Virologie première partie Flashcards
Comment les virus se distinguent de tous les vivants ?
Par l’absence de cellule virale (acellulaire)
Est-ce que les virus augmentent de taille et se divise ?
Non : absence de croissance et de divsion, car acellulaire
Est-ce que les virus peuvent communiquer avec le milieu extérieur ?
Non, absence de communication à cause de l’organisation acellulaire
Parasitisme (multiplication) intracellulaire
Comment les virus se multiplient ?
Par diverses fonction dans une cellule hôte
certain bactérie aussi donc ne défini pas le virus
Quel est le mode de multiplication des cellules par divisions binaires ?
Division biniare :
* Croissance (production de protéines)
* Duplication du génome
* Division de la cellule
Quel est le mode de multiplication des virus ?
Désassemblage et ré-assemblage :
* Désassemblage du génome
* Production de protéines + Multiplication du génome
* Assemblage des protéines et du génôme
Est-ce que les virus évoluent ?
Oui -> peuvent produire de nouvelles entités biologiques semblables à eux-même (sélection naturelle)
Quels sont les deux grandes classes de molécules que possèdent les virus ?
- Les acides nucléiques
- les protéines
Toutefois, quels sont les deux grandes caratéristiques moléculaires qui distinguent les virus des être vivants ?
- les virus sont tous dépourvus de systèmes permettant de générer de l’énergie (ATP) (pas de métabolisme -> utilisent celle de l’hôte)
- La synthèse des acides nucléiques viraux se font dans les ribosomes de la cellule (pas de machinerie pour la synthèse) (mais ont leur code génétique)
Est-ce que les virus utilisent le même code génétique que les cellules pour synthétiser leur acides nucléiques ?
Oui : triplet de nucléotides (codons)
Comment Guy Lemay définit les virus ? (les 3 phrases)
Agents infectieux, possédant une
organisation acellulaire et composés au minimum d’un génome d’acide nucléique et d’une capside protéique, mais dépourvus de métabolisme et de machinerie de synthèse protéique.
Virus, viroîdes et prions
Qu’est-ce que le définition de Guy Lemay sur les virus exclue ?
Les viroïdes et les prions, car ils sont composés d’une molécule d’acide nucléique (viroïde) ou d’une protéine sans acide nucléique (prions)
Où sont principalement retrouvés les viroïdes ? Et les prions ?
Chez les plantes
Ils sont responsables de qlq maladies (vache folle)
Classification des vrius
Comment peut on regrouper les virus en familles ? (4)
- Selon la nature du génome (ADN ou ARN)
- Selon la structure (monocaténaire, bicaténaire, linéaire..)
- Selon la structure de la capside
- selon la présence ou l’absence d’enveloppe lipidique
Quels sont les critères pour classifier les virus en sous-famille ?
- type d’hôte
- type de pathologie
- mode de transimission
Structure des particules virales - génome viral
De quoi est formée la structure suivant : nucléocapside ?
- acides nucléiques
- Protéines
Contrairement aux cellules, les virus peuvent être composés de quoi ?
d’ADN ou d’ARN (très grande diversité des acides nucléiques dans la nature)
ex : ARN monocaténaire circulaire, ARN bicaténaire, ADN linéaire monocaténaire…
Capside protéique
Le génome viral est entouré de quoi ?
D’une capside protéique
Est-ce que la capside protéique d’un virus change beaucoup d’une famille à l’autre ?
Oui, la forme, la taille et la complexité varient (peut être utilisé pour identifier les familles)
Vrai ou Faux ?
* la capside protéique est obligatoire ?
* l’enveloppe lipidique est obligatoire ?
- vrai
- faux, mais si présente, essentielle pour les virus qui la possèdent
Qu’est-ce que l’enveloppe lipidique ?
Double couche lipidique dans laquelle se retrouvent insérées des protéines (généralement « glycoprotéines »)
Est-ce que l’enveloppe lipidique dérive de la membrane cellulaire ?
Yes
Est-ce que la présence de l’enveloppe lipidique est essentielle pour les virus qui la possèdent ?
Oui, car on retrouve aussi des protéines virales insérées dans l’enveloppe lipidique
(l’enveloppe lipidique est fragile au détergents)
Trouvons-nous des hôtes du virus chez toutes les espèces vivantes ?
Oui :
* espèce bactérienne
* protozoaires
* plantes
* invertébrés
* poissons…
* humain
Est-ce que tous les virus peuvent inferter toutes les espèces vivantes ?
Non, la spécificité d’hôte est une propriété des virus.
Ce qui explique que certains virus ne peuvent pas infecter certaines espèces
Vrai ou Faux - La spécificité d’un virus pour un hôte peut être étroite (infecte quelques espèces) ou large (beaucoup d’espèce)?
Vrai
Antirécepteur (contre-récepteur) viral et récepteur cellulaire
Quelle est la première étape du cycle de multiplication de tous les virus ?
La fixation (ou adsorption) à la surface de la cellule-hôte
Par quoi est médiée la fixation du virus à son hôte ?
