Virologie Flashcards
Quelle est la première cause infectieuse de mortalité et morbidité au monde?
Le virus
Qu’est-ce qu’un bactériophage?
Un virus qui infecte une bactérie.
Quelle est la taille relative des virus?
entre 40 et 400 nm
Que requiert un virus pour se répliquer?
Une cellule hôte.
Qu’est-ce qu’un virion?
La forme libre du virus
Particule virale
Décris la classification d’avant et de maintenant.
AVANT: Classification classique
Selon les caractéristiques primaires et faciles à étudier
- Le tropisme pour un organe ou tissu
-Le vecteur (transmis pas quoi?)
AUJOURD’HUI: Classification moderne
- type d’acide nucléique
- mode de réplication
- Type de capside
- enveloppe lipidique?
Structure protéique qui entoure l’acide nucléique.
Capside
Que fait la capside?
- entoure l’Acide nucléique (ensemble = nucléocapside)
- Forme du virus (icosaédrique ou hélicoïdale)
De quoi est composée l’enveloppe ?
- Éléments de la cellule hôte
- Protéines virales
Pas tous les virus qui en ont une.
Quelles sont les différences entre les virus nus et enveloppés?
ENVELOPPÉS
- Fragiles
- peu résistants aux détergents et conditions extérieures
- Transmis par contact direct et intime
NUS:
- + Résistants
Donne des exemples de virus enveloppés et nus.
ENVELOPPÉS:
Herpès
VIH
NUS:
Virus causant la diarrhée
Norovirus
Rotavirus
Comment peut être l’acide nucléique d’un virus?
ADN / ARN
Double / Simple brin (mono/bicaténaire)
ARN polarité positive ou négative
Décris comment se fera la transcription d’un ADN 2-brins.
Brin - transcrit directement l’ARNm
Décris comment se fera la transcription d’un ADN 1-brin.
- Synthèse du 2e brin après l’entrée dans la cellule
- Brin - transcrira l’ARNm
Décris comment se fera la transcription d’un ARN 2-brins.
Brin + aura une fonction d’ARNm viral
Décris comment se fera la transcription d’un ARN -
Se copiera en ARN + et aura une fonction d’ARNm viral
Décris comment se fera la transcription d’un ARN +
Se copiera en ARN - qui transcrira l’ARNm
Décris comment se fera la transcription d’un ARN + (rétrovirus).
L’ARN est transcrit inverse en ADN -, qui fera un 2e brin (bicatenaire). Le brin ADN - sera transcrit en ARNm.
Décris les étapes du cycle viral.
- Attachement à des récepteurs spécifiques
- Pénétration cellulaire
- Décapsidation (acide nucléique libéré)
- Réplication du génome viral
- Synthèse des protéines virales
- Assemblage et encapsidation des particules virales produites
- Libération des virions
VOIR DIAPO 39
Quel est le récepteur de H1N1 ?
Acide sialique des voies respiratoires + digestives
Quel est le récepteur du VIH?
CD4 (plus il y en a, moins le virus fonctionne) + CCR5 (co-récepteur)
Quel est le récepteur du Parvovirus?
Antigène P des érythrocytes.
Décris la pénétration des virus enveloppés. + Influenza
-Fusion des membranes
-Endocytose
Influenza:
-pH acide par la pompe M2 de l’influenza A
Par quoi peut être inhibé.e la pompe M2 de l’influenza?
Amantadine
Décris la pénétration des virus non-enveloppés
peu connue.
Pores?
Quelle enzyme virale contient le virion?
ARN-dépendant-ARN-polymérase
Comment se réplique et se transcrit un virus à ARN?
Production du brin complémentaire qui sert de gabarit pour la production du génome viral
Enzyme virale: ARN-dépendant-ARN-polymérase
Comment se réplique et se transcrit un virus à ADN?
- Réplication dans le Noyau (sauf Poxvirus)
- Enzymes cellulaires pour transcription.
Comment se traduit un virus à ARN?
ARN +
- traduction de l’ARNm en un long polypeptide.
