פרק 1.2: יסודות הכימיה Flashcards
Bulk elements הינם _____ ולכן נדרשים בכמות של ____ . Trace elements הינם _____ ולכן נדרשים בכמות של ____ .
Bulk elements הינם רכיבים שחשובים מאוד לתאים ולרקמות האורגניזם ולכן נדרשים בכמות של גרמים באופן יום יומי. Trace elements הינם הכרחיים לתפקוד של חלבונים ואנזימים ספיציפיים ולכן נדרשים בכמות של מיליגרמים בודדים .
4 היסודות הכי שכיחים שמרכיבים יחד יותר מ-99% מהמסה של רוב התאים הינם _____
מימן, פחמן, חמצן, חנקן - HCON.
קשר סיגמא חזק/חלש/זהה לקשר פאי.
קשר סיגמא חזק מקשר פאי (קשר סיגמא חזק ויחיד במולקולה ונמצא על המישור. קשר פאי נמצא כשיש יותר מקשר אחד בין האטומים והוא ממוקם מעל או מתחת למישור- לכן קשר זה חלש יותר מסיגמא ומהיר יותר לפירוק).
ככל שקשר קוולנטי פולרי יותר, כך ____
ככל שקשר קוולנטי פולרי יותר, כך הוא חזק יותר ותדרש יותר אנרגיה לפרקו.
קשר כפול חזק וקצר/חלש וארוך מקשר יחיד, וקשר משולש חזק וקצר/חלש וארוך מקשר כפול.
קשר כפול חזק וקצר מקשר יחיד, וקשר משולש חזק וקצר מקשר כפול (אך לשים לב שקשר סיגמא בפני עצמו, חזק מקשר פאי).
כאשר האלקטרונים בקשר מסתובבים יותר סביב אחד הגרעינים נקבל מצב של ____
כאשר האלקטרונים בקשר מסתובבים יותר סביב אחד הגרעינים נקבל מצב של דו-קוטב או דיפול (dipole).
אופי הקשר התוך מולקולרי, משפיע על תכונותיה הכימיות של המולקולה ועל ______
אופי הקשר התוך מולקולרי, משפיע על תכונותיה הכימיות של המולקולה ועל סוג הקשרים הבין מולקולרים אותם תיצור (משפיע על היווצרות המתח החשמלי במולקולה והאם הוא יהיה לזמן ממושך -בקשר פולארי- או רגעי -בקשר לא פולארי-).
ככל שהקשרים התוך מולקולרים פולאריים יותר, כך חוזק הקשרים הבין מולקולרים של המולקולה ____
ככל שהקשרים התוך מולקולרים פולאריים יותר, כך חוזק הקשרים הבין מולקולרים של המולקולה יגדלו (המתח החשמלי בצד מסוים של המולקולה יוצר אסימטריה ויימשך למטענים המנוגדים אליו בסביבתו- משיכה אלקטרוסטטית).
ככל שהקשר התוך מולקולרי ____ יותר, כך תיווצר קוטביות לזמן ____ יותר, מה שימשוך ויחזיק יחד שתי מולקולות בתמיסה זמן רב יותר.
ככל שהקשר התוך מולקולרי פולארי יותר, כך תיווצר קוטביות לזמן ממושך יותר, מה שימשוך ויחזיק יחד שתי מולקולות בתמיסה זמן רב יותר.
סוג הקשר המרכזי באינטראקציות בין מולקולות הידרופוביות הוא ______
סוג הקשר המרכזי באינטראקציות בין מולקולות הידרופוביות הוא קשר ואן דר ואלס (לונדון).
עוצמת החיבור בקשרי ואן דר ואלס (לונדון) תקבע בעקר לפי ______
עוצמת החיבור בקשרי ואן דר ואלס (לונדון) תקבע בעקר לפי כמות הקשרים שבין המולקולות.
קשרי מימן חזקים/חלשים/זהים בהשוואה לקשרים קוולנטים.
