Structure De L'ADN Flashcards
Vrai ou faux : l’association en brin et la structure primaire des acides nucléiques
Vrai
Pourquoi T dans l’ADN et U dans l’ARN
ADN = support chimique de l’information génétique
Si désamination de C en U transcription en A au lieu de G
Mais il existe une enzyme qui corrige ses erreurs en modifiant les U en C
C’est pourquoi l’ADN ne peut pas contenirde U car il serait impossible de différencier les U codan des U desamines
Pourquoi du désoxyriboses dans l’ADN et du ribose dans l’ARN
Car présence d’un OH2’ propice à des réactions chimiques : l’ADN doit rester stable
Quant à l’ARN le OH2’ sert à l’excision des introns d’où l’utilisation du ribose dans l’ARN
Dans quel sens se fait la lecture de la chaîne polynucléotidique
5’P ->3’OH
Qu’est-ce que la structure secondaire de l’ADN
Une structure en double hélice
Vrai ou faux : les deux chaînes de l’ADN sont parallèles, complémentaires, hélicoïdales
Faut : elles sont bien complémentaires et hélicoïdal mais elles sont anti parallèle c’est-à-dire que le sens des nucléotides dans les deux brins est inversé
Grâce à quoi l’aDN maintient un diamètre constant
Par association d’une base purique avec une base pyrimidique
Combien y a-t-il de liaison hydrogène entre les bases AT et CG
Deux liaisons hydrogènes entre AT
Trois liaisons hydrogène entre GC
Vrai ou faux : la maximisation du nombre de liaisons assure la stabilité de la double hélice
Vrai
Vrai ou fauxLes squelettes pentoses phosphate sont à l’extérieur pour maximiser la répulsion entre les charges anioniques
Faux ils sont à l’extérieur pour minimiser la répulsion entre les charges anioniques
Vrai ou faux les bases sont à l’intérieur de la double hélice ils sont parallèles les unes aux autres
Vrai
À quoi est due la stabilité de la structure secondaire de l’ADN
Elle est due aux liaisons hydrogène + interactions hydrophobes des bases empilées
Quelles sont les trois configurations possibles de l’ADN
A, B, Z
Vrai ou faux la conformation Z est une hélice droite
Faux c’est une double hélice gauche
Quelle est la particularité de la conformation A
Enroulement droit plus torsadée que la conformation B
Vrai ou faux la conformation B est la plus stable aux conditions physiologiques
Vrai
Combien y a-t-il de paires de bases/ tour d’hélices dans la conformation de l’aDN B
10,5
Avec quelle élémentssepare t’on l’ADN des ARN des protéines
Avec du chlorure de césium
Vrai ou faux : les protéines sont plus dense que l’ADN qui est lui-même plus dense que l’ARN
Faut : c’est l’inverse l’ARN est plus dense que l’ADN qui est plus dense que les protéines
Vrai ou faux : les groupements phosphate sont ionisable à pH alcalin
Faut : les groupements phosphate sont ionisable à pH physiologique
Dans quelle fourchette de pH sont ionisable les N des cycles de base, les groupements amino des cycles et les formes Tautomère
Ils sont tous ionisable à pH basique entre 9,2 et 9,5
À quoi est due la charge négative des acides nucléiques à pH physiologique
Elle est du au groupement phosphate
Vrai ou faux : lors d’une électrophorèse les acides nucléiques migrent vers le pôle moins c’est-à-dire l’anode
Faut : les acides nucléiques migrent bien vers l’anode mais dans le cas d’une électrophorèse il s’agit d’une du pôle +
Quel élément précipite les molécules d’ADN
Les alcools
Vrai ou faux : l’absorbance de l’ADN et de l’ARN est égal à 260 nm mais l’absorbance diminue en intensité pour l’ADN de l’ordre de - 30 %
Vrai
En quoi consiste l’effet hypochrome
Cela veut dire que l’énergie d’une base libre est plus grande que l’énergie des bases appariées
C’est pourquoi l’intensité de l’absorbance de l’ARN est plus grand que celui de l’ADN de l’ordre de 30 %
En quoi consiste l’effet hyperchrome
Cela veut dire que l’ADN dénaturé (simple brin) à une absorbance supérieure à l’absorbance d’un ADN double brin de l’ordre de 1,6 X
Quel rapport établissons pour un contrôle de pureté de l’ADN
Absorbance 260 nm/280 nm
280 nm étant l’absorbance des protéines
Vrai ou faux le rapport de contrôle de pureté inférieur à 1,7 signifie une contamination par ARN
Faux la contamination par ARN est valable pour un rapport supérieur à 2
Et que signifie un rapport inférieur à 1,7 lors d’un contrôle de pureté de l’ADN
Contamination par protéine
Vrai ou fauxUne solution est pure si le rapport du contrôle de pureté de l’ADN est entre 1,8 et 2
Vrai
Qu’est-ce que la dénaturation de l’adn, par quel moyen peut-elle être réalisé
La dénaturation = passage de la forme double un simple brin de l’ADN
=une rupture des liaisons hydrogène et des liaisons concomitante : déstabilisation de la structure
