12. POGLAVJE: BIOSIGNALIZACIJA Flashcards

1
Q

Biološka funkcija prenosa signala:
B-limfocit
Dražljaji, ki se lahko prenesejo:

A
  • Varovanje in obramba; npr. sinteza protiteles
    o B-limfocit spozna virus
    o Ima B-celične receptorje (imunoglobuline), ki spoznajo virus (vsebuje vezavno
    mesto, neke proteine)
    o B-limfociti dobijo signal, da se namnožijo in ustvarijo veliko količino protiteles
    -> proliferacija (razmnožijo se celice) in diferenciacija (spremeni se program v
    celici – nastane B-celica plazmatka)
    o Kako se je limfocit diferenciiral na molekularnem nivoju? Prišlo je do regulacije
    transkripcije določenih genov
  • Rast in spremenjen metabolizem
    o Ali imamo dovolj aminokislin, OH…? Če ja, se lahko deli, drugače je potrebno varčevati z energijo (lahko potekajo različni programi, različno intenzivne
    metabolne poti)

Dražljaji, ki se lahko prenesejo:
* antigeni
* hormoni
* nevrotransmiterji
* svetloba
* otip
* feromoni…

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Kaj je receptor
skupine receptorjev

A

Receptor: Na membrano vezan ali topen protein/proteinski kompleks, ki po vezavi liganda povzroči nek fiziološki efekt

Skupine receptorjev:
* receptorji sklopljeni z G-proteinom – receptor adrenalina (epinefrina)
* z encimi povezani receptorji – inzulinski receptor
* z ligandi regulirani* ionski kanali* – nikotinski acetilholinski receptor
* drugi membranski receptorji – receptorji integrina
* jedrni receptorji – steroidni receptorji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Inzulinski receptor

A

Inzulinski receptor: ekstra in intracelularna domena, razteza se preko membrane

Vezava inzulina -> domeni se zbližata, zanka pride v aktivno mesto kinaze -> fosforilacija
AKTIVACIJSKA ZANKA na tirozin kinazi
zaradi fosforilacije zanka ne zapira več aktivnega mesta

vežejo se lahko različni substrati, ki imajo Tyr

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

5 ključnih lastnosti za prenos signala

A

SPECIFIČNOST: določene specifične molekule jih aktivirajo
* Celice imajo več istovrstnih receptorjev
* Iste celice imajo lahko različne receptorje, različne celice imajo lahko enake receptorje, a delujejo npr. na drugačen način (nekje apoptoza, drugje se začnejo deliti)
OJAČITEV SIGNALA: proizvede se veliko sekundarnih sporočevalcev
MODULARNOST: signali lahko pridejo iz različnih virov, lahko pride do različnih kombnacij
DESENZITACIJA: pomembno vlogo ima povratna zanka (signal se lahko tudi prekine)
* Desenzitacija paličic in čepkov recimo ko pridemo v zelo svetel prostor in se potem oči navadijo
INTEGRACIJA: celice se usklajujejo, če imamo nasprotujoče si signale

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Receptorji vežejo specifične ligande
Naštej tipične ligande.

A

Tipični ligandi so:
* majhni ioni
– železov ion: npr. v bakterijskem Fe receptorju
* organske molekule
– adrenalin (=epinefrin): epinefrinski receptor
* polisaharidi
-heparin: fibroblastni rastni faktor
* peptidi
– inzulin: inzulinski receptor
* proteini
– endotheljski rastni faktor: VEGF receptor

Vežejo se nekovalentno:
največ ionske (elektrostatske), lahko tudi Van der Waalsove, vodikove

slika:
modra – pozitivni elektrostatski potencial
rdeča – negativni elektrostatski potencial

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

VEZAVA RECEPTOR – LIGAND preučevanje

A

*ravnotežje vezave označenega (npr. radioaktivno) liganda z receptorjem
* če se vežeta je cel kompleks radioaktiven
* prosti ligand gre lahko skozi filter
* kompleks ne more skozi filter, ker se protein veže nanj

Koraki:
* izolacija membrane
* dodatek liganda k membrani
* filtracija
* spiranje nevezanega liganda
* meritev radioaktivnosti, ki je sorazmerna s količino kompleksa

