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BCM C2 > transcripcion y procesamiento de ARN > Flashcards

transcripcion y procesamiento de ARN Flashcards

1
Q

cual es el primer paso en la expresion de los genes

A

sintesis de una molécula de ARN

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Q

porque se determina la secuencia de nucleotidos del arn

A

la secuencia de nucleotidos presentes en la hebra molde o templado

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3
Q

q es la hebra molde o templado

A

la hebra de adn q se expresa

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4
Q

dde ocurre la transcripción

A

en el nucleo
pero tmb la mitocondria porque segmentos de su adn son trascritos en su int

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5
Q

q es la transcripción

A

sintesis de ARN

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6
Q

q es el transcrito

A

la molecula de ARN q se sintetiza

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7
Q

q es el procesamiento

A

modificsciones q tiene el transcrito antes de salir del nucleo

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8
Q

tipos de arn

A

mARN
tARN
rARN

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9
Q

unico arn q es codificante y q significa

A

mARN
es el unico q en el citoplasma es leido/decodificado x el mecanismo q lleva a la sintesis de proteinas

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10
Q

q es al ARN y diferencias con el ADN

A

Polimero de nucleotidos
- una hebra (en su int se pden formar estructuras secundarias a partir de complementariedad de bases intra-hebra)
- tiene nucleotidos con la base nitrogenada uracilo en vez de timina
- tiene el azucar ribosa en vez de desoxirribosa (la diferencia se ve en el carbono 2)

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11
Q

q es el enlace fosfodiester en la transcripción
qn cataliza este enlace

A

enlace covalente entre 2 nucleotidos necesario para la transcripción
entre nucleotido trifosfato libre y el C3’ de la pentosa en la cadena de ARN en sintesis
enzima RNA polimerass

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12
Q

sentido de crecimiento de ARN
y porque

A

5’ 3’
porque inicia en 5’ y crece a 3’ dde se le une el nucleotido trifosfato

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13
Q

sentido en q recorre la RNA Pol al ADN molde y porque

A

3’ 5’
porque la cadena de ARN crece antiparalela al ADN molde

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14
Q

cual hebra del ADN sirve cm molde para la transcripción

A

cualquiera

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15
Q

la secuencia de nucleotidos del ARN es ——— con la secuencia de nucleotidos del ADN molde

A

completamentaria

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16
Q

tipos de la RNA Pol q tienen en comun y en diferencia

A

I , rARN (5.8S, 18S y 28S)
II , mRNA
III , tRNA y rRNA5S
misma actividad enzimatica (catalizar formacion del enlace fosfodiester)
sintetizan ARN diferentes

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17
Q

en el inicio de la transcri la RNA Pol

A

comienza a polimerizar en promotores basales

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18
Q

q son los promotores basales

A

nucleotidos cerca del sitio de inicio de la transcri q actuan cm señales moleculares

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19
Q

q hay en los promotores basales, cual es el mas importante, q es y dde esta este

A

motivos
caja TATA (secuencia de adeninas y timinas)
en promotores de genes transcritos x la Pol II, antes del primer nucleotido transcrito

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20
Q

q se necesita para q se una la RNA Pol a las regiones promotoras basales, q son y porque se necesitan

A

TF (factores generales/basales de transcripción)
es un conjunto de proteinas
porque no se unen directamente

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21
Q

q es la TBP

A

una proteina del TF q se une directamente a la caja TATA
(proteina de union a caja TATA o TATA-box binding protein)

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22
Q

la forma de TBP le permite
q produce eso
porque es tan wuau

A

meterse en los surcos de la doble hebra de ADN (aun no se han separado)
deja ciertos atomos de cierto aa de la TBP lo suficientemente cerca cm para q se establezcan interacciones intermoleculares (puentes de hidrogeno)
porque las bases estan hacia dentro de la doble helice entonces no es tan comun interaccionar con ellas

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23
Q

ejemplo de TBP haciendo puentes de hidrogeno

A

con las bases nucleotidicas presentes en la caja TATA

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24
Q

cm se llama el TF del q forma parte la TBP
y porque se llama asi

A

TFIID
porque es TF de la RNA Pol II

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25
Q

q pasa entre el promotor y la TBP y q pasa dsp

A

promotor reconoce a la TBP q es parte del TFIID , dsp se unen otros TF hasta q se une la RNA Pol II

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26
Q

q es y q hace TFIIH
q permite esto

A

otro TF
tiene actividad helicasa:
provoca la separacion de las hebras de ADN
permite q la RNA Pol II acceda a la secuencia de la hebra molde
ademas tiene actividad kinasa:
fosforila la cola de carboxilo terminal de la RNA Pol II
esto permite q la RNA Pol II se libere de la union con los TF del promotor
esto permite q avance x el ADN sintetizando ARN de secuencia complementaria

