Traffic membranaire intracellulaire Flashcards

Question

Décris le transport de cholestérol via les lipoprotéines de bases densité (LDL). Ce type de transport est un exemple de tri/recyclage et dégradation de la voie d’intégration/endocytose du traffic membranaire;

Answer 1

1. récepteur sur la membrane plasmique externe recrute LDL et fait endocytose pour former vésicule avec manteau the clathrine. 2. vésicule dans cytoplasme pert son manteau et fusionne avec un endosome. 3. processus d'**acidification **dans **endosome précoce** fait que le pH acide sépare le LDL et son recepteur. Le LDL (**substrat**) est **trié** par l'**appareil de golgi** et continue vers les étapes **tardives** (endosomes tardifs et lysosome). En même temps, le **récepteur est recyclé** et retourne s'installer sur la membrane plasmique externe. 4. dans le lysosomes, les LDL sont **dégradés/clivés (dégradation)** par des enzymes hydrolitiques. 5. Cela permet **libération du cholestérol** dans le cytoplasme de la cellule.

Answer 2

lysosome où on trouve des enzyme hydrolitiques qui ont besoin d'un environnement acide pour complétér leur fonction de dégradation, pH = 5

Answer 3

lysosome qui possède enzymes ACTIVES juste en bas pH et INACTVE avant d'arriver dans lysosomes

Answer 4

**la V-ATPase vacuolaire** qui est présente sur la membrane des lysosomes elle utilise de **l'énergie ATP pour pomper des protons H+ dans le lysosomes** donc va créer environnement acide

Answer 5

1. endosomes:intra 2. lysosomes:intra 3. exosomes: extra

Answer 6

les vésicules extravesicullaires qui **proviennent du système endosomal** les exosomes sont libérés quand les CMV se fusionnent avec la membrane plasmique

Answer 7

**Les 3 mécanismes d'entrée à la voie endosomale sont:** 1. **Endocytose** (endosome précoce ->endo tardif -> fusionne à lysosome) médié par clathrine, cavéonine, etc 2. **Phagocytose** (phagosome se fusionne è lysosome) 3. **Autophagie/autodigestion** (autophagosome se fusionne à lysosome)

Answer 8

Se passe dans la cellule et avec substance contenu dans la cellule slmt; dégradation de matériel intracellulaire comme des organites (mitochondire, peroxysme), les protéines ou des aggrégats grâce à leur internalisation/fusion via un auto-phagosome avec lysosomes qui possède des enzymes hydrolitiques de dégradation

Answer 9

membrane double: double bicouche lipidique membrane formée via intermédiaire des phagophores qui s'assemblent via la rétinaculum endoplasmique de protéines spécifiques et la fusion des vésicules en provenant du rétinaculum endoplasmique. **phagophore + vésicule = autophagosome double bicouche lipidique**

Answer 10

1. nucléation 2. extension 3. maturation et fusion (NEM comme non en hongrois) Arrive; - **de façon consécutive (non-régulée)**, but: maintenir homéostasie de la cellule - **de façon régulée (stimulation) en cas de déprivation de nutriments**, but: proumevoir/stimuler survie

Answer 11

- présent dans **toutes les cellules eucaryotes** - ressemblent aux lysosomes (mais font pas partie du sys. endosomal) - **SIMPLE MEMBRANE**: simple bicouche lipidique - important pour **métabolisme et detoxification** - Contient corps cristallin (urate oxydase)

Answer 12

1. important pour métabolisme; oxidation des acides gras 2. important pour détoxification: production et dégradation du h202 et le métabolisme de ROS contenu enzymatique fait quoi: - catalase la plus abondante: ROS - synthèse des acides biliaires (foie) - synthèse de lipides (en plus de RE)

Answer 13

lysosome - systeme endosomal - simple bicouche - fx: metabolisme, detoxification peroxysme - PAS sys. endosomal - double bicouche - fx: dégradation

Answer 14

1. la plupart se forment par la fission et croissance (comme des mitochondries) régulés par la dynamine 2. par novo (bourgeonnement de vésicules provenant du RE)

Answer 15

les protéines ENDOCYTÉES sont soit RECYCLÉES (ex: récepteurs transmembranaires) à la membrane plasmique ou DÉGRADÉES (ex: substrat comme LDL) via les lysosomes, suit à un TRI fait dans l'endosome PRÉCOCE.

