Termodinamica Del Metabolismo Flashcards
Che tipo di sistema sono le cellule?
Sistemi isotermi (funzionano a T e P costante)
Quali sono le condizioni standard biochimiche?
pH = 7
[H2O] = 55,5 per le reazioni che coinvolgono Mg2+
[Mg2+] in soluzione = 1 mM
Qual è la reazione che lega ΔG’º alla Keq?
ΔG’º = -RT ln(Keq’)
=> se Keq’ > 1 allora ΔG’º è negativo
A PICCOLE VARIAZIONI DI ΔG’º CORRISPONDONO GRANDI VARIAZIONI DI Keq’
Dimmi l’equazione che descrive l’effetto di massa e cosa comporta
(A = Delta)
AG = AG’° + RT In [C]c [D]d /[A]a [B]b
La quantità di lavoro prodotta da una reazione a temperature pressione costante è sempre minore di quella teorica
In due reazioni sequenziali con un intermedio comune, come calcolo il ΔG’º e la Keq’?
- le ΔG’º delle due reazioni sono ADDITIVE
- le Keq’ sono MOLTIPLICATIVE
Cosa sono elettrofili e nucleofili?
Nucleofili: gruppi funzionali ricchi di elettroni capaci di donarli
Elettrofili: gruppi funzionali poveri di elettroni e che li attirano
Quali sono le 5 reazioni biochimiche più frequenti?
-reazioni che furono dei legami carbonio carbonio o che li spezzano
-riarrangiamenti interni isomerizzazioni ed eliminazioni
-reazioni che coinvolgono radicali liberi
-trasferimenti di gruppi chimici
-reazioni redox
Da cosa sono rese possibili le reazioni che utilizzano Carbanioni o carbocationi?
Dimmi le principali reazioni in cui i leg C-C vengono formati o scissi
Dai gruppi carbonilici o imminici che delocalizzano gli elettroni del carbonio carbonilico,
cosa che può essere ulteriormente favorita da un catalizzatore acido o da uno ione metallico Me2+ come Mg2+
3 classi principali di reazioni nelle quali i leg C-C vengono formati o scissi:
-condensazioni alcoliche
-condensazioni di claisen
-decarbossilazioni
Qual è la caratteristica delle reazioni di riarrangiamenti interni?
La ridistribuzione degli elettroni ha come risultato alterazioni di diverso tipo
SENZA che si verifichi una variazione nello stato di ossidazione della molecola
Come una redox tra gruppi diversi della stessa molecola
Es. : formazione di fruttosio 6-P a partire da glucosio 6-P
in cui il C1 viene ridotto da aldeide ad alcol,
mentre il C2 viene ossidato da alcol a chetone
Fammi esempi di molecole utili in reazioni con radicali liberi
-vit. B12: adensoilcobalammina
-S-adenosilmetionina
Qual è il ruolo delle reazioni di trasferimento di gruppi nel metabolismo?
L’attacco di un buon gruppo uscente o un intermedio metabolico in modo da attivare l’intermedio per le successive reazioni
Esempio:
Pi PPi migliori gruppi uscenti per SN
In genere gruppi fosforilico trasferito da ATP a alcol
Come si chiamano le reazioni di ossidazione in cui un composto perde due e- e due ioni H+?
Deidrogenazioni, catalizzate da deidrogenasi
Quali sono gli enzimi che catalizzano le reazioni in cui un atomo di carbonio si lega covalentemente a un atomo di ossigeno?
-ossidasi
-ossigenasi se l’O deriva direttamente da O2
NB: in queste reazioni l’accettore di e- è l’O
Quali classi di enzimi sono coinvolti nella formazione o scissione di legame covalenti?
- Ligasi: catalizzano reazioni di condensazione in cui due atomi vengono uniti tramite l’energia di idrolisi di ATP o diverse fonti di energia (sintetasi)
- Sintasi: catalizzano condensazione in cui non sono necessari i nucleotidi trifosfato
- Sintetasi: utilizzano condensazione utilizzando ATP o nucleotidi trifosfato
- Liasi: canalizzano la rottura di un legame tra due atomi
Quali enzimi sono coinvolti nel trasferimento di gruppi fosforici?
- Chinasi: trasferisco gruppo fosforico da nucleotidi trifosfato a molecole accettrice (zucchero, nt…) (fosforilazione)
- Fosforilasi: (fosforolisi) il fosfato attacca il substrato e si lega covalentemente al punto di rottura
- Fosfatasi: (defosforilazione) rimozione gruppo fosforile