קשרי מימן חלשים בהשוואה לקשרים קוולנטים (אך חזקים מקשרי לונדון ודיפול דיפול).
שני הכללים ליצירת קשרי מימן הם ____
שני הכללים ליצירת קשרי מימן הם שבכל מולקולה חייב להיות אטום N.O.F אחד ושבאחת המולקולות לפחות קיים קשר קוולנטי בין אטום ה-N.O.F לבין מימן H.
מני 2 דברים שקשרים בין מולקולריים ישפיעו עליהם
המסיסות של החומר (קשרי מימן יצרו קשר עם מים אך מולקולות הידרופוביות לא בהכרח - יכול להיות למולקולה צדדים הידרופובים והידרופילים) ומצב הצבירה של החומר (ככל שהקשרים הבין מולקולרים חזקים יותר, כך הם ייטו ליצור מצב צבירה מוצק מנוזל או נוזלי מגז).
טמפ’ ההתכה והרתיחה של החומר נקבעת עפ”י ______
סוג הקשרים הבין מולקולרים וחוזקם (יותר חזק- טמפ’ התכה ורתיחה גבוהה יותר וכן כמות האנרגיה לאידוי החומר גבוהה יותר) וכמות הקשרים הבין מולקולרים (יותר קשרים במולקולה ארוכה יותר או בעלת שטח פנים גדול יותר- טמפ’ גבוהה יותר).
רדיוס ון-דר-ולס הינו _____
רדיוס ון-דר-ולס הינו מידת הקרבה אותה מאפשר אטום מסוים לאטום אחר (כאשר שני גרעינים מתקרבים, ענני האלקטרונים שלהם מתחילים לדחות אחד את השני). במודלים של מילוי במרחב האטומים נראים בגודל פרופורציונלי לרדיוס הון דר ולס האופייני להם.
Hydrocarbon הינו _____ שקשור ל___ ול_____
Hydrocarbon הינו פחמן שקשור למימנים ולקבוצות פונקציונליות
פחמן מהווה _____ המשקל היבש של תאים.
פחמן מהווה יותר ממחצית המשקל היבש של תאים.
במקרה של ארבעה קשרים בודדים שיוצאים מאטום פחמן (טטראדר) הזווית בין כל שני קשרים היא ____ ואורך הקשר הממוצע הוא _____
במקרה של ארבעה קשרים בודדים שיוצאים מאטום פחמן (טטראדר) הזווית בין כל שני קשרים היא 109.5 ואורך הקשר הממוצע הוא 0.154nm.
שני אטומי פחמן המשתתפים בקשר יכולים להסתובב ביחס אליו _____. לעומת זאת, קשרים כפולים בניהם הינם _____ ולכן בעלי רוטציה ____.
שני אטומי פחמן המשתתפים בקשר יכולים להסתובב ביחס אליו בלי הגבלה (אלא אם לכל אחד מהם קשורה קבוצה גדולה או טעונה מאוד). לעומת זאת, קשרים כפולים הינם קצרים וקשיחים יותר (0.134 nm) ולכן בעלי רוטציה מוגבלת ולא חופשית.
במולקולות בעלות קשר כפול בין הפחמנים ישנה זווית של ____ בין קבוצות צד.
במולקולות בעלות קשר כפול בין הפחמנים ישנה זווית של 120 מעלות בין קבוצות צד (שני הפחמנים והאטומים שוכבים כולם באותו מישור קשיח).
מטבוליטים מרכזיים מכילים _____ ולעומתם מטבוליטים משניים מכילים _____ .
מטבוליטים מרכזיים מכילים קבוצה אוניברסלית של מולקולות קטנות, ולעומתם מטבוליטים משניים מכילים ביומולקולות קטנות הספציפיות לסוגים מסוימים של תאים או אורגניזמים .
