Taxonomía Flashcards
Qué es la taxonomía?
Ciencia que busca dar una categoría o clasificación a los seres vivos
Defina sistemática
Estudio de las relaciones y clasificación de los organismos
Defina taxón
Conjunto en el cuál se agrupa 1 o varios organismos en algo que es común
Defina fenotipo
Conjunto de carácteres visibles que un individuo presenta cómo resultado de la interacción entre su genotipo y el medio
Defina genotipo
Información genética de un organismo, en forma de ADN
Defina Gen
Unidad física y funcional de la herencia, formados por ADN, determina la aparición de carácteres hereditarios
Defina genoma
Conjunto completo de ADN en un organismo
Que es la secuenciación?
Tecnología que permite conocer y descifrar el código genético de todos los seres vivos
Qué hace la filogenia?
Estudia el origen y evolución de los seres vivos
Qué es el árbol filogenético?
árbol que muestra relaciones evolutivas entre varias especies o entidades que según se cree tienen descendencia en común
Defina cepa
Población de microorganismos de una sóla especie descendientes de una única célula o muestra en particular
Qué es la cepa tipo?
Aislamiento original de una bacteria depositada en una colección de cultvio oficial obtenida de uno puro, papel importante en la definición filogenética de bacterias y permite asignar relaciones evolutivas e identificar nuevas especies
Qué es una variante?
Cambio en la secuenciación del ADN de una célula
Describa el PCR
Método de laboratorio que sirve para hacer muchas copias de un trozo determinado de ADN a partir de una muestra que tiene cantidades diminutas de este ADN, con la PCR se amplifica (multiplica este trozo de ADN) para que se pueda detectar
Qué es la metagenómica?
Estudio directo del conjunto de los genomas de un determinado entorno a partir de muestras de este sin necesidad de asilar y cultivar sus especies y enfocándose en la recopilación de información genética a través de las secuencias de su material genético
Describa el proceso de CRISPR
Repeticiones cortas agrupadas y generalmente espaciadas que se generan en el genoma de las bacterias, es como cortar y pegar un trozo de ADN
Cuáles son algunas aplicaciones del proceso de CRISPR?
Modelos de enfermedades, estudiar nuevos fármacos, producir con mayor seguridad plantas transgénicos, proyectos de impulso genético
Cuáles son los diferentes conjuntos de taxones en la vida en la tierra?
Dominio: Archea, bacteria y eukarya
Reino: Animalia, plantae, fungi, protista y monera
Filo o división
Clase
Orden
Familia
Género, subgénero
Especie, subespecie
Cuáles son las 4 reglas establecidas por el sistema lineanobinomial de nomenclatura científica?
-Especie son 2 palabras, género sólo una
-Todo el nombre debe ser diferenciado del resto del texo, mayúscula sólo la primera letra
-Todo nombre se escribe completo y nunca abreviado (sólo si ya lo escribí completo lo puedo abreviar)
-Primero se escribe el género, la primera letra en mayúscula y luego todo en minúscula
Explique brevemente cómo se determina o establece un nombre científico
Puede ser producto de una característo morfológica, fisiológica, localización, dedicatoria, la persona en descubrir una especie es quién le da nombre y es en latín y con las reglas de nomenclatura, deben ser validados por comités para que se convierta en un nombre universal
Mencione las posibilidades de nombre científico en las diferentes condiciones:
-Especie sin identificar: sp, se escribe luego del género
-Especies sin identificar: spp
-Subespecie cómo taxón: ssp
Dé dos ejemplos de especie sin identificar
Candida sp
Moraxella sp
Dé dos ejemplos de especies sin identificar
Shigela spp
Glossina spp
Dé dos ejemplos de subespecie cómo taxón
Klebsiella pneumoniae ssp
Lampropeltis triangulum ssp
Cite 3 aspectos que contempla de taxanomía polifástica
-Fenotípicos
-Genotípicos
-Filogenéticos: Estudio de la evolución y las relaciones dentro o fuera de grupos de microorganismos
Defina clasificación genotípica:
Compara similitud genética en microorganismos, se pueden comparar genes individuales o genomas completos, ha sido aceptado que los procariotas cuyos genomas son 70% homólogos pertenecen a la misma especie pero no se basa en consideraciones teóricas sobre la identidad de las especies
Cuáles son los reactivos a utilizar en la PCR?
Taq polimerasa, iniciadores, ADN y nucléotidos, estos se colocan en un tubo y se meten en un termociclador
Cuál es la primera etapa del proceso de PCR?
Desnaturalización: 96C, reacción se calienta bastante para separar o desnaturalizar las cadenas de ADN, esto proporciona los moldes de la cadena sencilla para los siguientes pasos
Cuál es el segundo paso del proceso de PCR?
Templado, la reacción se da 55-65 C, se enfría para que los iniciadores puedan unirse a sus secuencias complementarias en el molde de ADN de cadena sencilla
Cuál es la tercera etapa en el proceso de PCR?
Extensión: Se da a 72 C, temperatura se eleva para que la taq polimerasa extienda los indicadores y sintetice así nuevas cadenas de ADN
Cómo se visualizan los resultados de PCR?
Se repite el proceso unas 25-30 veces, se pueden obtener millones de copias en 4h y se visualizan en la electroforesis en gel
Dé una breve explicación qué es la prueba PCR en tiempo real (qPCR)
La acumulación de ADN es cuantificado a medida que va pasando la reacción avanza, se logra incorporando una molécula fluorescente que se asocia al ADN amplificado, es cuantitativa, permite saber cuánto molde se convierte en ADN con la transcriptapasa inversa
Dé dos características de qPCR
-Fluorescencia aumenta a medida que se acumulan los productos de PCR durante ciclos iniciales
-Se utilizan termocicladores diseñados específicamente para PCR en tiempo real que registra la cantidad de producto PCR generado a medida que sucede
Cómo se realiza la qPCR?
-Muestras se recolectan son isopo nasofaríngeo
-Una vez realizada la prueba, es colocado en un tubo estéril que tiene un medio de transporte viral, el método estándar para testear coronavirus es PCR
Cómo se desarrollan estudios filogenéticos en la actualidad?
Con base en árboles filogenéticos moleculares basados en ARN ribosomal, pero también sobre la base de proteínas y genes
Cual es el principal factor que dificulta saber la filogenia de una bacteria?
Transcuencia genética
Qué es la taxonomía numérica ?
Clasifica organismos basada en su fenotipo, no en su evolución, se clasifican en el mismo grupo los organismos con la mayoría de similitudes
Cuales son los criterios de clasificación bacteriana?
Crecimiento en medios de cultivo
Microscópia bacteriana
Bioquímica
Serológica
Inestabilidad genética
