חלבונים

Question 1

שתי מולקולות של חומצות אמינו יכולות להתחבר יחד _____, בקשר הנקרא “קשר ____” היוצר ____ (=עם קשר ____ יחיד).

Answer 1

שתי מולקולות של חומצות אמינו יכולות להתחבר יחד קוולנטית, בקשר הנקרא “קשר פפטידי” היוצר די-פפטיד (=עם קשר פפטידי יחיד).

Question 2

קשר פפטידי הוא ריאקציית
____________
שבמהלכה ______ מולקולת מים
(________).
הידרוקסיד מהקבוצה ה______ של ח.א אחת ומימן מה____ של ח”א שנייה.
כך, נוצר הקשר הפפטידי בין החומצות, שזהו גם קשר ____ בין הפחמן הקרבונילי לחנקן האמיני היוצרים
______.

Answer 2

קשר פפטידי הוא ריאקציית דחיסה
(condensation),
שבמהלכה מוסרת מולקולת מים
(dehydration).
הידרוקסיד מהקבוצה הקרבוקסילית של ח.א אחת ומימן מהאמין של ח”א שנייה.
כך, נוצר הקשר הפפטידי בין החומצות, שזהו גם קשר אמידי בין הפחמן הקרבונילי לחנקן האמיני היוצרים אמיד.

Question 3

קשר פפטידי הוא גם קשר _____ בין הפחמן הקרבונילי לחנקן האמיני היוצרים
______.

Answer 3

קשר פפטידי הוא גם קשר אמידי בין הפחמן הקרבונילי לחנקן האמיני היוצרים אמיד.

Question 4

כיצד נוצר הקשר הפפטידי?

Answer 4

קשר פפטידי הוא ריאקציית דחיסה
(condensation),
שבמהלכה מוסרת מולקולת מים
(dehydration).
הידרוקסיד מהקבוצה הקרבוקסילית של ח.א אחת ומימן מהאמין של ח”א שנייה.
כך, נוצר הקשר הפפטידי.

Question 5

הכיווניות של קשירת חומצות אמינו מהקצה ה
____
לקצה ה
________.
כלומר ח”א
____
תוקפת את ח”א
_____

תמיד נוסיף ח.א לצד ה
_______.

Answer 5

הכיווניות של קשירת חומצות אמינו מהקצה האמיני
(הנוקלאופיל - N)
לקצה הקרבוקסילי
(האלקטרופיל-הפחמן הקרבונילי).
כלומר ח”א
X+1
תוקפת את ח”א
X.
תמיד נוסיף ח.א לצד הקרבוקסילי.

Question 6

תמיד נוסיף ח.א לצד ה
________.

Answer 6

קרבוקסילי

Question 7

שתי מולקולות של חומצות אמינו מחוברות ע”י קשר פפטידי ____, ליצירת
_____.
שלוש חומצות אמינו, קשורות ב____ קשרי פפטיד ויוצרות
_____.
ארבע חומצות אמינו קשורות ב____ קשרים פפטידים ויוצרות
_____
חמש חומצות אמינו קשורות ב____ קשרים פפטידים ליצירת _____ וכך הלאה.

Answer 7

שתי מולקולות של חומצות אמינו מחוברות ע”י קשר פפטידי יחיד, ליצירת די-פפטיד.
שלוש חומצות אמינו, קשורות בשני קשרי פפטיד ויוצרות טריפפטיד.
ארבע חומצות אמינו קשורות בשלושה קשרים פפטידים ויוצרות טטרה פפטיד (tetrapeptide),
חמש חומצות אמינו קשורות בארבע קשרים פפטידים ליצירת פנטה-פפטיד (pentapeptide) וכך הלאה.

Question 8

אוליגו-פפטיד
oligopeptide -
שרשרת _____ של חומצות אמינו, ואילו פולי-פפטיד
polypeptide -
שרשרת _____ של חומצות אמינו.

Answer 8

אוליגו-פפטיד
oligopeptide -
שרשרת קצרה של חומצות אמינו, ואילו פולי-פפטיד
polypeptide -
שרשרת ארוכה של חומצות אמינו.

Question 9

לעיתים מבלבלים בין המושג חלבון לפוליפפטיד.
לפי הספר, לפוליפפטידים יש בדרך כלל משקל מולקולקרי ____ דלטון (גרם למול) ולחלבונים יש משקל מולקולרי _____ יותר.

Answer 9

לעיתים מבלבלים בין המושג חלבון לפוליפפטיד.
לפי הספר, לפוליפפטידים יש בדרך כלל משקל מולקולקרי מתחת ל-10,000 דלטון (גרם למול) ולחלבונים יש משקל מולקולרי גבוה יותר.

