VIRUS RNA 1 Flashcards
influenza virus adalah famili
orthomyxoviridae
influenza virus A menginfeksi sp saja
manusia, horses, pigs, seals, whales
influenzavirus yg paling penting pd zoonosis
A
influenzavirus yg hanya menginfeksi manusia saja
B
influenzavirus yg jarang menyebabkan penyakit serius
C
influenzavirus C menginfeksi
manusia dan babi
influenzavirus dibedakan berdasarkan
internal nucleoprotein and matrix proteins
jumlah HA influenzavirus
18
jumlah NA influenzavirus
11
bentuk virion influenzavirus
Pleiomorphic, often ovoid or speherical, predominantly
filamentous
jenis RNA influenzavirus
Linear negative-sense single-stranded RNA
jumlah segmen RNA influenzavirus tipe A dan B
8 segmen
jumlah segmen RNA influenzavirus tipe C
7 segmen
influenzavirus yang segmen RNA ada 8
A dan B
3 segmen genom terbesar influenzavirus mengode?
RNA-dependent RNA polymerase
3 segmen genom intermediete influenzavirus mengode?
segments hemagglutinin (HA), neuraminidase (NA), nucleoprotein
2 segmen genom largerinfluenzavirus mengode?
M1 matrix protein, M2 ion channel protein
1 segmen genom kecil influenzavirus mengode?
2 non structural proteins (NS2/NEP)
apakah influenzavirus beramplop?
ya
sebutkan bahan penyusun influenzavirus
Contains 2 glycoproteins hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) protein, membrane (M2) protein
peran HA
- melekatnya virus ke susceptible cell
- ag mayor melawan ab
- bertanggung jawab thd munculnya strain baru dan evolusi berkelanjutan
- menggumpalkan eritrosit
peran NA
- Memfasilitasi keluarnya virus melalui budding
2. memotong sialic acid residu dr viral glikoprotein shg mencegah self agregation virus dan virus bisa menyebar
pada tahun berapa terjadi pandemi influenza
1918
berapa angka kematian didunia akibat pandemi influenzavirus 1918
> 40 jt
tipe influenzavirus yang menyebabkan seasonal epidemics
A dan B
influenzavirus yg bisa menyebabkan pandemi
A
influenzavirus yang menyebabkan mild illness dan tidak menyebabkan pandemi
C
subtipe influenzavirus yang sering menyerang manusia
H1N1 DAN H3N2
sebagian besar reservoar influenzavirus A adalah
burung
influenzavirus yang bisa antigenic shift
tipe A
influenzavirus yang bisa antigenic drift
tipe A dan B
bagaimana influenzavirus A bisa menyebabkan pandemi
- reservoar di hewan
- perubahan diversitas, ekspresi protein
- terbentuk ligan virus yg bisa berikatan ke reseptor manusia
- pandemi
ada berapa lineage influenzavirus B
2
sebutkan lineage influenzavirus B
B/Victoria and B/Yamagata
tipe influenzavirus yang tidak menyebabkan epidemi
C
tipe influenzavirus yang baru diidentifikasi
D
tipe influenzavirus yang hanya menginfeksi cattle
D
influenzavirus D menyerang
cattle
begitu dilepaskan dari kapsidnya, genom influenzavirus bergerak menuju
nukleus
jelaskan patogenesis influenzavirus
- replikasi di epitel RT
- inflamasi menyebabkan sekresi serous nasal dan perubahan RT bawah
- infeksi sekunder = conjungtivitis, pneumonia, faringitis.
