Structure De L'ADN Flashcards

1
Q

Vrai ou faux : l’association en brin et la structure primaire des acides nucléiques

A

Vrai

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Q

Pourquoi T dans l’ADN et U dans l’ARN

A

ADN = support chimique de l’information génétique
Si désamination de C en U transcription en A au lieu de G
Mais il existe une enzyme qui corrige ses erreurs en modifiant les U en C
C’est pourquoi l’ADN ne peut pas contenirde U car il serait impossible de différencier les U codan des U desamines

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3
Q

Pourquoi du désoxyriboses dans l’ADN et du ribose dans l’ARN

A

Car présence d’un OH2’ propice à des réactions chimiques : l’ADN doit rester stable
Quant à l’ARN le OH2’ sert à l’excision des introns d’où l’utilisation du ribose dans l’ARN

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4
Q

Dans quel sens se fait la lecture de la chaîne polynucléotidique

A

5’P ->3’OH

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5
Q

Qu’est-ce que la structure secondaire de l’ADN

A

Une structure en double hélice

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6
Q

Vrai ou faux : les deux chaînes de l’ADN sont parallèles, complémentaires, hélicoïdales

A

Faut : elles sont bien complémentaires et hélicoïdal mais elles sont anti parallèle c’est-à-dire que le sens des nucléotides dans les deux brins est inversé

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7
Q

Grâce à quoi l’aDN maintient un diamètre constant

A

Par association d’une base purique avec une base pyrimidique

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8
Q

Combien y a-t-il de liaison hydrogène entre les bases AT et CG

A

Deux liaisons hydrogènes entre AT

Trois liaisons hydrogène entre GC

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9
Q

Vrai ou faux : la maximisation du nombre de liaisons assure la stabilité de la double hélice

A

Vrai

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10
Q

Vrai ou fauxLes squelettes pentoses phosphate sont à l’extérieur pour maximiser la répulsion entre les charges anioniques

A

Faux ils sont à l’extérieur pour minimiser la répulsion entre les charges anioniques

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11
Q

Vrai ou faux les bases sont à l’intérieur de la double hélice ils sont parallèles les unes aux autres

A

Vrai

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12
Q

À quoi est due la stabilité de la structure secondaire de l’ADN

A

Elle est due aux liaisons hydrogène + interactions hydrophobes des bases empilées

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13
Q

Quelles sont les trois configurations possibles de l’ADN

A

A, B, Z

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14
Q

Vrai ou faux la conformation Z est une hélice droite

A

Faux c’est une double hélice gauche

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15
Q

Quelle est la particularité de la conformation A

A

Enroulement droit plus torsadée que la conformation B

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16
Q

Vrai ou faux la conformation B est la plus stable aux conditions physiologiques

A

Vrai

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17
Q

Combien y a-t-il de paires de bases/ tour d’hélices dans la conformation de l’aDN B

A

10,5

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18
Q

Avec quelle élémentssepare t’on l’ADN des ARN des protéines

A

Avec du chlorure de césium

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19
Q

Vrai ou faux : les protéines sont plus dense que l’ADN qui est lui-même plus dense que l’ARN

A

Faut : c’est l’inverse l’ARN est plus dense que l’ADN qui est plus dense que les protéines

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20
Q

Vrai ou faux : les groupements phosphate sont ionisable à pH alcalin

A

Faut : les groupements phosphate sont ionisable à pH physiologique

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21
Q

Dans quelle fourchette de pH sont ionisable les N des cycles de base, les groupements amino des cycles et les formes Tautomère

A

Ils sont tous ionisable à pH basique entre 9,2 et 9,5

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22
Q

À quoi est due la charge négative des acides nucléiques à pH physiologique

A

Elle est du au groupement phosphate

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23
Q

Vrai ou faux : lors d’une électrophorèse les acides nucléiques migrent vers le pôle moins c’est-à-dire l’anode

A

Faut : les acides nucléiques migrent bien vers l’anode mais dans le cas d’une électrophorèse il s’agit d’une du pôle +

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24
Q

Quel élément précipite les molécules d’ADN

A

Les alcools

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25
Q

Vrai ou faux : l’absorbance de l’ADN et de l’ARN est égal à 260 nm mais l’absorbance diminue en intensité pour l’ADN de l’ordre de - 30 %

A

Vrai

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26
Q

En quoi consiste l’effet hypochrome

A

Cela veut dire que l’énergie d’une base libre est plus grande que l’énergie des bases appariées
C’est pourquoi l’intensité de l’absorbance de l’ARN est plus grand que celui de l’ADN de l’ordre de 30 %

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27
Q

En quoi consiste l’effet hyperchrome

A

Cela veut dire que l’ADN dénaturé (simple brin) à une absorbance supérieure à l’absorbance d’un ADN double brin de l’ordre de 1,6 X

28
Q

Quel rapport établissons pour un contrôle de pureté de l’ADN

A

Absorbance 260 nm/280 nm

280 nm étant l’absorbance des protéines

29
Q

Vrai ou faux le rapport de contrôle de pureté inférieur à 1,7 signifie une contamination par ARN

A

Faux la contamination par ARN est valable pour un rapport supérieur à 2

30
Q

Et que signifie un rapport inférieur à 1,7 lors d’un contrôle de pureté de l’ADN

A

Contamination par protéine

31
Q

Vrai ou fauxUne solution est pure si le rapport du contrôle de pureté de l’ADN est entre 1,8 et 2

