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MBA6023- Génétique des mo industriels > Cours 5 : systèmes de sécrétion > Flashcards

Cours 5 : systèmes de sécrétion Flashcards

1
Q

Quel type de bactéries sont généralement associées au TSS7?

A

Les mycobactéries.

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2
Q

Que veut dire TAT

A

Twin Arginine translocation

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3
Q

Quels systèmes peuvent 1 seule membrane?

A

sec, Tat, T2SS, T5SS

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4
Q

Quels systèmes peuvent être communs aux G+ et G-?

A

Sec/Tat

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5
Q

Comment fonctionne le système SRP/SR?

A

Srp reconnait des séquences très hydrophobes (souvent des protéines de la membrane) directement au niveau du ribosome. Cette association bloque la traduction jusqu’à l’association avec le récepteur de SRP (SR), qui se nomme FtsY et qui est une GTPase. Après, le signal passe dans le SecYEG qui est le canal, et peut être intégrée à la membrane.

Le ribosome pourrait aussi aller à YidC qui est un canal conducteur de protéines, avec ou sans SRP

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6
Q

Comment fonctionne le système SecB/SecA?

A

Ce système est retrouvé seulement chez les Gram-.

SecB reconnait une protéine qui sort du ribosome, pas encore repliée, pour que tout aille au bon endroit. Sec A permet ensuite de faire le lien entre le canal SecYEG et SecB grâce à l’ATP.

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7
Q

Le système Sec transporte-t-il des protéines pliées ou dépliées?

A

Dépliées.

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8
Q

Le système Tat transporte-t-il des protéines pliées ou dépliées?

A

Pliées.

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9
Q

Comment fonctionne le système Tat? Avec quelle source d’énergie?

A

TatBC reconnaissent la protéine repliée avec son motif RR en N-terminal, et vont ensuite la sécréter à travers le canal TatA grâce à de l’énergie exclusivement générée par la force protomotrice.

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10
Q

Qu’est-ce que le système sortase? Chez quel type de bactéries on le retrouve?

A

Les systèmes sortases reconnaissent des motifs (LPXTG en N-Term, et un C-terminal hydrophobe avec une queue d’acides aminés positifs) associés à la membrane. Permet de faire des ajouts qui permettent la liaison avec les acides aminés associés à la paroi. On se retrouve à avoir des protéines ancrées à la membrane grâce aux sortases, après leur passage dans le canal sec.

Chez les Gram+!

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11
Q

Nommez les deux systèmes qui sont Sec-dépendants.

A

T2SS et T5SS.

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12
Q

Quels sont les facteurs de virulence et substrats majoritairement sécrétés par le TSS2?

A
  • Enzymes

- Toxines.

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13
Q

Quel est le lien entre le TSS2 et sec?

A

La protéine est transportée à travers le système Sec, la protéine est repliée dans le périplasme, et est ensuite envoyé dans le TSS2 ou il peut traverser la OM à travers PulDS.

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14
Q

Quelle structure bactérienne possède une forte analogie avec le TSS2?

A

Le pili de type IV.

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15
Q

Le TSS5 possède 2 groupes. quels sont-ils?

A

Autotransporteur (AT) et TPS (Two-partner secretion),

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16
Q

Comment fonctionne les protéines autotransporteur du Tss5, et comment sont-elles structurellement?

A

Ce sont des protéases diverses.

  • Il y a un peptide signal, qui transporte la protéine dans le périplasme par le système Sec.
  • En N-terminal, fonction autotransporteur.
  • Domaine B : qui permet de faire une pore dans la OM pour transloquer l’autotransporteur à la surface de la membrane externe.

Selon la condition, il peut y avoir un ancrage dans la membrane, ou sortir seulement une partie de la protéine, et être clivé pour être relâché dans l’environnement.

17
Q

La formation de fimbriae et curlis sont-ils dépendant de sec?

A

Oui!

18
Q

Comment se forme un fimbriae?