Question 10

חומצת אמינו בפפטיד נקראת לעיתים קרובות
____
החלק שנותר לאחר שהמולקולה איבדה את ה____ - אטום המימן מקבוצת ה___ שלה וההידרוקסיל מקבוצת ה____ שלה.

Answer 10

חומצת אמינו בפפטיד נקראת לעיתים קרובות שייר
(residue),
החלק שנותר לאחר שהמולקולה איבדה את המים - אטום המימן מקבוצת האמינו שלה וההידרוקסיל מקבוצת הקרבוקסיל שלה.

Question 11

כאשר מוצג רצף חומצות אמינו של פפטיד, פוליפפטיד או חלבון, הקצה האמינו טרמינלי תמיד ימוקם בצד ____, והקצה של הקרבוקסיל החופשי מ____. וכן, הרצף תמיד יקרא מ
_____
(_______)
ל
______
(_______).

Answer 11

כאשר מוצג רצף חומצות אמינו של פפטיד, פוליפפטיד או חלבון, הקצה האמינו טרמינלי תמיד ימוקם בצד שמאל, והקצה של הקרבוקסיל החופשי מימין. וכן, הרצף תמיד יקרא משמאל
(N-terminal)
לימין
(C-terminal).

Question 12

בפפטיד, שיירי חומצות האמינו שבקצוות, זו עם קבוצת-האמינו החופשיות, נקראת ה
_____ (______)
ואילו חומצת האמינו שבקצה השני, בעלת קבוצת קרבוקסיל חופשית- נקראת
_______ (______)
והם ____ מעורבים בקשר הפפטידי.

Answer 12

בפפטיד, שיירי חומצות האמינו שבקצוות, זו עם קבוצת-האמינו החופשיות, נקראת האמינו טרמינל
(N-terminal)
ואילו חומצת האמינו שבקצה השני, בעלת קבוצת קרבוקסיל חופשית- נקראת הקרבוקסי טרמינל
(C-terminal)
והם אינם מעורבים בקשר הפפטידי.

Question 13

למרות שהידרוליזה של קשר פפטידי הינה ריאקציה אקסרגונית (_____), היא מתרחשת באופן ____, מכיוון שיש לה אנרגיית אקטיבציה ____ מאוד.
בזכות המחסום האנרגטי הזה, הקשרים הפפטידים בחלבונים ____ יחסית (____ מעורבות של אנזימים), עם זמן מחצית חיים
(t1/2)
של כ-___ שנים בתנאים התוך-תאיים.

Answer 13

למרות שהידרוליזה של קשר פפטידי הינה ריאקציה אקסרגונית (ספונטנית), היא מתרחשת באופן איטי, מכיוון שיש לה אנרגיית אקטיבציה גבוהה מאוד.
בזכות המחסום האנרגטי הזה, הקשרים הפפטידים בחלבונים יציבים יחסית (ולא מתפרקים ללא מעורבות של אנזימים), עם זמן מחצית חיים
(t1/2)
של כ-7 שנים בתנאים התוך-תאיים.

Question 14

מהו זמן מחצית החיים
(t1/2)
של חלבונים?

Answer 14

כ-7 שנים בתנאים התוך-תאיים.

למרות שהידרוליזה של קשר פפטידי הינה ריאקציה אקסרגונית (ספונטנית), היא מתרחשת באופן איטי, מכיוון שיש לה אנרגיית אקטיבציה גבוהה מאוד.
בזכות המחסום האנרגטי הזה, הקשרים הפפטידים בחלבונים יציבים יחסית (ולא מתפרקים ללא מעורבות של אנזימים),

Question 15

האם המשקל המולקולרי של פפטיד קשור לטיב או חשיבותו תפקודו?
תני דוגמה.

Answer 15

המשקל המולקולרי של פפטיד או חלבון לא בהכרח קשור לטיב או חשיבות תפקודו. אפילו לפפטידים הקטנים ביותר יכולות להיות השפעות חשובות מבחינה ביולוגית.
ניקח לדוגמה את האספרטיים
L-aspartyl-L-phenylalanine ,
ממתיק המסונתז באופן מלאכותי שהינו די פפטיד (מורכב משתי ח”א - אספרטאט ופנילאלאנין שבקצהו מתיל)

Question 16

החלבון הכבד ביותר הינו

Answer 16

Titin (human)

*** המשקל המולקולרי של פפטיד או חלבון לא בהכרח קשור לטיב או חשיבות תפקודו.

Question 17

_____
חומצות האמינו הנפוצות, כמעט אף פעם לא/תמיד ימצאו בכמות שווה בחלבון.

Answer 17

20
חומצות האמינו הנפוצות, כמעט אף פעם לא ימצאו בכמות שווה בחלבון.