- clivée par une protase virale
Quels sont les inhibiteurs de la protase virale de l’hépatite C?
- Boceprevir
- Telaprevir
- Simeprevir
- Sofosbuvir
Comment se traduit un virus à ADN?
Contrôle important
-ARNm précoce et tardif
PRÉCOCE:
Code des protéines qui régularisent la réplication virale et la transcription de l’ADN viral
TARDIF:
Code des protéines structurelles virales.
Où se produit généralement l’Assemblage et l’encapsidation?
dans une portion de la cellule (inclusion virale)
- Concentration élevée localisée
- Acides nucléiques virales
- Protéines virales pour la capside
- Protège les composantes virales du syst.immun.
Au microscope, qu’est-ce qui nous permet de savoir si on a la rage?
Les Corps d’inclusion (Corps de Niggiri)
Quelles sont les modes de libération des virions?
- Mort cellulaire
- Bourgeonnement de la membrane
- Exocytose
Quelles sont les principales cibles thérapeutiques d’un virus?
- Polymérases
- Protéases (agent puissant)
- Neuraminidase (influenza)
Mécanisme moins spécifique:
-Interféron-a
modifie l’immunité contre le virus et non le virus
Interaction entre le virus et l’hôte dans une série d’étapes pour conduire à la maladie.
Pathogénèse
De quoi dépend le tropisme viral?
- Récepteur d’attachement
- Éléments génétiques qui favorisent l’expression des gènes viraux (selon certains tissus)
Quels sont les facteurs de l’hôte qui influencent la pathogénese?
STATUT IMMUNITAIRE:
- Déficit congénital
- VIH
- Traitements immunosuppresseurs
- Femme Enceinte + Foetus
Décris les étapes de la pathogénèse.
- Entrée
- Réplication locale
- Dissémination (dispersion)
- Tropisme musculaire
- 2e réplication tissulaire
- Dommage cellulaire
- Réponse immunitaire
Quels sont les modes d’exposition d’un hôte à son virus?
- Aérosols
- Goutelettes
- Fécale-orale
- Percutanée
- Muqueuses
- Verticale (trans-placentaire) (mère-foetus)
Donne des exemples de transmission aérienne.
Variole
Varicelle
Rougeole
Donne des exemples de transmission par goutelettes.
Influenza Virus respiratoire syncytial (RSV) Adénovirus Métapneumovirus Parainfluenza Parvovirus B19
Donne des exemples de transmission fécale-orale.
Entériques
Hépatite A
Hépatite E
Donne des exemples de transmission percutanée.
VIH
Hépatite B
Hépatite C
Donne des exemples de transmission par les muqueuses.
VHS-1 VHS-2 Infection Cytomegalovirus Mononucléose VPH
Donne des exemples de transmission trans-placentaire.
Infection Cytomegalovirus
Parvovirus
Rubéole
Quelles sont les contraintes du diagnostic virologique?
- Microorganismes petits
- Impossible de cultiver dans des milieux artificiels
- Cellules vivantes
- certains virus ne se cultivent pas ou sont trop virulents.
Quand devrait être effectuer le prélèvement du spécimen?
le plus tôt possible au début de la maladie, pour les acheminer rapidement au labo.
Que permet la microscopie électronique?
-Identification sommaire
Quelles sont les conditions d’utilisation de la microscopie électronique?
- Expertise
- limitée parce que certains virus sont difficiles à cultiver
- cède le pas graduellement à la biologie moléculaire.
Quelle est la technique immunologique directe?
Détection antigénique (comme un test de grossesse)
Décris la détection antigénique.
Enzyme Immuno-Essai (EIA) -pas de culture -rapide -Utilisation clinique pour : RSV Influenza Rotavirus Les antigènes sont sur une plaque. si on a un virus, les anticorps vont capter les antigènes.
Immunofluorescence
- Expertise supérieure
- herpès + autres virus respiratoires.
Quelle est la pierre angulaire (indispensable) dans les laboratoires de virologie?
La culture cellulaire
Décris la culture cellulaire.
