Transcrição

Question 1

Nos procariotas o transcrito é o _________ e nos eucariotas é o ___________:

Answer 1

mRNA
RNA primário que tem de ser processado para dar origem ao mRNA.

Question 2

Outros tipos de RNA que dão origem a proteínas:
* tRNA:
* rRNA:

Outros RNA nos eucariotas:
* snRNA:
* snoRNA:
* miRNA:

Outros RNA nos procariotas:
* tnRNA:
* sRNA:

Answer 2

• tRNA: transporta os aminoácidos para os ribossomas
• rRNA: faz parte do ribossoma e representa 80% do RNA total
• snRNA: processamento do RNA;
• snoRNA: processamento de rRNA
• miRNA: regulação de RNA
• tnRNA: marcam proteínas incorretas para degradação
  *sRNA: regulação genética

Question 3

Diferenças entre o inicio e localizaçao da translaçao nos procariotas e eucariotas:

Answer 3

• Procariotas: começa antes da síntese de mRNA estar completa, ocorrendo ambos no mesmo compartimento
• Eucariotas: o mRNA depois de ser sintetizado precisa de ser transportado para o citoplasma e ai ocorre a translação.

Question 4

Processamento do RNA primario nos eucariotas:

Answer 4

• Adição de caps e caudas nas extremidades
• Remoção dos introes (ao contrário do que ocorre nos procariotas, os genes não são constituídos por segmentos contínuos de sequências codificantes (exões), estando estas separadas/interrompidas por sequências intervenientes (intrões)).

Question 5

Tipo de RNA produzido nos procariotas e eucariotas:

Answer 5

• Procariotas: o mRNA e poliscistronico (o mesmo mRNA pode dar origem a mais do que uma proteína, uma vez que são produzidos a partir de operoes - conjunto de genes sob o controlo do mesmo promotor e terminador)
• Eucariotas: o mRNA e monocistronico (codifica apenas uma proteína)

Question 6

Discute o tema da compartimentalizaçao nas bacterias:

Answer 6

Apesar de não haverem estruturas ladeadas por membranas que separam certas funções celulares de outras, existe uma certa organização espacial das funções, observando-se padrões de localização de mRNA ou proteínas específicas. Estes são constantes de célula para célula quando sob as mesmas condições experimentais, mostrando que é essencial que certo mRNA ou proteína esteja localizada naquele local da célula para efetuar a sua função.

Question 7

Padrões de localização de mRNA nas bacterias:

Answer 7

• helical
• membranar adjacente a membrana)
• polar (num dos polos da celula)

Question 8

Padrões de localização de proteínas nas bactérias:

Answer 8

• integradas na membrana
• localizadas nos polos
• helicais (citoesqueleto)
• capsula proteica que encapsula outras moleculas (compartimentalizam vias metabolicas) - metabolossomas poliedrais

Question 9

Partes de um operao:

Answer 9

• promotor: local onde se liga a RNA polimerase (e, portanto, onde vai ocorrer a maior parte dos mecanismos de regulação genica, com envolvimento de fatores de transcrição)
• operador: local de ligação de fatores inibidores da transcrição, que não existe em genes constitutivos)
• genes
• terminador

Question 10

O RNA e sintetizado no sentido de _______ e a cadeia molde e sempre lida de _______.

Answer 10

• 5’ para 3’
• 3’ para 5’

Question 11

Durante o processo de transcrição forma-se um hibrido de DNA-RNA de cerca de _____ nucleotídeos nos procariotas e _____ nos eucariotas, que e bastante estável.

Answer 11

• 14
• 16

Question 12

Sequencias consenso nos promotores dos procariotas:

Answer 12

-10: TATAAT
-35: TTGACA
(separadas por 15 a 19 nucleotídeos)

Quanto mais a sequencia promotora se aproximar da sequencia consenso acima representada, mais forte será o promotor, dado que a RNA Polimerase terá mais afinidade

Question 13

Passos gerais na transcrição:

Answer 13

1. Iniciação (reconhecimento da sequencia de DNA)
2. Elongação
3. Terminação

Question 14

A RNA polimerase precisa de primer para iniciar a transcrição?

Answer 14

Não

Question 15

Subunidades de core da RNA polimerase:

Answer 15

• β e β’ - sitio ativo da enzima que se liga ao DNA e RNA
• α e α - regiões N-terminal provocam a sua dimerização responsável pela ligação das subunidades β e uma região C-terminal que interage com o DNA e com proteínas regulatórias
• Ω - não intervêm diretamente na transcrição mas e precisa para a ligação das outras subunidades e para a estabilidade das enzimas

Question 16

Que subunidade se junta ao core da RNA Polimerase que e necessária para o inicio da transcrição:

Answer 16

σ - reconhece as sequencias consenso dos promotores

Existem diferentes subunidades σ (σ70 e a utilizada nos housekeeping genes e o fator mais abundante nas E.Coli)

Question 17

A subunidade σ e composto por 4 regioes que reconhecem:

Answer 17

• σ1: elemento descriminante
• σ2 e σ4 reconhecem as zonas -10 e -35 respetivamente do promotor
• σ3: zona TGTG

Região σ2 também esta diretamente envolvida na formação do complexo aberto

Question 18

Que regiao tambem reconhece o dominio C-terminal da subunidade α?

Answer 18

Up element

Question 19

Iniciação da transcrição em promotores bacterianos:

Answer 19

1. A RNA polimerase interage com o promotor, formando um complexo fechado (RPc)
2. O duplex de DNA circundante ao local de inicio da transcrição e desnaturado, para formar o complexo aberto (RPo). Forma-se a bolha de transcrição (10-12 nucleotídeos)
3. O complexo de iniciação (RPinit) forma-se e começa a síntese de RNA direcionada pela cadeia-molde de DNA
4. Fator σ dissocia-se para que o alongamento possa ocorrer.

Question 20

Mecanismo de terminação da transcrição bacteriana por terminadores independentes de Rho?

Answer 20

Sequencias invertidas (de C’s e G’s), seguidas por vários A’s (que serão U’s no RNA) → as sequencias invertidas vão levar a formação de um loop e as ligações entre os A’s e U’s seguidos são uma região pouco estável dado que apenas envolve 2 ligações de hidrogênio → a RNA polimerase perante a instabilidade, tenta voltar atras para estabilizar a região e encontra o loop que provoca a sua separação.

Question 21

Mecanismo de terminação da transcrição bacteriana por terminadores dependentes de Rho?

Answer 21

O hairpin e a sequência repetitiva de U’s não são suficientes, sendo necessária a intervenção da proteína Rho, uma translocase e uma helicase. Esta reconhece sequências específicas no RNA (rut – Rho utilization site –, ricas em pirimidinas (C’s) e com mais de 30 nucleótidos) ligando-se ao mesmo quando encontra estas sequências, percorrendo, depois, a molécula (atividade de translocase), até encontrar a RNA Polimerase, que está parada na transcrição após o hairpin, e causa a sua dissociação do RNA, com a atividade de helicase que separa o DNA do RNA ou com a sua atividade de translocase com que “empurra” a Polimerase do complexo de elongação

Question 22

O mecanismo de terminação dependente de Rho existe apenas em:

Answer 22

Bactérias Gram -

Question 23

A proteína Rho e dependente de:

Answer 23

ATP