Tema 2: El laboratori de microbiología clínica

Question 1

Quins són els objectius del laboratori de microbiología clínica?

Answer 1

• Diagnòstic etiològic.
• Informar sobre la susceptibilitat als antimicrobians dels gèrmens aïllats–> elaborar un antibiograma.
• Ajudar al clínic en la interpretació de l’informe del laboratori.

Question 2

Que es porta a terme en un diagnòstic etiològic?

Answer 2

En aquest diagnòstic es porta a terme una detecció, un aïllament i una identificació del microorganisme.

Question 3

Defieneix signes

Answer 3

Signes: manifestacions que són objectives i mesurables (febre, zona amb calor, inflamació…)

Question 4

Defineix símptomes

Answer 4

Símptomes: sensacions que té el pacient (dolor, malestar…)

Question 5

Defineix síndrome

Answer 5

Síndrome: conjunt de símptomes i signes, quadre clínic. El que ens determinarà d’on extreure la mostra.

Question 6

Quina és la diferència entre una mostra clínica i un producte patològic?

Answer 6

• Mostra clínica: producte normal (orina, femta…)
• Producte patològic: mostra anormal causada per la infecció (pus, abscés…)

Question 7

Quines consideracions generals s’han de tenir per portar a terme la selecció i recollida de la mostra?

Answer 7

• Sempre que sigui possible agafar la mostra abans de tractar amb cap antibiòtic.
• Lloc on és més probable trobar el microorganisme responsable amb la menor contaminació externa
  possible.

Question 8

Quins són els 4 pasos d’analsisi d’una mostra?

Answer 8

1- Determinació de la mostra adequada.
2- Obtenció
3- Trasnport
4- Emmagatzematge

Question 9

Quins són els pasos més importants durant le transport d’una mostra?

Answer 9

• Transport en contanidors estèrils i hermètics.
• Etiquetatge
• Full de petició

Question 10

De quina manera s’emmagatzema els bacteris i fongs?

Answer 10

• Mostra sense microbiota associada, a temperatura ambient o 37oC
• Mostres amb microbiota associada, a la nevera a 4oC. Ex: orina, LCR

Question 11

De quina manera s’emmagatzema els virus?

Answer 11

La mostra normalment es congela

Question 12

De quina manera s’emmagatzema els protozous?

Answer 12

• Tª ambient per veure’ls in situ
• Fixar-los immediatament (solucions fixadores que contenen formol) perquè són molt làbils

Question 13

De quina manera s’emmagatzema els helmints i artròpodes?

Answer 13

A temperatura ambient es pot conservar bé.

Question 14

Quins dos tipus de diagnòstics hi han?

Answer 14

Diagnòstic directe i indirecte

Question 15

Quines metedologies es porten a terme en el diagnòstic directe?

Answer 15

• Microscopia: amb diferents tincions
• Cultiu: per obtenir el microorganisme aïllat.
• Proves ràpides: no es necesiten aparells específics.

Question 16

Quins tipus d’identificació es porten a terme en el diagnòstic directe?

Answer 16

• Basada en àcids nucleics de la colònia aïllada (APIs, PCRs).
• No basada en àcids nucleics, a nivell fenotípic (MALDI-TOF, microrray, antibiograma)

Question 17

En que es basa el diagnòstic indirecte?

Answer 17

Mesura la resposta immune que provoca algún microorganisme

Question 18

Quins dos tipus de detecció hi han en el diagnostic indirecte?

Answer 18

• Detecció antigen (immunocromatografia) i PCR–> directe
• Detecció de la resposta immune que t’ha general la infecció–>indirecte

Question 19

De que tracta la detecció antigen i PCR?

Answer 19

En la prova d’antígens, tenim anticossos
anti-S (proteïna S), en el cas de que hi hagi presencia del virus, s’enganxaran als
anticossos marcats els quals s’enganxaran i veurem la ratlla del positiu al test. Tenim un anticòs que reconeix un anticòs que estava al líquid, per tant, es marcarà la ratlla del test i es servirà per veure si el test s’ha dut a terme correctament.

Question 20

De que tracta la detecció de la resposta immune que t’ha generat la infecció–>indirecte

Answer 20

Generalment, aquelles proves indirectes són serològiques, mirem els anticossos. Excepte quan fem proves
com la de la tuberculina on observem la inflamació causada pels macròfags i neutròfils produint interferó
gamma. Per la tuberculosi també es pot fer un test d’aglutinació o un western blot.

Question 21

Que permet la metagenòmica?

Answer 21

És una eina que permet detectar a l’hora la presencia de molts microorganismes al mateix temps.

Question 22

Quin és el primer pas a l’btenir una mostra d’un pacient per fer una prova metagenòmica?

Answer 22

El que es fa com a primera fase es preparar una preparació per eliminar el DNA humà. Després depenent del que tinguem/busquem usarem cert sistema informàtic que ens donarà les seqüències del microorganisme.

Question 23

Que ens permet un diagnòstic sindròmic?

Answer 23

Ens permet que en 3h en una màquina de diagnòstic sindròmic podem tenir el microorganisme causant del sindrome identificat. D’aqeusta manera el pacient que estpa esperant no supondrà una gran despesa economica i no es perdrà temps com passaria en el mètode tradicional.

Question 24

Quantes PCR multiplex es porten a terme i quans patògens s’identifiquen en un diagnòstic sindròmic?

Answer 24

Es fan 2 PCR multiplex i es mesuren la presència de 45 patògens.

Question 25

Com s’observen els resultats d’un diagnòstic sindròmic?

Answer 25

Els resultats els analitza un ordinador. Els panells són rèpliques i han de donar 2 de les 3 repeticions positives perquè puguis concloure que el microorganisme s’ha detectat. Obtenim un informe del panell amb els 23 resultats: detectat i no detectat de cada
microorganisme.

Question 26

Quan s’inicia el diagnòstic d’una malaltia infecciosa?

Question 27

Importància de la mostra clínica

Question 28

Per recollir la mostra clínica adequada, prèviament hem de …

Question 29

Que és una síndrome?

Question 30

Perquè en el cas del diagnòstic microbiològic és especialment important el transport i emmagatzematge adequats?

Question 31

Quan conclou el diagnòstic d’una malaltia infecciosa?

Question 32

Quines eines tenim per a reduir el temps de processament de mostres, identificació
i d’informació de resultats en el laboratori de microbiologia clínica?