Structure des macromolécules (cours 3) Flashcards
Qu’est ce qui différencie les purines des pyrimidines?
Les purines ont un double cycle
Quelles sont les purines?
dAdénosine et dGuanosine
Quelles sont les pyrimidines?
dCytosine et dThymidine
Qu’elle est la règle de Chargaff?
%A = %T et %C = %G
Explique la diffraction par rayons X…
Les rayons X sont diffractés par la présence de quelque chose. Le pâle c’est la molécule
Question
A et T font combien de lien? Et quel type de lien? (Et pour G et C?)
A et T ont 2 ponts H
G et C en font 3
Facts à savoir sur structure ADN…
- 2 chaines de nucléotides
- Enroulée en double hélice
- Squelette alternance de sucres et de phosphate
- Bases orientées vers l’intérieur
- Chaine antiparallèle
- Les bases sont complémentaires
- La complémentarité des bases maintient les 2 chaines ensembles
Explique la différence entre le sillons mineur et majeur…
Voir dessin tutorat
Grand sillon = 240° lui qui permet de différentier laquelle est de quel coté
Petit sillon = 120° permet de juste différencier si cest CG et AT
Nomme les deux types de lien que le Désoxyribose peut faire?
Lien phosphomonoester (avec l’acide phosphorique) (OH de 5’)
Lien glycosidique (avec la base) (OH de 1’)
Comment nomme-t-on l’association de 2 liens phosphoester?
1 phosphodiester
Relie le OH en 3’ de un avec le P attaché en 5’ de l’autre
Comment nomme-t-on l’association de 2 liens phosphoester?
1 phosphodiester
Relie le OH en 3’ de un avec le P attaché en 5’ de l’autre
Pourquoi les acides nucléiques croissent de 5’ vers 3’?
À cause de la structure du nucléotide qui fait en sorte qu’il y a un hydroxyle libre en 3’
Explique l’empilement des bases…
Les bases appariées forment une surface hydrophobe et les interactions de van der Waals entre les bases adjacentes stabilisent la molécule
Chaque base forme un angle de ____ avec sa voisine.
30°
L’hélice d’ADN tourne le plus souvent vers la…
Droite
Il faut environ combien de paires de bases pour parcourir un tour complet de l’hélice?
11pb
Par rapport au grand et petit sillon…
Nomme les groupes chimiques spécifiques…
A: Accepteur de lien H
D: Donneur de lien H
M: Méthyle (hydrophobe) -> juste la thymine)
*La succession de ces groupe dans la molécule permet de reconnaitre des séquences spécifiques dans l’ADN
Dans quelles régions que la double hélice est plus facilement brisée et pourquoi?
Dans des régions où il y a une série de AT.
À cause de l’empilement des bases et la force moins grande que CG, ça engendre que certaine bases sont tordues et change localement la largeur des sillons.
Dans quelles régions que la double hélice est plus facilement brisée et pourquoi?
Dans des régions où il y a une série de AT.
À cause de l’empilement des bases et la force moins grande que CG, ça engendre que certaine bases sont tordues et change localement la largeur des sillons.
Qu’est ce que l’ADN Z?
c’est une hélice de pas gauche… Le lien qui attache le sucre à la base de chaque nucléotide peut avoir la conformation syn ou anti. Dans l’hélice de pas droit, le lien est anti. Dans hélice de pas gauche, les pyrimidines sont anti, mais les purines sont trans
Question
Vrai ou faux?
ADN double brin absorbe moins de lumière UV.
Vrai
Qu’est ce que le Tm?
le melting temperature
T° de dénaturation
Correspond au point d’augmentation de l’absorbance sur le graphique