A

Vrai

32
Q

Qu’est-ce que la dénaturation de l’adn, par quel moyen peut-elle être réalisé

A

La dénaturation = passage de la forme double un simple brin de l’ADN
=une rupture des liaisons hydrogène et des liaisons concomitante : déstabilisation de la structure
Peut être réalisé par des moyens physiques : température/pH extrême/diminution de la concentration en sel/soude

33
Q

Pour la Renaturation de l’ADN quelle différence y a-t-il entre une température qui est lentement abaissée ou un refroidissement rapide

A

Si température lentement abaissé : association des deux brins complémentaires
Si refroidissement rapide : obtention de deux brins simple relativement stable

34
Q

Par quel type d’enzyme est faite L’hydrolyse enzymatique de l’ADN

A

Par des nucléases ou par des enzyme de restrictions = endonucléases

35
Q

Quel est le principe de l’hydrolyse enzymatique par les nucléase

A

Les Nucléase sont des phosphodiestérase specifiques classés en fonction de leurs spécificités (Spécificité de substrat, structure, modes d’attaque, site, types de coupure)

Elle catalyse l’hydrolyse des liaisons phosphodiesters des acides nucléiques

36
Q

Mécanisme d’action des enzymes de restrictions

A

Spécifique de l’ADN double brin reconnaît les séquences de palindrome de 4–10 nucléotides

37
Q

Qu’est-ce que la restriction virale

A

Par exemple : il enzyme de restrictions permettent aux bactéries de résister aux virus en hydrolysant l’ADN du virus mais pas le leur puisqu’il est methylé

38
Q

Quelle est la différence entre deux ADN topo isomères

A

Même séquence mais diffèrent par leurs nombre de tour qu’un des brins fait autour de l’autre

39
Q

Quelles sont les différents états de topo isomères

A

état relâché

État surenroulé : positif gauche / négatif droit

40
Q

Quelle etat surenroulé est une structure observée in vivo

A

Sur enroulée négatif : super hélice droite

41
Q

Qu’est-ce qu’un topoisomere dans un état relâché

A

ADN en configuration canonique : contrainte minimal : configuration + stable

42
Q

Vrai ou faux : un État sur enroulée correspond à un nombre d’enlacement supérieur à l’état relâché

A

Faut : les états sur enroulés correspondent à un nombre d’enlacement supérieur ou inférieur à l’état relâché

43
Q

À quoi sert une topo isomérase

A

Enzyme contrôlant le super enroulement de l’ADN

44
Q

Quelle topo isomèrase additionne des super tour négatif

A

la topo isomérase 2

45
Q

quelle topo isomérase supprime les super tour négatif

A

Topo isomérase 1

46
Q

Quelle topo isomérases est ATP dépendante

A

La topo isomérases 2

47
Q

Quelle topo isomérase réenoule l’ADN sur 1 tour

A

Topo isomérase 1

48
Q

Quel topo isomérases desenroule l’ADN sur deux tours

A

Topoisomerase 2

49
Q

Vrai ou faux : la quinolone est un inhibiteur de la topoisomerase 1 des bactéries

A

Faux: la quinolone est un inhibiyeur de la topoisomerase 2

50
Q

Facteur de compactation du genome humain

A

X10 000

51
Q

Fraction proteique et fraction nucléique de la chromatine

A

1/3 d’ADN et 2/3 de protéines dont 50% d’histones

52
Q

Vrai ou faux : la chromatine est un complexe nucleo proteique dont l’unite de base est nucleosome

A

Vrai

53
Q

De quoi est composé le nucleosome

A

Noyau / octamere => 4 paires H2A H2B H3 et H4
+ 1 histone de liaison H1
+ ADN enroulé

54
Q

Par combien de paires de bases sont reliés les nucléosomes entre

A

60

55
Q

Pour un nucléosome donné combien de paires de bases d’ADN sont enroulées

A

146

56
Q

À quoi correspond l’empaquetage de l’ADN en fibres de 11 nm

A

Correspond à l’empaquetage des nucleosomes

57
Q

Vrai ou faux : le collier de perles correspond au compactage de la chromatine en fibre de 30 nm par l’intermédiaire des Histones H1

A

Vrai

58
Q

Le chromosome méta phasiques est un enroulement complexe de quel type de structure

A

Enroulement complexe de boucle/structure centrale autour d’une matrice nucléaire

59
Q

La séquence d’attachement à la matrice est une séquence riche en quel type de base

A

En base AT

60
Q

Qu’est-ce que l’euchromatine

A

l’euchromatine= réseau lâche associé À des modifications chimiques et à des protéines favorisant une structure décompacter qui se condense juste avant la mitose

61
Q

Qu’est-ce que l’heterochromatine

A

Région restant condensé : composition en séquence génomique plus ou moins modifiée
Protéine induisant une structure très contacter : ne permet pas la transcription

62
Q

Quelle chromatine à une réplication tardive // laquelle a une réplication précoce

A

l’euchromatine : réplication précoce

L’heterochromatine : réplication tardive

63
Q

Quelle chromatine trouve-t-on plutôt en périnucléaire/ nucleolaire
Laquelle retrouve-t-on à l’intérieur du nucléoplasme

A

On retrouve l’euchromatine dans le nucléoplasme et l’heterochromatine en périphérie et dans le nucléoles

64
Q

Caractéristiques de l’hétéro chromatine constitutive

A

toujours condensé + inactive

= régions dénué de gènes/formé principalement de telomere et de centromère

65
Q

Vrai ou faux: l’hétéro chromatine correspond à une région condensé inactive

A

Faut : hétéro chromatine facultative est représenté soit
sous forme de lésions condensé inactive mais peut aussi être présente sous forme de régions lâche active
=création d’un corpuscules de Barr