Scatchard-ova analiza: gledamo, kako hitro vezava doseže nasičenje

Analiza podatkov:
* Lahko določimo disociacijsko konstanto (Kd,
močne vezave, 10-10 M)
Večina liganda je v kompleksu, kar ni v
kompleksu je v redu razreda nanomolov
* Število receptorjev (Bmax – vsa vezavna mesta)
* Kooperativnost
o R+L=RL
o Ka=[RL]/([R][L])=1/Kd

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Transmembranski receptorji:

A

niso sposobni preiti fosfolipidnega dvosloja, zasidrani, prenesejo signal

  • Prenos signalov z G-proteini
    o Receptorji povezani z G proteini (GPCR)
  • Tirozin kinazni receptorji
    o Fosforilirajo aminokislino tirozin
  • Guanilil ciklaze
    o Imajo znotrajcelično strukturo, ki proizvaja GMP sporočevalec
  • Ionski kanalčki
    o Specifično prepuščajo ione
    o Napetostno regulirani (odvisnost od membranskega potenciala) ali od liganda regulirani (odvisnost od specifičnega primarnega sporočevalca, liganda)
  • Adhezijski receptorji
    o Signalizacija poteka v obe smeri (povsod drugje se nekaj veže na zunanji strani in prenese signal v notranjost); lahko pride do vezave molekule tudi znotraj celice
  • Jedrni receptorji
    o Niso v membrani jedra!
    o Vežejo hidrofobni primarni sporočevalec in lahko prehajajo lipidni dvosloj,
    skupaj lahko potem potujejo naprej, velikokrat regulirajo transkripcijo
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Zgradba G-proteinov
A

GPCR: z G-proteini sklopljeni receptorji
* 7 transmembranskih alfa heliksov (serpentinski receptorji)
* G-proteini so heterotrimerni (αβγ) z membrano-povezani proteini, ki vežejo GTP
α in γ zasidrana v membrano (fiksacija in pravilna orientacija)
* G-proteini prenesejo signal od GPCR do drugih tarčnih proteinov
imajo veliko zank
sodelujejo v beta adrenergični poti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Delovanje G proteinov
A
  • Osnova signalizacije je disociacija αβγ trimera po aktivaciji reeptorja
  • Ko se receptor aktivira, se vezan GDP zamemja z GTP v α podenoti
    (GTP in GDP se izmenjujeta nastane en iz drugega!!!)
  • GTP-vezan stimulacijski GαS interagira z adenilat ciklazo in jo aktivira (v primeru β-
    adrenergične receptorske signalne poti, ki poteka v jetrih)

Ko je notri GTP: Zanki se lahko povežeta, nastane bolj aktivna podenota, ki je bolj kompaktna
o Proizvaja se ciklični AMP (cAMP) zaradi vezave na adenilat ciklazo.
o Ciklični AMP je sekundarni sporočevalec
* Čez nekaj časa alfa podenota razgradi GTP, zanki se razvežeta, ne more se
več vezati na adenilat ciklazo, signal je prekinjen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Delovanje G proteinov
    Kako pride do konformacijskih sprememb?
A
  • Imamo RAS in helikalno domeno, gleda se razdalja med njima
    o Razdalja se poveča, ko je vezan aktiviran receptor
  • Ugotovili so, da se kompleks stalno odpira in zapira in da je večino časa zaprt
  • Alfa heliks 5 je ključen pri vezavi GDPja – nekovalentno se veže in stabilizira
  • Tudi, ko se domeni razkleneta, se GDP drži noter in še ne gre takoj proč
  • Alfa heliks 5 se mora premakniti, da gre
    GDP stran
  • Ko se veže GTP se alfa podenota aktivira, pride do razpada kompleksa
  • Alfa sedaj aktivira druge encime (npr. za izgradnjo cAMP)
  • Razpad: hidroliza GTP

