Virologi Flashcards
Hur stora är virus?
20-300 nm
Hur definieras virus?
De är obligata intracellulära parasiter utan egen metabolism och beroende av en levande cell för sin förökning. Majoriteten orsakar ingen sjukdom, men vissa har kapacitet att ge allvarliga utbrott.
Vad är ett virion?
En infektiös viruspartikel.
Vilka är de 4 grundstrukturerna som virus kan ha?
- Icosahedral
- Helical
- Naket
- Enveloped
Vad innebär det om ett virus är enveloped?
Att det har ett lipidhölje (med glykoprotein).
Vad är spike?
Glykoprotein på lipidhöljet hos virus.
Vad är kapsomer?
Proteinenheter som bygger upp viruspartiklar på ett regelbundet sätt.
Vad kallas proteinenheterna som bygger upp viruspartiklar på ett regelbundet sätt?
Kapsomer
Vad är bakteriofager?
Virus som infekterar bakterier.
Vad kallas virus som infekterar bakterier?
Bakteriofager
Vad är kapsid?
Proteinskal hos virus.
Vad kallas proteinskal hos virus?
Kapsid
Vad är nukleokapsider?
Proteinskal hos virus med arvsmassa inuti.
Vad kallas proteinskal hos virus med arvsmassa inuti?
Nukleokapsider
Vilka funktioner har proteinskalet hos virus?
- Det skyddar (arvsmassan) mot miljö.
- Det binder till celler.
Har alla virus ett lipidhölje?
Nej
Vad innebär det om ett virus är naket?
Att det inte har något lipidhölje.
Vilka funktioner har lipidhöljet hos virus?
- Det skyddar.
- Det deltar vid virusupptag.
Vad är arvsmassan hos virus?
Ritningen som styr virusförökningen i celler och värddjur.
Vilka olika sorters arvsmassa kan virus ha?
- Linjärt dubbelsträngat DNA
- Cirkulärt dubbelsträngat DNA
- Linjärt enkelsträngat DNA
- Cirkulärt enkelsträngat DNA
- Positivt enkelsträngat RNA
- Negativt enkelsträngat RNA
- Dubbelsträngat RNA
Vad är unikt för virus gällande arvsmassan?
De kan ha DNA eller RNA, inte båda.
Hur många olika genomtyper kan virus ha?
7
Utifrån vad kan virusklassificering göras?
- Yttre kriterier
- Genomtyp
- Serotyp
Vad innebär serotyp, och varför är det viktigt?
Det är ett sätt att klassificera virus som baseras på vilka antikroppar viruset neutraliseras av. De som neutraliseras av antikroppar med serotyp A tillhör själva serotyp A, och virus kan ha flera olika serotyper dvs neutraliseras av flera olika antikroppar. Detta är viktigt till strategi vid vaccination för att välja vilka serotyper man ska vaccinera mot, samt vid utveckling av antivirala läkemedel. Ju fler serotyper ett virus har desto svårare är det att bekämpa.
Vad är speciellt med positivt RNA-virus?
Arvsmassan kan användas som mRNA direkt då RNA-beroende RNA-polymeras gör en komplementär negativ enkelsträng till RNA som används till nya positiva RNA-strängar.
Vad är speciellt med negativt RNA-virus?
Arvsmassan kan inte användas som mRNA direkt, så viruset måste ta med eget RNA-beroende RNA-polymeras som gör en positiv komplementär mall över hela arvsmassan för att sedan göra nya negativa enkelsträngade RNA.
Vad är speciellt med dubbelsträngat DNA-virus?
Det måste in i cellkärnan för att mRNA ska kunna transkriberas mha cellens RNA-polymeras.
Vad är retrovirus?
De har positivt RNA som arvsmassa men det kan inte fungera som mRNA, så virus tar med sig omvänt transkriptas som omvandlar RNA till dubbelsträngat DNA. Detta går in i cellkärnan och integreras i arvsmassan där det kan vara aktivt eller vilande i väntan på en trigger för att bygga nya viruspartiklar.
Vad är provirus?
Virus vars arvsmassa har integrerats med arvsmassan i en cell och ligger vilande.
Vilka steg har infektionscykeln för virus?
- Fastsättning
- Absorption
- Frisättning
- Tidig genexpression
- Sen genexpression
- Sammansättning
- Frigörning
Vad innebär fastsättning?
Virus hittar en levande cell och binder till specifika receptorer på cellytan. Vissa virus kan binda till flera olika receptorer pga att de har olika glykoprotein i lipidmembranet.
Vad innebär absorption?
Virus upptas i cellen via direkt fusion eller receptormedierad endocytos.
Vad innebär direkt fusion?
Absorption genom att virusets lipidhölje (som är ett krav för att detta ska kunna ske) smälter samman med cellens lipidmembran så att viruset kommer in i cellen.
Vad innebär receptormedierad endocytos?