Par l’intéraction entre le récepteur situé à la surface cellulaire et l’antirécepteur (ou contre-récepteur) à la surface de la particule virale
Est-ce que la fixation des particules virales aux récepteurs situé à la surface cellulaire se fait de la même manière chez les virus possédant une enveloppe lipidique ?
Presque - ce sont les protéines de l’enveloppe qui permettront la fixation au récepteur cellulaire.
Chez les vrius sans enveloppe (capside-nue) ou se situera la protéine qui se liera au récepteur situé à la surface de la cellule cible ?
Une protéine de la capside exposée à l’ext. de la particule virale.
Quel est un facteur déterminant de la spécificité hôte/virus ?
L’intéraction anti-récepteur et le récepteur de la cellule hôte
L’intéraction anti-récpteur/récepteur s’agit-elle du seul facteur influençant la fixation ?
Non, car certains virus pouvant interagir avec le récepteur peuvent être bloqués dans leur
multiplication à des étapes ultérieures
Donc est-ce que l’interaction entre le récepteur et l’aintirécepteur peut déterminer si un virus infecte une ou plusieurs cellules (en ne tenant pas compte des autres facteur) ?
Oui :
* Si la structure de la région du récepteur reconnue par le virus a été très conservée dans l’évolution chez de nombreuses espèces, le virus pourra infecter toutes ces espèces
* au contraire, une légère divergence évolutive pourrait prévenir l’adsorption du virus si elle est située dans une région essentielle
Est-ce que les récepteurs membranaires de la cellule de l’hôte sont faites pour être attaqués par les virus ?
Non, ils ont d’autres fonctions au sein de la cellule de l’organisme, mais exploitées par le virus
Spécificité cellulaire ou tissulaire
Que permet la différenciation cellulaire ?
Une composition différente de la surface cellulaire.
* Par exemple, on s’attend évidemment à retrouver des molécules différentes à la surface d’une cellule épithéliale comparativement à une cellule neuronale -> mène au récepteur que les virus peuvent utiliser, limite donc l’infection au cellule n’ayant pas ces récepteurs
Comment nommant nous les virus agissant sur les neurones ?
Les virus neurotrope
Tropisme = sur quel type de cellule le virus agit
Aperçu des méthodes d’étude des virus
Quels sont les deux approches principales permettant aux virus de se multiplier ?
- L’utilisation de cellules isolées en culture
- L’utilisation de l’organisme complet
Ne fonctionne pas sur les virus unicellaires
Aperçu des méthodes d’étude des virus
Est-ce que la diversité de types cellulaire pouvant être utilisée chez le virus est variable ?
Oui, dépend des virus.
Comment peut-on étudier la multiplication des virus ?
- sur des cellules animales en labo
- Sur des animaux en labo (oeurf de poule embryonné ou embrion d’animal)
- Souris, rat, lains…
La gamme de l’espèce varie d’un virus à un autre
Est-ce que les étapes du cycle de multiplication peut varier d’une famille de vrius à l’autre ?
Oui, beaucoup. Toutefois, les grands principes restent les mêmes.
Dis moi en ordre les grands principes du cycle de multiplication du virus (6)
- Fixation
- Entrée
- Transcription
- Traduction
- Réplication
- Assemblage
- Sortie (relargage)
FETTRAS
Caractéristiques de la fixation
- première étape
- spécifique à un récepteur présent à la surface cellulaire
Caractéristique de l’Entrée
- varie d’un virus à un autre
- Virus à enveloppe lipidique : 2 méthodes
- Fusion et endocytose
- La nature de la glycoprotéine virale et surface cellulaire détermine mode d’entrée.
- Sans enveloppe lipidique = endocytose
- Virus composé d’ADN se réplique dans noyau cellule eucaryote -> nécessite seconde entrée
Parle moi du mode d’entrée par fusion d’un virus à enveloppe lipdique
Lors de l’entrée par fusion, l’interaction entre le récepteur cellulaire et la glycoprotéine d’enveloppe virale (contre-récepteur) entraîne un changement de conformation de la protéine virale et le rapprochement des membranes lipidiques virales (enveloppe) et cellulaires (membrane cytoplasmique).
Après la fusion, le capside se retrouve à l’intérieur de la cellule.
Parle moi du mode d’entrée par endocytose d’un virus à enveloppe lipdique
L’interaction entre le récepteur cellulaire et
le contre-récepteur viral n’est pas suffisante pour déclencher le processus de fusion; on assiste plutôt à l’internalisation du virus par le schéma classique d’endocytose à la surface cellulaire.
L’acidification de l’endosome -> entraine changement de conformation = fusion enveloppe virale et de la membrane de l’endosome. -> Capside dans cytoplasme
Qu’est-ce qui détermine le mode d’entré d’un virus avec une enveloppe lipdique ?
La nature de la glycoprotéine virale et de la surface cellulaire.
(changement de conformation se fait à la surface cell. ou à l’int. de l’endosome)
Quelle mode d’entrée est le plus populaire chez les virus sans enveloppe lipdique ?
L’endocytose
Selon les données récentes que se passerait-il après l’entrée du capside virale au cytoplasme ?
