Процесинг Flashcards

1
Q

Зреене на еукариотни мРНК етапи и елементи

A

Хетерогенна ядрена РНК
| кепинг, полиадениране
| сплайсинг
Зряла мРНК (шапка, 5’-нетранслиран участък, кодиращ сегмент, 3’-нетранслиран участък, опашка)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

5’-шапка същност, структура

A
  • нуклеотид с метилиран гуанин се свързва към краен фосфат на пре-мРНК чрез 5’-5’ трифосфатна връзка
  • гуанин се метилира от метил-трансфераза (често се метилират и двете рибози след това)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

5’-шапка функции

A
  • стабилност на мРНК
  • транспорт през ядрени пори
  • сигнал за сплайсинг на първите екзони
  • разпознава се от малка субединица, указва посока на транслация
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

3’-полиА опашка срещане, образуване, разновидност

A
  • при всички мРНк без хистоновите
  • срязване на мРНК след ААУААА, присъединява се полиА полимераза, която добавя 100-200 аденинови рибонк
  • някои опашки са смесени - съдържат Г в края на опашката за защита от бързо разграждане
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

3’-полиА опашка функции

A
  • стабилност на мРНК при транслация
  • преминаване през ядрени пори (без хистони)
  • сигнал за сплайсинг на последни екзони
  • свързване с шапката чрез PABP, elF4G, CAP - иницииране на транслация, остават свързани по време на синтез на пп
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Сплайсинг същност и механизми

A
  • отстраняване на интроните и снаждане на екзоните в ядрото по време или след транскрипция
    1) Самосплайсващи се интрони - изрязани от рибозими, оформени в собствените им вериги (конформация, оформена от двуверижни бримки в РНК)
    2) Интрони, които се изрязват от сплайсозома (мяРНК, белтъци)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Сплайсозома действие, етапи

A

1) Елементи на сплайсозома разпознават границите екзон-интрон (интрони започват с GUпуринова - донорен участък, и завършват с много пирамидиновиAG - акцепторен участък)
2) Два белтъка се свързват с branch point
3) Помощни белтъци се изместват от snRNP - мяРНК от U2 хибридизира около branch point, мяРНК от U1 хибридизира с началото на интрона (точност на процеса се осигурява от комплементарност между мяРНК и последователности от пре-мРНК)
4) Приближаване на краищата на екзоните, оформяне на комплекс от три snRNP
5) Взаимодействие на мяРНК на комплекса с мРНК - образува се ласо, интрона се изрязва, донорен и акцепторен участък се свързват

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Контрол за износ на мРНК от ядрото

A
  • не се пропускат мРНК с неправилен сплайсинг, без шапка и без опашка (хистонови преминават)
  • дефектни мРНК могат да бъдат опасни и се разграждат в ядрото
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Как клетката различава нормалните мРНК от огромното количество дефектни или разкъсани мРНК?

A
  • компоненти на ядрените пори разпознават маркерни белтъци, свързани с нормалните мРНК в места на успешен сплайсинг
  • някои маркерни белтъци се заменят с други (фактори на транслация), други напускат ядрото с мРНК
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Какво представлява екзомът?

A
  • екзоните в един геном
  • 1% от генома 180000 екзона
  • съдържа 85% от мутациите
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Какво представлява алтернативния сплайсинг?

A

При комбиниране на екзоните клетката синтезира белтъци с различни комбинации от активности и места за контакти (на различни домени)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Примери за алтернативен сплайсинг

A
  • в различни типове клетки/тъкани - различни варианти на тропомиозин в зависимост от изисквания (тъканно и клетъчно-специфични протеини)
  • две форми на IgM - секретируема и мембранно свързана (рецепторна) - само рецепторната има мембранно-закотвящ хидрофобен домен (поначало се произвежда рецепторен с всички екзони, след среща с антиген екзоните за хидрофобния домен се отстраняват)
  • бета-таласемия - грешка в сплайсинг на бета-веригата на хемоглобина
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Регулация на алтернативен сплайсинг

A
  • конститутивен алтернативен сплайсинг - случайно се избира сплайс място
  • стриктно регулиран - активна/неактивна форма, производство на различни пп
  • негативен контрол - репресор, който пречи на изрязване на интрон
  • позитивен контрол - активатор причинява изрязване
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Зреене на еукариотни рРНК етапи

A
  • 28S, 18S, 5.8S от RNApol I, 5S от RNApol III
  • копия на 28S, 18S, 5.8S в клъстери с некодиращи спейсери
    1) Синтез на 45S пре-рРНК с трите гена и спейсери
    2) Нуклеотиди се метилират, присъединяват се рибозомни белтъци
    3) 45S транскрипт се нарязва на отделни рРНК, спейсери се отстраняват
    4) Присъединява се 5S рРНК, рибозомни белтъци
    5) Оформяне на рибозомни субединици
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Структура на клъстери на 45S пре-РНК под микроскоп

A
  • едновременна транскрипция - “коледна елха”
  • стъбло - ДНК, белтъци (полимераза)
  • клони - транскрипти
  • топки в края - комплекси от рРНК и белтъци за процесинг
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Зреене на еукариотни тРНК, етапи

A
  • има 600 гена за тРНК, експресия само на определени варианти на гени за тРНК за определени клетки и тъкани
    1) Транскрипция от RNApol III
    2) Синтез на прекурсорни тРНК, които се подлагат на процесинг
    3) Подрязване на leader, trailer край от две ендонуклеази
    4) Към 3’ край се добавя ЦЦА от тРНК-нуклеотидил-трансфераза
    5) Интрон на антикодонова бримка се изрязва
    6) Някои бази се модифицират химично
    7) Зрелите тРНК се поемат от транспортни протеини, които ги пренасят в цитозола
17
Q

Процесинг на микро РНК етапи

A

1) Синтез на първична РНК с 1+ двойноверижни бримки, прибавяне на шапка и опашка
2) Още в ядрото се нарязва от Drosha (комплекс) до пре-miRNA с една фиба
3) Износ в цитозола, обработка от Dicer до получаване на микроРНК
4) Passenger strand се изрязва, остава guide strand, участва в RISC и се свързва компл. с таргетна мРНК

18
Q

МикроРНК особености на експресия

A
  • някои имат собствени гени
  • гените на други се намират в интрони на мРНК (митрони)
19
Q

Зреене при прокариоти

A
  • полицистронна мРНК е готова за транслация без зреене
  • трите рРНК (16,23,5) се копират като общ първичен транскрипт, който се нарязва на три вериги, които зреят чрез скъсяване и метилация
  • някои тРНК се копират от общ първичен транскрипт и има процесинг
  • ненужни части се изрязват от ендо- и екзо-рибонуклеази (разпознават последователности или конформация)