Transcription Flashcards

1
Q

La transcription permet la generation de quoi?

A

Un polymère de ribonucléotides

qui est synthétisé par une ARN polymérase

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Q

Quels sont les 3 caractéristiques génerales en ce qui concerne la TRANSCRIPTION d’un ARN par l’ARN polymérase?

A
  • L’ARN polymérase synthétise de 5’ à 3’
  • L’ARN est synthétisé sur le brin matrice (copie complémentaire)
    qui est lu de 3’ à 5’
  • L’ARN a la séquence du brin d’ADN codant mais avec des ribonucléotides
    au lieu de désoxyribonucléotides, et de U au lieu de T
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3
Q

Quel est la difference au niveau de la structure entre ARN et ADN?

A

L’ARN possede un groupe hydroxy sur son carbone 2 prime

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4
Q

Quel est la difference entre le uracil et la thymine?

A

Le uracil possede un H plutot que un groupement méthyl

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5
Q

Parle de la stabilité de l’ARN et comment on peut par exemple regler ca?

A

Le arn est instable, on doit par exemple utiliser des ribonuclease pour contrer instabilité

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6
Q

Conséquence du fait que tu as des interactions entre les base de l’ARN?

A

L’ARN a des structures secondaires et tertiaires

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7
Q

Quels sont les 3 formes que tu retrouve dans la structure secondaire de larn et dit brievement ce qui cause chaque structure?

A

Boucle: aucun appariement de base
Tige: base complémentaire qui s’attirent
Pseudoknot: Lorsque différent boucle s’attirent entre elles

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8
Q

De facon très generale, explique comment l’ARN polymerase permet de faire un ARN? (procaryote)

A
  1. Grace a son activiter helicase, elle separe les 2 brin ADN
  2. Tu as un region d’hélice hybride ADN/ARN qui va se former et dans laquelle se fait ajout de nucleotide pour ARN
  3. ADN ressort de ARN polymerase et le double brin se reforme
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9
Q

Comment se nomme la courte région

d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement? Combien de nucleotide possede-t-il environ?

A

Le heteroduplex, 9 nucleotide

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10
Q

Quelle est la majeure différence entre la synthese fait par ARN poly et ADN poly?

A

Arn poly n’a pas besoin de amorce

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11
Q

Pourquoi la ARN polyemerease a pas besoin de amorce?

A

la transcription n’a pas à être aussi précise
que la réplication d’ADN puisque les erreurs ont une durée de vie limitée
correspondant à la durée de vie du transcrit

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12
Q

Où est-ce que la ARN polyemerase va faire les liens phosphodiester?

A

En son site actif

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13
Q

Quels sont les 4 sortes de ARN produit par les eucaryotes, leur utilité et la proteine qui permet de synthetiser chaque type de ARN?

A

1- ARNm QUI CODENT POUR LES PROTÉINES (ARN POLYMÉRASE II)
2) ARNr QUI COMPOSENT LES RIBOSOMES (ARN POLYMÉRASE I)
3- ARNt QUI SERVENT D’ADAPTATEUR LORS DE LA SYNTHÈSE
PROTÉIQUE (ARN POLYMÉRASE III)
4- PETITS ARN QUI SONT UTILISÉS DANS DIFFÉRENTS
PROCESSUS CELLULAIRES (ARN POLYMÉRASE III)
snRNA,

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14
Q

De quoi larn poly a besoin pour initier et terminer la transcription chez les cell procaryote? (3 truc)

A

Un promoteur qui permet de initier transcription
Un terminateur qui permet de terminer la transcription
Des facteurs proteiques

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15
Q

Quand est-ce que le facteur sigma est liberé? (cell procaryote)

A

10 nucleotides après le début de la transcription par la ARN polymerase

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16
Q

Quel est le role du facteur sigma? (procaryote)

A

Le facteur s’associent à la polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription. Il va ainsi permettre la selection du promoteur du gene a transcrire

17
Q

C’est quoi un sequence consensus?

A

Sequence de nucleotide que on statistiquement, tu as beaucoup de promoteur qui vont contenir cette sequence

18
Q

C’est quoi la séquence TATAAT et ou est elle situé? procaryote

A

La séquence TATAAT (-10) située environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription

19
Q

Qu’est ce qui se passe lorsque une certain sequence se rapproche de plus en plus de la sequence ideal de promoteur?