Question 18

חלק מחומצות האמינו בחלבון יכולות/לא יכולות להימצא רק פעם אחת או כלל לא בסוג מסוים של חלבון בזמן שחומצות אמינו אחרות יכולות להימצא בכמות
_____.

Answer 18

חלק מחומצות האמינו בחלבון יכולות להימצא רק פעם אחת או כלל לא בסוג מסוים של חלבון בזמן שחומצות אמינו אחרות יכולות להימצא בכמות רבה.

Question 19

על פי מה חלבונים מצומדים מקוטלגים?

Answer 19

חלבונים מצומדים מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות הפרוסטטיות שלהם.

Question 20

תני 3 גומאות לקבוצות פרוסטטיות

Answer 20

חלבונים מצומדים מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות הפרוסטטיות שלהם.

ליפופרוטאינים Lipoproteins -
מכילים שומנים.
גליקופרוטאינים glycoproteins -
מכילים קבוצות סוכר.
מטאלופרוטאינים metalloproteins -
מכילים מתכות ספציפיות.

Question 21

חלבונים מצומדים מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות ה_____ שלהם.

Answer 21

חלבונים מצומדים מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות הפרוסטטיות שלהם.

Question 22

_____
מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות הפרוסטטיות שלהם.

Answer 22

חלבונים מצומדים מקוטלגים על בסיס הטבע הכימי של הקבוצות הפרוסטטיות שלהם.

Question 23

חלבונים יכולים להכיל קבוצה פרוסטטית ____ או ___. לרוב הקבוצה הפרוסטטית משחקת תפקיד קריטי בתפקוד ה_____ של החלבון.

Answer 23

חלבונים יכולים להכיל קבוצה פרוסטטית אחת או יותר. לרוב הקבוצה הפרוסטטית משחקת תפקיד קריטי בתפקוד הביולוגי של החלבון.

Question 24

לחלבונים ארבע רמות בהיררכיה של המבנה שלהם. מה הוא המבנה הראשוני
primary structure
?

Answer 24

מרכיב החשוב ביותר במבנה הראשוני הוא רצף חומצות האמינו בשרשרת הפוליפפטידית, הקשורות בקשר קוולנטי פפטידי אחת לשנייה.

כל סוגי הקשרים הקוולנטים, בעיקר קשרים פפטידים וקשרים די סולפידים
(S-S)
נחשבים כמבנה הראשוני של החלבון.

המבנה הראשוני של חלבון קובע כיצד החלבון מתקפל למבנה התלת ממדי הייחודי שלו, מה שיקבע את תפקוד החלבון.

Question 25

כל סוגי הקשרים ה_____, בעיקר קשרים ____ וקשרים _____, נחשבים כמבנה הראשוני של החלבון.

Answer 25

כל סוגי הקשרים הקוולנטים, בעיקר קשרים פפטידים וקשרים די סולפידים
(S-S)
נחשבים כמבנה הראשוני של החלבון.

Question 26

המבנה הראשוני של חלבון קובע כיצד החלבון _______, מה שיקבע את ______ החלבון.

Answer 26

המבנה הראשוני של חלבון קובע כיצד החלבון מתקפל למבנה התלת ממדי הייחודי שלו, מה שיקבע את תפקוד החלבון.

Question 27

לרוב הרצף של החלבון שמור אך לעיתים, נמצא גרסאות מעט שונות של רצפי ח”א בחלבונים האנושיים, הקיימים באוכלוסייה.
לחלבונים אלו קוראים חלבונים
________
המהווים כ-____% מהחלבונים של בני אדם.

Answer 27

לחלבונים אלו קוראים חלבונים פולימורפים
polymorphic
המהווים כ-25-30% מהחלבונים של בני אדם.

לרבים מהווריאציות הללו ברצף החלבון יש השפעה מועטה אם בכלל על תפקוד החלבון. ישנם חלבונים המבצעים פונקציה דומה במינים הרחוקים מאוד אחד מהשני, והם יכולים להיות שונים מאוד בגודל הכולל של החלבון וברצף חומצות האמינו.

למרות שרצף חומצות האמינו באזורים מסוימים של המבנה הראשוני עשויים להשתנות במידה ניכרת מבלי להשפיע על התפקוד הביולוגי, רוב החלבונים מכילים אזורים שמורים יותר, החיוניים לתפקודם ולכן הרצף שבאזור הספציפי הזה (בד”כ האזור הפעיל בחלבון) נשמר.
החלק היחסי של הרצף, שהוא קריטי לפעילות החלבון, משתנה מאוד מחלבון לחלבון.

