Maturation des ARNm, traduction et repliement Flashcards
Vrai ou faux, la maturation des ARNm consistent à 3 étapes distinctes chez les eucaryotes et les procaryotes ?
Faux, l’ARNm n’a pas besoin de maturer chez les procaryotes
Où se fait la transcription et la maturation des ARN chez les eucaryotes ?
Dans le noyau
Vrai ou faux, chez les procaryotes, un ARNm donne généralement une protéine ?
Faux, chez les EUCARYOTES, un ARNm donne généralement une protéine
Nommez les 3 étapes de la maturation des pré-ARNm chez les eucaryotes ?
- Addition de la coiffe (CAP) en 5’
- Polyadénylation en 3’
- Épissage des introns
Quel énoncé est faux en lien avec l’addition de la coiffe en 5’ :
a) La coiffe correspond au 7-méthylguanosine
b) La coiffe est ajoutée à l’extrémité 5’ du pré-ARN lorsqu’il a atteint 25 nucléotides de longueur
c) Stabilise l’ARN en la protégeant contre l’exonucléase du cytoplasme
d) Facilite l’import de l’ARNm vers le noyau
e) Stimule la traduction par les ribosomes
D est faux, il facilite L’EXPORT de l’ARNm vers le CYTOPLASME
Quelle enzyme permet la liaison de la séquence poly-A en 3’ ?
La poly-A polymérase (PAP)
Quelles sont les 3 fonctions associées à la queue poly-A ?
- Augmente la stabilité de l’ARNm en protégeant l’extrémité 3’
- Facilite l’exportation de l’ARNm vers le cytoplasme
- Favorise la traduction en identifiant les molécules d’ARNm matures
À quoi sert la séquence “AUAAA” ?
De signal pour les facteurs de clivage
Quelle protéine assure la stabilité de la queue poly-A ?
PABP (poly-A binding proteins)
Quel énoncé est faux :
a) Pour la plupart, les exons correspondent aux séquences codantes de l’ARNm
b) Les introns son excisés par le processus d’épissage de l’ARN
c) Il arrive que les premiers et derniers exons contiennent des séquences non-codantes (5’ UTR et 3’ UTR)
d) Les exons sont généralement plus longs que les introns
e) L’ARNm mature est constitué d’exons reliés entre eux post excision des introns
D est faux, les exons sont généralement plus COURTS que les introns
Qu’est-ce que les snRNPs (small nuclear ribonucleic particles) ?
Il s’agit de petites ribonucléoprotéines nucléaires qui identifient les jonctions 5’ et 3’ des introns et participent à la coupure de l’ARN aux jonctions intron/exon.
Qu’est-ce qui détermine les limites des exons et des introns ?
Introns :
Début : GURAGU (où R doit être une purine (A ou G))
Fin : YYYYYYYYYYNCAG
Exons :
Début : G
Fin : AG
Expliquez les étapes du processus d’excision des introns (avec la formation du lasso) ?
- Liaison des snRPs U1 (5’) et U2 (A) suivi de l’ajout de U4, U5 et U6 ce qui favorise le repliement de l’intron
- L’adénine (A) de l’intron attaque l’extrémité 5’ au point d’épissage et coupe le squelette sucre/phosphate
- L’extrémité 5’ coupée de l’intron se lie de façon covalente au 2’ OH du ribose de l’adénine (A) pour former un lasso
- Relâchement de U1 et U4 suivi d’un déplacement de U5 et U6
- L’extrémité 3’ OH libre de l’exon 1 se lie avec le 5’ de l’exon 2, formant ainsi une séquence codante continue.
- L’intron (sous forme de lasso) lié aux unités U5 et U6 est libéré et sera éventuellement dégradé
Vrai ou faux, tout comme les introns, les snRNP sont dégradés dans le noyau ?
Faux, les snRNP sont recyclés
Qu’est-ce qui peut expliquer la diversité des protéines du génome humain ?
L’épissage alternatif
Quel est l’action d’un répresseur de l’épissage ?
Inclusion d’un intron dans l’ARNm mature
Quel est l’action d’un activateur de l’épissage ?
Exclusion d’un intron dans l’ARNm mature
Quel énoncé est faux en lien avec l’ARNm mature :
a) Seuls les ARNm matures peuvent sortir du noyau
b) La PABP est une protéine qui signale que l’ARNm est mature
c) La CBP est une protéine qui signale que l’ARNm est mature
d) L’EJC est un complexe protéique qui signal que l’ARNm est mature
e) Seulement 1 des 3 protéines signales doit être reconnu pour permettre la migration de l’ARNm hors du noyau
E est faux, les 3 signaux doivent être présent
Quelle est l’étape principale pour la régulation de la plupart des gènes eucaryotes ?