cAMP
* Aktivira druge proteine, največkrat je to encimi kinaza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Primeri delovanja G proteinov
    ADRENALIN (EPINEPHRINE): HORMON AKCIJE
    agonist
    antagonist
A
  • Sinteza v nadledvični žlezi, odziv na stres, potrebna je energija
  • Adrenergeni (adrenalinski) receptorji – beta adrenergeni receptorji
  • Maščobne kisline -> glukoza
  • Vezava na receptorje v mišičnih in jetrnih celicah inducira razgranjo glikogena
  • Vezava na receptorje maščobnih celic inducira hidrolizo lipidov
  • Vezava na receptorje celic v srcu poveča utrip srca – glukoza hitreje pride do tarče

agonist – molekula podobna primarnemu sporočevalcu, ki se veže na receptor in posnema naravne ligande
* npr. isoproterenol
se boljše veže kot adrenalin in ima isto funkcijo

antagonist- molekula podobna primarnemu sporočevalcu, ki se veže na receptor in ne sproži signala in s tem blokira efekt agonistov
* npr. propranolol
ne pride do signalizacije, zasede vezavno mesto in prepreči vezavo primarnemu sporočevalcu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI

VPLIV NA GTP-GDP izmenjavo

A

GTP – GDP izmenjevalni faktorji
* Sos – gvanozin exchange faktor / sun of sevenless
če bo GTP, bo aktiven G protein

GTPazna aktivnost – modulatorji
* GAP – proteini, ki aktivirajo GTPazno aktivnost
* RGS – regulatorji G proteinske signalizacije alfa podenote

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI

cAMP (morš znat narisat!)

A

cAMP (morš znat narisat!)
nastane iz ATP prek adenilat ciklaze
je cikličen AMP
* sekundarni obveščevalec
* cAMP fosforilira druge proteine (protein kinaza A), a ne vseh po vrsti
o hidroksilna skupina (serin, treonin, tirozin)
* alosterično aktivira od cAMP-odvisno protein kinazo A (PKA)
o to vodi do aktivacije encimov, ki katalizirajo razgradnjo glikogena do glukoze

cAMP je splošni sekundarni prenašalec
* veliko število GPCR povezanih signalov se prenese preko cAMP
* okoli 500 GPCR je namenjenih za zaznavanje vonja in okusa
* mnogo ligandov za GPCR še ni identificirnanih

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Primeri delovanja G proteinov
    ADRENALINSKA KASKADA
A

ADRENALINSKA KASKADA
ojačitev signala
* aktivacija GPCR vodi do aktivacije več molekul adenilat ciklaze
* vsaka aktivna adenilat ciklaza sintetizira več cAMP -> aktivacija encimov PKA
* aktivacija encimov, ki razgrajujejo glikogen
* sprostitev več 10000 molekul glukoze

avto-inaktivacija beta adrenergičnega signala
* adrenalin naj bi bil signal s kratkim časovnim delovanjem
* organizem mora zaustaviti sintezo glukoze, če ni več potrebe zanjo
* hidroliza GTP v alfa podenoti G proteina povzroči zmanjšanje koncentracije cAMP
cAMP se v celici razgradi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    zmanjšanje občutljivosti beta adrenergičnih recpeptorjev
A

4 procesi:
- hidroliza GTP
- hidroliza cAMP
- zmanjšanje koncentracije
-desenzitacija ali
zmanjšanje občutljivosti beta adrenergičnih recpeptorjev

  • celica skrije receptor v celico
  • beta gama podenota proteina, gor se lahko veže beta ARK, fosforilacija C-konca, gor se lahko veže beta arr (arrestin)
  • pride do endocitoze (vezikli
    z receptorji, ki so v celici), celica je desenzitirana
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Primeri delovanja G proteinov

Nekateri bakterijski encimi
deaktivirajo G-proteine

A
  • če deaktivirajo GTPazna aktivnost alfa podenote proteina, to povzroči, da je adenilat ciklaza vedno aktivna in proizvede preveč cAMP iz ATP
  • primer je Cholera (lahko dehidriraš), tudi oslovski kašelj

