positif: les individus se reproduisent
préférentiellement en fonction de leur similitude phénotypique

Chez les humains: assortiment positif en fonction de
la taille corporelle
Chez les plantes: en fonction du moment de la
floraison (ex. assortiment positif pour les plantes à
floraison précoce)

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Q

Quelle est la conséquence de l’assortiment positif sur les fréquences génotypiques d’une population?
Est-ce qu’une population qui subit l’assortiment positif est à l’équilibre de Hardy-Weinberg?

A

Conséquence de l’assortiment positif: - augmentation de la fréquence des
homozygotes au détriment des hétérozygotes;

Une population subissant l’assortiment positif n’est pas à l’équilibre de Hardy-Weinberg, car cet accouplement non aléatoire augmente la proportion d’homozygotes et réduit celle des hétérozygotes.

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3
Q

Qu’est-ce que l’assortiment négatif?

A

Assortiment négatif: les individus dissemblables s’accouplent
préférentiellement

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4
Q

Pourquoi la reproduction sexuée est-elle considérée un assortiment négatif?

Pourquoi plusieurs angiospermes (plantes à fleurs ) ont-elles évolué des mécanismes divers pour forcer l’assortiment négatif?

Quelle est la conséquence de l’assortiment négatif sur les fréquences génotypiques d’une population?

A

La reproduction sexuée est considérée comme un assortiment négatif, car elle favorise la diversité génétique en mélangeant les allèles entre individus différents, réduisant ainsi la probabilité d’accouplement entre proches génétiquement.

Chez les plantes à fleurs des mécanismes existent pour former l’assortiment négatif afin de limiter l’autofécondation, ou la reproduction entre variétés possédant le même type de fleur.

Conséquences génétiques: augmentation des
hétérozygotes au détriment des homozygotes
(fréquence des hétérozygotes >2pq).
Maintien de la variabilité génétique dans la population.

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5
Q

Quel est l’effet de l’isolement par la distance sur les fréquences génotypiques d’une population étalée sur un grand territoire?

A

L’isolement par la distance mène à la formation de gradients
de fréquences alléliques
L’isolement par la distance mène à un déficit en hétérozygotes par rapport à la loi de l’équilibre, homozygote entre allèle des deux régions.

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6
Q

Qu’est-ce que l’endogamie?
Quel est le risque individuel de l’endogamie chez les humains?

A

Reproduction entre individus apparentés.
Population consanguine: population dans laquelle
les unions entre individus apparentés se
produisent plus fréquemment qu’elles
n’auraient eu lieu par l’union au hasard
Au niveau individuel, la consanguinité augmente le risque
que la progéniture soit homozygote pour un allèle nocif
(létal ou déterminant une maladie héréditaire)

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7
Q

Qu’est-ce que le coefficient de consanguinité?
Comment calcule-t-on le coefficient pour un individu particulier?
Dans la formule Fi = (1/2)n (1+Fa), que signifie la variable « n »?
Dans cette même formule, que signifie Fa ?

A

Le coefficient de consanguinité c’est la probabilité que deux allèles se retrouvent à l’état homozygote chez la progéniture d’un couple consanguin car ils proviennent d’un ancêtre commun

Fi = Σ (1/2)^n
Le coefficient de consanguinité est égal à la somme des expressions 1/2 n
pour toutes les chaînes de parenté

n = nombre total d’individus dans une chaîne de parenté donc de la mère PUIS du père (en excluant l’individu pour
lequel on calcule le coefficient de consanguinité ) **VOIR DIAPO 18-19

un coefficient de consanguinité d’un parent de ce calcul = Fa (formule modifié quand c le cas Fi = Σ (1/2n)(1+ Fa) )

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8
Q

Quel est l’effet de la consanguinité sur les fréquences génotypiques d’une population?
Comment calcule-t-on (ou estime-t-on) le coefficient de consanguinité d’une population?

A

Conséquence principale de l’endogamie:
augmentation de la fréquence d’homozygotes
(= homozygotie par filiation) accompagnée d’une
réduction de la fréquence des hétérozygotes.
Les fréquences alléliques demeurent inchangées.

Le coefficient de consanguinité (F) d’une population
est égal à la moyenne des coefficients F de tous
les membres de cette population.

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9
Q

Pourquoi la consanguinité cause-t-elle des effets néfastes sur la santé de populations qui se reproduisent habituellement par hétérogamie?

A

La consanguinité augmente la fréquence des homozygotes dans une population, ce qui expose davantage les individus à des maladies génétiques récessives habituellement masquées chez les hétérozygotes.

NON Dans les populations habituées à l’hétérogamie, cette réduction de la diversité génétique peut aussi affaiblir la résistance aux maladies et réduire l’adaptabilité face aux changements environnementaux.

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10
Q

Qu’est-ce que la sélection?
Quels sont les deux paramètres individuels qui peuvent être affectés par la sélection?

A

La sélection consiste en un taux différentiel de survie (1) et de
reproduction (2) des individus. La sélection « choisit » les mutations déterminant les
phénotypes les mieux adaptés, avec meilleurs fitness.

