Transcrição Flashcards
Nos procariotas o transcrito é o _________ e nos eucariotas é o ___________:
mRNA
RNA primário que tem de ser processado para dar origem ao mRNA.
Outros tipos de RNA que dão origem a proteínas:
* tRNA:
* rRNA:
Outros RNA nos eucariotas:
* snRNA:
* snoRNA:
* miRNA:
Outros RNA nos procariotas:
* tnRNA:
* sRNA:
- tRNA: transporta os aminoácidos para os ribossomas
- rRNA: faz parte do ribossoma e representa 80% do RNA total
- snRNA: processamento do RNA;
- snoRNA: processamento de rRNA
- miRNA: regulação de RNA
- tnRNA: marcam proteínas incorretas para degradação
*sRNA: regulação genética
Diferenças entre o inicio e localizaçao da translaçao nos procariotas e eucariotas:
- Procariotas: começa antes da síntese de mRNA estar completa, ocorrendo ambos no mesmo compartimento
- Eucariotas: o mRNA depois de ser sintetizado precisa de ser transportado para o citoplasma e ai ocorre a translação.
Processamento do RNA primario nos eucariotas:
- Adição de caps e caudas nas extremidades
- Remoção dos introes (ao contrário do que ocorre nos procariotas, os genes não são constituídos por segmentos contínuos de sequências codificantes (exões), estando estas separadas/interrompidas por sequências intervenientes (intrões)).
Tipo de RNA produzido nos procariotas e eucariotas:
- Procariotas: o mRNA e poliscistronico (o mesmo mRNA pode dar origem a mais do que uma proteína, uma vez que são produzidos a partir de operoes - conjunto de genes sob o controlo do mesmo promotor e terminador)
- Eucariotas: o mRNA e monocistronico (codifica apenas uma proteína)
Discute o tema da compartimentalizaçao nas bacterias:
Apesar de não haverem estruturas ladeadas por membranas que separam certas funções celulares de outras, existe uma certa organização espacial das funções, observando-se padrões de localização de mRNA ou proteínas específicas. Estes são constantes de célula para célula quando sob as mesmas condições experimentais, mostrando que é essencial que certo mRNA ou proteína esteja localizada naquele local da célula para efetuar a sua função.
Padrões de localização de mRNA nas bacterias:
- helical
- membranar adjacente a membrana)
- polar (num dos polos da celula)
Padrões de localização de proteínas nas bactérias:
- integradas na membrana
- localizadas nos polos
- helicais (citoesqueleto)
- capsula proteica que encapsula outras moleculas (compartimentalizam vias metabolicas) - metabolossomas poliedrais
Partes de um operao:
- promotor: local onde se liga a RNA polimerase (e, portanto, onde vai ocorrer a maior parte dos mecanismos de regulação genica, com envolvimento de fatores de transcrição)
- operador: local de ligação de fatores inibidores da transcrição, que não existe em genes constitutivos)
- genes
- terminador
O RNA e sintetizado no sentido de _______ e a cadeia molde e sempre lida de _______.
- 5’ para 3’
- 3’ para 5’
Durante o processo de transcrição forma-se um hibrido de DNA-RNA de cerca de _____ nucleotídeos nos procariotas e _____ nos eucariotas, que e bastante estável.
- 14
- 16
Sequencias consenso nos promotores dos procariotas:
-10: TATAAT
-35: TTGACA
(separadas por 15 a 19 nucleotídeos)
Quanto mais a sequencia promotora se aproximar da sequencia consenso acima representada, mais forte será o promotor, dado que a RNA Polimerase terá mais afinidade
Passos gerais na transcrição:
- Iniciação (reconhecimento da sequencia de DNA)
- Elongação
- Terminação
A RNA polimerase precisa de primer para iniciar a transcrição?
Não
Subunidades de core da RNA polimerase:
- β e β’ - sitio ativo da enzima que se liga ao DNA e RNA
- α e α - regiões N-terminal provocam a sua dimerização responsável pela ligação das subunidades β e uma região C-terminal que interage com o DNA e com proteínas regulatórias
- Ω - não intervêm diretamente na transcrição mas e precisa para a ligação das outras subunidades e para a estabilidade das enzimas
Que subunidade se junta ao core da RNA Polimerase que e necessária para o inicio da transcrição:
σ - reconhece as sequencias consenso dos promotores
Existem diferentes subunidades σ (σ70 e a utilizada nos housekeeping genes e o fator mais abundante nas E.Coli)
A subunidade σ e composto por 4 regioes que reconhecem:
- σ1: elemento descriminante
- σ2 e σ4 reconhecem as zonas -10 e -35 respetivamente do promotor
- σ3: zona TGTG
Região σ2 também esta diretamente envolvida na formação do complexo aberto
Que regiao tambem reconhece o dominio C-terminal da subunidade α?
Up element
Iniciação da transcrição em promotores bacterianos:
- A RNA polimerase interage com o promotor, formando um complexo fechado (RPc)
- O duplex de DNA circundante ao local de inicio da transcrição e desnaturado, para formar o complexo aberto (RPo). Forma-se a bolha de transcrição (10-12 nucleotídeos)
- O complexo de iniciação (RPinit) forma-se e começa a síntese de RNA direcionada pela cadeia-molde de DNA
- Fator σ dissocia-se para que o alongamento possa ocorrer.
Mecanismo de terminação da transcrição bacteriana por terminadores independentes de Rho?
Sequencias invertidas (de C’s e G’s), seguidas por vários A’s (que serão U’s no RNA) → as sequencias invertidas vão levar a formação de um loop e as ligações entre os A’s e U’s seguidos são uma região pouco estável dado que apenas envolve 2 ligações de hidrogênio → a RNA polimerase perante a instabilidade, tenta voltar atras para estabilizar a região e encontra o loop que provoca a sua separação.
Mecanismo de terminação da transcrição bacteriana por terminadores dependentes de Rho?
O hairpin e a sequência repetitiva de U’s não são suficientes, sendo necessária a intervenção da proteína Rho, uma translocase e uma helicase. Esta reconhece sequências específicas no RNA (rut – Rho utilization site –, ricas em pirimidinas (C’s) e com mais de 30 nucleótidos) ligando-se ao mesmo quando encontra estas sequências, percorrendo, depois, a molécula (atividade de translocase), até encontrar a RNA Polimerase, que está parada na transcrição após o hairpin, e causa a sua dissociação do RNA, com a atividade de helicase que separa o DNA do RNA ou com a sua atividade de translocase com que “empurra” a Polimerase do complexo de elongação
O mecanismo de terminação dependente de Rho existe apenas em:
Bactérias Gram -
A proteína Rho e dependente de:
ATP