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27
Q

q pasa con RNA Pol I y III

A

son atraidas a otras regiones de ADN porque hay otras secuencias promotoras q se unen a otros TF (TFI y TFIII)

28
Q

en q formato se encuentra el ADN en el nucleo y q pasa con esto en la transcri

A

cm fibra nucleosomal
se modifica

29
Q

cm se modifica la fibra nucleosomal en la transcripción
esto es la base de

A

enzimas se unen a la cromatina y modifican las colas de las histonas (las q permiten la interacción entre nucleosomas)
esto genera una asociacion mas laxa entre nucleosomas y tmb entre el ADN y las histonas al int del nucleosoma
- base de la descompactacion de ADN (q permite q la maquinaria de transcripción acceda al ADN) y de la progresion de la ARN Pol x entre nucleosomas

30
Q

cual es una enzima q participa en la moficacion de nucleosomas y q hace

A

acetil transferasas de histonas (HAT)
agregan grupos acetilo a las colas de algunas histonas

31
Q

de q depende q la transcripción basal sea reprimida o estimulada

A
  • del estado de compactacion o accesibilidad de la cromatina (nivel pre transcripcional)
  • de la presencia de factores activadores/represores de la transcripción (nivel transcripcional)
32
Q

qnes participan en la regulación de la transcripción

A
  1. otras secuencias de ADN: necesitan unirse a TF específicos
    - promotores proximales: estan cercanas al promotor basal, son menos
    - potenciadores (enhancers): estan mas lejos del sitio de inicio de transcripción y son más
    - silenciadores (silencers): inhiben la transcripción
  2. otros TF
33
Q

q es el mediador

A

otro complejo proteico mediante el cual se activa la transcripción basal al unirse los TF específicos a los enhancers

34
Q

diferencia entre TF y promotores basales con los TF y promotores especificos (enhancer y silenciadores)

A

los primeros son comunes a multiples genes
los segundos son específicos para un grupo de genes, x lo q se relacionan directamente con la regulacion diferencial de l expresión génica

35
Q

pars q se requieren la maquinaria basal y estas otras secuencias regulatorias con sus factores proteicos

A

maquinaria basal para la transcripción
lo otro para aumentarla/disminuirla en grupos especificos de genes de manera diferencial (depende de las señales del medio)

36
Q

tipos de procesamiento del ARNm

A
  • adicion de capuchon (CAP) en 5’
  • splicing/ corte y empalme: remocion de intrones
  • poliadenilacion (cola poli A) en 3’
37
Q

adicion CAP q es y funciones asociadas

A

adicion de un nucleotido de guanina metilado (7-metil guanilato) a nivel transcripcional en el extremo 5’ del ARNm
es una union 5’-5’ catalizada x enzimas asociadas a la cola de la ARN Pol II
- mayor vida media del ARNm x disminucion de su degradacion
- reconocimiento en la traducción xq hay un factor de TRADUCCION q se une específicamente al CAP

38
Q

splicing q es

A

el transcrito inicial del ARNm tiene secuencias q son removidas en el nucleo (intrones)
se corta el ARNm en el limite de inicio del intron y en su termino
se unen los segmentos (exones) q estaban hacia 5’ del primer corte y hacia 3’ del segundo
resultado: una molecula lineal pero mas corta de ARNm

39
Q

q es el spliceosoma de q esta formado y q hace

A

-una maquinaria de reconocimiento de señales moleculares constituidas x secuencias de ARN
-formada x ARN pequeños y proteinas, asociados en un complejo ribonucleo-proteico. ademas tienen snARN (small nuclear ARN), pequeñas moleculas de ARN
- actua cm nucleasa: corta enlaces fosfodiester
- hace la union de los exones en regiones específicas (empalme)

40
Q

poliadenilacion q es

A

asociada al termino de la transcripción
adicion de adeninas no codificadas en el ADN x enzima PoliA polimerasa q no necesita leer ADN molde para hacerlo (distinta a RNA Pol)

41
Q

secuencia de termino de la transcri y qn la sintetiza

A

AAUAAA
ARN Pol II

42
Q

q pasa dsp de la sintesis de AAUAAA

A

se une al ARN proteinas q hacen un corte en el ARN en sintesis
dsp la PoliA Polimerasa adiciona las adeninas
meintras, la ARN Pol II transcribe x un ratito mas y dsp se libera del templado

