Transcription et régulation

Question 1

Qu’est-ce qui différencie un ADN d’un ARN au point de vue structural ?

Answer 1

ADN : Désoxyribose + thymine (T)

ARN : Ribose + uracile (U)

Question 2

Vrai ou faux, l’ARN présente une structure secondaire et tertiaire ?

Answer 2

Vrai

Question 3

Nommez les bases qui constituent l’ARN ainsi que leur appariement ?

Answer 3

A : Adénine
U : Uracile
C : Cytosine
G : Guanine

A-U & C-G

Question 4

Qu’est-ce qu’un “pseudonoeud” ?

Answer 4

Il s’agit d’un appariement de bases entre 2 régions simple-brin de boucles d’ARN.

Question 5

Quelle enzyme est responsable de la transcription ?

Answer 5

L’ARN polymérase

Question 6

Quel énoncé est faux au sujet de l’ARN polymérase :

a) L’ARN polymérase synthétise l’ARN en copiant un brin matrice d’ADN
b) Elle transcrit de 5’ vers 3’ mais doit lire le brin matrice de 3’ vers 5’
c) Elle ne nécessite pas d’amorce
d) La transcription doit être aussi précise que la réplication
e) Elle crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif

Answer 6

D est faux, la transcription N’A PAS à être aussi précise que la réplication d’ADN puisque les erreurs ont une durée de vie limitée (correspondant à la durée de vie du transcrit).

Question 7

Qu’est-ce qu’un promoteur et un terminateur ?

Answer 7

Promoteur : Site d’initiation de la transcription

Terminateur : Site de terminaison de la transcription

Question 8

Quel énoncé est faux en lien avec le facteur sigma (σ) chez les procaryotes :

a) Il existe plusieurs facteurs sigma (σ) chez les procaryotes
b) Il doit se lier à l’ARN polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
c) Il s’associe à l’ARN polymérase avant de se lier au promoteur
d) Il permet la sélection du promoteur au niveau du gène à transcrire
e) Il est relâché au niveau du terminateur chez les procaryotes

Answer 8

E est faux, il est relâché environ 10 nucléotides après l’initiation de la transcription (durant l’élongation).

Question 9

À quel niveau, l’ARN polymérase est-elle recrutée et relâchée ?

Answer 9

Elle est recrutée au promoteur et relâchée au niveau du terminateur

Question 10

Qu’est-ce qu’une séquence consensus ou canonique ?

Answer 10

Il s’agit de la séquence nucléotidique ou peptidique la plus fréquente à chaque position d’un alignement séquentiel.

Question 11

Nommez les 2 éléments nécessaires pour que l’ARN polymérase puisse initier et terminer la transcription ?

Answer 11

Il faut des facteurs de transcription protéiques (tel que le facteur sigma) et de signaux dans l’ADN (promoteur et terminateur)

Question 12

Vrai ou faux, plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus idéale, plus l’affinité du facteur sigma (σ) sera grande ?

Answer 12

Vrai

Question 13

Vrai ou faux, l’affinité du facteur sigma (σ) pour un promoteur favorise l’efficacité d’initiation de la transcription ?

Answer 13

Vrai

Question 14

Classez en ordre les étapes de la transcription chez les procaryotes :

a) Élongation
b) Rencontre du signal de terminaison
c) Ouverture locale de la double hélice d’ADN
d) Initiation de la synthèse
e) Association du facteur sigma (σ) à l’ARN polymérase
f) Relâchement du facteur sigma (σ)
g) Détachement de l’ARN polymérase pour libérer l’ARN

Answer 14

E-C-D-F-A-B-G

Question 15

Qu’est-ce que la boite “-10” et “-35” ?

Answer 15

Il s’agit de la position d’une séquence, reconnue par le facteur sigma (σ) bactérien, dictant le brin à utiliser ainsi que le sens de la transcription.

N.B : Les boites sont nommées selon leur distance par rapport au site d’initiation de la transcription.

Question 16

Qu’est-ce que la séquence “TATAAT (-10)” ?

Answer 16

Il s’agit d’un point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les procaryotes.