- Les lignées cellulaires ne sont pas universelles
- Inoculation sur plusieurs lignées virales
- Identification finale par immunofluorescence
Quels sont les effets observés dans la culture cellulaire?
- Tropisme cellulaire
- Vitesse de croissance
- Effet Cytopathique
Décris la biologie moléculaire.
TECHNIQUES:
- Technique d’amplification des acides nucléiques (TAAN) ex. PCR
- Sondes, micropuces,…
Rapide
Méthodes spécifiques
Multiplex (+ieurs virus dans un même prélèvement)
Quantitive OU Qualitative
Nomme les méthodes de prélèvement des virus.
1- Microscopie électronique 2-Détection antagonique 3- Culture cellulaire 4-Biologie moléculaire 5- Sérologie
Quels sont les désavantages de la biologie moléculaire?
- Très sensible à la contamination
- Personnel avec expertise
- Couteux
Décris la Sérologie.
Identifier des anticorps du patient dirigés contre des virus connus.
Différence entre une infection récente et ancienne avec des IgM(précoce) et IgG (tardif).
Que veut dire Virémie?
Symptômes viraux
Quels sont les premiers anticorps qu’on développe?
IgM
Quels sont les Anticorps spécifiques?
IgG (tardif, le patient va être en train de guérir)
Quels sont les avantages de la Sérologie?
- Seule méthode pour certains cas
- Simple
- Infections antérieures + traitement prophylactique
Quels sont les désavantages de la Sérologie?
- Expertise
- Diagnostic tardif
- Interférence avec d’autres infections
- Demeure positive meme si le patient a été traité.
Qu’arrive-t-il avec le traitement en pratique?
- Diagnostic clinique –> Traitement + Suivi
- Confirmation du diagnostic (si besoin)
- test rapide de cabinet
- lab hôpital: biomol, séro
- lab de référence - Modification du Tx si nécessaire.
Quelles sont les différentes manifestations cliniques (4)?
ASYMPTOMATIQUE
SYNDROME VIRAL (traite pas)
- fièvre
- Diminution de l’état général
ATTEINTES D'ORGANES -SNC (Arbovirus, VHS-1) -Voies respiratoires (influenza, VRS, adné, rhinovirus) -Foie (Hépatite ABCE) -Gastro-intestinaux: Adéno, Norovirus Peau: VHS, Varicelle
SYNDROME DE L’IMMUNODÉFISCIENCE HUMAINE ACQUISE (SIDA)
Quand consulter pour un virus à manifestation asymptomatique et à syndrome viral?
- dépend de l’état général
2. Patients immunosupprimés et femmes enceintes
Combien de temps dure les symptômes d’une manifestation asymptomatique et d’un syndrome viral?
7-14 jours
De quelle famille fait partie l’influenza?
Orthomyxoviridae
Influenza A,B,C
Comment est l’acide nucléique de l’influenza?
ARN ss
Segmentée
négative
Décris la capside de l’influenza.
Sphérique
Pléomorphe
80-120 nm
Est-ce que l’influenza possède une enveloppe?
Oui.
lipidique dérivée de la membrane cellulaire
Que contient la surface de l’enveloppe du virus de l’influenza?
Hémagglutinine A
- Identification
- H1, H2, H3 (humains)
Neuraminidase
- N1, N2 (humains)
- Cible antivirale
Comment se transmet l’influenza?
Par gouttelettes (toux, éternuements, parole)
Aérosols
Contacts humains + Surfaces inanimées
Quel est le taux d’attaque de l’influenza?
Variable
10-40%
Que se passe-t-il avec la muqueuse respiratoire supérieure durant l’influenza?
Elle se réplique
Incubation : 1-4jours
Quand le virus d’influenza est-il contagieux?
24h avant les symptômes
Durant les symptômes
24h après le dernier jour de fièvre
= 7 jours
Peut être prolongée
Décris les symptômes d’allure grippale (SAG)
-Début abrupt
-Fièvre
-Toux
+
Mal de gorge / Arthralgie/myalgie /prostration /fatigue
Chez qui les présentations de la grippe sont atypiques?