43
Q

porque la ARN Pol II se
linera del templado

A

porque el corto segmento de ARN q tiene unido es degradado c una ARNasa
tdo el resto de ARN sintetizado quedo separado

44
Q

funcion de la poliadenilacion

A

la cola de Poli A protege de la degradacion (se relaciona con la vida media)
tiene un rol en la traducción

45
Q

mecanismos q explican q hayan mas proteinas q genes

A

promotores alternativos
splicing alternativo
corte y poliadenilacion alternativa

46
Q

promotores alternativos explique

A

en algunos genes hay mas de un promotor basal (osea, mas de un sitio de inicio de transcripción)
en 2 tejidos distintos se pde iniciar la transcripción reconociendo una secuencia promotora distinta en cada uno

47
Q

splicing alternativo

A

ocurre muxo en cel normales
son las diferentes lecturas de un ARNm x parte de la maquinaria de splicing, lo q genera transcritos maduros con distintas secuencias
en una lectura pde ser un intron y en otra un exon

48
Q

splicing alternativo es aleatorio?

A

no, es regulado
40% de los ARNm lo tienen
de estos, un 70% de las veces se generan proteinas distintas

49
Q

corte y poliadenilacion alternativa q es

A

reconocimiento diferencial del sitio de corte y adicion de la cola poliA del ARNm

50
Q

dde estan los genes/cistrones ribosomales (rADN) y cual es si caracteristica

A

en los cromosomas 13, 14, 15 y 22 en el NOR (regiones organizadoras del nucleolo
estan repetidos (misma secuencia de nucleotidos)

51
Q

qn transcribe a los genes ribosomales

A

la RNA Pol I

52
Q

dde ocurre la transcripción, el
procesamiento de los transcritos y el ensamblaje de las subunidsfes ribosomales

A

en el nucleolo

53
Q

q origina cada gen ribosomal en la transcripción

A

el 45S, q es un largo transcrito q es procesado x corte (no es splicing pq no hay empalme post) y eliminacion de determinadas secuencias, lo q origina segmentos mas cortos de ARNr (5.8s, 18s y 28s)

54
Q

el procesamiento del rARN es realizado en el nucleolo x

A

una maquinaria ribonucleoproteica

55
Q

cm se ensamblan las subunidades ribosomales

A
  • el rRNA 18s se asocia con proteinas ribosomales y forman la subunidad ribosomal menor
  • el rRNA 5.8s y 28s se asocian con el rRNA 5s y con proteinas ribosomales formando la subunidad ribosomal mayor
56
Q

dde se sintetiza el rRNA 5s

A

fuera del nucleolo

57
Q

dsp q se ensamblan las subunidades ribosomales q pasa

A

salen del nucleo por los complejos de poro nuclear

58
Q

q hace el tRNA

A

en la sintesis de proteinas traduce la secuencia del ARNm dsd el idioma de los nucleotidos al de los aa

59
Q

de q esta hecho el tRNA

A

muxas moleculas chicas y distintas sintetizadas x la RNA Pol III a partir de genes para tRNA
estas se
pliegan en forma de trébol (estabilizado x complementariedad de bases)

60
Q

el procesamiento del tRNA

A
  • remover segmentos de tRNA
  • modificaciones quimicas de nucleotidos: adenina a pseudouridina, adenina a inosina, uridina a dihidrouridina
  • adicion de secuencia CCA a 3’
61
Q

formacion de aminoacil-tRNA

A

unión covalente de aminoacido (es distinto en cada tRNA) a 3’

62
Q

aminoacil tRNA sintetasas q son

A

enzimas q sustenta la especifidad entre tRNA y aa, tienen:
- sitios de union para tRNA con sitios de reconocimiento especifico para la region del anticodon (su secuencia es distinta entre cafa tRNA)
- sitio de union para aa especifico
- sitio de union de ATP

63
Q

para q genes operan los niveles traduccional y post traduccional de la regulación de expresion de los genes y porque

A

solo para genes codificantes de proteinas
porque los productos finales de la expresion genica tmb pden ser ARN

64
Q

a q se refiere la expresion génica

A

a la cantidad de producto final q se encuentre en la celula (incluye no solo a la transcripción)

65
Q

mecanismos de regulación de la expresion genica segun niveles

A

pre transcripcional:
- estructura de la cromatina
transcripcional:
- aumento/disminucion de transcripción
- promotores alternativos
post transcripcional:
- vida media de ARNm
- splicing alternativo
-otros
traduccional:
- aumento/disminucion traduccion
post traduccional:
- vida media de proteina
- en algunos tmb modificaciones quimicas (ej fosforilaciones)

BCM C2 (4 decks)

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