virus yang jarang viremia
influenzavirus, SARS-CoV 2
virus yang highly contagious
influenzavirus
rute transmisi influenzavirus
droplet, aerosol, fomit terkontaminasi
manifestasi klinis influenzavirus
- influenza syndrome
- spektrum penyakit dr mild upper respiratory symptomp sampai pneumonia
- komplikasi bergantung usia
- imun baik –> self limiting
komplikasi influenza pd anak2
pneumonia or middle ear infection
komplikasi influenza pd dewasa
secondary bacterial pneumonia or exacerbation of pre-existing chronic condition which may cause death
tanda khusus yang selalu menyertai infeksi influenzavirus
infeksi sekunder bakteri
spesimen influenzavirus
throat swabs but much more reliable
using throat washing or nasopharyngeal aspirates
diagnosis influenzavirus
- RT-PCR
2. MDCK line cell
obat antiviral yang mengganggu fungsi M2 channel influenzavirus
amantadine, rimantadine
THE KING = AMMAR
cara kerja amantadine, rimantadine
obat antiviral yang mengganggu fungsi M2 channel influenzavirus
obat antiviral yang menghambat fungsi neuroaminidase
oseltamivir, zanamivir
cara kerja oseltamivir, zanamivir
obat antiviral yang menghambat fungsi neuroaminidase
mengapa vaksin influenza harus diperbaharui setiap tahun
sangat mudah antigenic shift dan drift
Seasonal flu vaccine tidak memproteksi dari influenzavirus tipe apa
C dan D
terjadi perubahan dalam struktur genom yang mengode apakah bila terjadi antigenic shift dan antigenic drift
hemaglutinin dan neuroaminidase
perubahan dalam skala kecil genom influenzavirus disebut
antigenic drift
antigenic drift =
perubahan dalam skala kecil genom influenzavirus
perubahan dalam skala besar genom influenzavirus
antigenic shift
antigenic shift =
perubahan dalam skala besar genom influenzavirus
perubahan genom influenzavirus yang membentuk strain baru disebut
antigenic shift
penyebab influenzavirus tipe A menyebabkan pandemi
antigenic shift dan drift
jelaskan bagaimana proses terjadinya antigenic drift
- mutasi kecil di gen influenzavirus
- perubahan HA dan NA
- imun gagal mengenali ag influenzavirus
- utk mencegah reinfeksi, vaksin hrs diperbaharui setiap tahun
kapan terjainya antigenic drift
setiap 2-3 tahun
apa dampak yang disebabkan antigenic drift
local outbreak
jelaskan bagaimana proses terjadinya antigenic shift
- perubahan mayor pd genom influenzavirus
- terbentuk HA dan NA protein yg baru
- influenzavirus hewan mampu menginfeksi manusia
lebih sering manakah ag shift dengan ag drift?
drift
contoh kasus ag shit yg pernah terjadi
May cause pandemics such as 2009 pandemic influenza A(H1N1)
penyebab ag shift
akumulasi mutasi titik pd gen menghasilkan asam amino dan protein baru
apa yang terjadi pd genom virus ketika ag drift terjadi
perubahan drastis pd sekuens viral surface proteins
penyebab ag drift
genetic reassortment between human, swine, and avian influenza virus
sebutkan subfamili dari famili coronaviridae
- Coronavirinae
* Torovirinae
subfamili coronaviridae yg sering di manusia
Coronavirinae
subfamili Torovirinae sering menginfeksi
enteric infections of horse, cattel, pigs
subfamili coronavirinae terbagi jd brp genera
4
sebutkan anggota subfamili coronavirinae
Alphacoronavirus, betacoronavirus, gammacoronavirus, deltacoronavirus
Alphacoronavirus menginfeksi
manusia dan hewan
betacoronavirus menyebabkan
mouse hepatitis virus, other animal
viruses and human viruses include SARS-CoV, MERS-CoV and SARS-CoV-2
anggota subfamili coronavirinae yg paling banyak di manusia
betacoronavirus
apakah coronavirus beramplop
ya
bentuk coronavirus
sferis
masing2 partikel coronavirus dilingkupi oleh tonjolan yg disebut apa
corona
merepresentasikan apakah corona pd coronavirus
bulbous distal ends of envelope glycoproteins
jenis RNA coronavirus?
Single-stranded positive-sense RNA
virus genom RNA jenis apakaha yang lebih infeksius? positive/negative strand?
positive
mekanisme apa yang menyebabkan munculnya berbagai macam strain coronavirus
mutasi
sesampainya di sitosol, kemana genom coronavirus menuju?
sitosol
dimana kasus MERS-CoV muncul pertama kali
Jeddah, Saudi Arabia
sumber primer MERS-CoV
unta
reseptor seluler MERS-CoV
CD-26
mekanisme apa yang terlibat dalam reseptor CD28 tempat infeksi virus MERS-CoV
regulation of cytokine responses as well as glucose metabolism
bagaimana cara menetralisir infektivitas infeksi MERS-CoV
the binding of antibodies to S binding domain of MERS-CoV
manifestasi klinis MERS-CoV
- ranges, dari ringan hingga pneumonia
- pneumonia bisa berkembang jd ARDS, Syok septik, dan MODS
- infeksinya parah pd imunocompromised atau pada pasien yg sebelumnya sudah sakit
- manifestasi klinis di RT bawah terjadi early acute infection
patogenesis MERS-CoV
- ringan
- dyspneu
- pneumonia berat
beberapa kasus ada GIT symptomp
penyakit breprogresi cepat dalam 7-11 hari
spesimen MERS-CoV
respiratory aspirates, blood, urine, stool
diagnosis MERS-CoV
reverse transcriptase PCR
terapi MERS-CoV
- belum ada yang spesifik
2. terapi antimikroba utk resiko infeksi opportunis
SARS-CoV berasal dari negara
China
berapa persen kasus yang butuh intensive care SARS-CoV
20%
virus yang 20% kasus membutuhkan intensive care
SARS-CoV
reservoir SARS-CoV
kelelawar
bagaimana infeksi global SARS-CoV terjadi
human to human transmision
bagaimana epidemiologi kasus SARS-CoV untuk saat ini?