Answer 16

endosome précoce

Answer 17

La lumière des ENDOSOMES devient de plus en plus ACIDES dans les étapes TARDIVES de la voie endosomale (pH 5 dans le lysosome)

Answer 18

typiquement, un récepteur liant un ligand sera endocytosé avec son ligand. dans l'endosome précoce, le pH lègèrement plus acide permettera la dissociation du ligand et de son récepteur. ce dernier sera recyclé via l'endosome de recyclage et va retrouver et vers membrane plasmique, tandis que son ligand sera transporté dans les endosomes tardifs et les lysosomes (phase tardives) pour subir la dégradation

Answer 19

média par les protéines transmembranaires SNARES qui interagissent ensemble arrive dans mécanisme d'exocytose/sécrétion (vésicule dans cytosol est expulsé via la membrane plasmique)

Answer 20

v-snares sur vésicules t-snares sur mem. cible

Answer 21

coté externe de la membrane plasmique

Answer 22

fusion de la vésicule(v-snare) à la membrane plasmique (t-snare): **PAS besoin ATP** **désassemblage des complexes v-/t-SNARE après fusion: dépend de l'hydrolyse d'ATP**

Answer 23

Pour se fusionner, **une vésicule doit d'abord s'attacher et s'appareiller avec la membrane cible** Cela est possible grâce à une GTPase de la famille RAS: **RAB-GTP: forme active** RAB-GTP est sur la membrane de la vésicule et va se lier à une proteine d'attachement (proteine effectrice de RAB) sur la membrane cible. Cette liaison rapproche la vésicule de la mem. pour permettre l'étape de fusion.

Answer 24

RAB-GDP: inactif **RAB-GTP: active** - **Forme qui est reconnue par les protéines effectrices sur les membranes cibles: pemet appariement des vésicules à la membrane cible avant leur exocytose/fusion.** - contrôlée par 2 protéines: **GEF and GAP**

Answer 25

1. différents **SNARES** (v-snares, t-snares) 2. différents** RABS** (rab-gtp, rab-gdp: actif, inactif) 3. la **composition de la bicouche lipidique** est aussi différentes (différente **phosphoinositides** sont enrichis sur diff membane ce qui permet de reconnaitre)

Answer 26

la phosphorylation/déphosphorylation de l'anneau inositol des PI (phosphadidylinositol) sur **les positions 3, 4, 5** par 2 enzymes: **- kinases - phosphatases** Donne: **DES PHOSPHOINOSITIDES (variantes de PI phosphorylé)** PI3P, PI4P, PI5P, PI(4,5)P2, PI(3,4,5)P3 **PI un phospholipide mineur mais important et est généralement trouvé sur le **feuillet interne (face au cytosol de la cellule)**

Answer 27

kinases phosphatases

Answer 28

1. voie de sécrétion est en continuité avec enveloppe nucléaire ou s'attache RE 2. appareil de golgi 3. vésicule de transport qui se fusionne à mem. et exocyte

Answer 29

Bio-synthèse Exocytose

Answer 30

lieu de passage des protéines **nouvellement synthétisées au rétinaculum endoplasmique rugueux (RER) **et destinées à **3 places possible:** 1. la membrane plasmique 2. à l'exportation par sécrétion 3. ou à d'autres organites comme des lysosomes

Answer 31

Réseau de citernes ou sacs membranaires qui entoure le noyau cellulaire Role: **fabrique les membranes de la cellule; endomembranes** divisée en 2 surfaces/zones ayant chaque des rôles distincts: - **surface lisse (REL)** - **surface rugueuse (RER)** - à cause des ribosomes

Answer 32

enveloppe nucléaire/noyau de la cellule

Answer 33

- sans ribosomes - réseau de tubules - en continuité avec RER Fonctions: 1. **synthèse lipidique**: phospholipides,cholest, hormones steroides 2. **reservoir de Ca+**: retinaculum sarcoplasmique dans les muscles

Answer 34

- possède RIBOSOMES - réseau de citernes - en continuité avec REL Fonctions; 1. synthèse protéiques 2. repliment des protéines (ex par pont de disulfures) 3. contrôle de qualité 4. là où la **glycolisation des protéines commence**

