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BCM C2 > transcripcion y procesamiento de ARN > Flashcards

transcripcion y procesamiento de ARN Flashcards

1
Q

cual es el primer paso en la expresion de los genes

A

sintesis de una molécula de ARN

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Q

porque se determina la secuencia de nucleotidos del arn

A

la secuencia de nucleotidos presentes en la hebra molde o templado

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Q

q es la hebra molde o templado

A

la hebra de adn q se expresa

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4
Q

dde ocurre la transcripción

A

en el nucleo
pero tmb la mitocondria porque segmentos de su adn son trascritos en su int

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Q

q es la transcripción

A

sintesis de ARN

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6
Q

q es el transcrito

A

la molecula de ARN q se sintetiza

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7
Q

q es el procesamiento

A

modificsciones q tiene el transcrito antes de salir del nucleo

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8
Q

tipos de arn

A

mARN
tARN
rARN

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9
Q

unico arn q es codificante y q significa

A

mARN
es el unico q en el citoplasma es leido/decodificado x el mecanismo q lleva a la sintesis de proteinas

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10
Q

q es al ARN y diferencias con el ADN

A

Polimero de nucleotidos
- una hebra (en su int se pden formar estructuras secundarias a partir de complementariedad de bases intra-hebra)
- tiene nucleotidos con la base nitrogenada uracilo en vez de timina
- tiene el azucar ribosa en vez de desoxirribosa (la diferencia se ve en el carbono 2)

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11
Q

q es el enlace fosfodiester en la transcripción
qn cataliza este enlace

A

enlace covalente entre 2 nucleotidos necesario para la transcripción
entre nucleotido trifosfato libre y el C3’ de la pentosa en la cadena de ARN en sintesis
enzima RNA polimerass

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12
Q

sentido de crecimiento de ARN
y porque

A

5’ 3’
porque inicia en 5’ y crece a 3’ dde se le une el nucleotido trifosfato

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13
Q

sentido en q recorre la RNA Pol al ADN molde y porque

A

3’ 5’
porque la cadena de ARN crece antiparalela al ADN molde

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14
Q

cual hebra del ADN sirve cm molde para la transcripción

A

cualquiera

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15
Q

la secuencia de nucleotidos del ARN es ——— con la secuencia de nucleotidos del ADN molde

A

completamentaria

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16
Q

tipos de la RNA Pol q tienen en comun y en diferencia

A

I , rARN (5.8S, 18S y 28S)
II , mRNA
III , tRNA y rRNA5S
misma actividad enzimatica (catalizar formacion del enlace fosfodiester)
sintetizan ARN diferentes

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17
Q

en el inicio de la transcri la RNA Pol

A

comienza a polimerizar en promotores basales

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18
Q

q son los promotores basales

A

nucleotidos cerca del sitio de inicio de la transcri q actuan cm señales moleculares

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19
Q

q hay en los promotores basales, cual es el mas importante, q es y dde esta este

A

motivos
caja TATA (secuencia de adeninas y timinas)
en promotores de genes transcritos x la Pol II, antes del primer nucleotido transcrito

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20
Q

q se necesita para q se una la RNA Pol a las regiones promotoras basales, q son y porque se necesitan

A

TF (factores generales/basales de transcripción)
es un conjunto de proteinas
porque no se unen directamente

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21
Q

q es la TBP

A

una proteina del TF q se une directamente a la caja TATA
(proteina de union a caja TATA o TATA-box binding protein)

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22
Q

la forma de TBP le permite
q produce eso
porque es tan wuau

A

meterse en los surcos de la doble hebra de ADN (aun no se han separado)
deja ciertos atomos de cierto aa de la TBP lo suficientemente cerca cm para q se establezcan interacciones intermoleculares (puentes de hidrogeno)
porque las bases estan hacia dentro de la doble helice entonces no es tan comun interaccionar con ellas

