transcription de ADN Flashcards

1
Q

la réplication consiste à transformer x en x

A

ADN en ADN

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Q

la transcription consiste à transformer x en x

A

ADN en ARN

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Q

la traduction consiste à transformer x en x

A

ARN en protéine

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4
Q

la transcription génère quoi?

A

un polymère de ribonucléotides qui est synthétisé par une ARN polymérase

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5
Q

ARN polymérase synthétise dans quel sens?

A

5’ vers 3’

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6
Q

ARN est synthétisé sur quoi?

A

brin matrice (brin complémentaire)

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7
Q

le brin matrice est lu dans quel sens?

A

3’ à 5’

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8
Q

ARN possède quoi de l’ADN?

A

séquence du brin d’ADN codant

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9
Q

différence ARN et ADN

A

ribonucléotides au lieu désoxyribonucléotides

U au lieu de T

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10
Q

pourquoi l’ARN a une structure secondaire et tertiaire?

A

en raison de l’interaction entre ses bases

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11
Q

qu’est ce qu’un pseudo knot?

A

appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles

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12
Q

au carbone 2’, l’ARN possède un groupement…

A

OH

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13
Q

au carbone 2’, l’ADN possède un groupement …

A

H

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14
Q

la transcription se fait grâce à quoi?

A

ARN polymérase

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15
Q

expliquer le principe de transcription avec ADN polymérase

A

déroulement de ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par ARN polymérase
réformation de la double hélice en arrière par l’ARN polymérase

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16
Q

qu’est ce qu’un hétéroduplex?

A

courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement/environ 9 nucléotides

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17
Q

comment ARN polymérase synthétise l’ARN?

A

en copiant un brin matrice d’ADN

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18
Q

V ou F, ARN polymérase nécessite une amorce?

A

FAUX, ne nécessite pas d’amorce/peut commencer n’importe ou

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19
Q

estce que la transcription de ARN doit être aussi précise que celle de l’ADN?

A

NON, puisque les erreurs ont une durée de vie limitée (correspondent à la durée de vie du transcrit)/ pas vraiment de réparation nécessaire

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20
Q

ARN polymérase crée quel type de lien entre les nucléotides et son site actif?

A

lien phosphodiester

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21
Q

transcription commence et se termine ou sur l’ADN?

A

a des endroits précis sur l’ADN

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22
Q

qu’est ce qu’un promoteur?

A

site d’initiation de la transcription

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23
Q

qu’est-ce qu’un terminateur?

A

site de terminaison de la transcription

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24
Q

ARN polymérase a besoin de quoi pour initier et terminer la transcription?

A

facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN

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25
Q

rôle du facteur sigma

A
  • s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
  • aide polymérase à s’associer à un promoteur
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26
Q

ARN polymérase est recruté à quel niveau/ relâché ou?

A

recruté: au niveau du promotteur

relâché de l’ADN: niveau du signal STOP

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27
Q

qu’est ce qu’une séquence consensus ou séquence canonique?

A

ordre calculé des nucléotidiques (acides nucléiques) o acides aminés (protéines), trouvés à chaque position dans un alignement de séquences
*représente les résultats d’alignements de séquences multiple dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres et des pourcentages des motifs de séquences similaires sont calculés

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28
Q

V ou F, il y a plusieurs facteur sigma chez les procaryotes

A

VRAI

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29
Q

le facteur sigma s’associe à X pour former X avant de se lier au X

A

polymérase
complexe d’initiant de la transcription
promoteur

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30
Q

les facteurs sigma bactériens reconnaissent quoi?

A

une paire de courts motifs (séquences) conservés

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31
Q

comment s’appelle les courts motifs (séquences) conservés?

A

boites -35 et -10 (à cause de leur distance du site d’initiation de la transcription)
**position de cette séquences consensus dicte lr bin à utiliser ainsi que le sens de la transcription (donc de -35 à -10)

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32
Q

comment faire pour qu’un promoteur soit plus fort?

A

plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquences consensus (idéale), plus grande sera l’Affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la transcription (promoteur plus fort!!!)

