1 _ Begrippen Flashcards
Lyseren
Lyseren is het afbreken van het membraan van een cel, vaak door virale, enzymatische of osmotische mechanismen die de integriteit ervan in gevaar brengen.
De gaten die in het celmembraan gevormd worden zullen ervoor zorgen dat de massa van binnenin de cel naar buiten geraakt.
Elueren
Het afhalen van het gewenste celmateriaal van een membraan.
Supernatans
De bovenstaande vloeistof
SLM
Stop – en – laad – mengsel
Bevat EDTA om de werking van eventueel aanwezige enzymen te stoppen, bevat daarnaast ook sucrose of glycerol om ervoor te zorgen dat DNA niet gaat drijven in de buffer maar goed in de slotjes van de gel blijft tijdens het laden. Bevat ook SDS om eventueel aanwezige enzymen te denatureren.
‘discard the flow through’
Gooi de doorgelopen vloeistof weg
Resuspenderen
Pellet oplossen in buffer.
Op en neer pipeteren met je micropipet, terwijl je tip van de pipet in de oplossing blijft.
Plasmiden
Kleine, extra chromosomale, circulaire dsDNA - moleculen die zich onafhankelijk van de gastheercel repliceren. Ze komen voor bij de meeste bacteriën en bij gist.
Plasmiden bevatten genen die coderen voor eiwitten die niet - essentieel zijn voor het metabolisme van de gastheer maar vaak wel nuttig zijn.
Falconbuis
Ook wel een Greinerbuis genoemd, hierin geraakt ongeveer 50 mL.
Epjes
Ook wel Eppendorf - buisjes of microcentrifuge genoemd, hierin geraakt 1 mL vloeistof.
Qiagen – procedure
De Qiagen – procedure voor plasmidezuivering zijn gebaseerd op een gemodificeerde alkalische lysisprocedure, gevolgd door binding van plasmide-DNA aan Qiagen – hars onder geschikte omstandigheden met een laag zoutgehalte en pH. RNA, proteïnen, kleurstoffen en onzuiverheden met een laag molecuulgewicht worden verwijderd door middel van een middelzout wasmiddel.
Cloning – site
Plaats op plasmide waar we kunnen gaan knippen en plakken met genen.
Pellet
Vaste en zichtbare massa van moleculen of deeltjes (zoals eiwitten, nucleïnezuren of cellen).
Decanteren
scheidingsmethode die onder andere in de scheikunde wordt toegepast. Een mengsel van twee stoffen die een verschillende dichtheid hebben en niet in elkaar oplossen, zal na verloop van tijd twee fasen vormen.
Wanneer deze dan volledig van elkaar gescheiden zijn door het verschil in fase, kan je de bovenliggende vloeistof weggieten.
Centrifuge
Een apparaat dat middelpuntvliedende kracht gebruikt om verschillende componenten van een vloeistof te scheiden.
Micropipet
Een zeer duur precisie – instrument waarmee op een specifieke manier omgegaan en gewerkt moet worden.