Composition de la cellule (cours 1) Flashcards
L’élément le plus abondant dans la cellule?
Oxygène
La molécule la plus abondante dans le cellule?
l’eau
Les 3 grandes familles de chose qui composent la cellule?
H2O
Ions inorganiques
Molécules organiques
Facts sur H2O…
- Polaire (O=nég et H=positif)
- Formation dipôle
- Liens hydrogènes
- Ions solubles
Facts sur ions inorganiques…
- Composent -1% de masse cellulaire
- Essentiel à métabolisme
Facts sur molécules organiques…
- à base de carbone
- 4 liaisons covalentes
- forent un tétraèdre symétrique (chaque H sont équidistants, 109,5°)
Quelles sont les 4 classes de molécules organiques?
Sucre
Lipide
Acides nucléiques
Acides aminés
Polymère de glucose?
Polysaccharide amidon (plante) Glycogène (animaux)
Polymère acide nucléique?
ADN
Polymère acide aminé?
Protéine
Facts sur glucide… (3)
- Marqueurs pour le transport et le repliement des protéines
- Marqueurs de la surface cellulaire
- Reconnaissance et interaction entre les cellules des tissus
Quels sont les formes les plus communes de monosaccharides?
Hexose C(6) -> glucose
Triose
Pentose -> ADN et ARN
Différence entre oligosaccharide et polysaccharide?
oligo = quelques monosaccharide Poly = plusieurs centaine ou milliers
Le lien alpha(1->6) d’un polysaccharide permet quoi?
permet le branchement des molécules
Différence entre polymère alpha-glucose et Beta-glucoe?
alpha = de réserve, OH du C1 en bas
beta = de structure, OH de c1 en haut
Facts sur les lipides…
- Importante réserve d’énergie
- Composant principal de la membrane plasmique
- Signalisation cellulaire
Deux types d’acides gras?
Saturé (chaine linéaire)
Insaturé (double lien C=C)
De quoi est formé un triacylglycérol?
Formé de 3 acides gras et 1 glycérol
Facts sur les phospholipides…
- Glyérol
- 2 acides gras
- C3 lié à un phosphate
- Phosphate lié à une autre petite molécule
Quelles peuvent être l’autre petite molécule qui est lié au phosphate d’un phospholipide?
Éthanolamine
Choline
Sérine
Inositol
Comment se nomme le seul phospholipide qui ne contient pas de glycérol?
Sphingomyéline
Facts sur la Sphingomyéline… (2)
- C’est la principale composante de la gaine de myéline
- Le groupement polaire = sérine
Quelle est la structure d’un glycolipide?
2 acide gras liés par un groupe hydrophile lié à un sucre
Nomme 2 rôles des glycolipides.
- Constituant de la couche externe des membranes lipidiques
- Jouent un rôle dans la reconnaissance
Qu’est ce qui rend le cholestérol différent des autre lipides?
Constitué de 4 cycles à la place d’une chaine
Sucre de ARN VS ADN et leur différence…
ARN = ribose (OH en 2') ADN = désoxyribose (H en 2')
Qu’est ce qu’une adenosine?
Adénine + sucre
nucléoside
Qu’est ce qu’un AMP?
Un nucléotide
Adénine + sucre + Phosphate
(Adénosine + P)
Qu’est ce qu’un ADP?
adénosine di phosphate
Qu’est ce qu’un ATP?
adénosine tri phosphate
Lors de la polymérisation des nucléotides, il y a la libération d’un…
Pyrophosphate
Composition des acides aminées (4 différentes parties)
Carbone central Groupe acide (COOH) Groupe amine (NH2) Groupe variable (R)
Nomme les acides aminés non polaire. (10)
Glycine Alanine Valine Leucine Isoleucine Proline (seul à avoir un cycle interne) Cystéine (parfois polaire) Méthionine Phénylalanine Tryptophane
Nomme les acides aminés polaires. (6)
Sérine (peut être phosphorylé) Thréonine (peut être phosphorylé) Tyrosine (peut être phosphorylé) Asparagine Glutamine Cystéine
Nomme les acides aminés basiques (3)
Lysine
Arginine
Histidine
Nomme les acides aminés acides (2)
Aspartate
Glutamate
Vrai ou faux?
Lorsqu’il y a la formation d’un lien peptide, les chaines latérales ne peuvent plus pivoter
Vrai
Vrai ou faux?
La formation d’un lien entre deux atomes implique la libération d’énergie.
Vrai
Plus le lien est fort, plus l’É libérée est grande
Qu’est ce que la première loi de la thermodynamique?
La quantité d’énergie requise pour briser un lien est identique à la quantité d’énergie libérée lors de la formation de ce lien.
le nombre de liens créé égal le nombre de liens brisés…
à l’équilibre
Que signifie Delta G?