Cholera toxin
* patogen producira toksine, ki se vežejo na G proteine
dimerni protein
* podenota B se veže na specifične receptorje epitelnih črevesnih celic, odpre se pot za podenoto A, da lahko vstopi v celico
* A1 se poveže skupaj z ADP-ribozilatskiim faktorjem ARF6 (majhen G protein v gostiteljski celici) preko regij switch I in II

samo od tu naprej je na ppt
* posledica je prenos ADP-riboze od NAD+ do Arg v P loopu alfa podenote Gs
torej ADP-riboza se veže na Gs preko Arg
* !!!ADP-ribozilacija prepreči aktivnost GTP-aze, kar povzroči nenehno delovanje adenilat ciklaze, visoko koncentracijo cAMP in povišano aktivnost PKA
* PKA fosforilira Cl- kanalček in Na+ izmenjevalec, kar povzroči dehidracijo
(izguba vode zaradi osmoze)

17
Q
  1. PRENOS SIGNALOV Z G-PROTEINI
    Primeri delovanja G proteinov

GPCRs in FOSFOLIPAZA C

A

GPCRs in FOSFOLIPAZA C
prenos preko fosfolipaze C
* encim, ki cepi fosfolipide v celični membrani (cepi PIP2)
(poznamo tudi A1, A2 in D fosfolipaze)

  • ko se nek ligand veže na GPCR, lahko to vodi do aktivacije fosfolipaze C
  • fosfolipaza C je specifična za fosfolipide PIP2 (fosfoatidilinozitol 4,5-bisfosfat) in jih cepi do DAG (diacilglicerol; ostane v membrani) in IP3 (inozitol 1,4,5- trifosfat; je sekundarni
    sporočevalec)
  • IP3 se veže na IP3/Ca2+ kanalček na ER, kar povzroči, da se kalcij sprosti v citosol, koncentracija naraste
  • kalcij in DAG aktivirata encim kinazo C, kar povzroči forsforilacijo tarčnih proteinov
18
Q
  1. Z ENCIMI POVEZANI MEMBRANSKI RECEPTORJI
    Zgradba
    Delovanje
A

Zgradba membranskih receptorjev povezanih z encimi:
* Ektracelularna domena, ki veže ligande in intracelularna katalitična domena
o Ekstracelularna domena specifično veze sporočevalec, to povzroči aktivacijo
o Domene omogočajo interakcije (npr. IgG domene)

Delovanje receptorjev povezanih z encimi
katalitična domena
*TIROZIN KINAZNA AKTIVNOST
o Doda fosfoatno skupino sama sebi
o Avtofosforilacija povzroči spremembe v strukturi, kar omogoči vezavo in fosforilacijo specifičnih tarčnih proteinov
o Doda fosfatno skupino na Tyr substrat
* GVANILIN CIKLAZNA AKTIVNOSTt
o Pretvorijo GTP v cGMP, ki je sekundarni prenašalec

19
Q
  1. Z ENCIMI POVEZANI MEMBRANSKI RECEPTORJI

TIROZIN KINAZNI RECEPTORJI (RTKs)

A

TIROZIN KINAZNI RECEPTORJI (RTKs)
* Receptorji za rast, ki delujejo s pomočjo tirozin kinazne aktivnosti imajo tirozin kinazno domeno obrnjeno proti citoplazmi
* Zunajcelične domene so odvisne od tipa receptorja
o Navadno kombinacija s cisteinom ali leucinom bogatih segmentov in
segmentov značilnih za imunoglobuline

INS-R: receptor za inzulin
VEGF-R: vaskularni epidermalni rastni faktor
PDGF-R: rastni faktor iz trombocitov
EGF-R: epidermalni rastni faktor
NGF-R: živčni rastni faktor
FGF-R: fibroblastni rastni faktor

20
Q
  1. Z ENCIMI POVEZANI MEMBRANSKI RECEPTORJI
    Primeri delovanja

INZULINSKI RECEPTOR INS-R

A

INZULINSKI RECEPTOR INS-R
Inzulin: hormon vnosa glukoze in metabolizma
* sintetizirajo ga beta celice Langerhansovih otočkov v pankreasu
* inzulin se sintetizira in sprosti iz pankreasa kot odziv na hrano, kot je npr. glukoza
* pride do tarčnih celic po krvnem obtoku
* vezava inzulina na receptor povzroči kaskado dogodkov, ki vodijo k povečanemu sprejemu glukoze in metabolizmu
* nezmožnost sinteze ali zaznavanja inzulina vodi v diabetes (diabetes tipa 1)

