Transcripción Flashcards
¿Que es la Transcripción?
Síntesis de un ácido ribonucleico a partir de una plantilla de DNA.
¿Que es el mRNA?
Intermediario entre el gen y su polipéptido
Funciones de los mRNA
Separar la información genética
- Pequeños y móviles por lo que llegan rápido al citoplasma
- Plantilla para la traducción
- Permite a la célula incrementar su actividad
Cualquier RNA que especifica el orden de los aminoácidos en una proteína. Se produce por transcripción del DNA mediante…
Una RNA polimerasa
Enzimas encargadas de la transcripción tanto en eucariotas como procariotas.
RNA Polimerasas
Características de las RNA Polimerasas
- Procesividad: Capacidad para permanecer unida al DNA a lo largo de grandes segmentos y formar RNA muy largos
- Edición: Identifica y elimina un nucleótido incorporado de manera errónea.
- Especificidad: Requiere de factores de transcripción para identificar el sitio promotor del gen.
Secuencia de DNA que determina el inicio de la transcripción para una RNApol y que determina cuál de las dos cadenas de DNA se transcribirá.
Promotor
¿De que esta compuesta la Burbuja de Replicacion?
Esta compuesta de DNA monocatenario(15pb) y híbrido DNA-RNA (9pb)
Enzima que regula la hidrólisis de pirofosfato
Pirofosfatasa
¿Cual es el nombre en procariotas del polipéptido accesorio que se une al RNApol antes de su unión al DNA y da la especificidad de unión al promotor?
Factor Sigma
¿Que es una holoenzima?
Es una enzima formada por una apoenzima y un
cofactor, que puede ser una molécula orgánica compleja unida o no.
Región Promotora de DNA en E. Colli
+1: Nucleótido de Inicio de la Transcripción
-1: Nucleótido anterior al sitio de inicio
Características de la Caja Primbow
-10
Identificado por Sigma
Quita dos nucleótidos para fusionarse e iniciar la burbuja
¿Donde se encuentra TATAAT?
Secuencia -10
¿Donde se encuentra TTGACA?
Secuencia -35
En Procariotas ¿Que pasa cuando se unen satisfactoriamente 10 nucleótidos?
- Cambio conformacional de RNApol
- Se forma complejo transcripcional de elongación
- Se separa Sigma
Terminación de la Transcripción, en Procariotas
Rho: Proteína en anillo
Secuencia de terminación:
En eucariotas ¿Como se le llama al Segmento de DNA del cual proviene un transcrito primario?
Unidad de Transcripción
¿Que es un Transcrito Primario o pre-mRNA?
Son moléculas precursoras de RNA con una longitud igual a la del DNA que se transcribe. Siempre están unidas a proteínas nunca están desnudos
¿Como se le llama a los RNA pequeños funcionales derivados del proceso de corte y empalme?
mRNA o RNA mensajeros
¿Que sintetiza la RNApol I?
rRNA mayores
¿Que sintetiza la RNApol II?
mRNA, la mayoria de los RNA nucleares pequeños, la mayor parte de los microRNA y la RNA telomerasa
¿Que sintetiza la RNApol III?
RNA pequeños, incluidos los tRNA, el RNA 5S y el snRNA U6
¿Que sintetiza la RNApol IV y V?
Solo en plantas
siRNA (Small Interfering RNA)
Elementos Promotores (Secuencias Conservadas) en Eucariotas
Caja TATA: A ella se le unen los Factores de Transcripción/ 24-32 pb Rio Arriba
Iniciador Inr: Da inicio
DPE: Da la dirección 3`del inicio
Complejo de Pre-iniciacion en Eucariotas
RNA polimerasa II + Factores de Transcripción
¿Como se le conoce a cualquier proteína diferente a la RNApol necesaria para iniciar o regular la transcripción de eucariotas?
Factores de Transcripción
Proteínas necesarias para la transcripción de todos los genes, participan en el complejo de pre-iniciación
GTF (General Factor Transcription)
Factor General de Transcripción
Funciones de los Factores de Transcripción Específicos
Activan (activadores) o inhiben(represores) la transcripción de genes particulares mediante la unión a secuencias reguladoras
¿Cuantas y cuales son las subunidades de TFIID?
