transcription de ADN Flashcards
la réplication consiste à transformer x en x
ADN en ADN
la transcription consiste à transformer x en x
ADN en ARN
la traduction consiste à transformer x en x
ARN en protéine
la transcription génère quoi?
un polymère de ribonucléotides qui est synthétisé par une ARN polymérase
ARN polymérase synthétise dans quel sens?
5’ vers 3’
ARN est synthétisé sur quoi?
brin matrice (brin complémentaire)
le brin matrice est lu dans quel sens?
3’ à 5’
ARN possède quoi de l’ADN?
séquence du brin d’ADN codant
différence ARN et ADN
ribonucléotides au lieu désoxyribonucléotides
U au lieu de T
pourquoi l’ARN a une structure secondaire et tertiaire?
en raison de l’interaction entre ses bases
qu’est ce qu’un pseudo knot?
appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles
au carbone 2’, l’ARN possède un groupement…
OH
au carbone 2’, l’ADN possède un groupement …
H
la transcription se fait grâce à quoi?
ARN polymérase
expliquer le principe de transcription avec ADN polymérase
déroulement de ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par ARN polymérase
réformation de la double hélice en arrière par l’ARN polymérase
qu’est ce qu’un hétéroduplex?
courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement/environ 9 nucléotides
comment ARN polymérase synthétise l’ARN?
en copiant un brin matrice d’ADN
V ou F, ARN polymérase nécessite une amorce?
FAUX, ne nécessite pas d’amorce/peut commencer n’importe ou
estce que la transcription de ARN doit être aussi précise que celle de l’ADN?
NON, puisque les erreurs ont une durée de vie limitée (correspondent à la durée de vie du transcrit)/ pas vraiment de réparation nécessaire
ARN polymérase crée quel type de lien entre les nucléotides et son site actif?
lien phosphodiester
transcription commence et se termine ou sur l’ADN?
a des endroits précis sur l’ADN
qu’est ce qu’un promoteur?
site d’initiation de la transcription
qu’est-ce qu’un terminateur?
site de terminaison de la transcription
ARN polymérase a besoin de quoi pour initier et terminer la transcription?
facteurs protéiques et des signaux dans l’ADN
rôle du facteur sigma
- s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
- aide polymérase à s’associer à un promoteur
ARN polymérase est recruté à quel niveau/ relâché ou?
recruté: au niveau du promotteur
relâché de l’ADN: niveau du signal STOP
qu’est ce qu’une séquence consensus ou séquence canonique?
ordre calculé des nucléotidiques (acides nucléiques) o acides aminés (protéines), trouvés à chaque position dans un alignement de séquences
*représente les résultats d’alignements de séquences multiple dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres et des pourcentages des motifs de séquences similaires sont calculés
V ou F, il y a plusieurs facteur sigma chez les procaryotes
VRAI
le facteur sigma s’associe à X pour former X avant de se lier au X
polymérase
complexe d’initiant de la transcription
promoteur
les facteurs sigma bactériens reconnaissent quoi?
une paire de courts motifs (séquences) conservés
comment s’appelle les courts motifs (séquences) conservés?
boites -35 et -10 (à cause de leur distance du site d’initiation de la transcription)
**position de cette séquences consensus dicte lr bin à utiliser ainsi que le sens de la transcription (donc de -35 à -10)
comment faire pour qu’un promoteur soit plus fort?
plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquences consensus (idéale), plus grande sera l’Affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation de la transcription (promoteur plus fort!!!)
position de la séquence TATAAT
-10, située environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription
rôle de la séquence TATAAT
repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription
comment se fait cette reconnaissance moléculaire (entre sigma, ARN polymèrase etc…)?
via des liaisons chimiques faibles (non covalente);
1) forces de van der whall
2) pont hydorgène
3) liens ioniques
4) interactions hydrophobes