A

Les chaperones et placiers (usher) agissent ensemble pour permettre le bon placement et l’affinité à la membrane externe des protéines qui ont été transloqué avec Sec. On commence ensuite à faire la grande structure en assemblant les sous-unités.

19
Q

Quelle est la différence entre la formation des fimbriae et des curlis?

A

Les protéines qui se fixent sont très autoaggrégatives, et se fixent directement à la OM.

20
Q

Quels facteurs de virulence sont exportés par le T1SS?

A

Toxines de types RTX (haemolysines, cytotoxines, leukotoxines, etc…).

21
Q

Comment fonctionne le système T1SS?

A

Le peptide signal est reconnu mais pas clivé en C-TERM, par le transporteur ABC (HlyB), qui fournit l’énergie nécessaire pour le transport. HlyD a un role périplasmique, et TolC est un tunnel-canal, qui permet la sécrétion de plusieurs protéines de plusieurs systèmes (pas spécifique). Quand TolC interagit avec le ligand, il change de conformation et permet le passage des protéines. Après, le canal se referme.

22
Q

À quoi ressemble le T1SS? Avec quoi a-t-il des similitudes?

A

Avec les systèmes d’efflux de drogues.

23
Q

Comment a été découvert le T3SS?

A

Avec les Yersinia Outer Proteins (Yop).

24
Q

Que peut exporter le T3SS?

A

Des protéines espèces-spécifiques avec des fonctions spécifiques, comme des GAP, GEF, Rho, Rac, Cdc42, ou pour manipuler l’entree dans la cellule.

25
Q

À quoi le T3SS est-il homologue?

Quelle est sa structure?

A

Au corps basal des flagelles des gram+ et -

Traverse la IM et la OM avec 2 séries d’anneau et une aiguille moléculaire très longue. L’aiguille est formée de protéines sécrétées par le T3SS elle-même.

26
Q

Comment fonctionne le T3SS?

D’ou viens l’énergie?

A

Le T3SS traverse 3 membranes, sans intermédiaire périplasmique. Il fonctionne comme une seringue : Les protéines sécrétées traversent le diamètre de l’aiguille, jusqu’à ce qu’un pore soit créé par le bout de l’aiguille.

L’énergie viens de l’ATPase et d’une force protomotrice.

27
Q

qu’exporte le T4SS?

A

transfert d’ADN ou de plasmides pour la conjuguaison, en plus de facteurs de virulence pour les plantes et les humains.

28
Q

À quoi ressemble la séquence signal du T4SS?

A

C-terminal, région hydrophobe, et charge nette positive due à une alternance d’arginine.

29
Q

Quelles sont les protéines sécrétées par le T6SS? À quoi ressemble-t-il?

A

Les protéines Hcp (tube-like) et VgrG (trimères qui pourraient agir pour poncturer). Possible lien avec l’internalisation.

30
Q

À quoi ressemble le T6SS?

A

À un phage inversé.

31
Q

Comment est exportée ESAT-6?

A

C”est un facteur de virulence clé chez M. tuberculosis, qui est sécrété par un mécanisme sec-indépendant.
Il se lie à CFP-10 qui est aussi sécrété. Les gènes flanquant ces deux protéines sont requis pour leur sécrétion : Système Snm, puis système Esx puisqu’il a été découvert chez d’autres bactéries.

32
Q

Le peptide signal est-il en N-term ou en C-term pour sec et Tat?

A

En N-terminal.

33
Q

Quel genre de peptide est reconnue par SRP?

A

Des protéines très hydrophobes, dont généralement de la membrane.

34
Q

Quelle partie de la protéine reconnait secB?

A

Une pré-protéine mature, pas le peptide signal en N-terminal.

35
Q

Ou est le peptide signal de T1SS?

A

En C-terminal.

36
Q

Ou est le peptide signal de T2SS?

A

Pas de signal clair.

MBA6023- Génétique des mo industriels (3 decks)

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