Peut être réalisé par des moyens physiques : température/pH extrême/diminution de la concentration en sel/soude
Pour la Renaturation de l’ADN quelle différence y a-t-il entre une température qui est lentement abaissée ou un refroidissement rapide
Si température lentement abaissé : association des deux brins complémentaires
Si refroidissement rapide : obtention de deux brins simple relativement stable
Par quel type d’enzyme est faite L’hydrolyse enzymatique de l’ADN
Par des nucléases ou par des enzyme de restrictions = endonucléases
Quel est le principe de l’hydrolyse enzymatique par les nucléase
Les Nucléase sont des phosphodiestérase specifiques classés en fonction de leurs spécificités (Spécificité de substrat, structure, modes d’attaque, site, types de coupure)
Elle catalyse l’hydrolyse des liaisons phosphodiesters des acides nucléiques
Mécanisme d’action des enzymes de restrictions
Spécifique de l’ADN double brin reconnaît les séquences de palindrome de 4–10 nucléotides
Qu’est-ce que la restriction virale
Par exemple : il enzyme de restrictions permettent aux bactéries de résister aux virus en hydrolysant l’ADN du virus mais pas le leur puisqu’il est methylé
Quelle est la différence entre deux ADN topo isomères
Même séquence mais diffèrent par leurs nombre de tour qu’un des brins fait autour de l’autre
Quelles sont les différents états de topo isomères
état relâché
État surenroulé : positif gauche / négatif droit
Quelle etat surenroulé est une structure observée in vivo
Sur enroulée négatif : super hélice droite
Qu’est-ce qu’un topoisomere dans un état relâché
ADN en configuration canonique : contrainte minimal : configuration + stable
Vrai ou faux : un État sur enroulée correspond à un nombre d’enlacement supérieur à l’état relâché
Faut : les états sur enroulés correspondent à un nombre d’enlacement supérieur ou inférieur à l’état relâché
À quoi sert une topo isomérase
Enzyme contrôlant le super enroulement de l’ADN
Quelle topo isomèrase additionne des super tour négatif
la topo isomérase 2
quelle topo isomérase supprime les super tour négatif
Topo isomérase 1
Quelle topo isomérases est ATP dépendante
La topo isomérases 2
Quelle topo isomérase réenoule l’ADN sur 1 tour
Topo isomérase 1
Quel topo isomérases desenroule l’ADN sur deux tours
Topoisomerase 2
Vrai ou faux : la quinolone est un inhibiteur de la topoisomerase 1 des bactéries
Faux: la quinolone est un inhibiyeur de la topoisomerase 2
Facteur de compactation du genome humain
X10 000
Fraction proteique et fraction nucléique de la chromatine
1/3 d’ADN et 2/3 de protéines dont 50% d’histones
Vrai ou faux : la chromatine est un complexe nucleo proteique dont l’unite de base est nucleosome
Vrai
De quoi est composé le nucleosome
Noyau / octamere => 4 paires H2A H2B H3 et H4
+ 1 histone de liaison H1
+ ADN enroulé
Par combien de paires de bases sont reliés les nucléosomes entre
60
Pour un nucléosome donné combien de paires de bases d’ADN sont enroulées
146
À quoi correspond l’empaquetage de l’ADN en fibres de 11 nm
Correspond à l’empaquetage des nucleosomes
Vrai ou faux : le collier de perles correspond au compactage de la chromatine en fibre de 30 nm par l’intermédiaire des Histones H1
Vrai
Le chromosome méta phasiques est un enroulement complexe de quel type de structure
Enroulement complexe de boucle/structure centrale autour d’une matrice nucléaire
La séquence d’attachement à la matrice est une séquence riche en quel type de base
En base AT
Qu’est-ce que l’euchromatine
l’euchromatine= réseau lâche associé À des modifications chimiques et à des protéines favorisant une structure décompacter qui se condense juste avant la mitose
Qu’est-ce que l’heterochromatine
Région restant condensé : composition en séquence génomique plus ou moins modifiée
Protéine induisant une structure très contacter : ne permet pas la transcription
Quelle chromatine à une réplication tardive // laquelle a une réplication précoce
l’euchromatine : réplication précoce
L’heterochromatine : réplication tardive
Quelle chromatine trouve-t-on plutôt en périnucléaire/ nucleolaire
Laquelle retrouve-t-on à l’intérieur du nucléoplasme
On retrouve l’euchromatine dans le nucléoplasme et l’heterochromatine en périphérie et dans le nucléoles
Caractéristiques de l’hétéro chromatine constitutive
toujours condensé + inactive
= régions dénué de gènes/formé principalement de telomere et de centromère
Vrai ou faux: l’hétéro chromatine correspond à une région condensé inactive
Faut : hétéro chromatine facultative est représenté soit
sous forme de lésions condensé inactive mais peut aussi être présente sous forme de régions lâche active
=création d’un corpuscules de Barr