Question 28

מהם חלבונים פולימורפים
polymorphic?
כמה אחוז הם מהווים מהחלבונים של בני אדם?

Answer 28

לרוב הרצף של החלבון שמור אך לעיתים, נמצא גרסאות מעט שונות של רצפי ח”א בחלבונים האנושיים, הקיימים באוכלוסייה.
לחלבונים אלו קוראים חלבונים פולימורפים
polymorphic
המהווים כ-25-30% מהחלבונים של בני אדם.

לרבים מהווריאציות הללו ברצף החלבון יש השפעה מועטה אם בכלל על תפקוד החלבון. ישנם חלבונים המבצעים פונקציה דומה במינים הרחוקים מאוד אחד מהשני, והם יכולים להיות שונים מאוד בגודל הכולל של החלבון וברצף חומצות האמינו.

למרות שרצף חומצות האמינו באזורים מסוימים של המבנה הראשוני עשויים להשתנות במידה ניכרת מבלי להשפיע על התפקוד הביולוגי, רוב החלבונים מכילים אזורים שמורים יותר, החיוניים לתפקודם ולכן הרצף שבאזור הספציפי הזה (בד”כ האזור הפעיל בחלבון) נשמר.
החלק היחסי של הרצף, שהוא קריטי לפעילות החלבון, משתנה מאוד מחלבון לחלבון.

Question 29

לרבים מהווריאציות ברצף החלבון
(חלבונים
_____)
יש השפעה ____ על תפקוד החלבון.
תני דוגמה.

Answer 29

לרבים מהווריאציות ברצף החלבון
(חלבונים פולימורפים)
יש השפעה מועטה אם בכלל על תפקוד החלבון.

ישנם חלבונים המבצעים פונקציה דומה במינים הרחוקים מאוד אחד מהשני, והם יכולים להיות שונים מאוד בגודל הכולל של החלבון וברצף חומצות האמינו.

למרות שרצף חומצות האמינו באזורים מסוימים של המבנה הראשוני עשויים להשתנות במידה ניכרת מבלי להשפיע על התפקוד הביולוגי, רוב החלבונים מכילים אזורים שמורים יותר, החיוניים לתפקודם ולכן הרצף שבאזור הספציפי הזה (בד”כ האזור הפעיל בחלבון) נשמר.
החלק היחסי של הרצף, שהוא קריטי לפעילות החלבון, משתנה מאוד מחלבון לחלבון.

Question 30

למרות שרצף חומצות האמינו באזורים מסוימים של המבנה הראשוני עשויים להשתנות במידה ניכרת מבלי להשפיע על התפקוד הביולוגי, רוב החלבונים מכילים אזורים ____ יותר, ה___ לתפקודם ולכן הרצף שבאזור הספציפי הזה (בד”כ האזור ה____) ____.
החלק היחסי של הרצף, שהוא ___ לפעילות החלבון, ____ מאוד מחלבון לחלבון.

Answer 30

למרות שרצף חומצות האמינו באזורים מסוימים של המבנה הראשוני עשויים להשתנות במידה ניכרת מבלי להשפיע על התפקוד הביולוגי, רוב החלבונים מכילים אזורים שמורים יותר, החיוניים לתפקודם ולכן הרצף שבאזור הספציפי הזה (בד”כ האזור הפעיל בחלבון) נשמר.
החלק היחסי של הרצף, שהוא קריטי לפעילות החלבון, משתנה מאוד מחלבון לחלבון.

Question 31

החלק היחסי של הרצף השמור בחומצות האמינו, שהוא קריטי לפעילות החלבון, _____ מחלבון לחלבון.

Answer 31

משתנה מאוד

Question 32

תארי את המבנה השניוני
secondary structure
של החלבון

Answer 32

המבנה השניוני של החלבון מבוסס על אינטראקציות שנוצרות בין שיירי חומצות האמינו שיוצרים מבנים חוזרנים ויציבים. מבנים אלו נוצרים ע”י כיפופים ועיוותים בשלד הפפטיד (מאחר ולשלד הפפטיד תכונות של קשר כפול שלא מאפשר רוטציה חופשית), תוך יצירת קשרי מימן בין הקבוצות שאינן חלק משייר ה
R.

