transcripcion y procesamiento de ARN Flashcards
cual es el primer paso en la expresion de los genes
sintesis de una molécula de ARN
porque se determina la secuencia de nucleotidos del arn
la secuencia de nucleotidos presentes en la hebra molde o templado
q es la hebra molde o templado
la hebra de adn q se expresa
dde ocurre la transcripción
en el nucleo
pero tmb la mitocondria porque segmentos de su adn son trascritos en su int
q es la transcripción
sintesis de ARN
q es el transcrito
la molecula de ARN q se sintetiza
q es el procesamiento
modificsciones q tiene el transcrito antes de salir del nucleo
tipos de arn
mARN
tARN
rARN
unico arn q es codificante y q significa
mARN
es el unico q en el citoplasma es leido/decodificado x el mecanismo q lleva a la sintesis de proteinas
q es al ARN y diferencias con el ADN
Polimero de nucleotidos
- una hebra (en su int se pden formar estructuras secundarias a partir de complementariedad de bases intra-hebra)
- tiene nucleotidos con la base nitrogenada uracilo en vez de timina
- tiene el azucar ribosa en vez de desoxirribosa (la diferencia se ve en el carbono 2)
q es el enlace fosfodiester en la transcripción
qn cataliza este enlace
enlace covalente entre 2 nucleotidos necesario para la transcripción
entre nucleotido trifosfato libre y el C3’ de la pentosa en la cadena de ARN en sintesis
enzima RNA polimerass
sentido de crecimiento de ARN
y porque
5’ 3’
porque inicia en 5’ y crece a 3’ dde se le une el nucleotido trifosfato
sentido en q recorre la RNA Pol al ADN molde y porque
3’ 5’
porque la cadena de ARN crece antiparalela al ADN molde
cual hebra del ADN sirve cm molde para la transcripción
cualquiera
la secuencia de nucleotidos del ARN es ——— con la secuencia de nucleotidos del ADN molde
completamentaria
tipos de la RNA Pol q tienen en comun y en diferencia
I , rARN (5.8S, 18S y 28S)
II , mRNA
III , tRNA y rRNA5S
misma actividad enzimatica (catalizar formacion del enlace fosfodiester)
sintetizan ARN diferentes
en el inicio de la transcri la RNA Pol
comienza a polimerizar en promotores basales
q son los promotores basales
nucleotidos cerca del sitio de inicio de la transcri q actuan cm señales moleculares
q hay en los promotores basales, cual es el mas importante, q es y dde esta este
motivos
caja TATA (secuencia de adeninas y timinas)
en promotores de genes transcritos x la Pol II, antes del primer nucleotido transcrito
q se necesita para q se una la RNA Pol a las regiones promotoras basales, q son y porque se necesitan
TF (factores generales/basales de transcripción)
es un conjunto de proteinas
porque no se unen directamente
q es la TBP
una proteina del TF q se une directamente a la caja TATA
(proteina de union a caja TATA o TATA-box binding protein)
la forma de TBP le permite
q produce eso
porque es tan wuau
meterse en los surcos de la doble hebra de ADN (aun no se han separado)
deja ciertos atomos de cierto aa de la TBP lo suficientemente cerca cm para q se establezcan interacciones intermoleculares (puentes de hidrogeno)
porque las bases estan hacia dentro de la doble helice entonces no es tan comun interaccionar con ellas
ejemplo de TBP haciendo puentes de hidrogeno
con las bases nucleotidicas presentes en la caja TATA
cm se llama el TF del q forma parte la TBP
y porque se llama asi
TFIID
porque es TF de la RNA Pol II
q pasa entre el promotor y la TBP y q pasa dsp
promotor reconoce a la TBP q es parte del TFIID , dsp se unen otros TF hasta q se une la RNA Pol II
q es y q hace TFIIH
q permite esto
otro TF
tiene actividad helicasa:
provoca la separacion de las hebras de ADN
permite q la RNA Pol II acceda a la secuencia de la hebra molde
ademas tiene actividad kinasa:
fosforila la cola de carboxilo terminal de la RNA Pol II
esto permite q la RNA Pol II se libere de la union con los TF del promotor
esto permite q avance x el ADN sintetizando ARN de secuencia complementaria
q pasa con RNA Pol I y III
son atraidas a otras regiones de ADN porque hay otras secuencias promotoras q se unen a otros TF (TFI y TFIII)
en q formato se encuentra el ADN en el nucleo y q pasa con esto en la transcri
cm fibra nucleosomal
se modifica
cm se modifica la fibra nucleosomal en la transcripción
esto es la base de
enzimas se unen a la cromatina y modifican las colas de las histonas (las q permiten la interacción entre nucleosomas)
