Replicacion y Reparación de DNA Flashcards
Objetivo del Ciclo Celular
Producir dos células hijas
¿Cuales son las dos fases principales del Ciclo Celular?
Interfase y Fase M
¿Cuales son las subfases de la Interfase del Ciclo Celular y que ocurre en cada una?
Fase G1: La célula reúne sustancias nutritivas y sintetiza el ARN y las proteínas necesarias para la síntesis del ADN y la duplicación cromosomica
Fase S: Se duplica el ADN
Fase G2: La célula se prepara para su división
¿En que fase del Ciclo Celular se da la División del Genoma?
En la Fase M
¿Cual es el nombre de la división del núcleo que se da en la Fase M del Ciclo Celular?
Cariocinesis
¿Que es la Citocinesis?
La división de una célula
Duración aproximada de un Ciclo Celular Completo
24 horas
¿Como se llama la Proteína Supresora de Tumores que participa en el Ciclo Celular?
P53
Evento causado por el mal funcionamiento de los Puntos de Control del Ciclo Celular, que puede conducir a la Muerte Celular y desarrollo de Células Tumorales
Catástrofe Mitotica
Puntos de Control del Ciclo Celular
- Control G1
- Control G2
- Control al Final de la Fase M
Ciclinas y CDK`s presentes en el Ciclo Celular
Ciclinas D, E, A y B
CDK`s 1, 2, 4 y 6
Reguladoras del Ciclo Celular
Ciclinas
¿Por que la Replicacion es Semiconservativa?
Porque las hebras existentes sirven de molde complementario a las nuevas
¿Por que la Replicacion es Semidiscontinua?
Porque una de las hebras templado se replica de manera continua y la otra hebra de manera discontinua
¿Como se la llama a los segmentos de ADN que se sintetizan en la cadena rezagada durante el proceso de Replicacion?
Fragmentos de Okazaki
¿Que se necesita para la Polimerizacion de Nucleotidos?
- Ion divalente (Magnesio)
- DNA Polimerasa
En Procariotas ¿Cual es la función de OriC?
Dar la Secuencia Especifica de Inicio
En Procariotas ¿Cual es la proteína que se une a OriC?
DNA-A
En Procariotas ¿De que se compone el Primosoma?
De Helicasa(DNA-B) + Primasa(RNA-Pol)
¿Función del Primosoma?
Síntesis del Iniciador
En Procariotas ¿Que es el Replisoma?
Complejo completo de proteínas activas en la horquilla de replicacion. Incluidas la holoenzima DNA Pol II, la helicasa, SSB y primasa.
En Procariotas
Función de la Polimerasa I
Exonucleasa (Elimina cebadores) y rellena espacios
Función de la DNA ligasa
Une los fragmentos de Okazaki
La Replicacion Coordinada se da en el…
Asa de Replicacion
En Eucariotas, aproximadamente ¿Cuantos Sitios de Replicacion hay?
De 50-100 sitios
Aproximadamente ¿Cuantas horquillas hay por cada sitio?
10-100 horquillas de replicacion
En Eucariotas, el Crecimiento es…
Bidireccional
¿Que es un replicon?
Unidad de replicación del DNA que se replica a través de múltiples horquilllas replicadoras
¿Como están determinados los sitios de replicacion?
Epigeneticamente
¿Que es una ARS?
Es una Secuencia de Replicacion Autónoma (AT)
¿Que es ORC y cuantas subunidades tiene?
Complejo de Reconocimiento de Inicio y tiene 6 subunidades.
¿Que son las MCM activadas en eucariotas?
MiniCromosomal Manteinance
-DNA helicasa que desenrolla el duplex parental
En Eucariotas ¿Cual es la funcion de RPA?
-Mantiene el DNA en un estado monocatenario
¿Que es RFC?
Es el cargador de la pinza deslizante (PCNA)
¿Que es PCNA?
Pinza deslizante
¿Cual es la función de la Polimerasa alfa y la Primasa?
Síntesis de Cebador
¿Que es una PCR?
Reacción en Cadena de Polimerasa
-Una técnica utilizada para amplificar, o hacer muchas copias de, una región de ADN blanco en específico.
Componentes necesarios para una PCR
- DNA
- DNA primer (Iniciador)
- Nucleotidos
Función de FEN-1
Endonucleasa (Elimina cebadores)
Fases de la PCR y ºC que se requieren para cada una
- Desnaturalizacion: 94-98 ºC
- Unión del Cebador: 50-68 ºC
- Elongación: 72 ºC
Función de las Histonas
- Acetilan o metilan.
- Controlan el empaquetamiento
¿Nombre de la Chaperona que lleva histonas al DNA e interactiua con PCNA?
CAF-1
Características del Nucleosoma
- Unidad Estructural de la Cromatina
- Protección contra nucleasas
- 200 pb/10nm/DNA dobla 6 veces
¿Que es Core de Nucleosoma?
- DNA rodeando a Histonas
- 147 pb
¿Como esta compuesto un Cromatosoma?
-Nucleosoma + H1
¿Cuantos pares de bases hay entre dos cromatosomas separados por un DNA linker?
50 pares de bases
¿Que es la Cromatina?
- Es un complejo de DNA, histonas y proteínas a partir de los cuales se forman los cromosomas eucariontes
- Se dobla 50 veces
¿Cual es el material genético que condensado forma unidades de herencia?
Cromosomas
¿Cual es el nombre que recibe un par de cromosomas con la misma información pero derivadas de cada progenitor?