sudah tidak menginfeksi manusia, tp menginfeksi kelelawar
jelaskan patogenesis SARS-CoV
- minggu pertama = ringan
- minggu kedua = dyspneu, gangguan GIT
- akhir minggu kedua = berprogresi dengan cepat menjadi respiratory distress, 20% kasus membutuhkan intensive care
diagnosis SARS-CoV
serologi + Reverse transcriptase-PCR
yang terbaik = real time PCR
spesimen SARS-CoV
- Minggu 1 = throat swab, nasofaring swab, sampel serum
- Minggu 2 = stool dan respiratory spesimen
tes terbaik utk mengonfirmasi history infeksi SARS-CoV
serologycal assay
terapi SARS-CoV
masih belum jelas
apa yang menghambat dihasilkannya vaksin utk infeksi SARS-CoV dan CoV yang lain
variabilitas genetik, imun yang lemah
strain baru SARS-CoV 2 yang masuk ke indonesia dan jauh lebih infeksius?
B117
vaksin yang ada saat ini digunakan utk mencegah infeksi strain virus SARS-CoV 2 yang mana?
virus yg pertama kali datang saat januari 2020
penyakit yang disebabkan SARS-CoV 2
COVID-19
dimana SARS-CoV 2 pertama kali muncul
provinsi hubei, china
tempat emerge nya SARS-CoV 2
huanan seafood market
mengapa infeksi SARS-CoV 2 lebih cepat daripada infeksi SARS-CoV yang juga sama2 menyebabkan pandemi
saat ini, mobilitas orang meningkat. infeksi virus juga diperantarai oleh migrasi orang antarnegara
sebutan lain SARS-CoV 2
novel betacoronavirus
reservoar SARS-CoV 2
kelelawar, kemudian menyebar ke pangolin
bagaimana komposisi genom SARS-CoV 2
campuran dari genom MERS-CoV dan SARS-CoV 2
apa nenek moyang bersama dari SARS-CoV 2 dan SARS-CoV
sarbicovirus
patogenesis SARS-CoV 2
- berikatan ke epitel RT dan memulai replikasi
- migrasi virus dari jalan napas dan masuk epitel sel paru
- replikasi virus memicu dilepaskannya sitokin (proinflamasi) -> badai sitokin →menyebabkan inflamasi dan kerusakan jaringan
- ARDS dan kegagalan respiratori –> sebab utama kematian
virus yang menyebabkan badai sitokin
SARS-CoV dan SARS-CoV 2
reseptor SARS-CoV 2 memiliki kesamaan dengan reseptor virus apa
SARS-CoV
nama reseptor utk SARS-CoV 2
ACE 2
bagaimana karakteristik infeksi SARS-CoV 2
- keparahan tergantung imun dan usia
2. penyakitnya memiliki range tertentu
kepanjangan NAAT
nucleic acid amplification test
jelaskan alur diagnosis SARS-CoV 2
- pasien mengalami tanda klinis, dilakukan NAAT. PCC (positive confirmed case), atau
- negative dan ada gejala klinis, bisa diuji ulang, PCC atau
- negative, maka ab detection dengan semi kuantitatif serological assay pada fase akut di 2-4 minggu kemudian, PCC atau
- negative, artinya infeksi RT
apa yang menyebabkan pasien positif covid-19 tapi terdeteksi negatif
jumlah SARS-CoV 2 yg terambil dispesimen tidak memenuhi jml minim yg bisa dideteksi PCR
spesimen deteksi SARS-CoV 2
- upper RT = throat and nasopharyngeal swab, konsentrasi virus tertinggi ketika onset
- lower RT = sputum dan BAL, konsentrasi virus meningkat ketika minggu kedua
- feses = minggu kedua
- darah = jarang, karena jarang terjadi viremia
- saliva = jarang, karena virus akan dilarutkan oleh saliva
terapi SARS-CoV 2
belum ada
menghindari konsumsi susu unta adalah cara mencegah?
MERS-CoV
kondisi apa yang meningkatkan keparahan terjadinya badai sitokin
usia tua, immunocompromised
faktor risiko terbesar keparahan COVID-19
usia