Taxonomie animale Flashcards
Quelle est la définition de la taxonomie animale?
Branche de la biologie qui a pour objet de décrire les organismes vivants et de les regrouper en entités appelées taxons afin de les identifier, puis les nommer et enfin les classer, et de les reconnaître via des clés de détermination dichotomiques
Quel est l’objectif de la taxonomie?
Distinguer les espèces actuelles et les arranger dans un ordre hiérarchique, c’est-à-dire influencé par la théorie de l’évolution
Qui est le père des taxonomistes?
Carl Von Linné
Quelles sont les deux innovations apportées par Linné?
Nomenclature binomiale
Niveaux hiérarchiques
Quels sont les niveaux hiérarchiques?
Règne
Embranchement
Classe
Ordre
Famille
Genre
Espèce
Qu’est-ce qu’un taxon?
Nom pour désigner un certain niveau hiérarchique
Quelles sont les branches de la taxonomie?
Classification des taxons
Description d’organismes
Recherche fondamentale et appliquée
Qu’est-ce que la classification des taxons?
Reconstitution des relations évolutives
Construction d’arbres phylogénétiques
Qu’est-ce que la description d’organisme?
Décrire et nommer de nouvelles espèces
Distinguer des espèces entre elles
Création d’outils d’identification
QU’est-ce que la recherche fondamentale et appliquée?
Conservation de la biodiversité
Science citoyenne et participative
Quelles sont les règles de base de la conception et l’utilisation des clés d’identification?
Une clé n’est pas universelle, elle concerne seulement un contexte très défini
Il n’y a pas de limites au nombre de taxons pouvant être inclus dans une clé
On suit l’ordre numérique de la clé
Les critères sont dichotomiques (deux choix seulement)
Une clé ne reflète pas la classification des organisme ni leurs relations évolutives
Prioriser des critères de même catégorie (morpho externe, interne)
Quelles sont les étapes de création d’une clé d’identification?
Observer et dresser la liste des caractéristiques morphologiques externe
Placer les caractéristiques en ordre du plus général au plus spécifique
Relier les spécimens à un état pour chaque caractère
Créer la clé d’identification
Tester la clé
Quelles sont les méthodes étudiées pour construire un arbre phylogénétique?
Cladistique
Phénétique
Quel est le synonyme de la cladistique?
Classification phylogénétique
Quel est le synonyme de la phénétique?
Classification numérique
Quels sont les grands principes de la cladistique?
La classification est basée sur la proximité évolutive
Deux taxons apparentés ont un ancêtre commun dans l’arbre
La classification est le reflet de l’évolution et non du degré de ressemblance
Quelle est la différence entre phylogénie et généalogie?
Phylogénie : rapport de proximité évolutive
Généalogie : rapport d’ancêtre à descendant
Qu’est-ce qu’un noeud en cladistique?
Déduction des innovations spécifiques de l’ancêtre présumé, par rapport au design de base
Qu’est-ce qu’une innovations spécifiques en cladistique?
Caractères dérivés génétiques, comportementaux, morphologiques ou autres
Quel est le principe à respecter en cladistique?
Principe de parcimonie
Qu’est-ce que le principe de parcimonie?
La classification la plus probable est celle qui considère le moins de changement évolutifs, elle est fondée sur le caractère improbable des changements évolutifs
Qu’est-ce qu’une convergence évolutive?
Caractères similaires acquis dans deux espèces, mais qui ne provient pas d’un ancêtre commun
Qu’est-ce qu’un caractère homologue?
Caractères qui n’ont pas nécessairement les mêmes formes, mais qui sont issus d’un ancêtre commun
Qu’est-ce qu’un caractère analogue?
Caractères qui ont les mêmes formes, mais qui ne sont pas issus d’un ancêtre commun
Qu’est-ce qu’un groupe monophylétique en cladistique?
Groupe qui contient tous les descendant d’un ancêtre commun, ainsi que l’ancêtre commun
Qu’est-ce qu’un groupe paraphylétique?