המטבוליטים המרכזיים מעורבים במסלולים העיקריים/המשניים המתרחשים בחלק/כמעט בכל תא - המטבוליטים והמסלולים שנשמרו/נוצרו לאחרונה במהלך האבולוציה
המטבוליטים המרכזיים מעורבים במסלולים העיקריים המתרחשים כמעט בכל תא - המטבוליטים והמסלולים שנשמרו במהלך האבולוציה.
ממברנת התא חדירה/אינה חדירה למטבוליטים המרכזיים, ולכן הם _____ .
ממברנת התא אינה חדירה למטבוליטים המרכזיים, ולכן הם לכודים בתוך התא.
תני 3 דוגמאות למטבוליטים מרכזיים.
חומצות אמינו, נוקלאוטידים, סוכרים ונגזרותיהן המזורחנות, חומצות מונו, די וטרי קרבוקסיליות.
כל אוסף המולקולות הקטנות בתא נתון במכלול תנאים מסוים נקרא ____
כל אוסף המולקולות הקטנות בתא נתון במכלול תנאים מסוים נקרא מטבולום, metabolome (מקביל למונח “גנום”).
____ הוא האפיון השיטתי של המטובולום בתנאים ספציפיים מאוד (כגון מתן תרופה או חומר ביולוגי כגון אינסולין)
metabolomics הוא האפיון השיטתי של המטובולום בתנאים ספציפיים מאוד (כגון מתן תרופה או חומר ביולוגי כגון אינסולין)
____ הוא סך כל החלבונים הקיימים באורגניזם או תא מסוים (מקביל למונח מטבולום = כלל המטבוליטים בתא)
protrome הוא סך כל החלבונים הקיימים באורגניזם או תא מסוים (מקביל למונח מטבולום = כלל המטבוליטים בתא)
____ הוא האפיון השיטתי של החלבון, תחת מכלול תנאים ספציפי מאוד (מקביל למונח metabolomics)
proteomic הוא האפיון השיטתי של החלבון, תחת מכלול תנאים ספציפי מאוד (מקביל למונח metabolomics)
____ הם פולימרים של סוכרים פשוטים כגון גלוקוז (סוכרים=פחמימות).
הפוליסכרידים הם פולימרים של סוכרים פשוטים כגון גלוקוז (סוכרים=פחמימות).
שלושת התפקידים העיקריים של הפוליסכרידים הם:
משמשים כמאגרי דלק עשירים באנרגיה, משמשים כמרכיבים מבניים קשיחים של קירות התא (בצמחים ובחיידקים) וכאלמנטים לזיהוי חוץ-תאי הנקשרים לחלבונים בתאים אחרים.
ה- ____ של התא הוא כל המולקולות המכילות קרבוהידרטים (פחמימות).
ה- Glycome של התא הוא כל המולקולות המכילות קרבוהידרטים (פחמימות).
ה- ____ הם נגזרות פחמימנים (hydrocarbon) שאינן מסיסות במים.
השומנים, the lipids, הם נגזרות פחמימנים (hydrocarbon) שאינן מסיסות במים.
מה תפקידים של הליפידים (השומנים)?
משמשים כמרכיבים מבניים של ממברנות, כמאגרי דלק עשירים באנרגיה, פיגמנטים וכסיגנלים תוך תאיים.
פחמימנים הם ____ המכילות _____ לעומתם פחמימות (סוכרים) מכילות ______
פחמימנים הם תרכובות אורגניות המכילות אך ורק אטומי פחמן ומימן, לעומתם פחמימות (סוכרים) מכילות גם אטומי חמצן.
מול אחד של חלקיקים הם:
6.02*10^23
מס’ החלקיקים במול נקרא ___
מס’ החלקיקים במול נקרא מספר אבוגדרו.
אם כמות של חומר מסוים מכילה מספר אבוגרדו של חלקיקים, אותה הכמות היא ___ מול של חומר.
אם כמות של חומר מסוים מכילה מספר אבוגרדו של חלקיקים (6.02*10^23) אותה הכמות היא 1 מול של חומר.
כדי לעבור ממולים למספר חלקיקים _____ במספר אבוגדרו.