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23
Q

ejemplo de TBP haciendo puentes de hidrogeno

A

con las bases nucleotidicas presentes en la caja TATA

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24
Q

cm se llama el TF del q forma parte la TBP
y porque se llama asi

A

TFIID
porque es TF de la RNA Pol II

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25
q pasa entre el promotor y la TBP y q pasa dsp
promotor reconoce a la TBP q es parte del TFIID , dsp se unen otros TF hasta q se une la RNA Pol II
26
q es y q hace TFIIH q permite esto
otro TF tiene actividad helicasa: provoca la separacion de las hebras de ADN permite q la RNA Pol II acceda a la secuencia de la hebra molde ademas tiene actividad kinasa: fosforila la cola de carboxilo terminal de la RNA Pol II esto permite q la RNA Pol II se libere de la union con los TF del promotor esto permite q avance x el ADN sintetizando ARN de secuencia complementaria
27
q pasa con RNA Pol I y III
son atraidas a otras regiones de ADN porque hay otras secuencias promotoras q se unen a otros TF (TFI y TFIII)
28
en q formato se encuentra el ADN en el nucleo y q pasa con esto en la transcri
cm fibra nucleosomal se modifica
29
cm se modifica la fibra nucleosomal en la transcripción esto es la base de
enzimas se unen a la cromatina y modifican las colas de las histonas (las q permiten la interacción entre nucleosomas) esto genera una asociacion mas laxa entre nucleosomas y tmb entre el ADN y las histonas al int del nucleosoma - base de la descompactacion de ADN (q permite q la maquinaria de transcripción acceda al ADN) y de la progresion de la ARN Pol x entre nucleosomas
30
cual es una enzima q participa en la moficacion de nucleosomas y q hace
acetil transferasas de histonas (HAT) agregan grupos acetilo a las colas de algunas histonas
31
de q depende q la transcripción basal sea reprimida o estimulada
- del estado de compactacion o accesibilidad de la cromatina (nivel pre transcripcional) - de la presencia de factores activadores/represores de la transcripción (nivel transcripcional)
32
qnes participan en la regulación de la transcripción
1. otras secuencias de ADN: necesitan unirse a TF específicos - promotores proximales: estan cercanas al promotor basal, son menos - potenciadores (enhancers): estan mas lejos del sitio de inicio de transcripción y son más - silenciadores (silencers): inhiben la transcripción 2. otros TF
33
q es el mediador
otro complejo proteico mediante el cual se activa la transcripción basal al unirse los TF específicos a los enhancers
34
diferencia entre TF y promotores basales con los TF y promotores especificos (enhancer y silenciadores)
los primeros son comunes a multiples genes los segundos son específicos para un grupo de genes, x lo q se relacionan directamente con la regulacion diferencial de l expresión génica
35
pars q se requieren la maquinaria basal y estas otras secuencias regulatorias con sus factores proteicos
maquinaria basal para la transcripción lo otro para aumentarla/disminuirla en grupos especificos de genes de manera diferencial (depende de las señales del medio)
36
tipos de procesamiento del ARNm
- adicion de capuchon (CAP) en 5’ - splicing/ corte y empalme: remocion de intrones - poliadenilacion (cola poli A) en 3’
37
adicion CAP q es y funciones asociadas
adicion de un nucleotido de guanina metilado (7-metil guanilato) a nivel transcripcional en el extremo 5’ del ARNm es una union 5’-5’ catalizada x enzimas asociadas a la cola de la ARN Pol II - mayor vida media del ARNm x disminucion de su degradacion - reconocimiento en la traducción xq hay un factor de TRADUCCION q se une específicamente al CAP
38
splicing q es
el transcrito inicial del ARNm tiene secuencias q son removidas en el nucleo (intrones) se corta el ARNm en el limite de inicio del intron y en su termino se unen los segmentos (exones) q estaban hacia 5’ del primer corte y hacia 3’ del segundo resultado: una molecula lineal pero mas corta de ARNm
39
q es el spliceosoma de q esta formado y q hace
-una maquinaria de reconocimiento de señales moleculares constituidas x secuencias de ARN -formada x ARN pequeños y proteinas, asociados en un complejo ribonucleo-proteico. ademas tienen snARN (small nuclear ARN), pequeñas moleculas de ARN - actua cm nucleasa: corta enlaces fosfodiester - hace la union de los exones en regiones específicas (empalme)
40
poliadenilacion q es