Personnes âgées et jeunes enfants
Combien de temps durent les symptômes de la grippe
Toux: 2 semianes
Fatigue : 1 mois
reste: 5-7 jours
Quelles complications peuvent survenir d’une grippe?
- pneumonie virale
- surinfection bactérienne
- complications cardiaques
- myosite rhabdomyolyse
- atteinte SNC
- décès
Pourquoi devrait-on se faire vacciner annuellement pour la grippe?
-Touche 5-10% de la population (20 000 hospitalisation/année)
-4000 à 8000 mortalités
-Augmentation des antibio + C. difficile
-Variations de HA et NA
Antigénique drift (Minimes, HA NA)
Antigénique Shift: HA
Souches différentes: aviaires, humaine, porcine
-Faible durée de l’immunité vaccinale 4 à 6 mois
Combien de bouts de souches on met dans un vaccin contre la grippe, et quelle est la raison?
3 types , pcq l’immunité diminue s’il y en a trop.
Est-ce que les vaccins contre la grippe sont toujours à point?
Pas totalement, on les fait 1 an à l’avance, ça se peut que la souche change.
Qui décide des souches du vaccin contre la grippe?
OMS
L’efficacité du vaccin contre la grippe dépend de quoi?
- Concordance des souches + type d’influenza
- Immunogénicité du vaccin
- temps du début de la grippe
- Hôtes vaccinés
- Taux de vaccination de la population (80%)
Quelle est l’efficacité du vaccin pour les jeunes en santé et les personnes âgées et hébergées?
JEUNES:
-Prévention de la maladie à 59-90%
VIEUX:
- Prévention de la maladie 30-40%
- Hospitalisation: 50-60%
- Décès: 80%
Décris la grippe aviaire.
D’où elle provient, les souches décrites chez l’humain, la transmission.
-Influenza type A
-Oiseaux sauvages; les hôtes naturels de tous les influenza A: Asymptomatique
Souches: H5N1, H9N2, H7N9
-Contact avec la volaille
-transmission humain-humain?
Qu’est-ce qui peut aider au diagnostic d’un gastro-entérite?
-Clinique
-Microscopie électro: peu disponible
-Détection antigénique directe: Commerciaux pour : Rotavirus (A), Astrovirus et Adénovirus
Autres: Norovirus, Sapovirus
-Technique d’amplification d’acides nucléiques et Typage
-Culture cellulaire: moyen , usuelle : Aichi
Quelle est la famille des Norovirus?
Caliciviridae
Décris la forme du Norovirus.
30-38 nm
non enveloppé
ssARN+
Décris l’épidémiologie du Norovirus.
- 90% des gastroentérites
- Surtout l’hiver
Comment peut se transmettre le Norovirus?
- Fécale-Orale
- Aérosols (vomis)
- Contact aliments/eau contaminés, fruits de mer
- Excrétion virale peut continuer quelques semaines après les symptômes.
- Taux d’attaque secondaire élevé.
Quel est le traitement contre le Norovirus?
Hydratation
qu’est-ce que le Norovirus?
Virus de la gastro
Comment se traite un Zona?
Avec un antiviral après 72 heures.
Nomme les 8 espèces d’Herpes viridae (de VHH-1 à 8).
1: Herpes labial
2: Herpes génital
3: Varicelle et Zona
4: Mononucléose infectieuse
5:Infection cytomegalovirus (CMV)
6 et 7: Roséole
8: Sarcome de Kaposi
Décris la forme d’Herpesviridae.
ADN
Enveloppés
Réactivation + latence
Nomme les présentations de l’Herpès simple (VHS) + la Séropositivité.
VHS-1: 60%
VHS-2: 20%
(90% ignorent leur statut)
-Labiale (feu sauvage)
-Génitale
Occasionnellement:
-Infections disséminées
-Oculaires
-Méningées (VHS-2)
-Encéphalite (VHS-1)
Décris les infections que l’on peut avoir avec le VHS.