Son dos y son TBP y TAF
¿Cual es el único Factor de Transcripción con actividad enzimática?¿Cuales son sus subunidades y su función?
El único Factor de Transcripción con actividad enzimática es TFIIH
-Tiene 3 subunidades:
1 con actividad Cinasa (Fosforila RNApol)
2 con actividad Helicasa
Descripción del Cambio Conformacional del DNA
- TBP-promotor : inicia pliegue más de 80°
- D,A y B son plataforma para unión de RNApol con su TFIIF
- E y H se unen y activan RNApol
- DNA se enrolla alrededor del CPI de manera que todos los Fact. Grales. tengan contacto con ambos lados de DNA
Mientras más tiempo esté unido TFIID al promotor…
Mas RNApol II pueden unirse
¿Activación de la RNApol?
- Fosforilación del Dominio Carboxilo Terminal
- Sirve de Andamiaje para los factores que participan en el procesamiento del mRNA
- TFIIH: Fosforila Ser-5, desacopla la enzima de los FTG, DNA o promotor y por eso se mueve en la plantilla
- Inicia la formación del Casquete 5`
- P-TEFb: Fosforila Ser-2, recluta factores de corte y empalme y adición de la Cola Poli(A)
Encargado de fosforilar Ser2 así como de reclutar factores de corte y empalme y adición de cola poli(A)
P-TEFb
¿Cómo actúa la Actinomicina D?
Inhibe la Transcripción
Propiedades de los RNA nucleares heterogéneos (hnRNA) /Transcrito Primario/ Pre-RNA
- Pesos moleculares altos
- Heterogéneas
- Solo estan en el núcleo
- Se convierten en RNA más pequeños
- Vida Media Corta
Procesamiento de mRNA cotranscripcional
- Eliminación de intrones
- Adición de Casquete 5
y de la Cola Poli(A) 3
- Exportación del núcleo
¿Quienes fueron los descubridores de los Intrones Eucariotas?
Jeffreys y Flavell
¿Que es la Hibridacion de Acido Nucleico?
Asociación de dos hebras complementarias de ácido nucleico para formar moléculas de doble hebra que pueden contener dos hebras de DNA, dos hebras de RNA o una de DNA-RNA
¿Cuantos intrones tiene en promedio un gen humano?
9 intrones.
>95% de la Unidad de Transcripción
¿Como se le llama al proceso de Eliminación de Intrones del pre-RNA?
Proceso de Corte y Empalme
Descripción breve del Proceso de Corte y Empalme
- hnRNA se transcribe y se asocia con RNP
- Empalmosoma (contiene snRNP) se une a pre-mRNA
- Se unen los extremos de los exones
- Intrones se degradan en el núcleo
Función del Casquete 5’ y Cola Poli(A) 3’
Protección contra Exonucleasas
Función del CTD fosforilado
Reclutar las enzimas que generan el casquete
¿A que se une el extremo 5’ del pre-mRNA naciente?
A la Enzima Formadora del Capuchón
Resumen de la Formación del Casquete 5’
- El extremo 5’ del pre-mRNA naciente se une a una enzima formadora del capuchón
Dos sitios activos:
-Trifosfatasa: Remueve el grupo fosfato terminal
-Guanililtransferasa: Adiciona un residuo de guanina en orientación inversa. - Metiltransferasa: Agrega un grupo metilo al capuchon de guanosina terminal y a la ribosa del nucleótido
- Complejo proteico llamado CBC se une al Casquete
Resumen de la Formación de la Cola Poli(A)
El extremo 3’ de un pre-mRNA se ensambla un complejo grande de proteínas.
- Endonucleasa: Divide el transcrito de RNA primario, lo que genera un nuevo extremo 3’ en dirección 5’ del extremo 3’ original
- Polimerasa de Poli(A): Agrega residuos de adenosina al extremo 3’ sin intervención de una plantilla de DNA
Características del mRNA (RNA mensajero)
- Contienen secuencias continuas de nucleótidos que codifican un polipéptido específico.
- Se encuentran en el citoplasma
- Se unen a los ribosomas para traducirse
- Casquete en 5’ y Cola Poli(A) en 3’