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11
Q

Comment la sélection affecte-t-elle les deux types de fréquences (allélique et génotypique) dans la population?

A

La sélection modifie la fréquence allélique en favorisant ou en éliminant certains allèles.
Aussi influence la fréquence génotypique en altérant les proportions des génotypes associés, souvent en fonction de leur valeur sélective, sélectionne meilleur phénotype et donc leur génotype associé.

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12
Q

Que signifie la valeur adaptative relative/ fitness (W)?
Quelle valeur aura la valeur adaptative relative du (ou des) génotype le plus fit?

A

La probabilité relative de survie et le taux de reproduction
d’un génotype (phénotype) constituent sa valeur
adaptative (fitness) W
* C’est une valeur relative aux autres génotypes dans la population
* W = 1.0 pour le génotype (phénotype) le plus « fit » (+ haut mieux c’est)

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13
Q

Qu’est-ce que la sélection directionnelle?

A

variations des fréquences alléliques vers un certain seuil résultant de la sélection agissant pendant de nombreuses générations envers des allèles favoriser ou défavoriser!

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14
Q

Qu’est-ce que la sélection directionnelle positive?

A

variations des fréquences alléliques résultant de la
sélection vers un seuil plus élevé pour des allèles favorables

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15
Q

Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle dominant n’atteint-elle la fixation de l’allèle que très lentement dans les générations?

Pourquoi la sélection directionnelle positive qui favorise un allèle récessif atteint-elle la fixation de l’allèle plus rapidement que dans le cas d’un allèle dominant?

A

Un allèle dominant avantageux confère un bénéfice dès qu’il est présent, mais sa fréquence augmente lentement lorsque l’allèle récessif devient rare.
Cela s’explique par le fait que les hétérozygotes (𝐴𝑎) et les homozygotes dominants (𝐴𝐴) ont le même phénotype, ce qui masque l’effet de la sélection sur les hétérozygotes.
En revanche, un allèle récessif avantageux n’exprime ses bénéfices qu’en homozygote (𝑎𝑎), ce qui ralentit son démarrage, mais une fois fréquent, la sélection élimine rapidement l’allèle dominant désavantageux.
Ainsi, un allèle récessif atteint la fixation plus rapidement lorsqu’il est avantagé, car la sélection agit plus efficacement contre l’allèle dominant résiduel.

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16
Q

Qu’est-ce que la sélection directionnelle négative, ou sélection « purificatrice »?
Quel est l’effet de la sélection purificatrice sur la fréquence d’un allèle défavorable?

A

Perte d’un allèle défavorable chez une population, cette allèle va disparaitre avec le temps avec les individus qui sont désavantagé en la possédant sur leur survie et reproduction.

17
Q

Qu’est-ce que la sélection stabilisante?
Quel génotype est favorisé?

A

C’est la sélection en faveur des individus hétérozygotes. Lorsque P est élevé ou faible il va être ramener à une équilibre de 0.5.

Lorsque la valeur adaptative des hétérozygotes est
supérieure à celles des homozygotes, les fréquences
alléliques p et q tendent vers des valeurs stables.

18
Q

La sélection stabilisante dépend-elle de la fréquence des allèles?

A

Cette valeur « à l’équilibre » ne dépend pas des fréquences alléliques initiales!
Elle dépend des valeurs adaptatives seulement

Donc peut importe la fréquence des allèles, p et q seront ramener à 0.5 si les hétérozygotes sont avantagés selon la sélection.

18
Q

Dans le cas de l’anémie falciforme, pourquoi la fréquence de l’allèle HbS est-elle élevée dans certaines populations en Afrique?

A

Les hétérozygotes sont en surplus par rapport à la prédiction selon la loi de l’équilibre. C’est un cas de sélection stabilisatrice.

Les individus hétérozygotes ont une meilleur chance de survivre à la malaria.

Tandis que aa amène anémie grave qui tue l’enfant et AA, même si leur phénotypes sont normaux, ils sont plus sensible à la malaria très présente dans la région.

19
Q

Comment peut-on reconnaître un événement de sélection positif récent dans une population en observant les marqueurs génétiques (polymorphismes)?

A

Suite à la sélection d’un allèle favorable, les loci qui sont en désequilibre de liaison (LD) avec cet allèle augmentent aussi leurs fréquences.
Les marqueurs avec un fort LD sont à proximité d’un gène
sélectionné récemment.

20
Q

Qu’est-ce qu’un « balayage sélectif »?

A

Balayage sélectif: tous les haplotypes de la population sont identiques, fixation d’un allèle, 100% de la population l’a.

Ex.: couleur de peau des européens

21
Q

Comment peut-on reconnaître un locus sous effet de sélection stabilisante?

A

Il possède une grande diversité génétique (en nombre de paire de bases différente) Ceci pourrait découler d’une plus grande résistance des hétérozygote saux maladies infectieuses (et facilité par les mécanismes d’assortiment négatif).