N.B : Le “-10” signifie que la séquence est située à environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.

Question 17

Que favorise la “tige-boucle” (riche en C-G suivi d’une série de U) ?

Answer 17

La tige-boucle favorise une contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase ce qui favorise son détachement et donc, la terminaison de la transcription chez les procaryotes.

Question 18

Quels sont les 3 types d’ARN polymérases qu’utilisent les cellules eucaryotes et quels types d’ARN produisent-elles ?

Answer 18

1. ARN polymérase I : ARNr
2. ARN polymérase II : ARNm
   3 ARN polymérase III : ARNt

Question 19

Qu’est-ce que la boite “TATA (-25)” ?

Answer 19

Il s’agit du point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes.

N.B : Le “-25” signifie que la séquence est située à environ 25 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.

Question 20

Qu’est-ce qui permet la liaison de l’ARN polymérase II au promoteur chez les eucaryotes ?

Answer 20

La liaison entre l’ADN et les facteurs de transcription généraux TFIID (sous-unité TBP reconnait la boite TATA) et TFIIB (positionne adéquatement l’ARN polymérase sur le brin d’ADN)

Question 21

Quelle est la fonction du facteur de transcription “TFIID” ?

Answer 21

Sa sous-unité (TBP) reconnait la boite TATA (-25) au niveau de l’ADN

Question 22

Quelle est la fonction du facteur de transcription “TFIIB” ?

Answer 22

Recruté par TFIID, il positionne adéquatement l’ARN polymérase sur le brin d’ADN (au promoteur)

Question 23

Quelles sont fonctions du facteur de transcription “TFIIH” ?

Answer 23

Fonction hélicase (sépare localement les 2 brins d’ADN) et fonction kinase (phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase)

Question 24

Que provoque la phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase ?

Answer 24

Cela provoque la libération des autres facteurs de transcription (TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH) ce qui représente le signal de départ de la transcription et de l’élongation.

Question 25

Quels facteurs de transcription ne sont pas libérés suite à la phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase ?

Answer 25

TFIID (sous-unité TBP active durant le processus d’élongation)

Question 26

Qu’est-ce que le signal de polyadénylation “AAUAAA” ?

Answer 26

Il s’agit du terminateur chez les eucaryotes

Question 27

Démystifiez les termes “abondance” et “demi-vie” en lien avec l’ARN ?

Answer 27

Abondance : Quantité totale d’ARN

Demi-vie : Temps pour arriver à 50% de l’abondance

Question 28

Quel énoncé est faux en lien avec la régulation de l’expression génique :

a) Tous les gènes ne sont pas exprimés avec la même efficacité chez les procaryotes et les eucaryotes
b) Le taux de transcription détermine le niveau d’ARNm
c) Le taux de transcription d’un gène est régulé au niveau de l’initiation
d) Les facteurs de transcription spécifiques s’attachent sur la séquence du promoteur
e) La vitesse d’élongation de la transcription est variable

Answer 28

E est faux, la vitesse d’élongation est constante

Question 29

Comment se nomme une protéine qui facilite l’assemblage des facteurs généraux de la transcription ?

Answer 29

Un activateur de la transcription

Question 30

Comment se nomme une protéine qui empêche l’assemblage des facteurs généraux de la transcription ?

Answer 30

Un répresseur de la transcription

Question 31

Vrai ou faux, des protéines spécifiques peuvent se lier à l’ADN pour engendrer une activation ou une inhibition de la transcription ?

Answer 31

Vrai

Question 32

Nommez 2 éléments que possèdent les facteurs spécifiques de transcription ?

Answer 32

Un domaine spécifique de liaison à l’ADN et un domaine d’activation ou de répression

Question 33

Vrai ou faux, le complexe d’initiation de la transcription est différent pour la transcription de tous les gènes ?

Answer 33

Faux, il est identique pour la transcription de tous les gènes

Question 34

Vrai ou faux, les facteurs de transcription et les complexes protéiques se liant aux régions régulatrices des gènes sont combinés spécifiquement pour chaque gène ?

Answer 34

Vrai