Structure de la chromatine - Rokeach Flashcards
Qu’est-ce que l’unité de base de la chromatine?
Le nucléosome: séquence d’ADN constituée d’environ 146-147 paires de bases qui s’enroule autour d’un octamère d’histones (2 histones H2A, 2 histones H2B, 2 histones H3 et 2 histones H4), lesquelles sont chargées positivement.
Quelle est la charge portée par une histone? Qu’en est-il de l’ADN?
- Histone = positive
- ADN = négative
À quoi sert l’histone H1?
À sceller le nucléosome, le maintenir en place.
Quels sont les niveaux de condensation de la chromatine? Décrivez-les (où les retrouve-t-on, permettent-ils ou non la transcription, à quelles phases du cycle cellulaire sont-ils présents, etc.)
- Hétérochromatine (= chromatine fortement condensée et donc, peu accessible à la transcription (expression génique), et qui comporte conséquemment peu de gènes)
- Retrouvée au niveau des télomères et du centromère d’un chromosome
- Chromatine = sous cette forme lors de la mitose et l’interphase - Euchromatine (= chromatine dispersée et donc, accessible à la transcription (expression génique))
- Chromatine = sous cette forme lors de l’interphase
Quel niveau d’organisation de la chromatine retrouve-t-on lors de l’interphase exclusivement?
Euchromatine
Quel niveau d’organisation de la chromatine retrouve-t-on lors de l’interphase ET la mitose?
Hétérochromatine
Quel type de chromatine renferme peu de gènes? Pourquoi?
L’hétérochromatine parce qu’elle est peu accessible en termes de transcription et donc, d’expression génique en raison de son état fortement condensé.
Quel type de chromatine est accessible à la transcription et pourquoi?
L’euchromatine en raison de son état dispersé.
Quels sont les moyens de modification de l’état condensé ou non condensé de la chromatine?
- Complexes de remodelage
- Modifications post-traductionnelles des queues des histones
- Méthylation des cytosines de l’ADN
Qu’est-ce qu’un complexe de remodelage?
Complexe permettant de modifier la position de l’ADN enroulé autour d’un octamère d’histones, c’est-à-dire de modifier son état de condensation ou de décondensation, par le glissement des nucléosomes. Pour ce faire, il nécessite de l’ATP.
À compléter: Le complexe de remodelage nécessite de ______ pour fonctionner.
L’ATP
Quelles sont les 3 modifications post-traductionnelles des queues des histones?
- Acétylation des lysines
- Phosphorylation
- Méthylation des lysines ou des arginines
À quelle extrémité protéique correspondent les queues des histones?
N-terminale
Quel est le mécanisme derrière l’acétylation? Quel est son résultat final?
L’acétylation correspond à la neutralisation des charges positives à la surface des histones
Résultat: décondensation de la chromatine par répulsion.
Vrai ou faux. L’acétylation est irréversible, tout comme il a été montré avec le fonctionnement de l’aspirine.
Faux
Quel est le nom du mécanisme réversible de l’acétylation? Quelle est l’enzyme qui la catalyse?
Désacétylation catalysée par l’histone désacétylase (HD)
À quoi mène la désacétylation?
Reprise de la forme condensée initiale de la chromatine
Quelle est l’enzyme qui catalyse l’acétylation?
Histone Acétyle Transférase (HAT)
Qu’est-ce que la phosphorylation en tant que modification post-traductionnelle des queues des histones? Quel est le résultat final sur la structure de la chromatine?
- Ajout de groupements phosphate chargés négativement aux histones chargés positivement, ce qui empêche l’ADN chargé négativement de s’enrouler autour des octamères d’histones par répulsion
- Résultat: décondensation de la chromatine
Est-ce que la phosphorylation est réversible? Si oui, précisez l’état de la chromatine suivant cette modification réversible.
Oui, elle est réversible via la déphosphorylation.
La chromatine reprendra donc son état condensé initial.
Quelles AA des queues des histones peuvent subir une acétylation? Qu’en est-il pour la méthylation?
Acétylation: Lysine
Méthylation: Lysine + Arginine
Quelles enzymes catalysent la méthylation de la lysine et de l’arginine?
Méthylation de la lysine = catalysée par les enzymes arginines transférase PKMT
Méthylation de l’arginine = catalysée par les enzymes arginines transférases PRMT
À compléter: La méthylation des queues des histones mène soit à une 1) _______ ou à une 2)_________, dépendamment de 3)______________ ou de sa 4)_______ dans la chaîne protéique qu’est la queue de l’histone.
1) Condensation
2) Décondensation
3) L’acide aminé méthylé
4) Position
Vrai ou faux. La méthylation des queues des histones mène toujours à une condensation de la chromatine.
Faux.
Expliquez l’effet de la méthylation des queues des histones sur l’état de la chromatine.
Tout dépendant de l’AA méthylé et de sa position dans la queue de l’histone, la méthylation peut soit mener à une condensation (répression de la transcription et donc, de l’expression génique) ou à une décondensation (activation de la transcription et donc, de l’expression génique) de la chromatine.
Est-ce que la méthylation des queues des histones est réversible? Si oui, quel est son effet?
Oui, elle est réversible
Effet: perte des groupements méthyl mène à une reprise de l’état initial de la chromatine.
Quelle est l’unique base azotée pouvant être méthylée? S’agit-il d’une réaction réversible? Si oui, expliquez ses effets.
Cytosine
La méthylation des cytosines de l’ADN est réversible, ce qui mène à un retour à l’état décondensé de la chromatine.
Quel est le résultat de la méthylation de l’ADN?
La méthylation des cytosines de l’ADN mène toujours à une CONDENSATION de la chromatine et donc, à la répression de la transcription et, par le fait-même, de l’expression génique.
Vrai ou faux. La méthylation de l’ADN, contrairement à la méthylation des queues des histones, mène toujours à la condensation, tandis que l’autre type de méthylation mène toujours à une décondensation de la chromatine.
Faux, la méthylation des queues des histones peut soit mener à une condensation ou à une décondensation de la chromatine.
Vrai ou faux. La méthylation de l’ADN, contrairement à la méthylation des queues des histones, est irréversible.
Faux, elle est réversible aussi.