Answer 35

essentiel pour quoi : traduction des ARNm en protéines composé de quoi: ARNs ribosomales (ARNr) ET protéines ses sous-unités: grande (50s), petite (30s)

Answer 36

ribsomes traduit ARNm en protéines

Answer 37

5' a 3' sur ARNm en lisant chaque codons de 3 nucléotides Codon start: AUG, Codon stop: UAG Rôle des ARNt: les ARNt spécifiques pour chaque codon transfèrent chaque acide aminé à la chaine polypeptidique jusqu'à un codon STOP

Answer 38

multiples ribosomes en train de traduire le même ARNm simultanément

Answer 39

les protéines destinées à être sécrétées et/ouu transmembranaires ont **une séquence signal "signal peptide" N-terminal (agit comme étiquette)** qui dirige le ribosome au rétinaculum endoplasmique.

Answer 40

Pour les protéines cytosoliques (nucléaire, mitochondriale), la traduction commence; **avec les ribosomes libres dans le cytosol ** Pour les protéines destinées à être transmembranaires, sécrétées, ou qui fonctionnent dans le système endomembranaire (ex: les enzymes hydrolases dans les lysosome), la traduction comment dans ribosome mais: **finit avec ribosome au RER à cause de la séquence SIGNAL à leur queue N-terminal qui guide l'importantion ver le RE**: translocation co-traductionelle

Answer 41

La séquence signal sur le N-terminal de la protéines amènent la protéine (avec l'ARNm) en voie de traduction par un ribosome près du RÉR, à sa surface externe. La protéine qui continue à se former, s'allonge dans la citerne du rétinaculum à travers le **translocon** (complexe protéique). La séquence signale est ensuite clivée par un peptidase dans le RE. On appelle tout cela: **translocation co-traductionnelle au RER**

Answer 42

**via le translocon sur la membrane du RE** qui connecte la lumière du RE et le cytosol de la cellule le N-terminal de la protéine clivée après traduction reste dans la lumière de RE.

Answer 43

elle va intégrer membrane via translocon et devenir **protéine transmembranaire**

Answer 44

des proteines et lipides transmembranaires qui sont glycolisés sur la surface externe de la membrane plasmiques (dans l'espace intercellulaire) fx: - protection chimique (entérocytes intestinales) - reconnaissance cellulaire (cellules immunitaires)

Answer 45

**n-glucolisation:** - ajout d'une **(OSE/GLYCOSE)** à un **nitrogène (N)** de **l'asparagine (Asn)**, un aa de la chaine protéiques. - a lieu dans le **rétinaculum endoplasmique rugueux (debut de la glycolysation)** **o-glycolisation: ** - ajout d'un (**OSES/GALACTOSE)** à un **oxygène** de la **Sérine/Thr**) - se fait dans l'**appareil de golgi**

Answer 46

1. **COMMENCE**: Dans la lumière du retinaculum endoplasmique AVEC AJOUT DE GLYCANE PRÉFORMÉ: **un précurseur du glycolax** (oligosaccharide lié à un lipide de la membrane interne va être transféré par une proteine transférase **au N (nitrogène) d'un asparagine (Asn)** de la nouvelle protéine transmembranaire). **Tout cela à lieu dans la lumière de RE**. 2. **CONTINUE: dans l'appareil de golgi** ## Footnote DIAPO

Answer 47

dans la lumière du RE, un précurseur de glycane (glycane préformé) est glycolisé (ajouté) aux Nitrogène des Asparagine. Précurseur de glycane: - 2x GlcNAs (acétylglycosamine) - 9x mannoses - 3x glucoses

Answer 48

dans la lumière du RER (RE rugueux) le contrôle de qualité est un cycle qui utilise la présence ou absence de glucose pour s'assurer que les protéines adéquatemment repliées soit relâchées et contiuent vers l'appareil de golgi et que les protéines non-adéquatemment repliées soient retenues par les chaperons de calnexines sur la memb interne du RE. **Bon repliement:** - les 3 glucoses sont clivés et prot continue vers golgi **Mauvais repliement:** - 2 glucose clivé et le glucose restant est reconnu par la calnexine chaperonne (residente dans le RE) qui retient la protéine pour entammer un autre cycle et essayer qu'elle se plie bien cette fois.