esto genera una asociacion mas laxa entre nucleosomas y tmb entre el ADN y las histonas al int del nucleosoma
- base de la descompactacion de ADN (q permite q la maquinaria de transcripción acceda al ADN) y de la progresion de la ARN Pol x entre nucleosomas
cual es una enzima q participa en la moficacion de nucleosomas y q hace
acetil transferasas de histonas (HAT)
agregan grupos acetilo a las colas de algunas histonas
de q depende q la transcripción basal sea reprimida o estimulada
- del estado de compactacion o accesibilidad de la cromatina (nivel pre transcripcional)
- de la presencia de factores activadores/represores de la transcripción (nivel transcripcional)
qnes participan en la regulación de la transcripción
- otras secuencias de ADN: necesitan unirse a TF específicos
- promotores proximales: estan cercanas al promotor basal, son menos
- potenciadores (enhancers): estan mas lejos del sitio de inicio de transcripción y son más
- silenciadores (silencers): inhiben la transcripción - otros TF
q es el mediador
otro complejo proteico mediante el cual se activa la transcripción basal al unirse los TF específicos a los enhancers
diferencia entre TF y promotores basales con los TF y promotores especificos (enhancer y silenciadores)
los primeros son comunes a multiples genes
los segundos son específicos para un grupo de genes, x lo q se relacionan directamente con la regulacion diferencial de l expresión génica
pars q se requieren la maquinaria basal y estas otras secuencias regulatorias con sus factores proteicos
maquinaria basal para la transcripción
lo otro para aumentarla/disminuirla en grupos especificos de genes de manera diferencial (depende de las señales del medio)
tipos de procesamiento del ARNm
- adicion de capuchon (CAP) en 5’
- splicing/ corte y empalme: remocion de intrones
- poliadenilacion (cola poli A) en 3’
adicion CAP q es y funciones asociadas
adicion de un nucleotido de guanina metilado (7-metil guanilato) a nivel transcripcional en el extremo 5’ del ARNm
es una union 5’-5’ catalizada x enzimas asociadas a la cola de la ARN Pol II
- mayor vida media del ARNm x disminucion de su degradacion
- reconocimiento en la traducción xq hay un factor de TRADUCCION q se une específicamente al CAP
splicing q es
el transcrito inicial del ARNm tiene secuencias q son removidas en el nucleo (intrones)
se corta el ARNm en el limite de inicio del intron y en su termino
se unen los segmentos (exones) q estaban hacia 5’ del primer corte y hacia 3’ del segundo
resultado: una molecula lineal pero mas corta de ARNm
q es el spliceosoma de q esta formado y q hace
-una maquinaria de reconocimiento de señales moleculares constituidas x secuencias de ARN
-formada x ARN pequeños y proteinas, asociados en un complejo ribonucleo-proteico. ademas tienen snARN (small nuclear ARN), pequeñas moleculas de ARN
- actua cm nucleasa: corta enlaces fosfodiester
- hace la union de los exones en regiones específicas (empalme)
poliadenilacion q es
asociada al termino de la transcripción
adicion de adeninas no codificadas en el ADN x enzima PoliA polimerasa q no necesita leer ADN molde para hacerlo (distinta a RNA Pol)
secuencia de termino de la transcri y qn la sintetiza
AAUAAA
ARN Pol II
q pasa dsp de la sintesis de AAUAAA
se une al ARN proteinas q hacen un corte en el ARN en sintesis
dsp la PoliA Polimerasa adiciona las adeninas
meintras, la ARN Pol II transcribe x un ratito mas y dsp se libera del templado
porque la ARN Pol II se
linera del templado
porque el corto segmento de ARN q tiene unido es degradado c una ARNasa
tdo el resto de ARN sintetizado quedo separado
funcion de la poliadenilacion
la cola de Poli A protege de la degradacion (se relaciona con la vida media)
tiene un rol en la traducción
mecanismos q explican q hayan mas proteinas q genes
promotores alternativos
splicing alternativo
corte y poliadenilacion alternativa
promotores alternativos explique
en algunos genes hay mas de un promotor basal (osea, mas de un sitio de inicio de transcripción)
en 2 tejidos distintos se pde iniciar la transcripción reconociendo una secuencia promotora distinta en cada uno
splicing alternativo
ocurre muxo en cel normales
son las diferentes lecturas de un ARNm x parte de la maquinaria de splicing, lo q genera transcritos maduros con distintas secuencias
en una lectura pde ser un intron y en otra un exon
splicing alternativo es aleatorio?
