Transcription et régulation Flashcards
Qu’est-ce qui différencie un ADN d’un ARN au point de vue structural ?
ADN : Désoxyribose + thymine (T)
ARN : Ribose + uracile (U)
Vrai ou faux, l’ARN présente une structure secondaire et tertiaire ?
Vrai
Nommez les bases qui constituent l’ARN ainsi que leur appariement ?
A : Adénine
U : Uracile
C : Cytosine
G : Guanine
A-U & C-G
Qu’est-ce qu’un “pseudonoeud” ?
Il s’agit d’un appariement de bases entre 2 régions simple-brin de boucles d’ARN.
Quelle enzyme est responsable de la transcription ?
L’ARN polymérase
Quel énoncé est faux au sujet de l’ARN polymérase :
a) L’ARN polymérase synthétise l’ARN en copiant un brin matrice d’ADN
b) Elle transcrit de 5’ vers 3’ mais doit lire le brin matrice de 3’ vers 5’
c) Elle ne nécessite pas d’amorce
d) La transcription doit être aussi précise que la réplication
e) Elle crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
D est faux, la transcription N’A PAS à être aussi précise que la réplication d’ADN puisque les erreurs ont une durée de vie limitée (correspondant à la durée de vie du transcrit).
Qu’est-ce qu’un promoteur et un terminateur ?
Promoteur : Site d’initiation de la transcription
Terminateur : Site de terminaison de la transcription
Quel énoncé est faux en lien avec le facteur sigma (σ) chez les procaryotes :
a) Il existe plusieurs facteurs sigma (σ) chez les procaryotes
b) Il doit se lier à l’ARN polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
c) Il s’associe à l’ARN polymérase avant de se lier au promoteur
d) Il permet la sélection du promoteur au niveau du gène à transcrire
e) Il est relâché au niveau du terminateur chez les procaryotes
E est faux, il est relâché environ 10 nucléotides après l’initiation de la transcription (durant l’élongation).
À quel niveau, l’ARN polymérase est-elle recrutée et relâchée ?
Elle est recrutée au promoteur et relâchée au niveau du terminateur
Qu’est-ce qu’une séquence consensus ou canonique ?
Il s’agit de la séquence nucléotidique ou peptidique la plus fréquente à chaque position d’un alignement séquentiel.
Nommez les 2 éléments nécessaires pour que l’ARN polymérase puisse initier et terminer la transcription ?
Il faut des facteurs de transcription protéiques (tel que le facteur sigma) et de signaux dans l’ADN (promoteur et terminateur)
Vrai ou faux, plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus idéale, plus l’affinité du facteur sigma (σ) sera grande ?
Vrai
Vrai ou faux, l’affinité du facteur sigma (σ) pour un promoteur favorise l’efficacité d’initiation de la transcription ?
Vrai
Classez en ordre les étapes de la transcription chez les procaryotes :
a) Élongation
b) Rencontre du signal de terminaison
c) Ouverture locale de la double hélice d’ADN
d) Initiation de la synthèse
e) Association du facteur sigma (σ) à l’ARN polymérase
f) Relâchement du facteur sigma (σ)
g) Détachement de l’ARN polymérase pour libérer l’ARN
E-C-D-F-A-B-G
Qu’est-ce que la boite “-10” et “-35” ?
Il s’agit de la position d’une séquence, reconnue par le facteur sigma (σ) bactérien, dictant le brin à utiliser ainsi que le sens de la transcription.
N.B : Les boites sont nommées selon leur distance par rapport au site d’initiation de la transcription.
Qu’est-ce que la séquence “TATAAT (-10)” ?
Il s’agit d’un point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes.
N.B : Le “-10” signifie que la séquence est située à environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.
Que favorise la “tige-boucle” (riche en C-G suivi d’une série de U) ?
La tige-boucle favorise une contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase ce qui favorise son détachement et donc, la terminaison de la transcription chez les procaryotes.
Quels sont les 3 types d’ARN polymérases qu’utilisent les cellules eucaryotes et quels types d’ARN produisent-elles ?
- ARN polymérase I : ARNr
- ARN polymérase II : ARNm
3 ARN polymérase III : ARNt
Qu’est-ce que la boite “TATA (-25)” ?
Il s’agit du point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes.
N.B : Le “-25” signifie que la séquence est située à environ 25 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.
Qu’est-ce qui permet la liaison de l’ARN polymérase II au promoteur chez les eucaryotes ?
La liaison entre l’ADN et les facteurs de transcription généraux TFIID (sous-unité TBP reconnait la boite TATA) et TFIIB (positionne adéquatement l’ARN polymérase sur le brin d’ADN)
Quelle est la fonction du facteur de transcription “TFIID” ?
Sa sous-unité (TBP) reconnait la boite TATA (-25) au niveau de l’ADN
Quelle est la fonction du facteur de transcription “TFIIB” ?
Recruté par TFIID, il positionne adéquatement l’ARN polymérase sur le brin d’ADN (au promoteur)
Quelles sont fonctions du facteur de transcription “TFIIH” ?
Fonction hélicase (sépare localement les 2 brins d’ADN) et fonction kinase (phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase)
Que provoque la phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase ?
Cela provoque la libération des autres facteurs de transcription (TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH) ce qui représente le signal de départ de la transcription et de l’élongation.