Answer 49

La CHAPERON CALNEXINE retient les glycoprotéines INCORRECTEMENT REPLIÉES. Seules les protéines CORRECTEMENT REPLIÉES sont permises de quitter vers L'APPAREIL DE GOLGI.

Answer 50

**Enclenchement de la réponse UPR** (réponse aux proteines mal repliées) qui induit un **auto-contôle de la taille du RE.** Principe: la cellule va augmenter la transcription des genes du chaperon de calnexine pour augmenter la taille du RÉ. **IRE-1**, via un **facteur de transcription (XBP1)** va activer plusieurs **gênes du UPR** qui va inclure les **chaperons eux-même**. Effet: **augmente la transcription** de protéines des **chaperons** et les **calnexines** ce qui 1. **augmente la capacité du RE** de replier les protéines 2. **augmente sa taille (RE grossi)**.

Answer 51

IRE-1: une **endonucléase transmembranaire qui **contôle le splicing spécifique de l'ARN de XPB1** **XPB1**: est un **facteur de transcription**, qui voyage du cytosol au noyau de la cellule, qui **augmente la capacité de synthèse de la cellule via l'activation de gênes UPR** qui codent pour les nouveau chaperons et calnexines

Answer 52

**elles sont rétro-transloquées et éliminée via la dégradation associée au RE (ERAD)** Principe:passent par le translocon dans la membrane du RE et sont expulsées dans cytosol de la cellule où une enzyme clive le n-glycane et une autre ajoute un chaine de polyubiquitine ce qui va **guider la prot vers le proteasome ou elle sera dégradée**

Answer 53

Le RE LISSE et RUGUEUX sont en CONTINUITÉ avec eux-même et avec ENVELOPPE NUCLÉAIRE.

Answer 54

Le **RE** est la porte **D'ENTRÉE** de la voie de **SÉCRÉTION**. Le RE lisse est le site de **SYNTHÈSE DES LIPIDES**. Le RE rugueux est le site de **SYNTHÈSE DES PROTÉINES SÉCRÉTOIRES ET MEMBRANAIRES**, via la **TRANSLOCATION CO-TRADUCTIONELLE**.

Answer 55

RER grâce au contrôle de qualité

Answer 56

Le RER est le lieu du début de la N-GLYCOLISATION DES PROTÉINES.

Answer 57

Le RER a des mécanismes de **CONTRÔLE DE QUALITÉ**, grâce aux chaperons.

Answer 58

la cellule auto-contrôle la taille de son RE via le UPR

Answer 59

L'appareil de golgi est **responsable du flux net de transport des protéines bien repliées en provenant du RER.** point d'**entrée**/**coté RER**: réseau**CIS** **Mediane** point de **sortie**/**côté membrane plasmique**: réseau **TRANS**

Answer 60

Ce transport ce fait entre les 2 structures dans un **compartiment** qu'on appelle (**ERGIC**). Transport est médié par 2 types de protéines: 1. **COPII** qui assurent un **transport antérograde** des vésicules du **RE au réseau CIS-GOLGIEN** en formant manteau. 2.**COPI** qui assurent un **transport de récupération (transport rétrograde)** des vésicules du **réseau CIS-GOLGIEN au RE** en formant manteau.

Answer 61

**VIA TRANSPORT RÉTROGRADE** **(se passe dans cis-golgi ou ERGI)** le **cis-golgi et le ERGI possèdent des recepteurs transmembranaires (recepteur au signal KDEL)**qui reconnaissent les protéines résidentes du RE grâce a un **signal KDEL** s'est lié à elles. Une fois la reconnaissance, on observe **exocytose et formation d'un manteau de COPI**qui va permettre à la **vésicule de ramener la protéine vers le RE**.

Answer 62

passe du RER au cis golgi des recepteurs transmembranaires de chargement "cargo" sont activées quand une protéine résidente bien repliée dans le RE se lie. Un fois activée, un mateau de COPII se forme autour et on observe exocytose de la vésicule qui contient protéines bien repliées. extra: processus dynamique - En même temps on voit toujours des chaperons liés à des prot. non repliées mais eux, ne sont pas transportés.