Groupe qui contient un ancêtre commun et seulement une partie de ses descendants
Quels sont les étapes de l’analyse cladistique?
Délimitation du groupe d’intérêt
Définition du groupe de référence
Détermination de toutes les combinaisons d’arbres phylogénétiques possibles
Choix des caractères utilisés et identification de l’état ancestral (0) et dérivé (1)
Codage de la matrice des caractères
Évaluation de chaque arbre
Sélection d’un arbre
Dans l’analyse cladistique, quel est le critère de sélection d’un arbre?
Nombre de transformations des caractères (nombre de pas)
L’arbre le plus économique en événements évolutifs est sélectionné (principe de parcimonie)
Quel est le principe de base de la phénétique?
La comparaison d’un grand nombre de caractères (ressemblance) doit refléter l’évolution et conséquemment la phylogénie
Quel type de propriété peut servir de base à la classification phénétique?
N’importe quelle propriété mesurable du phénotype
Qu’est-ce qu’une matrice de distance?
Pourcentage de différence entre les taxons
Quelles sont les étapes de construction d’ne matrice de distance?
Détermination de quelle combinaison de taxon montre le moins de différences
Création d’un nouveau groupe dans la matrice pour recalculer une nouvelle matrice de distance
Construction de l’arbre phylogénétique en fonction des différences de pourcentage calculées
Comment se nomme l’alternative à la cladistique et à la phénétique?
Taxonomie évolutive
Quel est le principe de base de la taxonomie évolutive?
Percée adaptative : nouveaux défis qui mènent à l’évolution d’adaptations radicalement nouvelles, ce qui cause de la radiation adaptative, soit la création de nouvelles espèces
Quelle est la méthode de la taxonomie évolutive?
Incorporation des principes et des méthodes de la cladistique et de la phénétique
Quels sont les avantages de la taxonomie évolutive?
Éviter les conclusions inattendues
Éviter le puritanisme des cladisticiens
Parfait pour la communication scientifique et la vulgarisation
Qu’est-ce qu’un caractère taxonomique?
Attribut quelconque d’un membre d’un taxon par lequel il diffère ou pourrait différer d’un membre d’un taxon différent
Comment se fait le choix d’un caractère?
Dépend de l’information qu’il procure versus sa capacité de résolution ou sa signification évolutive
Qu’est-ce que la résolution d’un caractère?
Le degré d’adaptation du caractère pour le taxon observé
Qu’est-ce que la signification évolutive d’un caractère?
La méthode utilisée (cladistique ou phénétique)
Quelles sont les grandes familles de caractères?
Morphologiques
Écologiques
Biochimiques et moléculaires
Qu’est-ce qu’un caractère morphologique?
Morphologie et anatomie générale (Longueurs morphométriques, comparaison de caractères anatomiques)
Développement embryologique (Stades précoces du développement qui montrent la présence de caractères disparus à l’état adulte)
Qu’est-ce qu’un caractère écologique?
Caractères éthologiques
Niche écologique
Régime alimentaire
Mode de reproduction
Qu’est-ce qu’un caractère biochimique et moléculaire?
Structure des molécules (protéines)
Structure du code génétique (comparaison des séquences d’ADN et de protéines)
Quel est l’objectif des séquences moléculaires?
Déterminer l’ordre d’enchaînement des nucléotides d’un fragment d’ADN donné
Comparer le % de différences entre taxons
Quelles sont les propriétés des données moléculaires?
Caractères simples à analyser (4 a.n. et 20 a.a.)
Grande quantité d’information disponible
Indépendance des caractères (mutations indépendantes)
Poids égal entre les caractères (chaque mutation à le même poids)
Vrai ou Faux : il existe des cas où les caractères morphologiques sont plus précis que les caractères moléculaires
Vrai
Dans le cas des becs-croisés, pourquoi les analyses génétiques sont-elles inefficaces?
Parce qu’il y a de l’hybridation entre les espèces de becs-croisés, donc beaucoup de variabilité génétique
Il faut plutôt observé les différences morphologiques, les différences dans le chant et dans les comportements
Quel est le défi du choix du type de données moléculaires?