La transcription
Qu’est-ce qu’un triplet ou un codon ?
Une série de 3 bases sur l’ARNm qui codent pour des acides aminés
Quel est le codon qui détermine le site d’initiation du cadre de lecture ?
AUG (méthionine)
Quels sont les codons d’arrêt du cadre de lecture ?
UAA, UAG et UGA
Que signifie les termes ORF et UTR ?
ORF : Open reading frame (cadre de lecture ouvert)
UTR : Untranslated region (région non traduite)
Quel énoncé est faux en lien avec le ribosome :
a) Les 4 ARN constituant le ribosome ne représentent qu’une faible partie de la masse totale de l’organite
b) Il possède 1 site de liaison à l’ARNm
c) Il possède 3 sites de liaison aux ARNt (A, P et E)
d) La traduction se fait en 3 phases majeures (initiation, élongation et terminaison)
e) L’élongation est elle-même divisée en 4 étapes
A est faux, les 4 ARN comptent pour plus de la moitié de la masse du ribosome et ce, malgré les 80 protéines dont il est également constitué
Quel énoncé est faux en lien avec l’ARNt :
a) Structure en forme de trèfle composée de 70 à 80 nucléotides
b) Il s’agit d’un adaptateur moléculaire reliant les acides aminés et les codons
c) Le premier adaptateur du code génétique est l’aminoacyl-ARNt-synthétase
d) Le second adaptateur est la molécule d’ARNt dont le codon s’apparie avec le codon du ARNm
e) Un ARNt avec son acide aminé est appelé ARNt phosphorylé
E est faux, Un ARNt avec son acide aminé est appelé ARNt chargé
Classez en ordre les étapes de l’élongation :
a) L’embout carboxylique de la chaîne polypeptidique est découplé de l’ARNt situé au site P et lié au groupement aminé libre lié à l’ARNt au site A
b) Un déplacement de la grande sous-unité par rapport à la petite sous-unité du ribosome déplace les deux ARNt dans A et P vers les sites P et E de la grande sous-unité
c) La petite sous-unité se déplace de 3 nucléotides sur la molécule d’ARNm ce qui la repositionne en face de la grande sous-unité
d) Un ARNt chargé d’un acide aminé se lie au site A libre du ribosome selon le codon sur l’ARNm
D-A-B-C
Vrai ou faux, le repliement d’une protéine débute pendant sa synthèse ?
Vrai
Quel énoncé est faux en lien avec les chaperonnes moléculaires :
a) Elles aident les protéines nouvellement synthétisées à acquérir leur conformation adéquate
b) Elles préviennent l’agrégation des protéines
c) Les régions hydrophobes, prônent à s’agréger, sont ciblées par les chaperonnes
d) La fixation des chaperonnes au polypeptide en synthèse nécessite de l’ATP
e) L’ATP est également consommée au moment de déloger les chaperonnes de la protéine
D est faux, la fixation des chaperonnes au polypeptide en synthèse ne consomme pas d’énergie
Qu’arrive-t-il aux protéines qui n’acquièrent pas une structure adéquate ?
Elles sont marquées d’une étiquette d’ubiquitine afin d’être éventuellement dégradées par le protéasome
Quel énoncé est faux en lien avec la dégradation via le protéasome :
a) Utilise de l’ATP
b) Reconnaît les protéines à dégrader via leur étiquette ubiquitine
c) La protéine ciblée est dépliée pour rentrer dans le tube du protéasome
d) Les ubiquitines sont clivées à la fin de la dégradation de la protéine
e) Les protéines sont dégradées par hydrolyse
D est faux, les ubiquitines sont clivées avant que la protéine cible n’entre dans le tube du protéasome
Qu’est-ce que “E1” du système UPS ?
Enzyme activatrice du processus UPS nécessitant de l’ATP
Qu’est-ce que “E2” du système UPS ?
Enzyme de conjugaison qui sert de transport pour l’ubiquitine vers l’enzyme ligase E3
Quel est le rôle de l’enzyme E3 du système UPS ?
Transférer l’ubiquitine sur la protéine cible
Vrai ou faux, les protéines mal repliées qui ne sont pas éliminées peuvent causer de graves maladies ?
Vrai