A

Plus grande sera l’affinité du facteur sigma et l’efficacité de la transcription

20
Q

Que dicte la position de la sequence ideal?

A

Elle indique le brin a utiliser ainsi que le sens de la transcription

21
Q

Ce qui differe d’un facteur sigma a un autre?

A

Chaque facteur a sa propre specificité au niveau de la sequence qu’il reconnait sur l’ADN

22
Q

Quels sont les 6 étapes de la transcription d’un ARN chez les procaryote?

A

1) Le facteur sigma va se lier a larn polymerase et ce complexe dinitiation va aller se lier sur le promoteur
2) Le contact entre le complex et ladn fait que tu a la formation dune bulle de transcription
3) larn poly commence la transcription
4) le facteur sigma est liberer apres la synthese de 10 ribonucleotide
5) rencontre avec le signal de terminaison
6) larn poly se detache

23
Q

C’est quoi le signal de terminaison de facon precise?

A

Séquence qui une fois rencontré fait que le ARN va prendre la forme d’une tige boucle (formé a cause des appariement de base). La formation de cette boucle va venir tirer sur la ARN polymerase pour que elle se detache de lADN et c’est comme ca que on arrete la transcription

24
Q

Ce qui est caractéristique au niveau des nucleotides du signal de terminaison?

A

Elle va posseder une sequence riche en c-g qui vont permettre de former une tige, puis ensuite le ARN sera riche en nucleotique U

25
Q

Ce qui differencie la boite tata chez les pro et chez les eucaryote?

A

La boite tata va se trouve environ 25 paire de nucleotide en amont du site d’initiation

26
Q

Différence entre la liaison des facteur proteique cher les eu et procaryote

A

Le facteur se lie sur la arn poly cher les pro, alors que les facteur se lie sur la sequence promoteur chez les eucaryotes

27
Q

Que contient nottament la sequence promoteur chez les eucaryotes?

A

La boite TATA a -25

28
Q

Est-ce que la arn poly peut se lier directement au promoteur? eucaryote

A

Non, elle va se lier au facteur proteique qui eux meme sont lier a la sequence promoteur dans ADN

29
Q

Donne les différentes étape de la formation du complexe d’initiation de la transcription chez les eucaryotes.

A

1) Reconaissance de la boite TATA par TFllD (qui contient aussi le TBD)
2) Recrutement de TFIIB par TFIID lié à l’ADN

3) Recrutement de l’ARN polymérase II
+ de facteurs généraux de transcription (TFIIF, TFIIE, TFIIH)

4) L’ARN polymerase ainsi que les facteur proteique forment alors le complexe d’initiation
5) Phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARN polymérase par la kinase TFIIH, ce qui permet a la polymerase de se detacher du complexe de facteur et ainsi la transcription va commencer

30
Q

Quels sont les 2 actions de la TFllH?

A

Elle a un activité helicase qui permet de separer les 2 brin ADN
Elle a aussi un activité kinase car elle va phosphoryler la queue C-terminal de la polymérase?

31
Q

Qu’entraine la phosphorylation de larn poly 2? Quels sont les 2 facteurs qui ne sont pas liberer?

A

Ca entraine la libération des autres facteurs de transcription (TFIIB, TFIIE, TFIIF et TFIIH) pour qu’elle puisse commencer l’élongation de la chaîne d’ARN. TFIID avec TBP n’est pas libéré.

32
Q

Ce qui se passe simulatanement avec les ARN pendant leur trancription?

A

Leur modification par les protéines qui se trouve sur ARN polymérase

33
Q

C’est quoi le signal de terminaison chez les eucaryotes?

A

Séquence dans le pré-ARNm transcrit qui est aussi le signal de polyadénylation: AAUAAA

34
Q

Quels sont les 2 étapes de la terminaison de la transcription chez les eucaryotes?

A
  • Le pré-ARNm est clivé et polyadénylé

- La polymérase se détache

35
Q

Que retrouve-t-on en amont du site de clivage?

A

Une séquence riche en C-G