Énergie libre
Lorsqu’il y a utilisation d’énergie, le delta G est?
positif
lorsqu’il y a dégagement d’énergie, donc que des liens sont formés, le delta G est négatif
Quelle est la deuxième loi de la thermodynamique?
Les réactions spontanées s’accompagnent toujours d’une diminution de l’énergie libre (deltaG négatif)
Une réaction spontanée n’est favorable que si deltaG est…
Négatif
Quand l’équilibre est vers les produits, le K et le DeltaG sont…
K plus grand que 1
Delta G négatif
Quand l’équilibre est vers les réactifs, le K et le DeltaG sont…
K plus petit que 1
Delta G positif
Quelle est la constante des gaz parfaits?
R est 1,987cal/deg-mol
Les liens covalents ont des DeltaG autour de …
-50 à -110 kcal/mol
Les forces de Van der Waals et hydrophobe ont un DeltaG d’environ…
1 à 2 kcal/mol
Les pont hydrogènes et les liaisons ioniques ont un DeltaG d’environ…
3 à 7 kcal/mol
À 25°C l’énergie thermique génère…
0,6 kcal/mol
Qu’elle est la structure de l’eau?
Tétraède solide
Chaque molécule d’eau peut former 4 liens hydrogènes
Vrai ou faux?
Même une substance polaire à une solubilité limitée.
Vrai car les interactions H2O H2O sont plus favorables
l’hydrolyse d’un lien à grande énergie génère environ…
7 kcal/mol
Vrai ou faux?
La molécule énergétique la plus importante est l’ATP
Vrai
Lié par des liens covalents faibles
Globalement, ATP -> AMP engendre un DeltaG de…
-13 kcal/mol
-7 + -6
Les enzymes sont des catalyseurs. Qu’est ce que cela signifie?
elles augmente la vitesse de réaction en abaissant le Ea
Qu’est ce qu’un catalyseur?
Une substance utilisée pour modifier la vitesse d’une rx sans être elle-même altérée par cette réaction
Comment travaille une enzyme?
Elle facilite les échangent entre les substrats en se liant de façon transitoire aux substrats.
Facts sur les enzymes…
Doivent reconnaitre de façon très spécifique leur substrat
Les substrats sont adaptés au site actif de l’enzyme
Font des liens hydrogènes, ioniques et interaction hydrophobe
Explique la coupure par la chymotrypsine…
= enzyme digestive hydrolysant les protéines
La coupure du lien peptide entre la protéine a été rendu possible par l’hydrolyse de molécule d’eau
Qu’est ce qu’un coenzyme?
Fourni des groupements chimiques essentiels à la réaction pcq des fois le site actif d’une enzyme ne suffit pas pour catalyser la rx.
Quand le coenzyme est fixé de façon covalente à l’enzyme, on parle alors de…
Groupe prosthétique
La plupart des coenzyme sont dérivés de …
Vitamine!
Donne un exemple de coenzyme
ATP qui fournit un groupement phosphate transféré à une protéine par une kinase
Nomme les 6 grandes catégories de réactions enzymatiques.
Ozydoréductase (transfert l’électron)
Tranférase (Transfert de groupes fonctionnels)
Hydrolase (accélère le clivage hydrolotique)
Lyase (attacher/détacher des molécules sans attacher de façon covalente)
Isomérase (Change conformation 3D d’une molécule)
Ligase (Utilise l’hydrolyse de ATP pour catalyser rx de 2 substrats ensemble)
La vitesse de réaction dépend de…
La concentration des réactifs et du produit
Expliquer Vmax
Rendu la fin de la rx, toutes les molécules d’enzymes sont occupées par le substrat et travaillent à pleine capacité. Augmenter davantage la [substrat] ne modifiera plus la vitesse car aucun site actif n’est disponible
Qu’est ce que la constante de Mikaelis? (Km)
c’est la [substrat] où la vitesse de rx est à la moitié de Vmax
Km est la mesure de?
l’affinité de l’enzyme pour son substrat
Explique moi l’exemple de régulation enzymatique (rétroaction négative) de la thréonine.
Thréonine sous l’effet de la thréonine désaminase devient l’alpha-kétobutyrate qui engendre la synthèse d’isoleucine.
Celle-ci est régulateur se da propre synthèse parce que peut se lier à la thréonine désaminase et abolit son action
Qu’est ce que allostérie?
un autre site capable de se lier à une autre molécule
EX: l’inhibitur se lie à l’allostie, ça change la conformation de l’enzyme qui ne peut plus se lier à son substrat
Vrai ou faux?
Les liaisons allostériques peuvent est activatrice.
Vrai
Vrai ou faux?
La phosphorylation est un exemple d’activation ou de désactivation.
Vrai
L’ajout d’un groupement phosphate à un effet significatif sur la conformation 3D.