asociada al termino de la transcripción adicion de adeninas no codificadas en el ADN x enzima PoliA polimerasa q no necesita leer ADN molde para hacerlo (distinta a RNA Pol)
41
secuencia de termino de la transcri y qn la sintetiza
AAUAAA ARN Pol II
42
q pasa dsp de la sintesis de AAUAAA
se une al ARN proteinas q hacen un corte en el ARN en sintesis dsp la PoliA Polimerasa adiciona las adeninas meintras, la ARN Pol II transcribe x un ratito mas y dsp se libera del templado
43
porque la ARN Pol II se linera del templado
porque el corto segmento de ARN q tiene unido es degradado c una ARNasa tdo el resto de ARN sintetizado quedo separado
44
funcion de la poliadenilacion
la cola de Poli A protege de la degradacion (se relaciona con la vida media) tiene un rol en la traducción
45
mecanismos q explican q hayan mas proteinas q genes
promotores alternativos splicing alternativo corte y poliadenilacion alternativa
46
promotores alternativos explique
en algunos genes hay mas de un promotor basal (osea, mas de un sitio de inicio de transcripción) en 2 tejidos distintos se pde iniciar la transcripción reconociendo una secuencia promotora distinta en cada uno
47
splicing alternativo
ocurre muxo en cel normales son las diferentes lecturas de un ARNm x parte de la maquinaria de splicing, lo q genera transcritos maduros con distintas secuencias en una lectura pde ser un intron y en otra un exon
48
splicing alternativo es aleatorio?
no, es regulado 40% de los ARNm lo tienen de estos, un 70% de las veces se generan proteinas distintas
49
corte y poliadenilacion alternativa q es
reconocimiento diferencial del sitio de corte y adicion de la cola poliA del ARNm
50
dde estan los genes/cistrones ribosomales (rADN) y cual es si caracteristica
en los cromosomas 13, 14, 15 y 22 en el NOR (regiones organizadoras del nucleolo estan repetidos (misma secuencia de nucleotidos)
51
qn transcribe a los genes ribosomales
la RNA Pol I
52
dde ocurre la transcripción, el procesamiento de los transcritos y el ensamblaje de las subunidsfes ribosomales
en el nucleolo
53
q origina cada gen ribosomal en la transcripción
el 45S, q es un largo transcrito q es procesado x corte (no es splicing pq no hay empalme post) y eliminacion de determinadas secuencias, lo q origina segmentos mas cortos de ARNr (5.8s, 18s y 28s)
54
el procesamiento del rARN es realizado en el nucleolo x
una maquinaria ribonucleoproteica
55
cm se ensamblan las subunidades ribosomales
- el rRNA 18s se asocia con proteinas ribosomales y forman la subunidad ribosomal menor - el rRNA 5.8s y 28s se asocian con el rRNA 5s y con proteinas ribosomales formando la subunidad ribosomal mayor
56
dde se sintetiza el rRNA 5s
fuera del nucleolo
57
dsp q se ensamblan las subunidades ribosomales q pasa
salen del nucleo por los complejos de poro nuclear
58
q hace el tRNA
en la sintesis de proteinas traduce la secuencia del ARNm dsd el idioma de los nucleotidos al de los aa
59
de q esta hecho el tRNA
muxas moleculas chicas y distintas sintetizadas x la RNA Pol III a partir de genes para tRNA estas se pliegan en forma de trébol (estabilizado x complementariedad de bases)
60
el procesamiento del tRNA
- remover segmentos de tRNA - modificaciones quimicas de nucleotidos: adenina a pseudouridina, adenina a inosina, uridina a dihidrouridina - adicion de secuencia CCA a 3’
61
formacion de aminoacil-tRNA
unión covalente de aminoacido (es distinto en cada tRNA) a 3’
62
aminoacil tRNA sintetasas q son
enzimas q sustenta la especifidad entre tRNA y aa, tienen: - sitios de union para tRNA con sitios de reconocimiento especifico para la region del anticodon (su secuencia es distinta entre cafa tRNA) - sitio de union para aa especifico - sitio de union de ATP
63
para q genes operan los niveles traduccional y post traduccional de la regulación de expresion de los genes y porque
solo para genes codificantes de proteinas porque los productos finales de la expresion genica tmb pden ser ARN
64
a q se refiere la expresion génica
a la cantidad de producto final q se encuentre en la celula (incluye no solo a la transcripción)
65
mecanismos de regulación de la expresion genica segun niveles
pre transcripcional: - estructura de la cromatina transcripcional: - aumento/disminucion de transcripción - promotores alternativos post transcripcional: - vida media de ARNm - splicing alternativo -otros traduccional: - aumento/disminucion traduccion post traduccional: - vida media de proteina - en algunos tmb modificaciones quimicas (ej fosforilaciones)

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