Structure du génome (cours 4) Flashcards
Qu’est ce qu’un gène?
Ensemble de segment d’acide nucléique contenant l’info nécessaire pour produire un ARN (un transcrit) fonctionnel de façon contrôlé
est ce que dire qu’un gène = une protéine est une bonne définition?
Non Parce que peut codé pour autre chose.
On dit plutôt que c’est un transcrit
C’est les séquences contrôlant la production de ce transcrit
Vrai ou faux?
Un gène est un caractère transmissible.
Vrai
Qu’est ce qu’un opéron?
Un regroupement de plusieurs gènes
Qu’est ce qu’un polycistronique?
Un cistron est une séquence codante.
Donc c’est plusieurs séquences codante pour une protéine
On retrouve des polycistroniques chez quels individu?
Chez les bactéries
Différemment de chez les bactéries (procaryotes), les eucaryotes ont un gène code pour une seule protéines. Comment est ce qu’on appelle cela?
Monocistronique
Vrai ou faux?
L’ADN des eucaryotes est discontinu.
Vrai
présence d’intron
Qu’est ce qu’un génome?
l’ensemble des informations contenues dans l’ADN
Séquence nécessaire pour coder tous les ARN
Qu’est ce que la différence entre les chromosome des eucaryotes et procaryotes?
eucaryote -> ADN est réparti dans u ensemble de chromosome différent
Procaryote -> tous leur gènes sur un seul chromosome circulaire
Vrai ou faux?
ADN n’est condensé sous la forme de chromosome seulement lors de la mitose.
Vrai
Lors de l’interphase, l’ADN est sous quelle forme?
sous forme de filament dans le noyau qu’on appelle chromatine
Vrai ou faux?
Peut importe l’espèce l’ADN est liée à plusieurs protéine (en chromatine)
Vrai
Qu’est ce qu’un plasmide?
de petit ADN circulaire indépendant du chromosome chez les bactéries
Qu’est ce que contient les plasmides?
Pas des gènes important pour la croissance.
Confère seulement un caractère avantageux
Vrai ou faux?
Les mitochondries et les chroloplastes portent leur propre génome.
Vrai
Où se retrouve les copies de l’ADN mitochondiral?
dans le stroma
Est ce que la taille de l’ADN mitochondrial est invariable?
Non
Il est variable
Est ce vrai que même un organisme diploïde contient des cellules haploïdes?
Oui! les gamètes
Est ce qu’il est possible que des cellules soient polyploïdes?
Oui! les plaquettes sanguines
Nommes les 3 division majeures du règne du vivant.
- Bactérie (génome circulaire)
- Archéobactérie (circulaire mais semblable aux eucaryotes)
- Eucaryote (chromosomes linéaires)
La grosseur du génome est proportionnel à …
la complexité de l’individu (dans évolution)
Quel est le bémol concernant la grosseur du génome?
Le nombre de gènes codés par les gros génomes croit beaucoup moins rapidement
(gros génome mais bcp d’introns)
Quel est l’effet de l’accroissement des génomes mais pas des gènes codés?
la densité génique est de plus en plus faible au fil de l’évolution
Les chromosomes alignés dans une cellule font combien de mètre de long?
2m
Quel est la grosseur d’un noyau cellulaire?
10-15um
Les protéines qui enroulent l’ADN représentent quelle proportion de la masse des chromosomes?
1/2
Qu’est ce que la chromatine?
l’ADN + les protéines qui lui sont associées
Comment appelle-t-on les protéines de la chromatine?
Histones
= petite protéines basiques
Vrai ou faux?
La réduction en chromatine interfère avec la réplication, la réparation, la recombinaison et la transcription de l’ADN.
Vrai
comment s’appelle la structure empacté du chromosome circulaire d’un procaryote?
Nucléoïde
Est ce que les bact. contiennent des histones?
NON
Mais d’autre petites protéines basiques
En interphase, l’ADN se présente sous 2 formes de chromatine…
Les fibres condensée 30nm
Les fibres étendues 10nm
Un nucléosome contient combien d’histone?
8
l’ensemble des nucléosomes forment la chromatine
Combien de pb ça prend pour faire un tour d’histone?
147 pb (environ 150pb)
l’ADN reliant chaque nucléosome est appelé…
intercalaire
Chaque noyau d’histone contient…
2 dimères et 1 tétramère
Les histones contiennent un fort pourcentage de…
d’acide aminées chargée positivement ce qui leur permet d’interagir avec l’ADN chargé négativement
Comment s’assemble les nucléosomes?
