Synthèse Et Trafic Des Protéines Partie 1 Flashcards
Vrai ou faux : l’initiation de la traduction débute toujours dans le cytosol
Vrai
Quels sont les deux cas de traduction possibles ?
A quel type de protéine correspond chaque traduction ?
- Entièrement cytosolique : pour les protéines cytosolique ou les protéines destinée à être importées dans un organite
- débute dans cytosol et termine dans le RER : pour les protéines transmembranaires, sécrétées ou destinées à être transportées vers d’autres compartiments du système endomembranaire
PROTÉINE CYTOSOLIQUE :
Quels sont les deux types de chaperons cytosoliques ?
Les chapronines à chambre : gros complexe
Protéines type HSP : petites protéines isolées
PROTEINES CYTOSOLIQUES :
Quels types de modifications co et post traductionnelles peuvent subir les protéines ?
- phosphorylation
- déphosphorylation
- methylation
- carboxylation
- sumoylation (création liaison covalente entre lysine et protéine SUMO)
- ubiquitination
- ajout de chaîne lipidique (permet au protéines de devenir des protéines intrinsèques)
Dans quel type de cellule les RER est il très abondant ?
Dans les cellules sécrétant beaucoup de protéines
Avec quels organites le RER est il en continuité ?
Avec l’enveloppe nucléaire et la membrane du REL
PROTÉINES RER :
Vrai ou faux : la translocation des protéines jusqu’au RER est post traductionnelle
Faux : elle est co traductionnelle
PROTÉINE RER :
Qu’est ce que le peptide signal ?
Où se situe-t-il n fonction du type de protéine ?
Le peptide signal est une séquence d’aa qui fait partie intégrante de la séquence de la protéine native
Dans les protéines solubles : il est proche de l’extrémité N term
Dans les protéines transmb : il est au niveau des séquences internes hydrophobes
PROTÉINES RER :
Quels sont les 3 acteurs de la translocation co-traductionnelle de la protéine ?
Le SRP, le récepteur du SRP et le Translocon
PROTÉINES RER : Concernant le SRP : Quelle est sa nature ? Son activité est elle ATPasique où GTPasique ? Quelle est sa fonction ?
C’est une ribonucléoprotéine
Il possède une activité GTPasique
Il reconnaît le peptide signal et contrôle son arrimage à la face cytosolique du RER
PROTÉINES RER :
Concernant le récepteur du SRP :
Où se situe-t-il ?
Quel est son rôle ?
Il est ancré à la membrane du RER
Il permet la liaison du SRP au niveau du RER
PROTÉINES RER :
Concernant le Translocon :
Quelle est sa nature ?
Où est il situé ?
C’est un complexe multiproteique à plusieurs domaines transmembranaires
Il se trouve sur la membrane du RER et forme un canal aqueux
Vrai ou faux : un polyribosome permet de traduire en même temps plusieurs ARNm
FAUX : le polyribosome permet la traduction d’UN SEUL ARNm
PROTÉINES RER :
Décrivez la translocation co-traductionnelle en 5 étapes :
1- Reconnaissance peptide signal par SRP + fixation SRP sur son récepteur
2- Arrimage du ribosome en cours de traduction à extrémité du Translocon fermé
3- Ouverture du canal du Translocon + traduction de la protéine à travers le canal
4- hydrolyse GTP de SRP en GDP
5- recyclage du SRP
PROTÉINES RER :
Comment se passe la traduction de la protéine à travers le Translocon pour les protéines SOLUBLES ?
A) traduction de la protéine dans le canal la pousse dans la lumière du RER + reconnaissance du peptide signal dans le canal = formation d’une boucle au sein de la protéine
B) inclusion du peptide signal dans la bicouche lipidique
C) quand traduction terminée : excision du peptide signal par signal peptidase et est hydrolysé
La protéine possède une nouvelle extrémité Nterm
PROTÉINES RER :
Comment se passe la traduction à travers le Translocon pour les protéines TRANSMEMBRANAIRES ?
A) chaque séquence hydrophobe interne est reconnue par le SRP. La translocation s’arrête quand le Translocon a reconnu le peptide signal
B) peptide signal est transféré latéralement sur la membrane
C) domaine N-term côté cytosolique : boucle dans le Translocon lors de la traduction
Comaine C term côté cytosolique : pas de formation de boucle dans le Translocon lors de la traduction
PROTÉINES RER :
Quelles modifications co-traductionnelles peuvent subir les protéines dans la lumière du RER ?
Quel est le rôle de chaque modification cotrad ?
1) Ajout d’un glycosylphosohatidylinositol : GPI
GPI : structure complexe synthétisée avant d’être ajoutée aux protéines
Rôle : ancrage pour les protéines intrinsèque extra cellulaire
Consomme de l’ATP
2) N glycosylation
Se fait sur l’asparagine de la protéine traduite si l’asparagine est contenue dans une séquence : Asp-X-Ser ou Thr
PROTÉINES RER : Concernant le contrôle qualité : Quel est son objectif ? Par quel type de protéine est il réalisé ? Quel est le rôle de ces protéines ?