כדי לעבור ממולים למספר חלקיקים מכפילים במספר אבוגדרו.
כדי לעבור ממספר חלקיקים למספר מולים _____ במספר אבוגדרו.
כדי לעבור ממספר חלקיקים למספר מולים מחלקים במספר אבוגדרו.
_____ היא המסה בגרמים של כמות חומר המכילה מספר אבוגדרו של חלקיקים והיא נמדדת ביחידות של _____ .
מסה מולרית היא המסה בגרמים של כמות חומר המכילה מספר אבוגדרו של חלקיקים והיא נמדדת ביחידות של גרם למול gram/mole.
מסה מולקולרית מבטאת את המסה של _____ , מחושבת ע”י ____ ומבוטאת ביחידות של _____
מסה מולקולרית מבטאת את המסה של מולקולה אחת , מחושבת ע”י מסה מולארית * מספר המולים, ומבוטאת ביחידות של דלטון (Da/u).
_____ הינם מולקולות עם הרכב אטומים זהה, אך חיבור שונה של האטומים.
איזומרים מבניים הינם מולקולות עם הרכב אטומים זהה, אך חיבור שונה של האטומים (למשל טאוטומרים, קטון ואלדהיד).
אותה נוסחה כימית, סידור מבני שונה - איזומרים ____
איזומרים מבניים (למשל קבוצת הקרבוניל נמצאת בקצה השרשרת באלדוז ובפחמן השני בקטוז).
ציס וטרנס הם איזומרים ____
מרחביים (stereoisomers) לא כיראליים (איזומרים הנבדלים זה מזה בסידור הקבוצות המתמירות ביחס לקשר הכפול המונע סיבוב סביבו).
הגורמים הקובעים את הקונפיגורציה (תצורה) המולקולרית הם:
נוכחות קשרים כפולים (מונעים כמעט לחלוטין תנועה סביבם) ומרכזים כיראליים (קבוצות מתמירות מסודרות סביבם באוריינטציה מסוימת).
ניתן/לא ניתן להמיר סטראואיזומר אחד לאחר מבלי לפרק קשר קוולנטי אחד או יותר.
לא ניתן להמיר סטראואיזומר אחד לאחר מבלי לפרק קשר קוולנטי אחד או יותר.
איזומרים נחלקים לאיזומרים _____. ____ נחלקים לפי _____ כאשר בקבוצה אחת נכללים _____ ובקבוצה השנייה ____.
איזומרים נחלקים לאיזומרים מבניים ומרחביים (stereoisomers). איזומרים מרחביים נחלקים לפי מרכז כיראלי, כאשר בקבוצה אחת נכללים איזומרי ציס וטראנס ובקבוצה השנייה אננטיומרים ודיאסטיומרים. (תכונותיהם הכימיות דומות, אך תכונותיהם הביולוגיות והפיזיקליות שונות).
קבוצה מרכזית, שהקבוצות הסובבות אותה יכולות להתארגן ביותר מצורה מרחבית אחת נקראת ____
מרכז כיראלי
אטום פחמן שקשורים אליו ארבעה מתמירים שונים נקרא ____ , ואטומי פחמן _____ נקראים ______.
אטום פחמן שקשורים אליו ארבעה מתמירים שונים נקרא א-סימטרי, ואטומי פחמן א-סימטרים נקראים מרכזים כיראלים.
מס’ הסטריאואיזומרים של מולקולה לה מרכזים כיראלים הוא _____
2^n , כאשר n = מס’ המרכזים הכיראלים.
פחמן בעל 3 קבוצות שונות הינו ___
א-כיראלי/סימטרי (רק תצורה אחת אפשרית).
זוג סטראואיזומרים שכל אחד מהם הוא תמונת מראה של רעהו הם ___
אננטיומרים
____ מתקבלים כאשר יש יותר ממרכז כיראלי אחד והם אינם תמונת ראי זה של זה.
דיאסטריומרים