Question 33

המבנה השניוני של החלבון מבוסס על אינטראקציות שנוצרות בין שיירי חומצות האמינו שיוצרים מבנים ____ ו____. מבנים אלו נוצרים ע”י ____ ו___ בשלד הפפטיד (מאחר ולשלד הפפטיד תכונות של ___ ש____), תוך יצירת קשרי ___ בין הקבוצות שאינן חלק משייר ה
R.

Answer 33

המבנה השניוני של החלבון מבוסס על אינטראקציות שנוצרות בין שיירי חומצות האמינו שיוצרים מבנים חוזרנים ויציבים. מבנים אלו נוצרים ע”י כיפופים ועיוותים בשלד הפפטיד (מאחר ולשלד הפפטיד תכונות של קשר כפול שלא מאפשר רוטציה חופשית), תוך יצירת קשרי מימן בין הקבוצות שאינן חלק משייר ה
R.

Question 34

תארי את המבנה השלישוני tertiary structure
של החלבון

Answer 34

המבנה השלישוני של החלבון מתאר את כל האספקטים של הקיפול התלת מימדי של הפוליפפטיד
(כל הקשרים האפשריים קיימים, כולל השתתפות שיירי ה
R)

Question 35

המבנה השלישוני של החלבון מתאר את כל האספקטים של ה____ של הפוליפפטיד
(כל הקשרים ____, כולל השתתפות שיירי ה
R)

Answer 35

המבנה השלישוני של החלבון מתאר את כל האספקטים של הקיפול התלת מימדי של הפוליפפטיד
(כל הקשרים האפשריים קיימים, כולל השתתפות שיירי ה
R)

Question 36

תארי את המבנה הריביעוני
quaternary structure
של החלבון

Answer 36

המבנה הרביעוני הוא הארגון של מספר תת יחידות פוליפפטידיות של החלבון במרחב, ליצירת קומפקס.

Question 37

המבנה הרביעוני של החלבון הוא ה____ של מספר תת יחידות פוליפפטידיות של החלבון במרחב, ליצירת
____.

Answer 37

המבנה הרביעוני של החלבון הוא הארגון של מספר תת יחידות פוליפפטידיות של החלבון במרחב, ליצירת קומפקלס.

Question 38

תארי את 4 רמות ההיררכיה של מבנה החלבון.

Answer 38

המבנה הראשוני -
רצף חומצות האמינו בשרשרת הפוליפפטידית.

המבנה השניוני -
אינטראקציות שנוצרות בין שיירי חומצות האמינו שיוצרים מבנים חוזרנים ויציבים. אלפא הליקס.
נוצר ע”י כיפופים בשלד הפפטיד ויצירת קשרי מימן בין הקבוצות שאינן חלק משייר האר.

המבנה השלישוני -
כל האספקטים של הקיפול התלת מימדי של הפוליפפטיד (כל הקשרים האפשריים קיימים). שרשרת פוליפפטידית.

המבנה הרביעוני -
ארגון מס’ תת יח’ פוליפפטידיות של החלבון במרחב ליצירת קומקפלס.

Question 39

הארגון המרחבי של האטומים בחלבון או בכל חלק בחלבון נקרא _____. ה_____האפשרית של החלבון או מקטע החלבון כוללת כל מצב של מבנה שהוא יכול לרכוש ללא
_________.
הצורך במספר ____ יציבות משקף את ה____ שחייבים להעשות ברוב החלבונים בעת קשירתם למולקולות אחרות או בעת שהם מזרזים ריאקציות.

Answer 39

הארגון המרחבי של האטומים בחלבון או בכל חלק בחלבון נקרא קונפורמציה. הקונפורמציה האפשרית של החלבון או מקטע החלבון כוללת כל מצב של מבנה שהוא יכול לרכוש ללא שבירה של קשרים קוולנטים.
הצורך במספר קונפורמציות יציבות משקף את השינויים שחייבים להעשות ברוב החלבונים בעת קשירתם למולקולות אחרות או בעת שהם מזרזים ריאקציות.

Question 40

חלבונים בצורתם המקופלת כראוי והפונקציונלית נקראים חלבונים
______.
נגדיר יציבות כנטייה של החלבון להישמר בקונפורמציה ה____ שלו
(הכי מועדף תרמודינמית - בעלות האנרגיה החופשית של גיבס הנמוכה ביותר).

Answer 40

חלבונים בצורתם המקופלת כראוי והפונקציונלית נקראים חלבונים נאטיביים
(native) (=מצבם הטבעי).
נגדיר יציבות כנטייה של החלבון להישמר בקונפורמציה הנאיטיבית שלו
(הכי מועדף תרמודינמית - בעלות האנרגיה החופשית של גיבס הנמוכה ביותר).