Absorption genom att viruset fäster vid cellens yta och använder en vesikel för att ta sig in i cellen.
Vad innebär frisättning?
Att arvsmassan frisätts. Hos vissa virus (ofta de med dubbelsträngat DNA) måste det ske inuti cellkärnan. Virus kan använda sig av kärnporer (små/docka/öppna), aktiv transport eller själva gå sönder och bara spruta in arvsmassan.
Vad innebär tidig genexpression?
Viruset binder till cellen, absorberas och frisätter sin arvsmassa. Vissa gener uttrycks för att ta över cellen samt har immunreglerande funktioner och förberedelser för att kopiera arvsmassan, vilket ger möjlighet till förändring via mutation.
Är det vanligare att DNA eller RNA muteras? Varför?
RNA, eftersom RNA-polymeras tillåter felkopiering i sekvensen av arvsmassa och inte har mekanismer att korrigera fel.
På vilka sätt kan virus mutera?
- Felkopiering/Punktmutation
- Reassortment
- Rekombination
Vad innebär reassortment?
Att 2 virus med segmenterad arvsmassa infekterar samma cell och blandar gener med varandra.
Vad innebär rekombination?
Att 2 virus med osegmenterad arvsmassa infekterar samma cell och RNA-polymeras hoppar mellan mallarna vilket skapar en ny kombination.
Vad innebär sen genexpression?
Virusets arvsmassa kopieras och protein som ska bygga ihop nya virus produceras.
Vad innebär sammansättning?
Det är då alla beståndsdelar till virus sätts ihop, bla packas en kapsid med ett fullt genom mha packningssignaler som skiljer på cell- och virussekvenser i arvsmassan.
Vad innebär frigörning?
Att nya virus tar sig ut ur cellen via avknoppning eller lysering.
Hur kan virus frigöras från celler?
- Avknoppning
- Lysering
Vad innebär avknoppning?
Att virus vandrar mot cellytan och tar med sig en del av cellens lipidmembran.
Vad innebär lysering?
Att virus producerar protein som öppnar membranporer så att vätska kommer in och cellen sprängs av osmotiskt tryck.
Vad är agens?
Ett smittämne.
Vad är ett annat ord för smittämne?
Agens
Vad är R0?
Det är ett värde baserat på miljö som anger hur många individer en sjuk individ kan smitta i genomsnitt. Ju högre siffra, desto mer smittsam är sjukdomen.
Hur kan virus spridas?
- Horisontellt (direkt eller indirekt)
- Vertikalt
Ge exempel på indirekta smittvägar.
- Vektor
- Luftburet/Aerosol/Droppsmitta
- Mat/Foder
- Vatten
- Redskap
- Hantering
Ge exempel på direkta smittvägar.
- Fysisk kontakt
- Sexuell kontakt
- Slickande
- Bitande
Vad innebär vertikal spridning av virus?
Att virus överförs från mamman till avkomman, antingen via mjölk eller hos vissa djurslag transplacentalt.
Varför är stabilitet viktigt för virus?
Det har betydelse för smittspridning, då virus inte smittar lika bra om de faller sönder.
Är virus med lipidhöljen stabila eller instabila?
Instabila
Är virus med tajta proteinskal stabila eller instabila?
Stabila
Är virus med lipidhöljen eller virus med tajta proteinskal mest stabila?
Virus med tajta proteinskal.
Vad kan påverka stabiliteten hos virus?
- Om de har lipidhölje eller ett tajt proteinskal.
- Vilket material viruset befinner sig i.
- Temperaturen.
Vad är direkt viruspåverkan?
Det innebär att virus infekterar celler så att de producerar virus istället för att utföra sin normala funktion (som är inhiberad eller helt förstörd), vilket kan leda till organsvikt.
Hur kan T-celler orsaka sjukdom?
De slår ut infekterade celler vilket eventuellt kan leda till organsvikt, feber eller cytokinstorm/överreaktion med massiv cellpåverkan och död.
Vad är immunosupression?
Det innebär att virus kan blockera vissa immunceller och signalleringsmekanismer, vilket fördröjer det naturliga immunförsvaret. Vissa virus kan även replikera immunceller vilket förändrar balansen mellan cytokiner. Global immunosuppression kan leda till sekundära infektioner, ofta bakteriella från tex normalfloran.
Vad är akut infektion?
Den produktiva fasen av infektionen med snabbt förlopp och akut sjukdom.
Vad innebär persistent infektion?
Det är låggradig, länge pågående, produktiv infektion utan symtom men kan vara smittsam tidvis eller hela tiden, tex FIP/vingelsjuka/mul- och klövsjuka.
Vad innebär latent infektion?
Att virusmängden nästan försvinner efter initial infektion men efter en tid (eventuellt år) blossar upp igen med en smittsam period, försvinner igen osv, tex herpesvirus.
Vad innebär långsam progressiv infektion?
Att virusmängden ökar sakta över månader eller år, men när djuret väl blir sjukt så leder det alltid till död, tex valpsjuka.