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33
Q

position de la séquence TATAAT

A

-10, située environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription

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34
Q

rôle de la séquence TATAAT

A

repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

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35
Q

comment se fait cette reconnaissance moléculaire (entre sigma, ARN polymèrase etc…)?

A

via des liaisons chimiques faibles (non covalente);

1) forces de van der whall
2) pont hydorgène
3) liens ioniques
4) interactions hydrophobes

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36
Q

étapes de la transcription

A

1)facteur sigma s’associe à ARN polymérase avant la transcription/ ce complexe ira se fixer sur le promoteur
2) contact de ARN polymérase avec le promoteur entraine l’ouverture locale de la double hélice d’ADN (bulle de transcription)
3)initiation de la synthèse d’ARN à 50 ribonucléotides par seconde
4)Relâchement du facteur sigma après la synthèse d’une chaine de +/- 10 ribonucléotides ET élongation (2 étapes en 1)
5) Rencontre du signal de terminaison (forme que prend ARN grâce aux appariements locaux (intramoléculaires)/ quand ARN est sous cette forme= ARN polymérase doit se relâcher
6) ARN polymérase se détache, libérant ARN
(ARN polymérase peut ensuite aller retrouver un facteur sigma pour enclencher une nouvelle transcription)

37
Q

ou se trouve le signal de terminaison de la transcription encodée par ADN

A

à l’extrémité de 3’ de l’ARN néo-synthétisée

38
Q

la séquence d’ARN transcrite du signal de terminaison permet la formation de quoi?

A

tige boucle créant une contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase (favorise le détachement de l’ARN polymérase)

39
Q

les cellules eucarytoes utilisent combien d’ARN polymérase?

A

3 (et produisent plusieurs type d’ARN

40
Q

rôle ARN m

A

codent pour les protéines (ARN polymérase II)

ARNnc (non codant), miRNA, incRNA

41
Q

rôle ARNr

A

composent les ribosomes (ARN polymérase I)

42
Q

rôle ARNt

A

adaptateur lors de la synthèse protéique (ARN polymérase III)

43
Q

rôle petits ARN

A

utilisés dans différents processus cellulaires (ARN polymérase III)
*snRNA, snoRNA

44
Q

position boite TATA

A

-25

donc 25 paires de nucléotidesde bases en amont du site d’initiation de la transcription

45
Q

rôle boite TATA

A

sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

46
Q

position de GC box

A

-100

47
Q

position de CAAT box

A

-80

48
Q

la transcription commence ou?

A

+1

49
Q

exemples de séquences d’ADN conservées qui sont impliquées dans la régulation des gènes

A

-80, -100, enhancers

50
Q

le promoteur est caractérisé par quoi?

A

la boite TATA

51
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TBP subunit

A

1/reconnait la boite TATA

52
Q

2 sous unité du facteur TFIID

A

TBP et TAF

53
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TAF

A

11/reconnait autres séquences ADN proche du début de la transcription, régularise l’association de l’ADN par le TBP

54
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TFIIB

A

1/reconnait élément BRE du promoteur, positionne bien les ARN polymérase au début de la transcription

55
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TFIIF

A

3/stabilise interactions de ARN polymérase avec TBP et TFIIB

56
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TFIIE

A

2/attire et régularise TFIIH

57
Q

nombre de sous unités et fonction du facteur TFIIH

A

9/dézipe ADN au point de départ de transcription, phosphorylyse Ser5 de ARN polymérase CTD, libère ARN polymérase à partir du promoteur

58
Q

l’initiation de la transcription implique quoi?

A

multiple facteurs généraux de transcription= GTFs; général transcription factors ou TFII soit transcription factor 2

59
Q

ARN polymérase se fixe a la boite TATA via quoi?

A

via les transcriptions factors (ne reconnait pas le promoteur directement)

60
Q

quels facteurs de transcription s’associent à ADN du promoteur en premier?

A

facteurs de transcription généraux TFIID et TFIIB (ce qui permet à ARN polymérase II de se lier)

61
Q

séquence du signal de polyadénliation

A

AAUAAA

62
Q

Pourquoi ARN est constamment synthétisé et dégradé?