Question 41

מהם חלבונים נאטיביים?

Answer 41

חלבונים בצורתם המקופלת כראוי והפונקציונלית נקראים חלבונים נאטיביים
(native) (=מצבם הטבעי).

נגדיר יציבות כנטייה של החלבון להישמר בקונפורמציה הנאיטיבית שלו
(הכי מועדף תרמודינמית - בעלות האנרגיה החופשית של גיבס הנמוכה ביותר).

Question 42

הקונפורמציה האפשרית של החלבון או מקטע החלבון כוללת כל מצב של מבנה שהוא יכול לרכוש
__________

Answer 42

ללא שבירה של קשרים קוולנטים.

Question 43

האנטרופיה
(S)
והאינטראקציות קושרות המימן של קבוצות רבות בשרשרת הפוליפפטידית עם המים
(H),
נוטות לתחזק את המצב ה
_________.
זאת משום שבאופן תיאורטי שרשרת פוליפפטיד נתונה יכולה להיות בעלת _____ קונפורמציות (=יותר _____).

מה הן האינטראקציות הכימיות שמשנות מצב זה ומצייבות את הקונפורמציה הנאיטיבית כוללות?

Answer 43

האנטרופיה
(S)
והאינטראקציות קושרות המימן של קבוצות רבות בשרשרת הפוליפפטידית עם המים
(H),
נוטות לתחזק את המצב הלא מקופל. זאת משום שבאופן תיאורטי שרשרת פוליפפטיד נתונה יכולה להיות בעלת אינספור קונפורמציות
(=יותר אי סדר).

האינטראקציות הכימיות שמשנות מצב זה ומצייבות את הקונפורמציה הנאיטיבית כוללות:
קשרים דיסולפידים (קוולנטים חזקים) ואינטראקציות חלשות שאינן קוולנטיות: קשרי מימן, אינטראקציות הידרופוביות ויוניות.

Question 44

האינטראקציות הכימיות שמצייבות את הקונפורמציה הנאיטיבית כוללות
….

Answer 44

קשרים דיסולפידים (קוולנטים חזקים) ואינטראקציות חלשות שאינן קוולנטיות: קשרי מימן, אינטראקציות הידרופוביות ויוניות.

האנטרופיה והאינטראקציות קושרות המימן של קבוצות רבות בשרשרת הפוליפפטידית עם המים , נוטות לתחזק את המצב הלא מקופל. זאת משום שבאופן תיאורטי שרשרת פוליפפטיד נתונה יכולה להיות בעלת אינספור קונפורמציות (=יותר אי סדר).

Question 45

הסביבה ____ הינה בעלת יכולת חיזור גבוהה עקב ריכוזים גבוהים של מחזרים כמו גלוטטיון. לכן רוב הסולפהידרילים
(sulfhydryls)
ישארו במצב המחוזר.
הסביבה ____, לעיתים קרובות, הרבה יותר מחמצנת וכך נוטה יותר לגרום ליצירה של קשרים דיסולפידים.

Answer 45

הסביבה בתוך רוב התאים הינה בעלת יכולת חיזור גבוהה עקב ריכוזים גבוהים של מחזרים כמו גלוטטיון. לכן רוב הסולפהידרילים (sulfhydryls)
ישארו במצב המחוזר.
הסביבה מחוץ לתא, לעיתים קרובות, הרבה יותר מחמצנת וכך נוטה יותר לגרום ליצירה של קשרים דיסולפידים.

Question 46

הסביבה בתוך רוב התאים הינה בעלת יכולת ____ גבוהה עקב ריכוזים גבוהים של ____ כמו ____. לכן רוב ה
_______
יהיו במצב ה
_____.

Answer 46

הסביבה בתוך רוב התאים הינה בעלת יכולת חיזור גבוהה עקב ריכוזים גבוהים של מחזרים כמו גלוטטיון. לכן רוב הסולפהידרילים (sulfhydryls)
ישארו במצב המחוזר.

Question 47

הסביבה מחוץ לתא, לעיתים קרובות, הרבה יותר _____ וכך נוטה יותר לגרום ליצירה של
_____.

Answer 47

הסביבה מחוץ לתא, לעיתים קרובות, הרבה יותר מחמצנת וכך נוטה יותר לגרום ליצירה של קשרים דיסולפידים.

Question 48

באאוקריוטים, קשרים דיסולפידים נמצאים בעיקר בחלבונים ש_____ (ההורמון ____ למשל מהווה דוגמה לכך).

Answer 48

באאוקריוטים, קשרים דיסולפידים נמצאים בעיקר בחלבונים שמופרשים אל מחוץ לתא (ההורמון אינסולין למשל מהווה דוגמה לכך).