L’objectif du contrôle qualité est de contrôler le repliement des protéines
Il est réalisé par des protéines chaperons
Les protéines chaperons :
- protègent les protéines d’un mauvais repliement
- réarrangent les ponts disulfures
- aident assemblage des protéines multimeriques
PROTÉINES RER :
Quelles sont les protéines assurant le contrôle qualité dans le RER ?
Bip, PDI et les Lectines : calnexine et calréticuline
PROTÉINES RER : Concernant la protéine Bip : De quelle nature est elle ? Comment interagit elle avec les protéines natives ? Quel est son rôle ? Quelle source d’énergie utilise t elle ?
Elle appartient à la famille des HSP70
Elle se lie aux domaines hydrophobes de la protéine native
Elle réalise des cycles successifs de liaison et de détachement jusqu’à ce que tous les domaines hydrophobes soient enterrés à l’intérieur de la protéine
Elle utilise l’ATP
(Nb: c’est la plus abondante dans le RER)
PROTÉINES RER :
Concernant la protéine PDI :
Quel est son rôle ?
Catalyse la formation des ponts S-S entre les cystéine où elle les réarrange s’il ont été formés de façon incorrecte
PROTÉINES RER :
Concernant les lectines ?
Quelle est la différence entre les calnexine et les calréticuline ?
La calnexine se trouve sur la membrane du RER
La calréticuline se trouve dans la lumière du RER
PROTÉINES RER :
Concernant les lectines :
Pour quelles protéines ont elle de l’affinité ?
De quoi dépend leur fonctionnement ?
Quels acteurs enzymatiques entrent en jeu ?
Elles ont de l’affinité pour les glycoprotéines ne portant qu’un glucose distal
Leur fonctionnement dépend de la présence de Ca2+
Les acteurs enzymatiques entrant en jeu sont:
- l’ERP57 qui catalyse la formation des ponts S-S
- l’UGGT qui distingue les protéines correctement pliées des autres
PROTÉINES RER :
Quel est le mécanisme de la calnexine en 5 étapes ?
1) reconnaissance d’une glycoprotéine par une glucosidase de type I : enlevé des glucoses jusqu’à ce qu’il ne reste qu’un glucose distal
2) glycoprotéine avec 1 glucose distal est reconnu par la calnexine
3) la calnexine recrute ERP57 : déplie la protéine
4) expulsion du glucose distal par la glucosidase de type II = repliement de la protéine
5) repliement correct : protéine perd son mannose et est exporté vers le Golgi
5’) repliement incorrect : protéine reconnue par UGGT qui lui fixe un glucose distal et le cycle recommence
5’’) repliement définitivement incorrect : protéine perd son mannose et quitte le RER par translocation rétrograde et est adressée au protéasome (ceci est une DARE : dégradation associée au reticulum endoplasmique)
PROTÉINES RER :
Concernant la réponse aux protéines mal pliées ou UPR :
Qu’est ce qui l’enclenche ?
Dans quelles cellules a t elle un rôle important ?
L’accumulation de protéines mal pliées dans le RER active les 3 voies de signalisation de l’UPR
Elle a un rôle important dans les cellules qui sécrètent beaucoup de protéines
PROTÉINES RER :
Quels sont les objectifs de l’UPR ?
Diminuer la synthèse des protéines
Augmenter la synthèse des protéines chaperons
Aider le RER à récupérer son homéostasie
PROTÉINES RER :
Quelles sont les 3 voies de signalisation de l’UPR ?
De quelles natures sont elles ?
Qu’est ce qui les inactive ?
PERK
ATF-6
IRE-1
Ce sont des protéines transmembranaires du RER
Elles sont inactives lorsqu’elles sont coiffée par Bip
PROTÉINES RER :
Quelles sont les conséquences de l’activation de PERK ?
PERK se dimérise et s’autophosphoryle
- inhibition de 95% de le synthèse des protéines
- induction synthèse ATF-4
ATF-4 = facteur de transcription
—> migration dans le noyau -> transcription gènes de l’UPR
PROTÉINES RER :
Quelles sont les conséquences de l’activation de IRE-1 ?
IRE-1 se dimérise et s’autophosphoryle
- induction epissage de l’ARNm codant pour HBP1
HBP1 mature = facteur de transcription
—> migration dans le noyau du facteur de transcription -> transcription des gènes de l’UPR
PROTÉINES RER :
Quelles sont les conséquences de l’activation de ATF-6 ?
ATF-6 migre dans Golgi : est activé par clivage
ATF-6 actif = facteur de transcription
—> migration de ATF-6 activé dans le noyau -> transcription des gènes de l’UPR
