Tema 2: El laboratori de microbiología clínica Flashcards
Quins són els objectius del laboratori de microbiología clínica?
- Diagnòstic etiològic.
- Informar sobre la susceptibilitat als antimicrobians dels gèrmens aïllats–> elaborar un antibiograma.
- Ajudar al clínic en la interpretació de l’informe del laboratori.
Que es porta a terme en un diagnòstic etiològic?
En aquest diagnòstic es porta a terme una detecció, un aïllament i una identificació del microorganisme.
Defieneix signes
Signes: manifestacions que són objectives i mesurables (febre, zona amb calor, inflamació…)
Defineix símptomes
Símptomes: sensacions que té el pacient (dolor, malestar…)
Defineix síndrome
Síndrome: conjunt de símptomes i signes, quadre clínic. El que ens determinarà d’on extreure la mostra.
Quina és la diferència entre una mostra clínica i un producte patològic?
- Mostra clínica: producte normal (orina, femta…)
- Producte patològic: mostra anormal causada per la infecció (pus, abscés…)
Quines consideracions generals s’han de tenir per portar a terme la selecció i recollida de la mostra?
- Sempre que sigui possible agafar la mostra abans de tractar amb cap antibiòtic.
- Lloc on és més probable trobar el microorganisme responsable amb la menor contaminació externa
possible.
Quins són els 4 pasos d’analsisi d’una mostra?
1- Determinació de la mostra adequada.
2- Obtenció
3- Trasnport
4- Emmagatzematge
Quins són els pasos més importants durant le transport d’una mostra?
- Transport en contanidors estèrils i hermètics.
- Etiquetatge
- Full de petició
De quina manera s’emmagatzema els bacteris i fongs?
- Mostra sense microbiota associada, a temperatura ambient o 37oC
- Mostres amb microbiota associada, a la nevera a 4oC. Ex: orina, LCR
De quina manera s’emmagatzema els virus?
La mostra normalment es congela
De quina manera s’emmagatzema els protozous?
- Tª ambient per veure’ls in situ
- Fixar-los immediatament (solucions fixadores que contenen formol) perquè són molt làbils
De quina manera s’emmagatzema els helmints i artròpodes?
A temperatura ambient es pot conservar bé.
Quins dos tipus de diagnòstics hi han?
Diagnòstic directe i indirecte
Quines metedologies es porten a terme en el diagnòstic directe?
- Microscopia: amb diferents tincions
- Cultiu: per obtenir el microorganisme aïllat.
- Proves ràpides: no es necesiten aparells específics.
Quins tipus d’identificació es porten a terme en el diagnòstic directe?
- Basada en àcids nucleics de la colònia aïllada (APIs, PCRs).
- No basada en àcids nucleics, a nivell fenotípic (MALDI-TOF, microrray, antibiograma)
En que es basa el diagnòstic indirecte?
Mesura la resposta immune que provoca algún microorganisme
Quins dos tipus de detecció hi han en el diagnostic indirecte?
- Detecció antigen (immunocromatografia) i PCR–> directe
- Detecció de la resposta immune que t’ha general la infecció–>indirecte
De que tracta la detecció antigen i PCR?
En la prova d’antígens, tenim anticossos
anti-S (proteïna S), en el cas de que hi hagi presencia del virus, s’enganxaran als
anticossos marcats els quals s’enganxaran i veurem la ratlla del positiu al test. Tenim un anticòs que reconeix un anticòs que estava al líquid, per tant, es marcarà la ratlla del test i es servirà per veure si el test s’ha dut a terme correctament.
De que tracta la detecció de la resposta immune que t’ha generat la infecció–>indirecte
Generalment, aquelles proves indirectes són serològiques, mirem els anticossos. Excepte quan fem proves
com la de la tuberculina on observem la inflamació causada pels macròfags i neutròfils produint interferó
gamma. Per la tuberculosi també es pot fer un test d’aglutinació o un western blot.
Que permet la metagenòmica?
És una eina que permet detectar a l’hora la presencia de molts microorganismes al mateix temps.
Quin és el primer pas a l’btenir una mostra d’un pacient per fer una prova metagenòmica?
El que es fa com a primera fase es preparar una preparació per eliminar el DNA humà. Després depenent del que tinguem/busquem usarem cert sistema informàtic que ens donarà les seqüències del microorganisme.
Que ens permet un diagnòstic sindròmic?
Ens permet que en 3h en una màquina de diagnòstic sindròmic podem tenir el microorganisme causant del sindrome identificat. D’aqeusta manera el pacient que estpa esperant no supondrà una gran despesa economica i no es perdrà temps com passaria en el mètode tradicional.
Quantes PCR multiplex es porten a terme i quans patògens s’identifiquen en un diagnòstic sindròmic?
Es fan 2 PCR multiplex i es mesuren la presència de 45 patògens.