06 RNA Processing Flashcards
Benenne die drei Hauptprozesse der RNA Verarbeitung.
Das anhängen eines 5’ Prime Caps (Base) am 5’ Ende der der neu synthetisierten RNA.
Polyadenylierung am 3’ Ende.
Splicing: das Entfernen des nicht kodierender Introns
Was sind die Funktionen der drei Hauptprozesse?
5’ Prime Cap
Es ist die erste Base die die RNA-Polymerase verwendet.
Besonderheit: es gibt eine 5’-5’ Verbindung
Schützt die RNA vor Degradation (Modifikation durch 7-Methylguanosin erschwert den Abbau am 5’ Ende).
Translation: Erkennungssequenz (Signaldarstellung für Transportprozesse: Erkennung von mRNA die vom Zellkern ins Zytosol transportiert werden soll).
Signalsequenz für die Initiierung der Translation.
Was sind die Funktionen der drei Hauptprozesse?
Poly (A)
Involvierte Enzyme?
Es hängt nur eine einzige Base an, nämlich A und davon sehr viele (ca 200 Nukleotide).
Template-unabhängige RNA Polymerase Interaktio, weil nur A angehängt wird.
Schutz der mRNA (3’) durch den Poly(A)-Schwanz vor Abbau im Zytosol
Enzyme: Endonuklease die den nicht kodierenden Teil OH’3’ abbaut und die Polyandelylatpolymerase die nur A schneidet.
Was sind die Funktionen der drei Hauptprozesse?
Splicing
Was ist die Splicing-Reaktion?
Eine energieneutrale Transesterfikation.
Group I Introns: Guanisin setzt an bestimmten Base mit Signalfrquenz am letzten Nukleotid des Exons und am ersten Nukleotid des darauffolgenden Exons an und bildet eine Ester-Verknüpfung.
Group II Introns: in Mitochondrien und Chloroplasten mRNA
Was ist die Relevanz der Hauptprozesse?
Funktionale Splicing Varianten
Zelluläre Varianten der Lokalisation
Nukleare Transpor
Funktionale Splicing Varianten
= Unterschiedliche Funktionen nur durch verschiedene Varianten der Entfernung der Introns (z. B. AK)
Zelluläre Varianten der Lokalisation
= Hydrophobe Anordnung von AS und dadurch entstehende Integrierung in der Membran
Nukleare Transport
= die mRNA wird durch die Nukleus Pore von Nukleus ins Zytosol hindurch gefädelt
Wann (zeitlich) und wo (räumlich) finden diese Hauptprozesse statt?
Wann und wo wird das 5’ Prime Cap angehängt?
Was ist das Problem?
Was ist die Lösung?
Was passiert nach der RNA Transkription statt?
Wann ist der mRNA Export?
Anhängen eines 5’ Prime Caps am 5’ Ende
= während der Transkription, also während sich die RNA-Polymerase am Doppelstrang entlang bewegt. Das findet im Zellkern statt
Problem: der neu synthetisierte Strang ist sehr empfindlich
Lösung: 5’ Prime Cap schützt
Nach abgeschlossener RNA Transkription, also wenn die RNA-Polymerase dissoziiert ist und die mRNA einzelsträngig vorliegt, finden die Polyadenylierung und das Splicing am 3’ Ende statt.
mRNA Export erst nach der kompletten Verarbeitung