no, es regulado
40% de los ARNm lo tienen
de estos, un 70% de las veces se generan proteinas distintas
corte y poliadenilacion alternativa q es
reconocimiento diferencial del sitio de corte y adicion de la cola poliA del ARNm
dde estan los genes/cistrones ribosomales (rADN) y cual es si caracteristica
en los cromosomas 13, 14, 15 y 22 en el NOR (regiones organizadoras del nucleolo
estan repetidos (misma secuencia de nucleotidos)
qn transcribe a los genes ribosomales
la RNA Pol I
dde ocurre la transcripción, el
procesamiento de los transcritos y el ensamblaje de las subunidsfes ribosomales
en el nucleolo
q origina cada gen ribosomal en la transcripción
el 45S, q es un largo transcrito q es procesado x corte (no es splicing pq no hay empalme post) y eliminacion de determinadas secuencias, lo q origina segmentos mas cortos de ARNr (5.8s, 18s y 28s)
el procesamiento del rARN es realizado en el nucleolo x
una maquinaria ribonucleoproteica
cm se ensamblan las subunidades ribosomales
- el rRNA 18s se asocia con proteinas ribosomales y forman la subunidad ribosomal menor
- el rRNA 5.8s y 28s se asocian con el rRNA 5s y con proteinas ribosomales formando la subunidad ribosomal mayor
dde se sintetiza el rRNA 5s
fuera del nucleolo
dsp q se ensamblan las subunidades ribosomales q pasa
salen del nucleo por los complejos de poro nuclear
q hace el tRNA
en la sintesis de proteinas traduce la secuencia del ARNm dsd el idioma de los nucleotidos al de los aa
de q esta hecho el tRNA
muxas moleculas chicas y distintas sintetizadas x la RNA Pol III a partir de genes para tRNA
estas se
pliegan en forma de trébol (estabilizado x complementariedad de bases)
el procesamiento del tRNA
- remover segmentos de tRNA
- modificaciones quimicas de nucleotidos: adenina a pseudouridina, adenina a inosina, uridina a dihidrouridina
- adicion de secuencia CCA a 3’
formacion de aminoacil-tRNA
unión covalente de aminoacido (es distinto en cada tRNA) a 3’
aminoacil tRNA sintetasas q son
enzimas q sustenta la especifidad entre tRNA y aa, tienen:
- sitios de union para tRNA con sitios de reconocimiento especifico para la region del anticodon (su secuencia es distinta entre cafa tRNA)
- sitio de union para aa especifico
- sitio de union de ATP
para q genes operan los niveles traduccional y post traduccional de la regulación de expresion de los genes y porque
solo para genes codificantes de proteinas
porque los productos finales de la expresion genica tmb pden ser ARN
a q se refiere la expresion génica
a la cantidad de producto final q se encuentre en la celula (incluye no solo a la transcripción)
mecanismos de regulación de la expresion genica segun niveles
pre transcripcional:
- estructura de la cromatina
transcripcional:
- aumento/disminucion de transcripción
- promotores alternativos
post transcripcional:
- vida media de ARNm
- splicing alternativo
-otros
traduccional:
- aumento/disminucion traduccion
post traduccional:
- vida media de proteina
- en algunos tmb modificaciones quimicas (ej fosforilaciones)