Answer 63

1. **finition/maturation** des protéines produites dans le RER par o-glycolysation (ajout oses sur l’oxygène de thy ou Ser pour activation et stabilisation des protéines) 2. cette **glycolysation** participe à **l'étiquetage des protéines** pour marquer leur destination finale (ex: ajout d'oses) 3. **triage, concentration et emballage** des protéines dans d**es vésicules ou granules de sécrétion**.

Answer 64

vésicules et granules sont achemiés à leur destination (ex: membrane plasmique) par transport** le long de microtubules** grâce è des **moteurs protéiques** (**dynéine, kinésine**).

Answer 65

La n-glycolysation des protéines **commence au RER**: - **contrôle de qualité** - protéines bien repliées qui quittent sont **enrichies en mannose (simple)** Se **termine au golgi**: - **maturation/finition** via o-glycolysations - protéines qui quittent sont des **oligosaccharides plus complexes (diversification)**

Answer 66

1. **VOIE DE SÉCRÉTION CONSTITUTIVE:** **vésicule de transport avce protéine solubes** qui va faire une **fusion** membranaire **non-régulée**et relâché contenu dans espace extracellulaire. 2. **VOIE DE SÉCRÉTION RÉGULÉE**:**vesicule sécrétoire stockant des protéines sécrétoires** qui va faire un **fusion** membranaire **régulée** grâce à un **signal** (hormone ou neuro-transetteur) qui **se lie à un récepteur sur la membrane plasmique externe** de la cellule.

Answer 67

- faites par **toutes les cellules** - **protéines solubes** sécrétées en **permanence** - une de ses fonctions est le **maintient de l'homéostasie de la membrane plasmique** (par exemple: **Na+/K+ ATPase**)

Answer 68

- se fait uniquement dans les**cellules sécrétoires** suite à un signal extracellulaire (par ex: **les cellules beta du pancréas qui sécrètent l'insuline en réponse au glucose**) - dans ces cellules, le **TGN fait le tri** pour **séparer les composantes** des différentes types de vésicules sécrétoires.

Answer 69

sécrétion régulée qui fonctionne avec section constitutive implique sécrétion régulée de neurotransmetteurs dans la synapse suite au signal d'un potentiel d'action

Answer 70

1. le contenu des vésicules synaptiques arrive à la membrane plasmique via des boutons synaptiques qui ont été produit dans la région trans du golgi. Ces vésicules arrivent de **manière constitutive (nonrégulée)** et se fusionnent avec membrane (exocytose). Ces vésicules contiennent déjà les composantes necessaires pour former des vésicules synaptiques qui vont provenir de la membrane plasmique avec du contenu de la synapse. **Composantes necessaires: proteine de transport transmembranarie et protéine transmembranaire)** 2. reinternalisation et endocytose des composantes necessaires pour former vesicules synaptiques (prot the transport et prot transmembranaire) 3. vésicules fusionnent avec endosomes où leur contenu est trié 4. endosome va bourgeonner et former nouvelles vésicules avec contenu mnt trié: chaque vésicule possède 1 protéine de transport transmembranaire qui permet à cellule de se charger en neurotransmetteurs et une protéine transmembranaire synaptique pour se lier à la membrane plasmique quand le signal est reçu. 5. après bourgeonnement, vésicule se charge de neurotransmetteur: cela forme le pool de vésicules synaptiques qui vont attendre le signal pour être relâchés dans la synapse (se fusionner avec membrane plasmique et faire exocytose de son contenu): **C'est le principe de sécrétion régulée!** 6. une fois le signal reçu (dans ce cas un potentiel d'action), la vésicule se fusionne avec mem. plasmique et procède à exocytose des neurotransmetteurs dans la synapse. TOUT ÇA PERMET: maintient de l'homéostasie grâce à la sécrétion consitutive et régulée

Answer 71

2 membranes plasmiques: 1. apicale 2. baso-latérale séparé par les jonctions serrés

Answer 72

via un systeme endosomale baso-latéral et un système endosome apical et donc on va avoir **différents niveaux de tri nécéssaire**

Answer 73

**cellules polarisées**: ont 2 systemes endosomales (1 pour mem, apical et 1 pour mem.baso-latéral). concept/principe: - **endocytose de la membrane plasmique apicale** suivi de transport et **fusion (exocytose) avec la membrane plasmique baso-latéral**. - **BUT:** Permet de **contourner les jonctions serrées** pour transporter à travers la cellule.