Inzulinski receptor se aktivira, ko se nanj veže inzulin
* Dimer, zanka se malo premakne
* Glukozni transporterji pridejo na membrano, ko se inzulin veže na receptor
* GLUT4 se skrijejo in lahko pridejo na površje, GLUT2 pa so recimo v jetrnih celicah stalno na površju
* vezava inzulina aktivira katalitično domeno
* katalitična domena ene kinaze fosforilira Tyr v sosednji domeni
* receptorska avto-fosforilacija omogoča vezavo in fosforilacijo IRS-1 proteina
* posredna interackija fosforiliranega IRS proteina z Ras proteinom povzroči celo serijo fosforilacij proteinov
o Raf-1, MEK, ERK
* ERK (fosforilirana proteinska kinaza) vstopi v jedro
* transkripcijski faktor Elk1 se fosforilira in povzroči ekspresijo specifičnih genov
glukozni transporter (GLUT4)

Regulacija izražanja genov s pomočjo
inzulina preko MAP kinazne kaskade reakcij
* ISN-R je sestavljen iz dveh alfa podenot (zunaj) in dveh beta podenot (znotraj)
* Vezava inzulina na alfa podenoto povzroči konformacijske spremembe in avtofosforilacijo Tyr predela v beta podenoti
* Aktivira se tudi Tyr kinazna domena, ki katalizira fosforilacijo tarčnih proteinov
* Regulacija poleg INS-R vključuje tudi druge kinaze (npr. MEK, ERK)

21
Q
  1. Z ENCIMI POVEZANI MEMBRANSKI RECEPTORJI
    Primeri delovanja

GLIKOGEN SINTAZA in INZULIN

A

Kovalentna modifikacija (izpitno vprašanje!!)
* Če je inzulin prisoten, mora biti glikogen sintaza aktivna
* Poleg Grb2 proteina (omenjen prej), se lahko na fosforiliran IRS-1 veže tudi
PI-3 kinaza preko SH2 domene
o PI-3K pretvori PIP2 v PIP3K
* Protein kinaza B (PKB) se lahko veže z PIP3 in se tako fosforilira s pomočjo PDK1
* Fosforilirana PKB fosforilira GSK3 (glikogen sintaza kinaza 3)
o GSK3 je tako inaktivirana (zaradi fosforilacije), ne more pretvoriti GS v neaktivno
obliko
o GS sintetizira glikogen
* Če ne bi bil prisoten inzulin, ne bi prišlo do deaktivacije GSK3, ki lahko inaktivira GS (glikogen se ne bi proizvajal)
* PKB sproži tudi spremembe v GLUT4 transporterjih, poveča se vnos glukoze v celice iz krvi

22
Q
  1. Z ENCIMI POVEZANI MEMBRANSKI RECEPTORJI
    Primeri delovanja

JAK-STAT TRANSDUKCIJSKI MEHANIZEM ZA ERITROPOETINSKI RECEPTOR

FOSFORILACIJSKO ODVISNE PROTEINSKE INTERAKCIJE V SIGNALNIH POTEH

A

JAK-STAT TRANSDUKCIJSKI MEHANIZEM ZA ERITROPOETINSKI RECEPTOR

  • Tyr kinaza (JAK) je aktivirana ob vezavi z receptorjem
  • JAK fosforilira transkripcijski faktor STAT (lahko tvorijo
    dimere), ki nato vstopi v
    jedro in vpliva na izražanje genov glede formacije eritrocitov pri sesalcih

FOSFORILACIJSKO ODVISNE PROTEINSKE INTERAKCIJE V SIGNALNIH POTEH
* Veliko signalnih proteinov ima domene, ki vežejo fosforilirane Tyr, Ser ali Thr predele drugih proteinov
* SH2-domene in PTB (fosfotirozin vezavne) domene vežejo proteine s fosforiliranim tirozinom
* SH3 in PH domene vežejo membranske fosfolipide PIP3

