variaciones en el genoma humano Flashcards
su objetivo fue conocer
la forma en que está constituido el
genoma humano nuclear
Proyecto Genoma Humano
principales variaciones genéticas
polimorfismos en los fragmentos de restricción
secuencias repetidas en Tándem
variantes de un solo nucleotido
inserciónes y deleciones
variaciones estructurales
primeras variantes descritas en el genoma humano
polimorfismos en fragmentos de restricción
cambio en la secuencia del DNA que da lugar a la creación o eliminación de un sitio de reconocimiento para una
endonucleasa
polimorfismos en fragmentos de restricción
como se clasifican las variantes de repeticiones en tándem
minisatélite y microsatélite
son resultado de errores durante la replicación, debido a las ADN polimerasas. Reduciendo o aumentando el numero de unidades de repetición
polimorfismo en secuencias mini y microsatelite
pueden modificar el número de
unidades de repetición presentes en uno o ambos alelos.
errores en la recombinación
entre cromosomas homólogos o
cromátidas hermanas
variación que tiene una tasa elevada de mutación y pueden ser
variantes de riesgo en enfermedades complejas, constituir variantes patogénicas
Microsatélites
hay una variación de estas cada 300 a 1000 pb en el genoma humano
variantes de un solo nucleotido
variante que por su bajo polimorfismo reduce su utilidad como marcadores para estudios de ligamiento y mapeo génico
variantes de un solo nucleotido
variación genética que se localiza den regiones génicas y extragénicas, ademas de que puéden hallarse en regiones codificares o no
variantes de un solo nucleotido
de que depende el efecto de las variantes de un solo nucleotido
de su localización
variantes que se localizan en las regiones transcritas de los genes y afectan las funciones del RNA
variantes de un solo nucleotido ESTRUCTURALES
variantes genéticas (con juntos de variantes de un solo nucleotido) que se heredan juntas en un bloque
haplotipo
proyecto que relaciono un mapa de haplotipos del genoma humano
Proyecto HapMap
busca caracterizar las variaciones en el ADN, específicamente los polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs)
Proyecto HapMap
En que consiste la face I del Proyecto HapMap
en 2005 se identificaron 1.1 mill. de SNPs en 270 individuos
en que consiste la fase II del proyecto HapMap
finalizada en 2007, se amplio el mapa con mas de 2.1 mill. de SNPs adicionales
Perdida de segmentos de ADN
deleciones
copia adicional de segmentos, que puede resultar en genes duplicados
duplicaciones
Segmentos de ADN que se invierten, alterando el orden de los genes
inversiones
Segmentos que se trasladan a diferentes ubicaciones dentro del genoma
Translocaciones
alteraciones que involucran más de dos puntos de ruptura que modifican la estructura cromosómica
Rearreglos Genómicos
formas no balanceadas que conducen a CNV e incluyen deleciones, duplicaciones e inserciones, y formas balanceadas como inversiones y translocaciones
variantes estructurales
variaciónes que constituyen el mayor porcentaje de diferencias entre los genomas individuales
Variación Estructural
cuantas variantes estructurales existen aproximadamente en el genoma humano
2,100 a 2,500 variantes que altérales a 20 mill. de Pares de nucleótidos
mecanismos que generan variantes estructurales
secuencias repetidas de bajo y alto numero de copias
inserción de elementos móviles
errores en la replicación
segmentos de DNA, repeticiones en un número bajo de copias, con una longitud mayor de 50 pares de bases y hasta varias megabases que contienen secuencias codificantes y no codificantes de una región genómica en particular.
VARIANTES EN EL
NÚMERO DE COPIAS
las variantes en el núnero de copias constituyen, que porentaje de la diversidad genómica
5% al 10%
las variantes en el numero de copias puédense ser:
hereditarias o de novo
los cromosomas se rompen y los fragmentos se reúnen de manera incorrecta, pero sin pérdida o ganancia de DNA, sobre todo por NAHR (recombinación homóloga no alélica)
VARIACIONES ESTRUCTURALES BALANCEADAS
que mecanismos incluyen las variaciones estructurales balanceadas
inversiones
translaciones
inserciones
variante que no modifica el fenotipo del individuo portador, aunque pueden crear gametos desbalanceados.
VARIACIONES ESTRUCTURALES BALANCEADAS
variaciones que pueden afectar a un gen, si los puntos de rotura ocurren dentro de su secuencia,
VARIACIONES ESTRUCTURALES BALANCEADAS
variación que se hereda exclusivamente por vía materna y posee una tasa de mutación mayor que la del genoma nuclear.
VARIABILIDAD DEL
GENOMA
MITOCONDRIAL
¿Qué es la Eva mitocondrial?
el genoma de todos los grupos humanos modernos desciende de una secuencia ancestral única proveniente de una mujer que vivió hace 200 000 años
grupos de haplotipos que comparten un ancestro común y se definen por mutaciones específicas en la secuencia del ADN mitocondrial.
haplogrupos de mtDNA
