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Microbiologie > Virologie partie 1 > Flashcards

Virologie partie 1 Flashcards

1
Q

Définition d’un virus

A

à la barrière entre vivant et inerte, parasites intra-cellulaires: ne peuvent se multiplier qu’à l’intérieur de cellules. ils sont pratiquement inertes hors des cellules. ce n’est pas unique aux virus, on retrouve d’autres parasites intra-cellulaires

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Q

Caractéristiques d’un virus

A

ne sont pas composés de cellules, organisation acellulaire, pas d’échanges avec milieu extérieur, pas de divisions, pas de croissance

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3
Q

Résumé multiplication d’un virus

A

Le virus se multiplie à l’intérieur d’une cellule, il va se désassembler: son génome, composé d’acides nucléiques, va être relâché de la capside, (contient protéines + génome) le génome est relâché dans la cellule → production des nouvelles protéines virales → le génome se multiplie → ré assemblage

donc mécanisme de désassemblage ré assemblage

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4
Q

Les caractéristiques qui rapprochent les virus du monde vivant?

A

ils possèdent des protéines + acides nucléiques (composent le génome). possèdent le même code génétique que tous les habitants de la terre car doivent utiliser la machinerie de la cellule pour se multiplier.
- soumis à la pression sélective
- ils peuvent changer et évoluer
- peuvent se multiplier en être biologiques semblables

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5
Q

Comment les virus évoluent?

A

mécanismes classiques d’évolution darwinienne. pression de sélection (agent antiviral) -> seulement es plus résistants survivent

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6
Q

Les caractéristiques moléculaires des virus? Ce qui les éloigne des vivants.

A

Pas de génération d’ATP, pas de métabolisme, pas d’énergie, doivent utiliser métabolisme de la cellule pour énergie. pas de machinerie de traduction, ils font synthétiser les protéines par la cellule.

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7
Q

Vrai ou faux: le virus code et synthétise les protéines?

A

Faux, il code mais ne synthétise pas.

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8
Q

Définition capside protéique

A

protège le génome viral, desfois comporte des enzymes

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9
Q

Qu’est ce qui manque au virus?

A

machinerie de traduction + synthèse d’ATP

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10
Q

Pourquoi les virus doivent se multiplier à l’intérieur d’une cellule?

A

Car ils doivent utiliser la machinerie de synthèse des protéines + métabolisme pour ATP de la cellule.

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11
Q

Comment peut être le génome viral?

A

Peut prendre différentes formes: ARN, ADN, linéaire, circulaire, très grande diversité

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12
Q

Trois composants de la structure virale?

A
  • génome viral
  • capside protéique
  • enveloppe lipidique (seulement certains)
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13
Q

C’est quoi l’enveloppe lipidique + caractéristiques?

A

Seulement certains virus l’ont.
bicouche lipidique
il y a des protéines d’enveloppe à l’intérieur
ceux qui en possèdent ne peuvent pas s’en passer
ceux qui en possèdent sont + sensibles aux détergents
virus sans enveloppe sont + résistants

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14
Q

Critères de classification des virus?

A
  • type de génome viral
  • structure de la capside
  • autres critères: hôte, pathologie, transmission
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15
Q

C’est quoi les méthodes d’études des virus?

A
  • cultures cellulaires (limite: on étudie pas le SI)
    -modèles animaux (on étudie le SI, différenciation en organes)
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16
Q

Première étape de l’infection virale:

A
  • détermine la spécificité de l’infection virale
  • interaction entre protéine présente à la surface de la particule virale (antirécepteur) et la protéine à la surface cellulaire (récepteur)
  • velcro moléculaire, retient le virus -> entrée dans la cellule
17
Q

Qu’est ce détermine la première étape de l’infection virale?

A

la spécificité d’hôte: l’espèce animale que le virus va pouvoir infecter. divergence évolutive: SIDA infecte seulement humain, rage infecte tous les mammifères: si le virus reconnait une séquence protéique très conservée -> peut infecter toutes sortes d’animaux

18
Q

De quoi dépend la capacité du virus de passer d’une espèce à l’autre?

A

De la présence de mutations sur les séquences reconnues -> virus reconnait le récepteur ou pas

19
Q

C’est quoi le deuxième niveau de spécificité d’infection virale?

A

quand on est infectés par un virus, tous les tissus ne sont pas infectés. c’est pas la divergence évolutive mais la différenciation cellulaire. toutes les cellules n’expriment pas les mêmes protéines. virus infecte poumons -> ne va pas infecter cerveau

20
Q

Schéma général de multiplication virale?

A

Donc le virus se fixe à la surface de la cellule avec le récepteur. → cycle de multiplication virale. les virus n’ont qu’un but dans la vie: se multiplier: synthétiser de nouveaux génomes viraux → multiplication.

ce qui a été sélectionné par l’évolution c’est la capacité à se multiplier + synthétiser les génomes. pas la capacité à rendre malade.

21
Q

C’est quoi le cycle de multiplication virale chez les virus avec enveloppe lipidique?

A
  • mode de fusion
  • endocytose
22
Q

Mode de fusion chez virus avec enveloppe lipidique

A

antirécepteur viral se fixe sur le récepteur à la surface de la cellule, cette interaction va entrainer un changement dans la structure, conformation de cette protéine, rapproche enveloppe lipidique et la membrane cytoplasmique, permet la fusion de ces deux membranes. la fusion se fait à la surface de la cellule, le virus se retrouve à l’intérieur.