Le tétramère H3H4 se lie à ADN
2 dimères (H2AH2B) se joignent au complexe
Comment se nomme la longue extension N-terminale des histones?
Queue
Elles permettent de rapprocher encore plus l’ADN en faisant des spirales ou en zigzag.
Vrai ou faux?
L’affinité des histones pour l’ADN est très grande.
Vrai
Vrai ou faux?
La liaison des histones à ADN déforme la double hélice
Vrai
Est ce qu’il y a spécificité de séquence dans la liaison des histones à l’ADN?
Non
Les intéreaction sont avec le squelette de l’ADN
(Peut s’attacher n’importe où pas obligé d’être avec le sillon majeur)
Combien de point de contact ADN-histone à l’intérieur d’un nucléosome?
14 points
Un pour chaque fois que le sillon mineur fait face au noyau
140 lien hydrogène et 7 avec les bases du petit sillon
l’ADN se réplique toujours selon un modèle…
Semi-conservateur
Comment la polymérase reconnait le bon nucléotide où s’introduire?
la géométrie de la double hélice
Comment contrer les ribonucléotides (ARN) qui sont en bcp plus grand nombre que les désoxyribonucléotide (ADN)?
La présence de l’OH en 2’ exclut les ribonucléotides qui ne peuvent s’aligner correctement
Nomme un synonyme de ADN polymérase.
Télomérase
Est ce que la polymérase peut cliver un lien pour retirer un nucléotide?
Oui
Se nomme l’activité exonucléase
Quelle enzyme est impliquée dans la synthèse de l’amorce?
la primase
Qu’est ce que la primase?
c’est une ARN polymérase
Explique la synthèse de l’amorce…
Elle ajoute des courte séquence ARN sur le brin matrice.
les ribonucléotide de l’amorce seront remplacé par des désoxyribonucléotides
Qu’est ce que les fragment d’okazaki?
les fragments du brin discontinu
Quelle enzyme dégrade les ARN de l’amorce dans le but de les remplacer par de l’ADN?
la RNase H
Est ce que la RNase retire tous les nucléotides de l’amorce?
Non, sauf le dernier
Quelle enzyme retire le dernier nucléotide de l’amorce?
exonucléase 5’
Qui qui rajoute les ADN après avoir retirer l’ARN de l’amorce par la RNase et exonucléase?
l’ADN polymérase comble la brèche
Explique le fonctionnement de la ligase…
elle attache deux fragment d’ADN en reformant une liaison phosphodiester entre 2 nucléotides adjacents
Quelle enzyme ouvre la double hélice d’ADN?
l’hélicase
Vrai ou faux?
l’hélicase se fixe sur l’ADN simple brin?
vrai
Qu’est ce que l’hélicase brise?
les ponts H entre les deux brins
Qu’est ce qui se fixe au brin libre pour le maintenir après que l’hélicase soit passée?
les protéines de liaison à l’ADN simple brin (SSB)
Qu’est ce qui aide la polymérase à rester sur le brin matrice?
le complexe clamp
Explique l’origine de réplication des bactéries…
Un seul endroit où un gros complexe protéique se fixe pour être capable d’attirer l’hélicase
Explique les deux choix expliquant a réplication de l’ADN (par rapport a l’oeil d’origine)…
1) 2 enzymes sur la même origine de réplication, part dans les 2 directions différentes
2) Modèle projecteur = l’ADN défile au milieu du complexe et les enzyme ne bougent pas
Qu’est ce qu’une ribonucléoprotéine?
un complexe formé d’un ARN et une protéine
Comment est ce que les télomère sont ajouté par la télomérase?
Elle utilise sa partie ARN comme patrice pour allonger l’extrémité 3’ des chromosomes
Vrai ou faux?
La télomérase est active dans le cellules embryonaire, mais cessent sont travail avec le vieillissement
Vrai
Vrai ou faux?
La télomérase permet d’allonger les deux brins d’ADN.
Vrai
Nomme les 3 types de transposons.
Transposons ADN
Retrotransposon avec LTR
Rétrotransposon poly-A
Qu’est ce qu’un transposon?
Certaines séquence du génome (télomère) sont mobile et peuvent se déplacer dans l’ARN