Choisir la molécule qui évolue à une vitesse appropriée pour le groupe d’espèces examiné
Qu’est-ce que l’horloge moléculaire?
Les molécules sont des horloges dont les aiguilles tournent à des vitesses inégales
Quel est le meilleur choix moléculaire pour un taxon ancien?
Ne pas utiliser une molécule à évolution rapide, car l’horloge aura fait plusieurs tours au cours de l’histoire qu’on veut retracer
Prioriser une molécule à évolution lente
Quel est le meilleur choix moléculaire pour un taxon récent?
Ne pas utiliser une molécule à évolution lente, car l’horloge n’aura pas enregistré assez de changement
Prioriser une molécule à évolution rapide
Vrai ou Faux : les grands groupes phylogénétiques représentent des taxons récents
Faux
Qu’est-ce que l’ADN mitochondrial?
Une molécule très utilisée pour la recherche phylogénétique
Quels sont les avantages de l’ADN mitochondrial?
Petite molécule d’environ 5 mm
Transmission maternelle, donc pas de recombinaison méiotique (variations en raison des mutations)
Taux de mutation élevé (mutation rapide)
Qu’est-ce que le concept phénétique de l’espèce?
Ensemble d’organismes suffisamment semblables entre eux et suffisamment différents des organismes des autres espèces
Basé sur la similarité phénétique, soit la mesure et la comparaison de caractères
Manque de base cohérente puisque les décisions sont subjectives et arbitraires
Qu’est-ce que le concept biologique de l’espèce?
Ensemble d’organismes interféconds qui procréent entre eux, mais pas avec les membres d’une autre espèce
Quels sont les mécanismes d’isolement reproductif?
Isolement mécanique (incompatibilité génitale)
Létalité des hybrides (bébés meurent ou est infertile)
Isolement éthologique (désintérêt pour l’autre sexe)
Dans quel contexte les concepts phénétiques et biologique ne coïncident pas?
Aucune différence morphologique, mais ne s’hybrident pas, même en laboratoire
Qu’est-ce que le concept par reconnaissance mutuelle de l’espèce?
Ensemble d’organismes qui possèdent leur propre système de reconnaissance de partenaire sexuel
Vrai ou Faux : Le concept d’espèce par reconnaissance mutuelle est une extension au concept biologique de l’espèce
Vrai
Qu’est-ce que le concept écologique de l’espèce?
Ensemble d’organismes adaptés à une niche particulière dans la nature
Quel est le mécanisme de formation des espèces dans le concept écologique de l’espèce?
Populations poussées à constituer des ensembles phénétiques (espèces) à cause des pressions externes (compétition) qui définissent le partage des ressources (exclusion compétitive)
Qu’est-ce que l’anneau d’espèces?
Série géographiquement interconnectée de populations interfécondes, où il existe 2 formes extrêmes aux extrémités de la distribution, empêchant l’hybridation dans la zone où elles coexistent
Qu’est-ce que le polymorphisme trophique?
Plasticité dans l’utilisation des ressources alimentaires
Qu’est-ce que la spéciation sympatrique?
Spéciation possible à l’intérieur d’une même zone géographique, dont la barrière n’est pas physique
Qu’est-ce que la spéciation allopatrique?
Spéciation dont la barrière est physique
Qu’est-ce qu’un exemple de polymorphisme trophique?
Une espèce de poisson qui habite dans deux parties différentes du lac et ont des différences morphologiques en raison de leur alimentation différentielle
Qu’est-ce que le problème des «jeunes» espèces?
Espèces différentes morphologiquement, mais qui ont des cycles de fission et de fusion dans l’hybridation
Qu’est-ce que la notion de sous-espèce?
Ensemble d’individus isolés (pour des raisons écologiques, géographiques, anatomiques) et qui évolue en parallèle des l’espèce de référence
Quels sont les problèmes du concept de sous-espèce?
