Synthèse et utilisation de polysaccharides bactériens Flashcards
Les systèmes sucrases dépendants sont-ils pour la production intra ou extracellulaire?
Est-ce qu’on retrouve ce système chez les Gram+ ou Gram-?
Extracellulaire. Chez les gram+ et Gram-.
Décrivez le fonctionnement d’un système sucrase-dépendant.
Il y a 2 copies d’une enzyme qui a le sucrose (fructose-glucose) comme substrat. En présence de sucrose, cette dernière va se fixer aux sites de liaisons de l’enzyme, et l’enzyme va hydrolyser la liaison entre les deux sucres (glucose-fructose). Le fructose sera libéré, et le glucose sera maintenu au site. Avec chaque molécule de glucose générée, l’enzyme peut polymériser les monomères de glucoses. Ensuite, le polymère est libéré, et il peut y avoir ajout d’une protéine accepteur pour générer le produit.
Donnez 2 exemples de molécules produites par des systèmes sucrase-dépendant, et l’enzyme qui catalyse la réaction de polymérisation
Dextran : polymère de glucose : dextransucrase.
Levan : polymère de fructose : levansucrase.
Comment la levansucrase est-elle activée?
Elle est produite dans le cytoplasme, puis sécréée dans la membrane interne de la bactérie. À ce moment, il y a un changemnet de conformation de l’enzyme, et une activation subséquente. L’enzyme est ensuite envoyé dans l’environnement extérieur, ou il est fonctionnel, et peut interagir avec les unités de sucres pour faire la rx de polymérisation.
Nommez les 3 systèmes de synthèse de polysaccharides intracellulaire. Spécifiez la plus commune chez les bactéries
- Systèmes synthase-dépendants
- Systèmes ABC transporteurs dépendants
- Systèmes Wzx/Wzy dépendants (+ commune).
Expliquez globalement le système synthase-dépendant.
- Quel type de polymères formés
- Comment la polymérisation se fait
- Régulation
- Sécrétion
Permet la synthèse d’homopolymères.
La polymérisation (cytoplasme) et la sécrétion sont couplés par l’Addition d’un sucre. En d’autre termes, quand on ajout un sucre à la base, le polymère est poussé vers l’extérieur.
Parfois, la régulation de la synthase peut se faire par un récepteur de c-di-GMP.
La sécrétion est médiée par une proéine TPR dans le périplasme, et un B-barrel dans la membrane externe.
Nommez 2 exemples de systèmes synthase-dépendants.
- Alginate (m-bloc, g-block, MG-blocks)
- Acide hyaluronique
Expliquez globalement le système ABC-transporteur-dépendant
- Comment la polymérisation se fait
- Sécrétion
La biosynthèse de faire sur un lipide de type C55, dans le cytoplasme. Les monosaccharides sont ajoutés au terminus distal du polymère, donc à l’opposé de la membrane. Quand la longueur est atteinte, l’ATP est essentiel pour le transport à la surface, via un canal OPX dans la membrane externe.
Nommez 2 exemples de systèmes ABC transporteur dépendants.
AgO et capsule bactérienne.
Expliquez globalement le système Wzx/Wzy dépendant.
- Quel type de polymères formés
- Comment la polymérisation se fait
- Régulation
- Sécrétion
- Synthèse d’hétéropolymères.
- La biosynthèse se faire sur un lipide C55 dans le cytoplasme, avec un repeat de 3 sucres. Chaque repeat est transporté par une flippase Wzx à travers la membrane interne, pour atteindre le périplasme.
- La polymérisation se fait du côté du périplasme de la membrane interne. Les repeats sont ajoutés en bas du polymère.
- La régulation de la longueur est faite par des protéines PCP.
- La sécrétion se fait via un canal OPX dans la membrane externe.
Nommez 2 exemples de systèmes Wzx/Wzy dépendants
- AgO et gomme de xanthane.
À quoi sert le système Rcs et comment fonctionne-t-il?
Le système Rcs a été identifié chez E.coli comme un régulateur positif de la synthèse d’un exopolysaccharide : l’Acide colanique.
RcsC est le senseur membrannaire (kinase hybride) et RcsB est le régulateur.
Au début RcsC recoit un signal (qui peut venir de RcsF à la membrane), et son His est phosphorylé. Le P est transféré au domaine receveur de RcsC (Asp). Le domaine senseur de RcsD est phosphorylé, puis le domaine receveur de RcsB est phosphorylé. RcsB-P peut activer l’expression de plusieurs gènes. Lorsque RcsA est aussi produite (régulateur instanle), il peut y avoir l’activation de la synthèse de l’acide colanique.
Comment le système Rcs est-il activé?
Chocs osmotiques, déshydratation, traitement qui affectent l’integrité de la IM ou OM (LPS).
Un senseur membranaire possède 5 parties. Nommez les.
1- Domaine senseur périplasmique. 2- Hélices TM. 3- Domaine de transduction du signal 4- Domaine senseur cytoplasmique 5- Domaines catalytiques & DHp.
Quel est le rôle du domaine senseur périplasmique dans le senseur du SDC.
Nommez les 3 types de domaines possibles et dites le plus commun.
interagit directement avec le signal avec son domaine extracellulaire.
- Domaine PAS (+ commun)
- Domaine tandem PAS
- Domaine complètement hélicoïdal.