Question 49

קשרים דיסולפידים ____ נפוצים גם בחלבונים בקטריאלים. לעומת זאת בחיידקים תרמופיליים
thermophilic bacteria
ובארכיאה, החיים בסביבות בעלות טמפ’ גבוהות, דווקא ___ חלבונים רבים המכילים קשרים דיסולפידיים חזקים התורמים ל
_______.

Answer 49

קשרים דיסולפידים אינם נפוצים גם בחלבונים בקטריאלים. לעומת זאת בחיידקים תרמופיליים
thermophilic bacteria
ובארכיאה, החיים בסביבות בעלות טמפ’ גבוהות, דווקא יש חלבונים רבים המכילים קשרים דיסולפידיים חזקים התורמים ליציבות החלבונים.

Question 50

לשם שבירה של קשר קוולנטי יחיד דרושים כ-____ עד
_____
kJ/mol.
בעוד שאינטראקציות חלשות ניתנות לשבירה ע”י ____ עד
_____
kJ/mol.

Answer 50

לשם שבירה של קשר קוולנטי יחיד דרושים כ-200 עד 400
kJ/mol.
בעוד שאינטראקציות חלשות ניתנות לשבירה ע”י 1.4 עד 30
kJ/mol.

Question 51

למרות שלשם שבירה של קשר קוולנטי יחיד דרושים כ-____ עד
____
kJ/mol.
בעוד שאינטראקציות חלשות ניתנות לשבירה ע”י ____ עד
______
kJ/mol,
מכיוון שהאינטראקציות החלשות ____ יותר ו____ יותר בחלבון, הן אלו שיהוו את ה_____ ה____ בסופו של דבר את מבנה החלבון

Answer 51

למרות שלשם שבירה של קשר קוולנטי יחיד דרושים כ-200 עד 400
kJ/mol.
בעוד שאינטראקציות חלשות ניתנות לשבירה ע”י 1.4 עד 30
kJ/mol,
מכיוון שהאינטראקציות החלשות נפוצות יותר ורבות יותר בחלבון, הן אלו שיהוו את ההשפעה העיקרית המייצבת בסופו של דבר את מבנה החלבון

Question 52

מי הן האינטראקציות החלשות שהכי תורמות ליציבות החלבון?

Answer 52

אינטראקציות הידרופוביות

Question 53

אינטראקציות הידרופוביות הן האינטראקציות ה____ שהכי תורמות ל
___________.

Answer 53

אינטראקציות הידרופוביות הן האינטראקציות החלשות שהכי תורמות ליציבות החלבון.

Question 54

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה, שנקראת
__________

Answer 54

שכבת המסה
solvation layrt.

Question 55

מה היא שכבת המסה
solvation layrt
?

Answer 55

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה, שנקראת שכבת המסה
solvation layrt.

Question 56

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה
(שנקראת
_____).
העליה בסדר של ארגון מולקולות המים בשכבת המעטפת נמצאת בקורולציה עם ____ באנטרופיה
(S)
של המים שאינה מועדפת. המולקולה ההידרופובית גם ___ קשרי מימן שהמים שבסביבה יצרו בינם לבין עצמם, אך לא מספקת לכך פיצוי! כלומר ישנה גם ____ באנתלפיה
H.

Answer 56

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה
(שנקראת שכבת המסה -
solvation layrt).
העליה בסדר של ארגון מולקולות המים בשכבת המעטפת נמצאת בקורולציה עם ירידה באנטרופיה
(S)
של המים שאינה מועדפת. המולקולה ההידרופובית גם מנתקת קשרי מימן שהמים שבסביבה יצרו בינם לבין עצמם, אך לא מספקת לכך פיצוי! כלומר ישנה גם עלייה באנתלפיה
H.

Question 57

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה
(שנקראת
_________).
ה____ בסדר של ארגון מולקולות המים בשכבת המעטפת נמצאת בקורולציה עם ירידה ב
_____
של המים שאינה מועדפת. המולקולה ההידרופובית גם מנתקת קשרי מימן שהמים שבסביבה יצרו בינם לבין עצמם, אך לא מספקת לכך פיצוי! כלומר ישנה גם עלייה ב
________.