Concept très arbitraire
Difficulté à définir le moment où une sous-espèce devient une espèce
Terminologie intraspécifique difficile à définir rigoureusement
Qu’est-ce que l’inflation taxonomique?
La découverte et la création de nombreuses espèces dans un temps très court
Quels sont les avantages/désavantages de l’inflation taxonomique?
Possibilité d’obtenir du financement en conservation s’il y a plus d’espèces
Risque de perte de crédibilité
Quelle est la définition la plus convaincante de l’espèce?
L’espèce est un continuum entre les populations
Comment la découverte d’une nouvelle espèce peut-elle être officialisée?
Elle doit être publiée dans une revue scientifique relue par les pairs
Quelles sont les informations à inclure dans le traitement descriptif d’une nouvelle espèce dans un article?
Proposition d’un nom
Détails sur l’holotype
Détails sur les paratypes
Diagnose
Tableau comparatif des principales caractéristiques
Observations
Étymologie
Dans un article scientifique, que doit contenir la proposition du nom?
Nom proposé en latin, suivant la nomenclature binomiale et suivi de la mention sp. nov
Nom anglais proposé
Dans un article scientifique, que doit contenir la section “détails sur l’holotype”?
Musée où il est déposé
Code du spécimen
Sexe
Localité de récolte
Altitude, latitude
Date de récolte
Nom du récolteur
Qu’est-ce qu’un holotype?
Premier individu capturé et souvent tué qui sert à faire la description de la nouvelle espèce
Qu’est-ce qu’un paratype?
Ce sont les individus suivants le premier qui sont capturés et souvent tué pour confirmer les détails de l’holotype
Dans un article scientifique, que doit contenir la diagnose?
Elle doit contenir les caractéristiques qui permettent de différencier cette espèce des autres taxons apparentés
C’est une description qualitative de l’espèce
Dans un article scientifique, que doit contenir le tableau comparatif des principales caractéristiques?
Il doit contenir un comparatif quantitatif de la nouvelle espèce avec les autres espèces des taxons apparentés
Dans un article scientifique, que doit contenir la portion “Observations”?
Habitat
Comportement
Reproduction
Écologie
Dans un article scientifique, que doit contenir la portion “Étymologie”?
Elle doit contenir les raisons qui ont amené le choix du nouveau nom
Est-ce qu’un holotype peut être vivant?
Lorsque les espèces compte peu d’individu, oui
L’holotype est alors tagué et les scientifiques attendent sa mort naturelle
Comment se nomme le site qui présente toutes les règles de présentation d’une nouvelle espèce?
International Code Of Zoological Nomenclature (ICZN)
Comment choisir quel nom conservé lorsque plusieurs espèces sont désignées sous un seul nom ou que plusieurs auteurs ont nommé différemment la même espèce?
Application du principe de priorité, c’est-à-dire que le nom le plus ancien a priorité en cas de conflit
Quelles sont les 3 étapes que doivent respecter l’ICZA pour gérer les cas litigieux?
- Soumission du cas publiquement
- Phase de commentaire où les spécialistes sont invités à se prononcer
- Phase de l’opinion où un verdict est émis par l’ICZN
Quel est le conflit avec les nom d’oiseau éponyme?
Ils désignent des hommes autrefois sanguinaires et on veut retirer tous les noms d’humain et de lieu
Comment fait-on pour intégrer les connaissances autochtones?
On change des noms existants pour inclure les noms qu’ils utilisent depuis des millénaires
Dans quels contexte un biologiste doit validé le nom de son espèce?
Changement de nom fréquent
Guide d’identification désuet
Guide d’identification vulgarisé
Utilisation de régionalismes et de niveaux de langage variés
Quelle est la méthode pratique pour retracer et désigner les bons noms?
- Vérification rapide dans les outils instinctifs (Internet)
- Valider le nom français dans la Liste de la Faune Vertébrée du Québec disponible sur Données Québec
- Valider le nom scientifique dans les bases de données spécifiques à chaque groupe taxonomique
Quelle est la base de donnée spécifique au groupe taxonomique des plantes?