23
Q

Entocytose chez virus avec enveloppe lipidique

A

interaction va toujours se faire entre l’enveloppe virale et le récepteur à la surface de la cellule. pas de changement de conformation mais la particule virale au complet va subir l’endocytose : invagination de la membrane cytoplasmique, la particule virale va se retrouver dans un endosome à l’intérieur de la cellule. c’est à l’intérieur de l’endosmose qu’il y aura le changement de conformation. le résultat final: le changement de conformation se produit à l’intérieur de l’endosome et enveloppe lipide virale va se fusionner sur la membrane de l’endosome. c’est une fusion mais retardée

24
Q

différence entre endocytose et mode de fusion

A

la nature même de la glycoprotéine de l’enveloppe virale. dans un cas elle a la capacité de fusionner directement après l’interaction. sinon elle a besoin d’une étape supplémentaire

25
Q

Cycle de multiplication chez virus sans enveloppe lipidique

A
  • endocytose: même chose que les autres virus
  • pénétration directe: même interaction → changements de conformation dans la capside → formation de pores dans la membrane → peut pénétrer directement
26
Q

Cycle complet après fixation sur la cellule:

A

décapsidation partielle ou totale du virus → génome viral relâché dans le cytoplasme → transcrit en ARNm → traduction (synthèse protéique)→ réplication de génome viral (en parallèle)→ assemblage (acide nucléique viral nouvellement synthétisé)

les protéines virales sont synthétisées en parallèle pour pouvoir réencapsider chaque copie du génome viral pour → sortie des particules virales à l’extérieur de la cellule (lyse cellulaire)→ poursuivre multiplication du virus

27
Q

Particularité des virus enveloppés:

A

ils doivent acquérir l’enveloppe lipidique à partir de la cellule. → le bourgeonnement d’un virus enveloppé, ressemble à l’envers à l’étape de fusion.

Les glycoprotéines de l’enveloppe virale se retrouvent à la surface de la cellule, inséré dans la membrane cytoplasmique. L’acide nucléique viral avec les protéines de la capside sont assemblés à l’intérieur de la cellule, → interaction entre protéines de l’enveloppe et protéines de la capside → bourgeonnement → formation bourgeon → le virus sort de la cellule avec son enveloppe

la membrane cytoplasmique sert de précurseur à l’enveloppe lipidique → la membrane plasmique d’une cellule + enveloppe lipidique sont chargés négativement + se repoussent

28
Q

Quelles sont les étapes les plus variables d’un virus à l’autre?

A

étapes centrales: transcription et réplication du génome viral

29
Q

C’est quoi les 3 grands types de génomes viraux:

A
  • virus à ARN (grippe, COVID19)
  • virus à ADN (herpes, papillomes)
  • rétrovirus (SIDA)
30
Q

Stratégie de multiplication des virus à ARN à polarité positive

A
  • l’ARN peut directement être lu + traduit par les ribosomes de la cellule, c’est le cycle de réplication le + simple
  • généralement vont se répliquer au niveau du cytoplasme (au niveau du noyau on retrouve des enzymes, mécanisme de manipulation surtout de l’ADN, donc pas d’intérêt pour eux), mais il y a toujours des exceptions avec les virus
  • nos cellules ne possèdent pas d’ARN polymérase qui peuvent copier de l’ARN (ARN polymérase dépendante de l’ARN): enzyme qui synthétise de l’ARN en copiant une autre molécule d’ARN. nos cellules ne font jamais ça. DONC les virus à ARN doivent coder cette enzyme qui va permettre la réplication et ou la transcription du génome viral.
    à partir d’un exemplaire d’ARN génomique → plusieurs exemplaires d’ARN complémentaire (ou anti-génome)→ plusieurs exemplaires d’ARN génomiques → encapsidation par protéines virales → virus mature
31
Q

Virus à ARN polarité négative:

A

brin d’ARN ne peut pas coder pour protéines car il est complémentaire à ARN messager. d’abord → ARN messager → protéines. doivent transporter avec eux une polymérase.

32
Q

Est ce que les polymérises synthétisent à neuf ou copient?

A

copient

33
Q

Virus à génome ADN multiplication:

A
  • réplication au niveau du noyau (avantage à utiliser les enzymes du noyau car le génome ressemble au génome cellulaire) donc utilisent les ADN et ARN polymérase de la cellule + protéines virales
  • décapsidation → ADN génomique dans le noyau → transcrit par ARN polymérase de la cellule → ARNm (il faut qu’il porte des séquences permettant la reconnaissance par l’ARN polymérase = des promoteurs) → il doit y avoir eu une co-évolution entre virus et la cellule pour reconnaissance → cytoplasme → traduction → protéines virales → réplication génome viral (desfois avec aide protéines cellulaires) → plusieurs exemplaires de génome → encapsidation → virus mature
34
Q

Rétrovirus multiplication:

A
  • le génome est composé d’ARN mais une phase ADN va être utilisée au cours de la réplication du virus (exemple classique: VIH)
  • génome décapsidé→ cytoplasme → la capside virale a en plus du génome des enzymes (les rétrovirus doivent transporter avec eux une polymérase=transcriptase inverse)→ fait le contraire d’une transcriptase: prend une matrice d’ARN génomique monocaténaire → copie ADN donc c’est une ADN polymérase mais dépendante de l’ARN (copie de l’ARN→ ADN) mais avec une seconde activité: copie le premier brin d’ADN et en fait un deuxième complémentaire → ADN viral bicaténaire → noyau de la cellule → une autre enzyme virale de la capside (=intégrase) → intégrer génome viral au génome de la cellule (=provirus)→ ARN polymérase le transcrit en ARNm→ protéines virales → virus mature
35
Q

Chez les mammifères, quels sont les seuls virus qui doivent absolument intégrer le génome cellulaire pour se multiplier?

A

les rétrovirus

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