- Primaire
- Non-primaire (déjà + pour un autre VHS)
- Récurrente
- Cliniques OU asymptomatique.
COmment se transmet à 70% l’Herpes simplex?
lorsque le partenaire source est asymptomatique
Décris la durée des lésions et le temps d’incubation pour l’herpès Simplex.
Incubation: 4 jours
Durée des lésions:
-20 jours (infection primaire)
-10 jours (récidives)
Quels sont les traitements pour l’herpes simplex ?
Pas de traitement curatif!!!
- Valacyclovir-famciclovir PO
- Acyclovir IV
- Topique.
Décris l’épidémiologie de la varicelle (VZV).
90% chez les 15 ans
Décris la transmission du VZV.
Aérosols + infection via la muqueuse respiratoire suivie d’une virémie.
Décris les manifestations cliniques du VZV et du VHH-3 (Zona)
- Fièvre
- diminution État générale(DEG)
- Anorexie
- Rash maculopapulaire
- Vésicules sur base érythémateuse
- Lésions selon l’âge
Croûtes entre 2 et 4 jours et se résorbe complètement en 1 à 2 semaines.
Quelles peuvent être les complications de la varicelle?
-Infection SNC (encéphalite, ataxie, cérébelleuse, ACV)
-Pneumonie
1/400 chez adultes
10-15% d’atteinte asymptomatique
peut être mortelle en grossesse (2 et 3e trimestres)
- Surinfection bactérienne (streptocoque groupe A)
- Syndrome de Reye (Aspirine-Varicelle)Encéphalite et insuffisance hépatique
Quel est le point de latence à la réactivation de la varicelle?
Aux ganglions sensitifs.
Réactivation le long du nerf (unilatéral)
Réactivation locale
Dissémination possible.
Décris les différentes complications qui peuvent survenir avec le Zona.
- Zona ophtalmique (kératite et nécrose rétinienne)
- Ramsay-Hunt (ganglion géniculé du VIIe atteint et extension au VIII NC. Vésicules canal auditif + perte de goût 2/3 antérieur de la langue, paralysie faciale ipsolatérale)
- Atteinte branche mandibulaire du trijumeau: Lésions palais, amygdales, plancher buccal, langue
PRINCIPALE COMPLICATION:
-Névralgie post-herpétique (25-50% des cas chez les >50 ans)
Quel médicament antifectieux réagit avec la mononucléose et donne un rash ?
l’Amoxil Per Os
QU’est-ce que le Parvovirus B19?
5e maladie OU
Éryhtème infectieux
Décris Historique d’Ébola.
-Fièvre hémorragique
-virale
-Maladie à virus Ebola (MVE)
-1976 au Soudan + Rép. démo. du Congo (rivière Ébola)
+ de 20 épidémies
Décris les caractéristiques du virus Ébola.
Famille des Filoviridae (avec Marbourg)
ARN ss -
Enveloppé
Polymorphe
Nomme les espèces d’Ébola.
5 ESPÈCES:
- Bundibugyo
- Soudan
- Taï Forest
- Reston
- Zaire
Décris les manifestations cliniques du virus Ebola.
- Début soudain 8-10 jours après exposition
- dure de 2-21 jours
Symptômes:
fièvre, frissons, myalgies, faiblesse, malaise, douleur articulaire, saignent de partout
ressemble à la malaria / influenza.
Comment se transmet le virus Ebola?
Percutané
goutelettes
muqueuses
Oiseaux
Quels tests diagnostiquent le virus Ebola?
PCR:
moins de 24 heures
peut prendre 3 jours pour se positiver.
Sérologie.
Quels sont les traitements pour Ebola?
- Traitement de support
- Traitement spécifique:
- Sérums de convalenscence
- Zmapp
- Immunoglobulines
- Interféron
- Analogues nucléosidiques: brincidofovir
- Favipiravir
- Vaccins en développement
Nomme des virus transmis par les artropodes (arbovirus)
Alphavirus Bunyavirus Virus du Nil occidental Fièvre deng Virus Chicungunia