Seul le génome viral serait libéré… ou dans certaine cas, la formation de pores permet à la particule virale de traverser la membrane de l’endosome.
Certains virus ont mécansime de perméabilisation
Parle moi de la Transcription
- Virus ARN -> utilise ARNm sans transcription préalable (utilise son propre ARN)
- Certains font de la transcription pour produire ARNm (effectué grâce à des enzymes virales ou cellulaires)
Parle moi de la Traduction
En général : synthèse des protéines virales par la machinierie de synthèse protéique cellulaire par l’information contenue dans l’ARNm viral.
Peut utiliser mécanisme de transport pour aller à Membrane plasmique ou RE ou AGpour les protéines virales de l’enveloppe lipidique
Quelle est la distinction entre les protéines d’enveloppe et les protéines virales ?
- protéine d’enveloppe sont synthétisées par la cellule et utilise le mécansime de transport des protéines cellulaires pour aller à la membrane plasmique
Cycle de multiplication cellulaire
Parle moi de la Réplication
Synthèse de multiples copies du génome viral (variable selon le type de génome et peut faire appel à protéine virales, cellulaire ou les deux )
Cycle de multiplication
Parle moi de l’Assemblage
Après la réplication du génome virale, ceux-ci doivent être encapsidées par les protéines virales nouvellement synthétisées. Nécessite :
* intéraction entre protéines virales et séquences nucléotidiques (dans génome virale)
Cycle de multiplication
Parle moi de la Sortie (relargage)
S’effectuer par +sieurs mécanismes.
* Virus enveloppé : bourgeonnement viral -> capside virale relâchée de la cellule entrainant avec elle une partie de la membrane cytoplasmique -> devient enveloppe lipidique virale
* Virus nue : lyse cellulaire -> méthode la plus directe
Virus à génome d’ARN
Existe-t-il peu de variations a/n du cycle de multiplication des virus ARN ?
Non, il existe de multiple variations. Toutefois, il existe plusieurs points en commun.
Quels sont quelques point en commun qu’ont les virus ARN ?
- Ils se multiplient a/n du cytoplasme des cellules infectés (car ne possède pas d’enzyme nucléaire pouvant utilser l’ARN comme matrice)
- Les virus ARN doivent coder leur propre ARN polymérase dépendant de l’ARN
- Au tout début, un ARN complémentaire au génome viral est synthétisé puis copié -> forme +sieurs copies du génôme viral -> protéine de la capside se synthétisent et permettent l’encapsidation du génome répliqué
Rétro-virus
Qu’est-ce qu’ont les Rétrovirus de spécial ?
Une stratégie de multiplication hybride : Le génome est composé d’ARN, mais la multiplication du virus implique une phase sous la forme d’ADN.
Comment se passe, dans un premier temps la multiplication des rétrovirus ?
Une transcriptase inverse (ADN polymérase dépendante de l’ARN) fait une première copie d’ADN du génome virale. -> sert de matrice pour former un ADN bicaténaire (grâce à une 2e activité de la transcriptase qui agit comme ADN polymérase dépendante de l’ADN)
En deuxième temps, Que va faire la copie d’ADN bicaténaire du génome viral?
Elle s’intègre au génome de la cellule
* l’intégration se fait par l’intégrase virale.
En troisième temps, que fait la copie de l’ADN bicatenaire à la suite de son intégration dans la cellule ?
Le provirus peut alors être transcrit par l’ARN polymérase cellulaire comme s’il s’agissait de gènes de la cellule.
Le génôme viral (ARN) sera aussi synthéthisé de la même manière
En quatrièment temps, que suivra la synthèse du provirus et du génôme viral ?
L’encapsidation grâce à la synthèse des protéines virales par traduction des ARN messagers.
Est-ce que la transcriptase inverse et l’intégrase font également partie des nouveaux virions ?
Oui, afind’amorcer le cycle lors de l’infection de nouvelles cellules.
Vrai ou Faux - L’ARN génomique du virus peut être traduit directement ou être transcrit avant d’être traduit ?
Vrai
Est-ce que la majorité des virus ADN se répliquent (au moins) en partie a/n du cytoplasme des cellules ?
Non, a/n du noyau
Que permet la réplication a/n du noyau chez les virus à ADN ?
L’utilisation d’enzymes cellulaires (ex : ARN polymérase) pour la transcription -> produisant des ARNm viraux.
Est-ce que les virus ont évolué pour reconnaitre des séquences virales par les enzyames cellulaires ?
Effectivement.
Les ARNm des virus à ADN seront traduits pour générer quoi ?
Des enzymes (protéines) virales permettant la réplication du génome virale (requiert participation des protéines cellulaires) -> protéine de la capside seront également synthétisées.
Devrions nous voir des molécules de surface différentes entre des cellules épithéliales et des neurones ?
Oui (Spécificité cellulaire)
Comment appele-t-on les particules virale du génome viral ?
Virions : ils sont toujours composées d’acies nucléique et se retrouvent au coeur de la particule virale (souvent associés à des protéines) -> nucléocapsides.