23
Q

Modularna struktura signalnih proteinov

A
  • Domena – globularna struktura, ki ima neko funkcijo (neke funkcionalne enote z definirano 3D strukturo) - naštej 5 domen in njihovo funkcijo
    PIP3
    Tyr-P
    DNA
    fosfolipidi
  • Omogočajo vezavo ali inhibicijo vezave določenih molekul
24
Q
  1. IONSKI KANALČKI
    lastnosti
A
  • Regulirajo transport ionov skozi celično membrano glede na:
    o Spremembe membranskega potenciala
    o Vezave ligandov na specifično mesto receptorja
  • Pomembna vloga v živčnem sistemu
    o Napetostno regulirani natrijevi kanali
    o Nikotinski acetilholinski receptor
    o Glutamatni receptor
    o GABA receptor A
25
Q
  1. IONSKI KANALČKI
    Električno polarizirane membrane

Na+/K+ črpalka

A
  • Notranjost celice je največkrat nabita negativno glede na zunanjost
    o Vm -50 do -70 mV
  • Membranski potencial vzdržuje Na+/K+ ATPazna črpalka
    o 3 Na+ ven
    o 2 K+ v celico
  • Pretok različnih ionov preko membrane je odvisen od njihovega koncentracijskega gradienta in električnega potenciala
  • Na+/K+ črpalka ima tri mesta kamor se lahko veže natrij in na drugi strani 2 mesti za kalij
  • Je ATPaza (razgrajuje ATP) –
    konformacija se spremeni
    (enkrat odprta na eno stran,
    drugič na drugo)
  • Črpalka črpa natrij ven iz celice in kalij v celico
  • Črpanje ni uravnoteženo (3 Na, 2 K) – imamo membranski potencial (zunaj več kationov kot znotraj), ki je po definiciji negativen (-50 do -70mV)
  • Odpremo natrijev kanalček, Na gre v celico, membranski
    potencial se manjša (pride do
    depolarizacije), kanački v okolici se odprejo (pomembno pri
    živčnih prenosih)
  • Odpremo kalijev kanalček, K gre iz celice, razlika v naboju se še bolj poveča (pride do
    hiperpolarizacije ali repolarizacije membrane;
    odvisno če so bili pred tem
    natrijevi kanački odprti)

ΔG=RT ln (cin/cout)+ZFVm

26
Q
  1. IONSKI KANALČKI
    Prenos signalov po živcih
A
  • Živčni signali se prenašajo kot električni impulzi
  • Prenos impulza vključuje z napetostjo reguliran Na+ in K+ kanal
  • Z napetostjo reguliran Ca2+ kanal na koncu aksona povzroči sproščanje nevrotransmiterja acetilholina
  • Acetilholin odpre specifični kanal na celici, ki sprejme signal

POTOVANJE AKCIJSKEGA POTENCIALA PO

ŽIVCIH

  • V nekem trenutku pride do depolarizacije membrane (zaradi vdora natrija)
  • Kalijevi kanalčki se odprejo malo po tem, natrijevi se ponovno zaprejo – kalij gre ven iz celice in pride do repolarizacije
  • Akcijski potencial potuje naprej do konca sinaptične špranje
  • Tam so od napetosti odvisni kalcijevi kanačlki
  • Sekretorne granule izločijo vsebino iz celice, v tem primeru acetilholin (ligand,
    ki se veže na od acetilholina odvisne natrijeve-kalcijeve kanačlke)
  • Acetilholin potuje do naslednje celice in se veže na receptor: tako odpre
    kanalčke (niso zelo specifični, spustijo natrij in kalcij), nato se spet odprejo natrijevi in kalijevi kanalčki in signal potuje naprej
27
Q
  1. IONSKI KANALČKI
    Na+ kanalčki
A
  • Imajo senzor za napetost (alfa vijačnica), ki ima bazične ak v svoji sestavi (so + nabite), ki zaznajo membranski potencial
  • Senzorna alfa vijačnica prisitka na vrata in mehanično drži vrata zaprta
  • Ko pride do depolarizacije, naboja ni več, heliks ne pritiska več, kanalček se odpre (preprost mehaniski mehanizem, ki omogoči odpiranje kanalčkov)
  • Na kanalček prepušča samo natrijeve ione (kalijevih pa ne – so večji); tudi natrijev ne
    prepušča kalija
    o Kalij mora odvreči vode, da gre lahko skozi kanalček, te vode se nadomestijo z interakcijami z ak (desolvatacija in resolvatacija z ak)
    o AK v kalijevem kanalčku so predaleč za vezavo natrijevih ionov – lahko se veže samo na eni strani, kar pa je termodinamsko neugodno
    o Niso pa vsi kanalčki specifični (Na in K sta)
28
Q