Vascan
Quelle est la base de donnée spécifique au groupe taxonomique des mammifères?
Mammal Diversity Database
Quelle est la base de donnée spécifique au groupe taxonomique des amphibiens?
AmphibiaWeb
Quelle sont les bases de donnée spécifique au groupe taxonomique des oiseaux?
Checklist of bird species de l’American Ornithological Society
Avibase
eBird
CornellLab
Quels sont les avantages de l’utilisation de iNaturalist?
Très bon outil pour la recherche rapide
Couvre tous les taxons
Permet la recherche des noms communs en français
Quel est le désavantage de l’utilisation de iNaturalist?
Les noms français sont souvent des noms pratiquement jamais utilisés
Quels sont les avantages de l’utilisation de ITIS?
Couvre tous les taxons
Permet la recherche des noms communs en anglais et retrace ensuite le nom français
Excellent pour valider les noms scientifiques
Quel est le désavantage de l’utilisation de ITIS?
Bugge souvent quand on lui en demande trop (traits d’union)
Quels sont les rôle de la taxonomie animale?
Aspect légaux
Conservation
Recherche
Quelle est la solution pour définir l’espèce d’un point de vu légal?
Définition large qui inclut les spécificités de certains groupes taxonomiques
Quelle est la définition de l’espèce dans la loi sur les espèces menacées ou vulnérables (Québec)?
Pour l’application de la présente loi, est assimilée à une espèce une sous-espèce, une population géographiquement isolée, une race ou une variété, qu’elle soit faunique ou floristique
Quelle est la définition d’une espèce sauvage dans la loi sur les espèces en péril (Canada)?
Espèce, sous-espèce, variété ou population géographiquement ou génétiquement distincte d’animaux, de végétaux ou d’autres organismes d’origine sauvage
Quel est le but de la définition large de l’espèce juridique?
Identifier et protéger des unités biologiques irremplaçable
Qu’est-ce qu’une unité biologique irremplaçable?
Tout ensemble d’organismes qui présentent soit :
Des différences taxonomiques
Des différences génétique
Des évidences d’adaptation locales
Quels sont les catégories de statut à la L.E.P.?
Non en péril
Préoccupante
Menacée
En voie de disparition
Disparue
Quel est l’objectif de la loi sur les espèces en péril du Canada?
Empêcher la disparition des espèces indigènes, des sous-espèces et des populations distinctes du Canada
Prévoir le rétablissement des espèces en voie de disparition ou menacées
Favoriser la gestion des autres espèces pour empêcher qu’elles ne deviennent des espèces en péril
Plus spécifiquement, qu’est-ce que la loi sur les espèces en péril prône?
Interdiction de tuer, de blesser, de harceler, de capturer et de pêcher des espèces en péril
Illégal de détruire leur habitat essentiel
Qu’est-ce que le ministre doit faire dans la loi sur les espèces menacées ou vulnérables?
Établir des programmes favorisant la survie des espèces à statut, ainsi que la protection et l’aménagement d’habitats déjà existants, le rétablissement d’habitats détériorés ou la création de nouveaux habitats
Quelles sont les actions que peut faire le ministre pour faire appliquer la loi sur les espèces menacées ou vulnérables?
Déléguer à toute personne la réalisation des programmes visés et accorder des subventions à ces fins
Conclure une entente avec toute personne en vue de la réalisation des objectifs de la présente loi
Quel est l’objectif classique de la conservation?
Maintenir le plus grand nombre d’espèces possible
Quelle est l’approche alternative de la conservation?
Considérer l’isolation phylogénétique, l’unicité taxonomique et le parcours génétique unique
Comment devrait se faire la priorisation des efforts de conservation?
Conserver en priorité les espèces qui sont les seules représentantes de leur branche phylogénétique
Qu’est-ce que l’analyse quantitative multicritère?
Une analyse de l’efficacité par la multiplication de plusieurs facteurs tels que les bénéfices, l’unicité taxonomique et la probabilité de succès, divisé par les coûts