Answer 57

כאשר מולקולה הידרופובית מוקפת במים, הארגון האופטימלי של קשרי המימן יוצר מעטפת מבנה או שכבת מעטפת חזקה מאוד של מים סביב המולקולה
(שנקראת שכבת המסה -
solvation layrt).
העליה בסדר של ארגון מולקולות המים בשכבת המעטפת נמצאת בקורולציה עם ירידה באנטרופיה
(S)
של המים שאינה מועדפת. המולקולה ההידרופובית גם מנתקת קשרי מימן שהמים שבסביבה יצרו בינם לבין עצמם, אך לא מספקת לכך פיצוי! כלומר ישנה גם עלייה באנתלפיה
H.

Question 58

הקבוצות שאינן פולריות מתקבצות יחד לצבר. כל קבוצה בנפרד אינה מציגה את כל שטח הפנים שלה כלפי ה____ (ל____), אלא תנסה להיכנס כמה שיותר לתוך ___ החלבון, ועל כן רוחב שכבת המעטפת
____.
תוצאה זו מועדפת מכיוון שהיא גורמת לעלייה ב____ של המערכת (=המים ____ ממבנה הכלוב המאורגן שייצרו ו____ חופשיות ובאי סדר).

Answer 58

הקבוצות שאינן פולריות מתקבצות יחד לצבר. כל קבוצה בנפרד אינה מציגה את כל שטח הפנים שלה כלפי החוץ (לתמיסה המימית), אלא תנסה להיכנס כמה שיותר לתוך פנים החלבון, ועל כן רוחב שכבת המעטפת יורד.
תוצאה זו מועדפת מכיוון שהיא גורמת לעלייה באנטרופיה של המערכת (=המים ישתחררו ממבנה הכלוב המאורגן שייצרו ויהיו יותר חופשיות ובאי סדר).

Question 59

רצף חומצות האמינו של רוב החלבונים הינו בעל משמעות, מכיוון שהוא מכיל מידע הקשור לתוכן חומצות האמינו ה_____ בחלבון
(במיוחד של
____, ____, ____, ____ ו-____).
חומצות אמינו אלו ממוקמות כך שהן מקוצבות יחד בעת _____ וכך יוצרות ליבת חלבון
_____.

Answer 59

רצף חומצות האמינו של רוב החלבונים הינו בעל משמעות, מכיוון שהוא מכיל מידע הקשור לתוכן חומצות האמינו ההידרופוביות בחלבון
(במיוחד של
Phe, Val, Ile, Leu ו-Trp).
חומצות אמינו אלו ממוקמות כך שהן מקוצבות יחד בעת קיפול החלבון וכך יוצרות ליבת חלבון הידרופובית.

Question 60

אילו חומצות אמינו ממוקמות כך שהן מקוצבות יחד בעת קיפול החלבון וכך יוצרות ליבת חלבון הידרופובית
?

Answer 60

Phe, Val, Ile, Leu ו-Trp.

Question 61

רוב השינוי נטו באנרגיה החופשית כאשר נוצרות אינטראקציות חלשות בתוך חלבון, נגזר מה____ המוגברת של המערכת המימית בעקבות אינטראקציות ____בליבת החלבון. זה מפצה בצורה משמעותית יותר, על האובדן הגדול של ה____ של הפוליפפטיד עצמו, שהוגבל לקונפורמציה המקופלת המסוימת שלו.

Answer 61

רוב השינוי נטו באנרגיה החופשית כאשר נוצרות אינטראקציות חלשות בתוך חלבון, נגזר מהאנטרופיה המוגברת של המערכת המימית בעקבות אינטראקציות הידרופוביות בליבת החלבון. זה מפצה בצורה משמעותית יותר, על האובדן הגדול של האנטרופיה של הפוליפפטיד עצמו, שהוגבל לקונפורמציה המקופלת המסוימת שלו.

Question 62

רוב השינוי נטו באנרגיה החופשית כאשר נוצרות אינטראקציות חלשות בתוך חלבון, נגזר מהאנטרופיה המוגברת של המערכת ה______ בעקבות אינטראקציות הידרופוביות ב______. זה מפצה בצורה משמעותית יותר, על האובדן הגדול של האנטרופיה של ה______, שהוגבל לקונפורמציה המקופלת המסוימת שלו.

Answer 62

רוב השינוי נטו באנרגיה החופשית כאשר נוצרות אינטראקציות חלשות בתוך חלבון, נגזר מהאנטרופיה המוגברת של המערכת המימית בעקבות אינטראקציות הידרופוביות בליבת החלבון. זה מפצה בצורה משמעותית יותר, על האובדן הגדול של האנטרופיה של הפוליפפטיד עצמו, שהוגבל לקונפורמציה המקופלת המסוימת שלו.

Question 63

הקיפול התלת מימדי של החלבון מושפע בעיקר מ
………

Answer 63

עלייה באנטרופיה של המים.