Določanje strukture proteinov:

A
  • Rentgenska difrakcija
  • NMR
  • Krioelektronska mikroskopija
29
Q
  1. IONSKI KANALČKI
    Acetilholinski receptor
A

Acetilholinski receptor

  • Nikotinski acetilholinski receptor
    o Ionski kanal za vnos Na+, Ca2+
    o Odpre se pod vplivom acetilholina !moraš znati prepoznat! (ne pa narisat)
  • 5 heliksov, ki se razprostirajo skozi membrano
  • Ko se acetilholin veže na heliks, se razporeditev obrne za skoraj 90 stopinj in kanalček se odpre (od-liganda-odvisen-kanalček)
    o hidrofilne ak so sedaj obrnjene notri (modra barva na shemi)
30
Q
  1. ADHEZIJSKI RECEPTORJI
A

ADHEZIJSKI RECEPTORJI
Razlikujejo se po tem, da omogočajo direkten prenos signala v in iz celice (ni enosmerno)

npr. Integrinski receptorji
* Heterodimerni, običajo imajo alfa in beta verigo
* Molekule se vežejo v
ekstracelularnem matriksu npr. s kolagenskimi vlakni, znotraj celice pa interagirajo s citoskeletom
* Zaznavajo koliko je sosedov, vplivajo na proliferacijo celic
* Okvara lahko vodi do nastanka tumorjev
* Imunske celice: bele krvničke potujejo na mesto okužbe (adhezijski receptorji so pomembni za signalizacijo)
o Sproščajo se signalne molekule za aktivacijo adhezijskih receptorjev

31
Q
  1. JEDRNI RECEPTORJI
A
  • Topni proteini v citosolu ali jedru na katere se vežejo hidrofobne signalne molekule
  • Se ne nahajajo na membrani jedra!
  • Služijo prenosu molekul, ki lahko same prečkajo membrano
  • Tipično steroidni in tiroidni hormoni, derivati etinojske kisline
  • Ker so hidrofobni ne morejo sami potovati po krvi (ker niso topni) – potrebujejo transportne proteine
  • Ob vezavi signalne molekule se spremeni geometrija
  • Regulirajo transkripcijo določenih genov
32
Q

Aplikativno znanje: KAKO VIDIMO?

A
  • Retina polno palčic in čepkov
    o Ko nanje pade foton se aktivirajo, signal pride do možganov in nastane slika
  • Paličice imajo od natrija in kalcija odvisen kanalček
  • V mirujočih celicah je odprt, nanj vezan cikličen GMP
  • Ključno vlogo imajo od cGMP odvisni kanalčki in sam cGMP
  • Sodelujejo tudi G proteini
    o Paličice: rodopsin
    o Čepki: opsin
  • Pod vplivom svetlobe se 11-cis-retinal prevtori v trans-retinal, kar povzroči aktivacijo rodopsina
  • Aktiviran rodopsin omogoči zamenjavo GDP z GTP na transduktinu; alfa podenota transduktina nato odstrani inhibitorno podenoto iz PDE (cMP fosfodiesteraze) in jo aktivira (lahko začne pretvarjati cGMP v 5-GMP)
  • cGMP koncentracija pade, ne drži več odprih Na+/Ca2+ kanalčkov, kanački se zaprejo, zaradi delovanja
    črpalk pa pride do hiperpolarizacije, ki se prenese v notranjost
  • Nadaljni pretok Ca2+ ionov zmanjša koncentracijo v citosolu, kar aktivira GC in inhibira PDE
  • cGMP koncetntracija ponovno naraste, kationski kanalčki se spet odprejo
  • RK (rodopsin kinaza) fosforilira rodopsin, arestin pa se veže na forforiliran karboksilni konec, s čimer se
    rodopsin inaktivira
  • Arestin disociira, rodopsin se defosforilira in trans-retinal se nazaj transformira v cis-retinal; rodopsin je
    pripravljen za nov cikel