A

assurer une régulation stricte de son abondance

63
Q

Comment est régulé l’abondance (quantité totale) d’ARN?

A

régulée au niveau de l’initiation de la synthèse (transcription) et aussi régulation au niveau de sa dégradation

64
Q

dans le cytoplasme des eucaryotes, la demi-vie des ARNm est de…

A

quelques minutes à quelques heures (4,8 minutes en moyenne)

65
Q

qu’est ce qu’une demi-vie?

A

temps que ça prend pour arriver à 50% d’abondance

66
Q

qu’est ce qu’implique l’adaptation de l’organisme/cellules aux conditions changeantes de leur environnement?

A

changement des patrons d’expression des gènes, certains sont induits et d’autres sont réprimés

67
Q

qu’est-ce que la régulation de la transcription permet?

A

permet l’expression d’un gène au bon moment selon les besoins de la cellule

68
Q

qu’est ce que l’efficacité de la transcription détermine?

A

détermine la quantité d’ARN produit et a donc un impact sur la quantité de protéine traduite

69
Q

V ou F: tous les gènes sont transcrits (exprimés) avec la même efficacité?

A

FAUX ne sont PAS transcrits avec la même efficacité.

70
Q

taux de transcription détermine quoi?

A

le niveau d’ARNm et don aussi combien de protéine sera synthétisé

71
Q

le taux de transcription d’un gène est régulé au niveau de …

A

l’initiation par la séquence du promoteur et les facteurs de transcription spécifiques qui s’y attahcenet

72
Q

V OU F: la vitesse d’élongation peut varier?

A

FAUX: la vitesse d’élongation de la transcription reste toujours la même

73
Q

l’initiation de la transcription est contrôlée par quoi?

A

facteurs protéiques

74
Q

rôle des activateurs de la transcription

A

facilitent l’assemblage des facteurs généraux de transcription et de la polymérase sur le promoteur

75
Q

rôle des répresseurs

A

empêchent l’assemblage des facteurs généraux de transcription et de la polymérase sur le promoteur

76
Q

ces facteurs protéiques spécifiques stimulant ou inhibant la transcription se lient ou?

A

à des régions de contrôle spécifique de la transcription sur l’ADN en amont du promoteur (et même en aval)

77
Q

nom séquences activent transcription

A

enhancers

78
Q

nom séquences qui inhibent transcritption

A

silencers

79
Q

liaison des protéiques spécifiques sur ADN entraine quoi?

A

changement de conformation de ces complexes et de l’ADN (résultant en activation ou inhibition de la transcription)

80
Q

les facteurs spécifiques de transcription comprennent (2 éléments)

A

1) domaine de liaison à ADN

2) domaine d’activation (protéine d’activation) ou domaine de répression (protéine de répression)

81
Q

nom du domaine spécifique de liaison

A

DBD

82
Q

nom d’une porcine d’activation

A

TAD

83
Q

lors d’un effort physique, il a production de x/favorise la transformation de x en x

A

glucocorticoides

glycogène (réserve E) en glucose

84
Q

transformation de glycogène en glucose est possible grâce à

A

enzyme convertissant le glycogène
*enzyme pas constamment présente dans la cellule, synthétisée seulement au besoin (synthèse modulée par la présence de glucocorticoides)

85
Q

facteurs de transcription TF se liant à ADN et complexes protéiques qui se lient à ces facteurs déterminent quoi?

A

la vitesse d’initiation de la transcription qui varie d’un gène à l’autre et d’une condition à l’autre

86
Q

V OU F: le complexe d’initiation de la transcription (ARN polymère.rase et facteurs généraux de la transcription) est identique pour la transcription de tous les gènes?

A

VRAI

87
Q

exemples de facteurs pouvant remodeler la structure de la chromatine

A

acétyles d’histone et déacétylase

complexe de remodelage de la protéine

88
Q

modification de la chromatine: rôle activateur

A

recrutement acétyles d’histone par facteur de transcription activateur (queues d’histones acétyles, meilleure accessibilité à l’ADN)
*pour faire glisser les nucléosomes masquant le promoteur

89
Q

modification de la chromatine: rôle répresseur

A

recrutent des déacétylases d’histones (effet inverse activateur)