Cromosomas Homólogos
¿Como se le denomina a un cambio en la secuencia normal del DNA?
Mutación
¿Donde se encuentran los sitios inherentemente inestables?
Entre la Base y la Desoxirribosa
¿Como se le llama al cambio de un único par de bases de la secuencia del DNA?
Mutación Puntual
Tipos de Mutaciones e Implicaciones de cada una
- Sin Sentido: No tiene sentido. Se introduce un codon de parada.
- Sentido Equivocado: Cambio de la secuencia de la proteína.
- Silenciosa: No cambia la secuencia de aa (GAG por GAA, ambas codifican Glutamina)
- Cambio en la Secuencia No Codificante pero que participa en la regulación de la transcripción
- Desaminacion de Bases: Cambio en el apareamiento
Tipos de Reparación de Mutaciones
- Reparación de Escisión de Bases
- Reparación de la Unión Deficiente
- Reparación de Escisión de Nucleótidos
- Reparación de Rotura de Doble Cadena
- Recombinación Homologa
- Reparación por Recombinación Homóloga de la Ruptura de una Hebra
Características de la Reparación por Escisión de Bases
- La base que se encuentra modificada se escinde
- Ocasionada por químicos en la dieta o metabolismo
- Ocurre antes de la replicacion
Situaciones que requieren una Reparación por Escisión de Bases
- Desaminacion: Remoción del grupo amino de citosina
- Mal apareamiento: Cambio de C por T/U
- Guanina oxidada: Secundaria a daño por ROS
Características de la Reparación de la Unión Deficiente
- Se debe a un mal apareamiento de bases
- Ocurre después de la replicacion
¿Como identifica E. Colli sus bases mal apareadas?
Mediante la metilacion de su adenosina
¿Como identifican los eucariotas sus bases mal apareadas?
Utiliza el Sistema MMR
En la Vía Global, de la Reparación por Escisión de Nucleotidos ¿Quien es la encargada de reconocer el sitio dañado?
XPC
En la Vía Acoplada a la Transcripción, de la Reparación por Escisión de Nucleotidos ¿Quienes son los encargados de reconocer el sitio dañado?
RNApol + CSB
Características de la Reparación de Escisión de Nucleotidos
- Se requiere cuando hay algún tipo de daño por Luz UV
- XPB y XPD(Subunidades de Helicasa TF II H) son encargadas de abrir las cadenas de DNA
- Incision de XPG (3
) y XPF (5
) - Eliminación
En la Reparación por Escisión de Nucleotidos ¿Quien es la encargada de la reparación del sitio dañado?
La DNApol
En la Reparación por Escisión de Nucleotidos ¿Quien es la encargada de la ligación?
DNA ligasa I
¿Con que otro nombre se le conoce a la Reparación por Unión de Extremos No Homólogos?
Reparación de Rotura de Doble Cadena
Características de la Reparación por Unión de Extremos No Homólogos
- Se da cuando el daño es causado por Radiación Ionizante
- Rotura ocurre durante la replicacion del DNA
- Une los extremos pero se pierden bases
Proteínas involucradas en la Reparación por Unión de Extremos No Homólogos
- DNA-PK (Proteina quinasa dependiente de DNA)
- Heterodimero KU 80/KU 70
¿Con que otro nombre se le conoce a la Recombinación de Horquilla de Replicacion Colapsada?
Recombinación Homologa
Características de la Recombinación de Horquilla de Replicacion Colapsada
- 5` exonucleasa actúa en el extremo roto
- RecA y Rad51 invaden e hibridan las hebras
- Migración de la rama
- Formación de estructura Holliday
- Escisión de entrecruzamiento
Enzimas encargadas de la Invasión e Hibridacion de las hebras en la Recombinación Homologa
SecA y Rad51
Acerca de la Reparación por Recombinación Homologa de la Ruptura de un Hebra
Es la resolución alternativa de Holliday
- Regeneración de cromosomas originales
- Generación de cromosomas recombinantes
¿Que es un gen?
Regiones de DNA que están en lugares específicos del cromosoma y que codifican proteínas o RNA funcionales
¿Que es un alelo?
Son formas alternativas de un gen
¿De que se componen la Zona Reguladora y la Zona Codificante de un gen?
- Zona Reguladora: Silenciador, enhancer/potenciador y promotor
- Zona Codificante. Intrones y Exones
¿Que es un intron?
Parte de un transcrito primario que es eliminado por corte y empalme durante el procesamiento del RNA. No codifica
¿Que es un exon?
Porción de un gen que codifica aminoácidos
Regiones/Sitios UTR`s
-Sitio Poli(A) o de escisión 3`
S-itio Casquete 5`
Tipos de Genes
- Solitarios
- Duplicados
- Pseudogenes
- Genes repetidos en tàndem
- Del 25-50% de todos los genes son de este tipo.
- Representado una vez en el Genoma
Genes Solitarios
- Genes con secuencias cercanas pero no idénticas que están localizadas dentro de 5,000-30,000 pb una de otra
- Surgen por duplicación de un gen ancestral en la meiosis
Genes Duplicados
¿Que es un Pseudogen?
- Genes con la misma estructura que los genes funcionales pero estos no codifican
- Duplicación de un gen ancestral pero con poca presión selectiva
- No perjudican
- Poseen marcas del gen ancestral
Genes Repetidos en Tándem
- Genes que codifican RNA ribosómico y otros RNA que no codifican proteínas
- Satisfacen demanda celular (Células embrionarias)
- Región codificante no varia entre especies (intrones si)