Glicolisi

Question 1

Che funzioni hanno i gruppi fosforilici dei 9 intermedi glicolitici?

Answer 1

• impedisce questi escono dalla cellula per la mancanza di trasportatori nella membrana
• conservano energia metabolica
• Il legame di questi al sito attivo di un enzima produce energia di legame che abbassa l’energia di attivazione e aumenta la specificità, i gruppi fosfato formano complessi con Mg2+

Question 2

Particolarità esochinasi

Answer 2

• ne esistono di 4 tipi
• non sono specifiche per il glucosio, fosforilano anche altri zuccheri semplici
• presentano due domini di legame uno per l’ATP (legato a Mg2+) e uno per il glucosio, quando questa specie si legano i domini si avvicinano di 8 Å consentendo la fosforilazione è impedendo l’ingresso di acqua

Question 3

Cosa si forma transitoriamente durante la seconda tappa?

Answer 3

Un enediolo

Question 4

Come è controllata la PFK-1?

Answer 4

È controllata allostericamente da:

• concentrazione ATP, l’attività dell’enzima aumenta quando l’ATP scarseggia o l’ADP e l’AMP abbondano, alta concentrazione di ATP inibisce l’enzima perché simboleggia l’attività di altre vie metaboliche
• fruttosio 2,6-bisfosfato, è un grande attivatore, è il prodotto della PFK-2
• ribulosio-5-P, attiva indirettamente l’enzima, è un prodotto della via del pentosio fosfato

Question 5

Quali classi di aldolasi esistono? Come fa a procedere verso destra la quarta reazione?

Answer 5

• classe I: più presente negli animali e piante
• classe II: presente in funghi e batteri, è assente la formazione di una base di schiff nel meccanismo d’azione

La reazione aldolasica una lavorazione di energia libera standard positiva nella direzione della scissione del fruttosio, alle basse concentrazioni dei reagenti nella cellula variazioni di energia libera e modesta quindi la reazione è reversibile

Question 6

Parami della sesta e settima tappa

Answer 6

• 6ª: il gruppo aldeidico della G3P viene ossidato a gruppo carbossilico impegnato in un legame anidridico con l’acido fosforico, a formare un acil fosfato (AG’º=-49,3), con conseguente riduzione del NAD+
• 7ª: prima fosforilazione a livello del substrato, accoppiata energeticamente alla sesta tappa grazie all’intermedio comune, la reazione complessiva è esoergonica (AG’º=-12,2)
  Per mantenere un delta G negativo, il rapporto d’azione di massa Q deve rimanere inferiore a uno
  Per fare ciò:
• [NADH]/[NAD+] deve rimanere piccolo
• la tappa sette mantiene bassa la concentrazione dell’1,3-bisfosfoglicerato