Structure Des Protéines Flashcards

1
Q

Comment appelle-t-on une molécule qui est composée de moins de 10 AA ?

A

Peptide / Oligopeptide

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Q

Comment appelle-t-on une molécule qui est composée entre 10 et 100 AA ?

A

Polypeptide

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3
Q

Comment appelle-t-on une molécule qui est composée de plus de 100 AA ?

A

Protéine

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4
Q

Entre quelles fonctions la liaison peptidique se forme-t-elle ?

A

Entre la fonction carboxylique du 1er acide et la fonction amine du 2e

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5
Q

Dans quel sens lit-on une protéine ?

A

De N-ter à C-ter

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6
Q

Grâce à quelle réaction la liaison peptidique lie-t-elle deux AA ?

A

Réaction de condensation

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7
Q

Quelle molécule est libérée lors de la formation d’une liaison peptidique ?

A

H2O

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8
Q

La liaison peptidique confère un pic d’absorption de la lumière. À quelle longueur d’onde ?

A

210 ( UV )

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9
Q

Quelles sont les 3 caractéristiques de la liaison peptidique ?

A

Plane
Rigide
Polaire

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10
Q

Quelle est la translation ( distance entre deux AA ) de l’hélice alpha ?

A

1,5 Å

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11
Q

Quelle est la rotation entre 2 AA dans une hélice alpha ?

A

100 degrés

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12
Q

Combien y a t il de résidus d’AA par tour dans une hélice alpha ?

A

3,6

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13
Q

Que vaut le pas d’une hélice alpha ?

A

5,4 Å

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14
Q

Quelle est la structure secondaire la plus stable ?

A

L’hélice alpha

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15
Q

Quels AA déstabilisent l’hélice alpha ?

A

V,I,T ( encombrement stérique )

Enchaînement de D,E ou R,K ( répulsions )

P ( liaisons H impossible )

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16
Q

Quels AA stabilisent l’hélice alpha ?

A

L, W, F

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17
Q

Comment s’appelle l’hélice 3,6 13 ?

A

Hélice alpha

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18
Q

Comment s’appelle l’hélice 3,6 13 ?

A

Hélice alpha

19
Q

Comment s’appelle l’hélice 3 10 ?

A

Hélice de jonction

20
Q

Comment s’appelle l’hélice 4,4 16?

A

Hélice pi

21
Q

L’hélice gauche est formée par la succession de quels AA ?

A

Proline et Glycine

22
Q

Quelle est la translation maximale des brins bêta ?

A

3,5 Å

23
Q

Grâce à quel type de liaisons les feuillets bêta sont-ils stabilisés ?

A

Les liaisons hydrogène inter-brins

24
Q

De combien d’AA un coude bêta est-il composé ?

A

4 AA ( souvent une P et parfois des G )

25
Q

Quelle structure est souvent impliquée dans la jonction entre 2 brins bêta anti parallèles ou un brin bêta et une hélice alpha ?

A

Le coude bêta

26
Q

Citer un agent dénaturant réversible

A

Urée

27
Q

Citer un agent dénaturant irréversible

A

La chaleur

28
Q

Quel agent dénaturant permet la rupture des ponts disulfures ?

A

Le Bêta—mercaptoéthanol

29
Q

Lorsque la protéine prion PrPc est sous forme anormale PrPsc, que se passe t il au niveau de ses hélices alpha ?

A

Les hélices alpha se substituent en feuillets bêta : la protéine est résistante aux agents dénaturants et insensible aux protéases ( dégradation )

30
Q

Quelle est la protéine responsable du Covid19 ?

A

La protéine Spike

31
Q

De combien d’AA la protéine Spike est-elle composée ?

A

1200 AA

32
Q

Quel est le rôle diholoside-2 glucosyl-galactose dans le collagène ?

A

La glycosylation de la 5-hydroxylysine

33
Q

À quel récepteur le domaine RBD de la protéine Spike se lie t il ?

A

ACE2

34
Q

Combien y a t il de domaine dans la partie S1 de la protéine Spike ? Dans la partie S2 ?

A

2

5

35
Q

Comment la protéine Spike s’active t elle ?

A

Elle forme un trimère

36
Q
Les anticorps sont riches en...
Hélices alpha
Feuillets bêta
Coudes bêta 
Boucles Random Coil
A

Feuillets bêta

37
Q

Sur quel domaine les anticorps sont-il glycosylés ?

A

CH3 de la chaîne lourde

38
Q

Que vaut la translation du collagène ?

A

0,29 nm

39
Q

Que vaut le pas du collagène ?

A

0,87 nm

40
Q

Combien d’AA par tour dans le collagène ?

A

3

41
Q

Combien d’AA dans le collagène ?

A

1000 ( 3 hélices gauches )

42
Q

En quoi les hélices gauches du collagène s’enroulent-elles ?

A

Une super-hélice alpha

43
Q

Dans le collagène, la mutation de quelle enzyme peut entraîner l’apparition du syndrome d’Ehlers Danlos ?

A

La lysine-hydroxylase