Är rabies en zoonos?
Ja
Ge exempel på 1 viral zoonos.
Rabies
Beskriv sjukdomsförloppet hos rabies.
- Ett djur bits av ett smittat djur och viruset kommer in via infekterad saliv.
- Det sker viss replikering i muskelceller.
- Viruset inkuberas i djurets kropp i 3-12 v utan att visa sjukdomstecken.
- Viruset sprids via perifera nerver till ryggmärg och hjärna.
- Där förökas viruset snabbt, djuret börjar visa sjukdomssymtom (beteendeförändringar som aggressivitet) och viruset förs till andra inre organ, främst spottkörtlarna.
- Det infekterade djuret dör vanligen inom 7 dagar efter att symtom ses.
Vad är rabies?
En viral zoonos och dödlig sjukdom som kan komma med smugglade djur. Det finns inget botemedel, men vaccin kan tas förebyggande och post-infektion.
Hur kan virus orsaka cancer?
Eftersom virusinfektioner stör cellcykeln. Cancergenerna interagerar med kontrollpunkterna som cellen går igenom för att kunna dela sig, gör att cellcykeln pågår kontinuerligt utan reglering och skapar en tumör.
Vad innebär viremi?
Att virus sprids till blodet och då kan infektera större delar av kroppen.
Vad kallas det när virus sprids till blodet och då kan infektera större delar av kroppen?
Viremi
Hur odlas virus?
Det måste göras med levande celler då majoriteten av virus inte växer på medium, vilket gör det svårare att studera dem och ta fram antivirala medel.
Vad är direkt diagnostik?
Metoder med syfte att påvisa själva viruset.
Vad är indirekt diagnostik?
Metoder med syfte att påvisa antikroppar.
Vad är PCR?
En direkt metod som går ut på att man utifrån kunskap om virusets arvsmassa designar en primer som används för att påvisa en känd nukleinsyrasekvens.
Det är dock känsligt då virus muterar, och fungerar inte för virus med RNA.
Vad är ELISA?
En (in/direkt) metod som går ut på att antigen binder till en primär antikropp. Sedan tillsätts en sekundär antikropp med enzym samt ett substrat till enzymet. Om antikroppar finns så binds komplexet och ger färgomslag.
Alternativt så kan en testplatta täckt med virusantigen detektera närvaro av virusspecifika antikroppar i prov.
Ge exempel på metoder för virusdiagnostik.
- PCR
- ELISA
Vad är speciellt med virusdiagnostik?
Att det kan vara komplicerat och osäkert då det finns många olika virus som förändras över tid. Det kräver kunskap, specialdesign samt utprovning och alla metoder baseras på att det ska vara klinisk undersökning, rätt prov, rätt metod, specificitet, känslighet samt ev rätt förvaring och transport.
Kan man bota virussjukdomar?
Nej
Kan man bromsa replikation av virus?
Ja
Ge exempel på vaccinkoncept.
- Levande försvagade mikroorganismer
- Avdödade mikroorganismer
- Subenhetsvaccin
Vad innebär levande försvagade mikroorganismer som vaccinkoncept?
Att alla komponenter finns men viruset har odlats tills det tappat sin sjukdomsförmåga. Då kan det fortfarande infektera, men orsakar ingen sjukdom och blir därför ett effektivt vaccin. Nackdelen är att virus i vissa fall kan revertera och orsaka sjukdom hos individer med svagt immunförsvar, samt spridas i naturen.
Vad innebär avdödade mikroorganismer som vaccinkoncept?
Att alla komponenter finns men viruset är avdödat. Då kan de inte infektera, men får ändå ett svar med antikroppar och är säkert. Nackdelen är att det inte blir en normal immunologisk reaktion.
Vad är Virkon S?
Ett desinfektionsmedel som är effektivt för att inaktivera virus, mykoplasma, bakterier, svamp och sporer. I vattenlösning är det helt riskfritt och kan användas i lokaler, på utrustning, till desinfektion av djur samt vid luft- och vattendesinfektion.
Ge exempel på kemiska metoder för inaktivering av virus.
- Ammoniak
- Detergenter
- Organiska lösningsmedel
- Aldehyder
- Väteperoxid
- Klorföreningar
- Kvarternära ammoniumföreningar
Ge exempel på sätt att inaktivera virus.
- Hög värme
- pH-förändring (med syra eller kalk)
- UV-ljus
- Högtrycksbehandling
- Kemiska metoder
- Virkon S
Vilket virus orsakar rabies?
Lyssavirus
Nämn 3 unika virala enzym.
- Omvänt transkriptas
- RNA-beroende RNA-polymeras
- Intergras
Vad är prioner och hur replikeras de?
Det är protein som finns i kroppen och kan vara hjälpsamma, men vid en virusinfektion kan de göra oss sjukare om de påverkas av virus och saboterar proteinsyntesen.
